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Method Article
We provide a detailed description of a protocol for flow cytometric analysis of surface antigens and/or intracellular antigens in neural cell types. Critical aspects of experimental planning, step-by-step methodological procedures, and fundamental principles of flow cytometry are explained in order to enable neurobiologists to exploit this powerful technology.
Flow cytometry has been extensively used to define cell populations in immunology, hematology and oncology. Here, we provide a detailed description of protocols for flow cytometric analysis of the cluster of differentiation (CD) surface antigens and intracellular antigens in neural cell types. Our step-by-step description of the methodological procedures include: the harvesting of neural in vitro cultures, an optional carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE)-labeling step, followed by surface antigen staining with conjugated CD antibodies (e.g., CD24, CD54), and subsequent intracellar antigen detection via primary/secondary antibodies or fluorescently labeled Fab fragments (Zenon labeling). The video demonstrates the most critical steps. Moreover, principles of experimental planning, the inclusion of critical controls, and fundamentals of flow cytometric analysis (identification of target population and exclusion of debris; gating strategy; compensation for spectral overlap) are briefly explained in order to enable neurobiologists with limited prior knowledge or specific training in flow cytometry to assess its utility and to better exploit this powerful methodology.
La cytométrie en flux a été largement exploitée dans l'immunologie, hématologie et en oncologie pour définir des populations de cellules via des propriétés intrinsèques de dispersion, l'expression d'antigènes de surface cellulaire, et d'autres paramètres de fluorescence 3.1. Nos connaissances dans le sang le développement de la lignée et la maladie sont le résultat d'un degré significatif de l'amélioration continue de cette méthodologie après sa mise en œuvre initiale de 4,5. Sensibilisation accrue du potentiel analytique quantitative et globale de cytométrie en flux a récemment encouragé son utilisation plus répandue dans la recherche sur les cellules souches et peut permettre des progrès similaire profonde dans un délai plus court 6. Toutefois, l'application de la cytométrie en flux pour analyser spécifiquement et isoler des populations de neurones a longtemps été considérée comme difficile. Contrairement aux cellules hématopoïétiques qui existent naturellement en suspension, des types de cellules neurales sont typiquement récoltées à partir de sources excessivement complexes qui peuvent comprendre des cellules gliales et divers outres cellules environnantes ainsi que d'un réseau complexe de neurones de processus portant. Par conséquent, la neurobiologie a encore mis en œuvre la polyvalence de cytométrie de flux à son potentiel complet dans les routines quotidiennes de recherche. Toutefois, aussi longtemps que la suspension de cellules viables unique peut être générée (et protocoles ont été conçus et optimisés à cet effet 7), la cytométrie en flux et les cellules activé par fluorescence (FACS) peut être considéré comme un élément précieux du répertoire analytique en neurobiologie 8-11.
. Figure 1. Principe de l'analyse et de composants un cytomètre de flux cytométrie flux cytomètres de flux comprennent trois systèmes principaux: fluidiques, l'optique et l'électronique. Un écoulement laminaire de cellules en suspension (préparée à partir de tissu primaire ou en culture in vitro) est accomplie par la gaine de fluid via focalisation hydrodynamique, limitant l'échantillon à son noyau central. Les éléments optiques sont constitués de lasers qui illuminent le flux de cellules et de filtres optiques qui dirigent le signal de détecteurs appropriés. Les signaux lumineux détectés sont convertis en signaux électroniques, ensuite traitées par un ordinateur et visualisées sur un moniteur pour l'analyse des données et de déclenchement. Se il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Les utilisateurs de flux profit des méthodes de cytométrie d'au moins une compréhension de base des fondamentaux sous-jacents, y compris les blocs de construction d'un cytomètre (pour revue voir 12,13; voir aussi la figure 1). Un faisceau laser croise un flux fluide hydrodynamique concentré qui contient les cellules en suspension, qui à son tour passent par le faisceau laser dans "fichier unique" un après l'autre. Le interceptisur une cellule (ou tout autre particule, d'ailleurs) avec les résultats du laser dans la diffusion de la lumière à partir de ce point d'interrogation. La lumière diffusée peut être détectée dans la direction de poursuite laser (diffusion vers l'avant, associée à la taille de la particule), ainsi que perpendiculairement à sa direction (dispersion latérale; reflétant la granulosité de la particule / cellule). Ces propriétés de dispersion susmentionnés ne nécessitent pas de marquage spécifique, ce est pourquoi un échantillon non marqué (ou encore les débris cellulaires, des bulles d'air, etc.) va générer un signal (événement) sur la bivariée diffusion vers l'avant par rapport diagramme de dispersion latérale couramment utilisé pour déclenchement initial. En utilisant les lasers et des filtres spécifiques pour l'excitation et l'émission des spectres correspondant appropriées, une cellule peut être analysé pour déterminer sa positivité, le niveau d'intensité, ou l'absence de marqueurs fluorescents. La majorité des applications de cytométrie en flux ont porté sur la caractérisation par des antigènes de surface cellulaire. Contrairement à la LINEAG hématopoïétiquee, la lignée de neurones est resté moins largement définie selon les modèles 5 d'expression de l'épitope de surface. Un avantage de l'exploitation des antigènes de surface est que les cellules vivantes peuvent être soumis à des paradigmes de tri cellulaire telles que FACS. En revanche, l'antigène intracellulaire coloration nécessite fixation et perméabilisation étapes de médiation de l'interaction épitope-anticorps, ce qui empêche les applications en aval qui nécessitent des cellules viables. Fait à noter, ces approches permettent encore de nombreux essais quantitatifs 14 ainsi que des analyses en aval pour l'ARN et l'expression des protéines 15. Hématologie, l'immunologie et de l'oncologie ont souvent utilisé plus d'une douzaine de marqueurs en collaboration pour définir des sous-populations particulières 16. En outre, la cytométrie de masse CyTOF ou peuvent maintenant être utilisés pour analyser jusqu'à 30 paramètres simultanément 17,18.
Pour des applications de cellules souches neurales, ainsi que des cultures primaires 14,19,20 le hétérogénéité des cellules dansvitro est un phénomène commun 21-23. Les cellules qui ne représentent pas la population cible d'intérêt incarnent un facteur potentiellement confusion pour la lecture expérimentale 24,25. Idéalement, les différents sous-ensembles cellulaires présentes dans une suspension de cellules hétérogène portent les profils d'expression de l'antigène distinctes (connus ou encore à déchiffrer), qui peuvent être utilisés pour définir ces différentes populations. La cytométrie en flux peut donc jouer un rôle crucial dans la résolution de l'hétérogénéité cellulaire et, ainsi, faciliter les applications biomédicales (essais in vitro, thérapie cellulaire) et d'optimiser la lecture quantitative en se concentrant sur le sous-ensemble le plus pertinent 24,26. Diverses combinaisons d'antigènes de surface ont été identifiés au cours des dernières années afin de permettre la quantification et l'isolement de types spécifiques de cellules neurales. Cela comprend CD133 pour l'enrichissement de cellules souches neurales 27, une combinaison du CD15 / CD24 / CD29 des antigènes de surface pour l'isolement de NSC, differentiaTed neurone et les cellules de la crête neurale 28 ou CD15 / CD24 / CD44 / CD184 / CD271 pour isoler des sous-ensembles de neurones et cellules gliales 25, entre autres signatures 29,30. Au-delà de neurones comprennent des marqueurs gliaux A2B5 31, 25 CD44, NG2 32 et 33 GLAST. Une publication récente a exploité le mésencéphale platelage précurseur marqueur CORIN 34,35 pour enrichir précurseurs dopaminergiques dans la maladie de Parkinson transplantation de cellules paradigmes 36. CD molécules ne sont pas seulement des marqueurs, mais fonctionnellement pertinents de médiateurs interactions cellule-cellule et de la capacité d'une cellule à répondre à des signaux à partir de molécules de la matrice extracellulaire et des facteurs de croissance 37. Une stratégie de renforcer encore l'arsenal des antigènes CD combinatoires pour caractériser le développement de la lignée neuronale est d'utiliser des marqueurs intracellulaires connues pour cribler et définir des combinaisons d'antigènes de CD pour un type cellulaire particulier d'intérêt. Nous avons récemment exploité une telle approche et identifié CD49F - / CD200 des profils d'expression combinatoires élevées que une nouvelle approche pour enrichir des sous-ensembles de neurones différenciés neuronale pluripotentes induites systèmes de culture de cellules souches 38. Ici, nous incluons et discutons ce dernier protocole (et des variations de ceux-ci en option), dans lequel une coloration de surface et une coloration intracellulaire peuvent être utilisés simultanément pour définir des sous-populations de cellules neurales par cytométrie de flux.
Figure 2. Schéma du options de protocole expérimental. La figure illustre une représentation schématique des principales étapes dans le protocole. Les étapes facultatives (CFSE de colorants d'étiquetage ou d'antigène intracellulaire) sont indiquées par des cadres gris clair. Après la récolte, il est indispensable pour évaluer la viabilité cellulaire et nombre de suspensions de cellules neurales avant la coloration de la surface cellulaire. Positifainsi que des contrôles négatifs doivent être inclus, en plus des échantillons d'intérêt. Les échantillons peuvent être analysés par analyse de cytométrie en flux et / ou utilisés dans les paradigmes de triage des cellules. Se il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
Bien que nous ayons précédemment utilisé anticorps primaire en combinaison avec un anticorps secondaire pour la coloration intracellulaire 38, nous introduisons maintenant étiquetage non covalente de l'anticorps primaire par l'intermédiaire de fragments Fab fluorescents (d'étiquetage Zenon) comme une légère variation, ce qui réduit les étapes de manipulation de la cellule 39. En outre, comme un autre exemple de la polyvalence du protocole, nous employons un étiquetage facultatif d'un sous-ensemble expérimentale par carboxyfluorescéine succinimidyl ester (CFSE) avant l'antigène de surface de coloration. Cette CFSE pré-étiquetage permet la comparaison directe immédiate de deux lignées cellulaires ou des conditions expérimentales (CFSE marqué vs. non marqué) dans un tube à échantillon unique, la réduction ou la variance des différences subtiles dans le temps d'incubation et l'enregistrement anticorps. CFSE est un colorant fluorescent mis en place qui est couramment utilisé pour le suivi de la cellule 40, dans la prolifération 41,42 43,44 expériences par code barre. Enfin, alors que des mesures réelles de tri (FACS, séparation immunomagnétique ou immunopanning) ne font pas partie de ce protocole, en principe, les procédures de récolte et d'étiquetage décrites ici ne échantillons de rendement qui peuvent être soumis à la surface l'antigène ou des applications intracellulaires base étiquetage-tri 15 25,28.
Avec cet article, nous visons à: résumer une surface viable protocole antigène coloration 25,28, résumer un protocole pour la détection de cibles intracellulaires ainsi que la surface combinée et intracellulaire analyse de l'antigène 38, présenter un CFSE étiquetage de teinture étape intracellulaire 41,45 comme un option expérimentale pour comcomparative analyse des populations de cellules neurales, et résumer les approches à l'écoulement analyse cytométrique (des contrôles appropriés 13,46, ouverture de porte stratégie et la présentation des données 47).
1. Neural cellulaire récolte
2. intracellulaire Dye étiquetage Utilisation CFSE (Figure 3)
Figure 3. Détection de l'expression différentielle de l'antigène de surface de CD entre deux lignées cellulaires par l'intermédiaire de cellules SH-SY5Y de neuroblastome CFSE colorant étiquetage. Sont pré-marquées avec CFSE pour identification ultérieure par rapport à des fibroblastes BJ non marqués. Co-coloration de l'échantillon mélangé (panneaux de droite) avec des marqueurs de surface CD24 ou CD54 (à la fois conjugué à APC) démontre que les lignées cellulaires sont facilement distinguables à cause de la coloration CFSE (flèches = SH-SY5Y, des pointes de flèches = fibroblastes BJ). La majorité des cellules SH-SY5Y expriment CD24 mais pas CD54 (ICAM-1). En revanche, les fibroblastes BJ (CFSE-négatif) sont positives pour CD54 mais largement négatif pour CD24.Cible "https://www.jove.com/files/ftp_upload/52241/52241fig3highres.jpg" = "_ blank"> Se il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
3. coloration de surface cellulaire
Tube pas. | Nom Sample | Antigen-fluorophore | Dilution |
1 | Cellules non colorées | - | |
2 | Teinté Simple | CD24-APC | 01h50 |
3 | Teinté Simple | TUJ1-Alexa Fluor 488 nm | 1: 2000 |
4 | Double teinté | CD24-APC | 01h50 |
TUJ1-Alexa Fluor 488 nm | 1: 2000 | ||
5 | Teinté Simple | Secondaire seulement: Alexa fluor 488 nm | 1: 2000 |
Tableau 1. L ist de tubes à inclure dans un flux typique cytométrie expérience. Le tableau montre un ensemble minimal de tubes d'échantillon requis pour une expérience de co-coloration décrit dans cet article vidéo. Une expérience idéale doit inclure tous les contrôles nécessaires (contrôles négatifs, positifs de compensation ainsi que) pour l'interprétation précise des résultats obtenus.
Antigène | Type de cellule | Référence |
CD15 | Les cellules souches neurales | [28, 67] |
CD24 | Cellules neuronales | [28, 68] |
CD29 | Les cellules souches neurales | [28, 69, 70] |
CD44 | Les cellules gliales | [25] |
CD49f | Les cellules souches neurales | [38] |
CD56 (NCAM) | Cellules neuronales | [71] |
CD133 | Les cellules souches neurales | [27] |
CD184 | Les cellules souches neurales et les cellules gliales | [25] |
CD200 | Cellules neuronales | [38] |
CD271 | Les cellules souches de la crête neurale | [25] |
A2B5 | Les cellules gliales | [31] |
CORIN | précurseurs dopaminergiques | [35, 36] |
FORSE1 | Les cellules souches neurales (NSC) | [72] |
GLAST | Les cellules gliales | [33] |
NG2 | Les cellules gliales | [32] |
Tableau 2. Sélection des antigènes de surface de neurones. Ce tableau fournit une liste des épitopes de surface trouvés être exprimé par divers types de cellules neurales pour illustrer le panneau croissante des antigènes de surface utilisées pour caractériser la lignée de neurones. Notez que cette sélection est loin d'être complète et que la plupart de ces marqueurs sont également exprimée par une série d'autres cellules neurales et non neuronaux. Par conséquent, des combinaisons de plusieurs marqueurs seront nécessaires pour mieux définir et isoler les sous-ensembles de neurones indiqués.
4. Fixation et perméabilisation 38
5. Antigène coloration intracellulaire 38 (Figure 4)
Figure 4. Co-coloration de la surface et des protéines intracellulaires. Cytométrie en flux de données illustre une comparaison entre repose-anticorps primaire + secondaire par rapport coloration intracellulaire base-fluorescéine Zenon en combinaison avec une coloration de surface. Positivité exclusive sur l'axe des y (quadrant supérieur gauche) et l'axe des x (quadrant inférieur droit) montre des cellules colorées pour MAP2 et CD24, respectivement. Après co-coloration, MAP2 partagée et d'expression CD24 peut être vu dans le quadrant supérieur droit (des panneaux de droite). Comparaison de l'utilisation deAlexa fluor 488. (En haut; AF488) contre Zenon fluorescéine (en bas) pour les rendements MAP2-en matière d'étiquetage des résultats similaires Se il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.
6. Analyse par cytométrie en flux
Le protocole présenté ici permet d'approches expérimentales polyvalent (figure 2). Dans sa version la plus courte (étapes 1, 3 et 6), il peut être considéré comme un guide pour les simples coloration des antigènes de surface. Dans sa forme la plus complexe, un certain nombre de paradigmes co-marquage avec une gamme d'antigènes intracellulaires peut être poursuivi (étapes facultatives 2 et / ou 4-5). E...
Le protocole présenté ici est bien établie pour les cultures de cellules neurales dérivées de cellules souches humaines, mais peut être appliqué également à d'autres sources de cellules neurales, y compris le tissu primaire ou des lignées de cellules neurales. En plus des sources embryonnaires, les cellules neuronales souches ou progénitrices peuvent être extraits à partir des régions neurogènes de cerveau adulte 27. En outre, la cytométrie en flux et FACS peuvent être exploitées à quan...
The authors declare no potential conflicts of interest.
Our research program is funded through the Emmy Noether-Program of the German Research Foundation (DFG), grant PR1132/3-1. Further support by the Müller-Fahnenberg Foundation of the University of Freiburg is gratefully acknowledged. This study was supported in part by the Excellence Initiative of the German Research Foundation (GSC-4, Spemann Graduate School).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM/F12 (1:1) (Dulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture F-12) | ![]() | 11330057 | |
DPBS without Ca2+ Mg2+ | ![]() | 14190169 | |
Fetal bovine serum, qualified, E.U.-approved, South America origin (FBS) | ![]() | 10270-106 | |
MEM Non-essential amino acids (100x) | ![]() | 11140035 | |
TrypLE Express | ![]() | 12604013 | |
Trypan blue solution, 0.4% | ![]() | 15250061 | |
Paraformaldehyde | ![]() | 335.3 | |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | ![]() | K41-001 | |
Tween-20 Detergent | ![]() | 655205 | |
Carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) | ![]() | 65-0850-84 | |
DMSO | ![]() | A1584 | |
Bottle top filters express plus 0.22 µm, 250 ml | ![]() | SCGPU02RE | |
Cell culture treated flasks (T 25) | ![]() | 156367 | |
Cell culture treated flasks (T 75) | ![]() | 156499 | |
Conical tubes (15 ml) | ![]() | 188271 | |
Conical tubes (50 ml) | ![]() | 227261 | |
Pasteur pipet, glass (150 mm) | ![]() | S03710150 | |
Pipet tips (0.1-10 µl) | ![]() | 4125 | |
Pipet tips (1-200 µl) | ![]() | 4126 | |
Pipet tips (100-1000 µl) | ![]() | 4129 | |
Serological pipets, 5 ml | ![]() | 4051 | |
Serological pipets, 10 ml | ![]() | 4101 | |
Serological pipets, 25 ml | ![]() | 4251 | |
Microcentrifuge tubes (0.5 ml) | ![]() | 72,699 | |
Microcentrifuge tubes (1.5 ml) | ![]() | 616201 | |
Microcentrifuge tubes (2.0 ml) | ![]() | 72,695,500 | |
Anti-Human CD24 APC monoclonal antibody | ![]() | 17-0247-42 | Working dilution 1:50 |
Anti-Human CD54 PE monoclonal antibody | ![]() | 12-0549-42 | Working dilution 1:50 |
Neuronal Class III β-Tubulin (Tuj1) polyclonal antibody | ![]() | PRB-435P | Working dilution 1:2,000 |
Alexa Fluor 488 Donkey anti Rabbit | ![]() | A21206 | Working dilution 1:2,000 |
Zenon® Fluorescein Rabbit IgG Labeling Kit | ![]() | Z-25342 | |
Neubauer-Improved counting chamber | ![]() | 0640010 | |
Vortex | ![]() | G560E | |
Thermomixer comfort | ![]() | 5355 000.001 | |
Accuri C6 flow cytometer | ![]() | 653118 | |
Microcentrifuge refrigerated, PerfectSpin 24 R | ![]() | 91-PSPIN-24R | |
Orbital shaker, Unimax 1010 | ![]() | 543-12310-00 | |
Centrifuge refrigerated, Rotanta 96 RC | ![]() | 4480-50 | |
Class II Biological safety cabinet Safe 2020 | ![]() | 51026640 | |
CO2 Incubator, Heracell 240i | ![]() | 51026331 | |
Vacuum system, Vacusafe comfort | ![]() | 158320 | |
Microscope, Axiovert 40 CFL | ![]() | 451212 | |
Pipet controller, accu-jet pro | ![]() | 26303 | |
Micropipet, Pipetman neo P20N (2-20 µl) | ![]() | F144563 | |
Micropipet, Pipetman neo P200N (20-200 µl) | ![]() | F144565 | |
Micropipet, Pipetman neo P1000N (100-1000 µl) | ![]() | F144566 |
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