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Method Article
We provide a detailed description of a protocol for flow cytometric analysis of surface antigens and/or intracellular antigens in neural cell types. Critical aspects of experimental planning, step-by-step methodological procedures, and fundamental principles of flow cytometry are explained in order to enable neurobiologists to exploit this powerful technology.
Flow cytometry has been extensively used to define cell populations in immunology, hematology and oncology. Here, we provide a detailed description of protocols for flow cytometric analysis of the cluster of differentiation (CD) surface antigens and intracellular antigens in neural cell types. Our step-by-step description of the methodological procedures include: the harvesting of neural in vitro cultures, an optional carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE)-labeling step, followed by surface antigen staining with conjugated CD antibodies (e.g., CD24, CD54), and subsequent intracellar antigen detection via primary/secondary antibodies or fluorescently labeled Fab fragments (Zenon labeling). The video demonstrates the most critical steps. Moreover, principles of experimental planning, the inclusion of critical controls, and fundamentals of flow cytometric analysis (identification of target population and exclusion of debris; gating strategy; compensation for spectral overlap) are briefly explained in order to enable neurobiologists with limited prior knowledge or specific training in flow cytometry to assess its utility and to better exploit this powerful methodology.
A citometria de fluxo foi explorado extensivamente em imunologia, hematologia e oncologia para definir populações de células através de dispersão propriedades intrínsecas, a expressão do antigénio da superfície celular, e outros parâmetros de fluorescência 1-3. Os nossos insights sobre desenvolvimento linhagem de sangue e doença são o resultado de um significativo grau de refinamento contínuo desta metodologia após a sua implementação inicial de 4,5. O aumento da consciência do potencial analítico quantitativo e global de citometria de fluxo tem incentivado recentemente o seu uso mais difundido na pesquisa com células-tronco e pode permitir semelhante profunda progresso em um tempo mais curto 6. No entanto, a aplicação da citometria de fluxo para analisar especificamente e isolar populações neuronais tem sido entendida como um desafio. Em contraste com as células hematopoiéticas que existem naturalmente em suspensão, os tipos de células neuronais são tipicamente colhidas de fontes excessivamente complexas que podem incluir células gliais e vários outras células circundantes, bem como uma intrincada rede de neurônios portadores de processo. Consequentemente, neurobiologia ainda tem que implementar a versatilidade de citometria de fluxo para o seu potencial completo em rotinas do cotidiano da pesquisa. No entanto, desde que uma única suspensão de células viáveis podem ser gerados (e protocolos têm sido desenvolvidos e optimizados para esse fim 7), citometria de fluxo e de células activadas por fluorescência (FACS) pode ser considerado um elemento valioso do repertório analítico em neurobiologia 8-11.
. Figura 1. Princípio da análise de citometria de fluxo e componentes de um citômetro de fluxo Fluxo cytometers compreendem três sistemas principais: fluídicos, óptica e eletrônica. Um fluxo simplificado de células em suspensão (preparada a partir de tecido primário ou em cultura in vitro) é realizada pela bainha Fluid através de focagem hidrodinâmica, a limitação da amostra para o seu núcleo central. As peças ópticas são compostos de lasers que iluminam o fluxo de células e os filtros ópticos que encaminham o sinal para os detectores apropriados. Os sinais de luz detectados são convertidos em sinais eletrônicos, posteriormente processadas por um computador e visualizadas em um monitor para análise de dados e gating. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Usuários de métodos de citometria de fluxo de lucro de pelo menos um conhecimento básico dos fundamentos subjacentes, incluindo blocos de construção de um citómetro (para revisão ver 12,13; também veja a Figura 1). Um feixe de raios laser intersecta com um fluxo de fluidos hidrodinamicamente focado que contém as células em suspensão, que por sua vez, passam através do feixe de laser em um ficheiro único "um após o outro. O Interceptino de uma célula (ou qualquer outra partícula, para esse efeito) com os resultados de laser na dispersão de luz a partir deste ponto de interrogação. Luz dispersada pode ser detectada na continuação da direcção de laser (dispersão frontal, associada ao tamanho da partícula), bem como perpendiculares à sua direcção (dispersão lateral; reflectindo a granulosidade da partícula / célula). Estas propriedades de dispersão acima mencionados não exigem rotulagem específica, razão pela qual uma amostra não marcado (ou também os restos celulares, bolhas de ar, etc.) gerará um sinal (evento) na dispersão para a frente bivariada e lado dispersão comumente usado para gating inicial. Ao utilizar os lasers e filtros específicos para os espectros de excitação e de emissão correspondente adequadas, uma célula pode ser analisada quanto a sua positividade, o nível de intensidade, ou na ausência de marcadores fluorescentes. A maioria das aplicações de citometria de fluxo têm-se centrado na caracterização através de antigénios da superfície celular. Ao contrário do lineag hematopoiéticase, a linhagem neural permaneceu menos extensivamente definido de acordo com a superfície de expressão epitopo padrões 5. Uma vantagem de explorar os antigénios de superfície é que as células vivas podem ser submetidas a triagem celular paradigmas tais como FACS. Em contraste, a coloração do antigénio intracelular requer fixação e permeabilização passos para mediar a interacção epitopo-anticorpo, o que impede a jusante aplicações que exigem células viáveis. Digno de nota, tais abordagens ainda permitem inúmeros ensaios quantitativos 14, bem como análises a jusante para RNA e proteína expressão 15. Hematologia, imunologia e oncologia, muitas vezes utilizado mais de uma dúzia de marcadores em conjunto para definir determinadas subpopulações 16. Além disso, citometria de massa ou CyTOF pode agora ser utilizado para analisar se a 30 parâmetros simultaneamente 17,18.
Para aplicações de células-tronco neurais, bem como culturas primárias 14,19,20 A heterogeneidade das célulasvitro é um fenômeno comum 21-23. As células não representam a população alvo de interesse encarnar um fator potencialmente confusão para leitura experimental 24,25. Convenientemente, os diferentes tipos celulares presentes dentro de uma suspensão celular heterogénea suportar perfis de expressão de antigénio distintas (conhecidas ou ainda a ser decifrados), que podem ser utilizados para definir estes diferentes populações. A citometria de fluxo pode, portanto, desempenhar um papel crucial na resolução de heterogeneidade celular e, assim, facilitar aplicações biomédicas (ensaios in vitro, de terapia celular) e otimizar a leitura quantitativa, concentrando-se no subconjunto mais relevantes 24,26. Várias combinações de antigénios de superfície foram identificados nos últimos anos para permitir o isolamento e quantificação de tipos de células neuronais específicas. Isto inclui CD133 para o enriquecimento de células estaminais neurais 27, uma combinação dos / CD24 / CD29 antigénios de superfície CD15 para o isolamento da NSC, Differentiated neurônio e células da crista neural 28 ou CD15 / CD24 / CD44 / CD184 / CD271 para isolar neural e subconjuntos gliais 25, entre outras assinaturas 29,30. Além neurônios, marcadores gliais incluem A2B5 31, CD44 25, NG2 32 e GLAST 33. Uma publicação recente tem explorado o mesencéfalo marcador precursor floorplate CORIN 34,35 para enriquecer precursores dopaminérgicos no transplante de células Parkinson paradigmas 36. Moléculas de CD não são apenas marcadores, mas mediadores funcionalmente relevantes de interações célula-célula e da capacidade de uma célula para responder a estímulos a partir de moléculas de matriz extracelular e fatores de crescimento 37. Uma estratégia de reforçar ainda mais o arsenal de antigénios CD combinatórias para caracterizar desenvolvimento da linhagem neural é a utilização de marcadores intracelulares conhecidos para rastrear e definir as combinações de antigénios CD para um tipo particular de célula de interesse. Nós exploramos recentemente essa abordagem e identificaram CD49F - / CD200 padrões de expressão combinatórias altas como uma nova abordagem para o enriquecimento de subconjuntos de neurônios de pluripotentes induzidas sistemas de cultura de células-tronco diferenciadas neurally 38. Aqui, nós incluímos e discutir o último protocolo (e variações opcionais dos mesmos), em que a coloração da superfície e coloração intracelular pode ser utilizado simultaneamente para definir sub-populações de células neurais, por citometria de fluxo.
Figura 2. Diagrama do sistema de opções de protocolos experimentais. A figura ilustra uma representação esquemática dos principais passos envolvidos no protocolo. Passos opcionais (corante CFSE ou rotulagem antígeno intracelular) são indicados por caixas de cinza claro. Após a colheita, é essencial avaliar o número e a viabilidade de células de suspensões de células neuronais antes da coloração da superfície celular. Positivo comobem como os controlos negativos devem ser incluídos em adição às amostras de interesse. As amostras podem ser analisadas por análise de citometria de fluxo e / ou utilizadas em paradigmas de separação de células. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Embora se tenha usado previamente anticorpos primários em combinação com anticorpo secundário por 38 coloração intracelular, que agora introduzir a rotulagem não-covalente do anticorpo primário através de fragmentos Fab fluorescentes (rotulagem Zenon) como uma ligeira variação, reduzindo, assim, os passos de manipulação de células 39. Além disso, como mais um exemplo da versatilidade do protocolo, que empregam uma etiquetagem opcional de um subconjunto experimental por carboxifluoresceína éster de succinimidilo (CFSE) antes da coloração de antigénio de superfície. Essa pré-rotulagem CFSE permite a comparação direta imediata de duas linhas celulares ou condições experimentais (CFSE marcado vs. sem rótulo) dentro de um único tubo de amostra, reduzindo variação ou diferenças sutis no tempo de incubação e de poupança de anticorpos. CFSE é um corante fluorescente estabelecido que é comumente usado para rastreamento de células 40, na proliferação 41,42 e barcoding experiências 43,44. Finalmente, embora passos reais (FACS, de separação de células imunomagn�ica ou immunopanning) não fazem parte deste protocolo, em princípio, os procedimentos de colheita e de rotulagem descritos aqui fazer amostras de rendimento que podem ser submetidos a superfície antígeno ou aplicações de classificação baseada em rotulagem intracelulares 15 25,28.
Com este artigo, pretendemos: resumir um protocolo de coloração antígeno de superfície viável 25,28, resumir um protocolo para detecção de alvos intracelulares, bem como superfície combinada e análise do antígeno intracelular 38, apresentar uma CFSE marcação com corante passo intracelular 41,45 como um opção experimental para comanalisa comparativo de populações de células neurais, e resumir abordagens para análise de citometria de fluxo (controles apropriados 13,46, gating estratégia e dados apresentação 47).
1. Neural colheita celular
2. Corante intracelular Etiquetagem Usando CFSE (Figura 3)
Figura 3. Detecção de expressão diferencial entre o antigénio de superfície CD duas linhas de células por células SH-SY5Y neuroblastoma CFSE corante rotulagem. São pré-marcado com CFSE, para posterior identificação em comparação com fibroblastos BJ não marcados. Co-coloração da amostra mista (painéis à direita) com marcadores de superfície CD24 ou CD54 (ambos conjugados com APC) demonstra que as linhas celulares são facilmente distinguíveis devido à coloração CFSE (Setas = SH-SY5Y; setas = fibroblastos BJ). A maioria das células SH-SY5Y expressam CD24, mas não CD54 (ICAM-1). Em contraste, os fibroblastos BJ (CFSE-negativo) são positivas para CD54, mas amplamente negativo para CD24.Target "https://www.jove.com/files/ftp_upload/52241/52241fig3highres.jpg" = "_ blank"> Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
3. celular coloração da superfície
Tubo não. | Nome da amostra | Antigen-fluorophore | Diluição |
1 | Células não coradas | - | |
2 | Manchado Individual | CD24-APC | 01:50 |
3 | Manchado Individual | TUJ1-Alexa 488nm fluor | 1: 2000 |
4 | Duplo manchado | CD24-APC | 01:50 |
TUJ1-Alexa 488nm fluor | 1: 2000 | ||
5 | Manchado Individual | Secundária só: Alexa 488nm fluor | 1: 2000 |
Tabela 1. L ist de tubos para ser incluído em um fluxo típico citometria experimento. A tabela mostra um conjunto mínimo de tubos de amostra necessários para uma experiência de co-coloração descrito neste artigo de vídeo. Um experimento ideal deve incluir todos os controles necessários (e positivas, bem como controles negativos de compensação) para a interpretação precisa dos resultados obtidos.
Antígeno | Tipo celular | Referência |
CD15 | As células estaminais neurais | [28, 67] |
CD24 | Células neuronais | [28, 68] |
CD29 | As células estaminais neurais | [28, 69, 70] |
CD44 | As células da glia | [25] |
CD49f | As células estaminais neurais | [38] |
CD56 (NCAM) | Células neuronais | [71] |
CD133 | As células estaminais neurais | [27] |
CD184 | Células-tronco neurais e células gliais | [25] |
CD200 | Células neuronais | [38] |
CD271 | Células-tronco da crista neural | [25] |
A2B5 | As células da glia | [31] |
CORIN | Precursores dopaminérgicos | [35, 36] |
FORSE1 | Células-tronco neurais (NSC) | [72] |
GLAST | As células da glia | [33] |
NG2 | As células da glia | [32] |
Tabela 2. Selecção de antigénios de superfície neurais. Esta tabela fornece uma lista de epítopos de superfície que se verificou ser expresso por diversos tipos de células neurais para exemplificar o aumento painel de antigénios de superfície utilizados para caracterizar a linhagem neural. Note-se que esta selecção está longe de ser completa e que a maioria destes marcadores são também expressos por uma variedade de outras células neurais e não neurais. Por conseguinte, as combinações de vários marcadores será necessária para melhor definir e isolar os subconjuntos neurais indicados.
4. Fixação e permeabilização 38
5. Coloração Intracelular Antigen 38 (Figura 4)
Figura 4. Co-coloração de superfície e proteínas intracelulares. A citometria de fluxo de dados exemplifica uma comparação entre baseada em anticorpo primário + secundário contra a coloração intracelular com base em fluoresceína Zenon em combinação com coloração de superfície. Positividade exclusiva no eixo y (quadrante superior esquerdo) e o eixo x (quadrante inferior direito) mostra células coradas para MAP2 e CD24, respectivamente. Após co-coloração, MAP2 partilhada e expressão de CD24 pode ser visto no quadrante superior direito (painéis da direita). Comparação do usoAlexa Fluor 488. (Top; AF488) versus Zenon fluoresceína (em baixo) para os rendimentos de rotulagem MAP2 resultados semelhantes por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
6. Fluxo de análise de citometria
O protocolo aqui apresentado permite abordagens para versátil experimentais (Figura 2). Na sua versão mais curta (passos 1, 3 e 6), ele pode ser considerado como um guia para a coloração simples de antigénios de superfície. Na sua forma mais complexa, um número de paradigmas de co-marcação com uma gama de antigénios intracelulares pode ser prosseguido passos opcionais (2 e / ou 4 a 5). Além d...
O protocolo aqui apresentado é bem estabelecido para as culturas de células neurais derivadas de células estaminais humanas, mas pode ser igualmente aplicado a outras fontes de células neurais, incluindo tecido primário ou linhas de células neuronais. Para além das fontes embrionárias, células estaminais ou progenitoras neurais pode ser extraído a partir das regiões do cérebro adulto neurogénicos 27. Além disso, a citometria de fluxo e FACS pode ser explorada para quantificar, analisar e isolar ...
The authors declare no potential conflicts of interest.
Our research program is funded through the Emmy Noether-Program of the German Research Foundation (DFG), grant PR1132/3-1. Further support by the Müller-Fahnenberg Foundation of the University of Freiburg is gratefully acknowledged. This study was supported in part by the Excellence Initiative of the German Research Foundation (GSC-4, Spemann Graduate School).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM/F12 (1:1) (Dulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture F-12) | ![]() | 11330057 | |
DPBS without Ca2+ Mg2+ | ![]() | 14190169 | |
Fetal bovine serum, qualified, E.U.-approved, South America origin (FBS) | ![]() | 10270-106 | |
MEM Non-essential amino acids (100x) | ![]() | 11140035 | |
TrypLE Express | ![]() | 12604013 | |
Trypan blue solution, 0.4% | ![]() | 15250061 | |
Paraformaldehyde | ![]() | 335.3 | |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | ![]() | K41-001 | |
Tween-20 Detergent | ![]() | 655205 | |
Carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) | ![]() | 65-0850-84 | |
DMSO | ![]() | A1584 | |
Bottle top filters express plus 0.22 µm, 250 ml | ![]() | SCGPU02RE | |
Cell culture treated flasks (T 25) | ![]() | 156367 | |
Cell culture treated flasks (T 75) | ![]() | 156499 | |
Conical tubes (15 ml) | ![]() | 188271 | |
Conical tubes (50 ml) | ![]() | 227261 | |
Pasteur pipet, glass (150 mm) | ![]() | S03710150 | |
Pipet tips (0.1-10 µl) | ![]() | 4125 | |
Pipet tips (1-200 µl) | ![]() | 4126 | |
Pipet tips (100-1000 µl) | ![]() | 4129 | |
Serological pipets, 5 ml | ![]() | 4051 | |
Serological pipets, 10 ml | ![]() | 4101 | |
Serological pipets, 25 ml | ![]() | 4251 | |
Microcentrifuge tubes (0.5 ml) | ![]() | 72,699 | |
Microcentrifuge tubes (1.5 ml) | ![]() | 616201 | |
Microcentrifuge tubes (2.0 ml) | ![]() | 72,695,500 | |
Anti-Human CD24 APC monoclonal antibody | ![]() | 17-0247-42 | Working dilution 1:50 |
Anti-Human CD54 PE monoclonal antibody | ![]() | 12-0549-42 | Working dilution 1:50 |
Neuronal Class III β-Tubulin (Tuj1) polyclonal antibody | ![]() | PRB-435P | Working dilution 1:2,000 |
Alexa Fluor 488 Donkey anti Rabbit | ![]() | A21206 | Working dilution 1:2,000 |
Zenon® Fluorescein Rabbit IgG Labeling Kit | ![]() | Z-25342 | |
Neubauer-Improved counting chamber | ![]() | 0640010 | |
Vortex | ![]() | G560E | |
Thermomixer comfort | ![]() | 5355 000.001 | |
Accuri C6 flow cytometer | ![]() | 653118 | |
Microcentrifuge refrigerated, PerfectSpin 24 R | ![]() | 91-PSPIN-24R | |
Orbital shaker, Unimax 1010 | ![]() | 543-12310-00 | |
Centrifuge refrigerated, Rotanta 96 RC | ![]() | 4480-50 | |
Class II Biological safety cabinet Safe 2020 | ![]() | 51026640 | |
CO2 Incubator, Heracell 240i | ![]() | 51026331 | |
Vacuum system, Vacusafe comfort | ![]() | 158320 | |
Microscope, Axiovert 40 CFL | ![]() | 451212 | |
Pipet controller, accu-jet pro | ![]() | 26303 | |
Micropipet, Pipetman neo P20N (2-20 µl) | ![]() | F144563 | |
Micropipet, Pipetman neo P200N (20-200 µl) | ![]() | F144565 | |
Micropipet, Pipetman neo P1000N (100-1000 µl) | ![]() | F144566 |
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