Method Article
פרוטוקול זה מספק שיטה ללמוד זיהום שחפת Mycobacterium במאקרופאגים אנושיים M1- או M2 מקוטבים המבוססים על בידול של מונוציטים היקפיים-דם לתאים דמויי מקרופאג' הנגועים בזן הארסי H37Rv המסומן על ידי GFP, ומנותחים עם ציטומטריית זרימה באמצעות פאנל של 10 צבעים כולל ביטוי של סמני M1/M2 נבחרים.
מקרופאגים אנושיים הם תאים מארחים ראשוניים של שחפת מיקובקטריום תאית (Mtb) זיהום ולכן יש תפקיד מרכזי בשליטה החיסונית של שחפת (שחפת). הקמנו פרוטוקול ניסיוני למעקב אחר קיטוב חיסוני של תאים שמקורם במיאלואידים לתוך M1 (מופעל קלאסית) או M2 (לחילופין מופעל) תאים דמויי מקרופאגים באמצעות הערכה עם לוח cytometry זרימה 10 צבעים המאפשר הדמיה ואפיון עמוק של חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP)-labeled Mtb בערכות מאקרו מגוונות. מונוציטים שהתקבלו מתורמי דם בריאים היו מקוטבים לתאי M1 או M2 באמצעות בידול עם גורם מגרה מקרופאג-מושבה גרנולוציטים (GM-CSF) או מקרופאג-מושבה מגרה גורם (M-CSF) ואחריו קיטוב עם IFN-γ ו lipopolysaccharide (LPS) או IL-4, בהתאמה. תאי M1 ו- M2 מקוטבים לחלוטין נדבקו ב- Mtb-GFP במשך 4 שעות לפני שמאקרופגים נגועים ב- Mtb היו מוכתמים בציטומטריית זרימה ב- 4 או 24 שעות לאחר ההדבקה. רכישה לדוגמה בוצעה עם cytometry זרימה והנתונים נותחו באמצעות תוכנת ניתוח cytometry זרימה. גטינג ידני, כמו גם הפחתת ממדיות עם קירוב והקרנה סעפת אחידה (UMAP) וניתוח פנוגרף בוצע. פרוטוקול זה הביא לקיטוב יעיל של M1/M2 המאופיין ברמות גבוהות של CD64, CD86, TLR2, HLA-DR ו- CCR7 בתאי M1 שאינם מושפעים, בעוד שתאי M2 שאינם מושפעים הציגו ויסות חזק של סמני פנוטיפ M2 CD163, CD200R, CD206 ו- CD80. תאים מקוטבים M1 הכילו בדרך כלל פחות חיידקים בהשוואה לתאים מקוטבים M2. כמה סמני M1/M2 היו downregulated לאחר זיהום Mtb, מה שמרמז כי Mtb יכול לווסת קיטוב מקרופאג. בנוסף, נמצאו 24 אשכולות תאים שונים בגדלים שונים המופצים באופן ייחודי בין התאים M1 ו- M2 שאינם נגועים בתאים נגועים Mtb ב 24 שעות לאחר ההדבקה. פרוטוקול cytometry זרימה M1/M2 זה יכול לשמש כעמוד שדרה במחקר Mtb-macrophage ולהיות מאומץ לצרכים מיוחדים בתחומים שונים של מחקר.
מקרופאגים הם תאים חיסוניים התורמים באופן משמעותי לוויסות הומאוסטזיס של רקמות, דלקת ופתולוגיות של מחלות. בהיותו מרכיב חיוני של חסינות מולדת, שושלת מונוציט-מקרופאז 'של תאים מבטאת פנוטיפים הטרוגניים בתגובה לרמזים סביבתיים משתנים, המשקפים את הפלסטיות שלהם ואת הסתגלותם למקומות אנטומיים ואימונולוגיים שונים1. בהתאם לגורמי הגדילה, ציטוקינים ומתווכים אחרים הנמצאים במיקרו-ווירוניזציה, מקרופאגים סווגו לשתי אוכלוסיות הפיכות עיקריות, כל אחת עם תפקיד שונה בבקרה וסיווגחיידקיים 2: המקרופאג'ים הפרו-דלקתיים, המופעלים באופן קלאסי M1 והמאקרופאגים האנטי-דלקתיים, המופעלים לחילופין M2-מקוטבים שנקראו במקור לחקות את T helper (Th) nomenclature3. קיבוץ זה של מקרופאגים מקוטבים חיסוניים נחשב לעתים קרובות פשטני, כמו הפעלת מקרופאג ובידול אינו ליניארי, אבל יותר מדויק כמו רצף שבו לכל אוכלוסייה יש מאפיינים שונים ותפקידים תפקודיים בתוצאה של התפתחות המחלה והתקדמות4,5,6,7. עם זאת, ישנם יתרונות ניסיוניים רבים עם מודל מקרופאג M1/M2 שניתן להשתמש בהם במספר תחומי מחקר שונים.
שחפת Mycobacterium (Mtb) הוא הסוכן הסיבתי של שחפת (שחפת) והוערך להדביק אדם אחד בכל שנייה ונחשב לסוכן הזיהומי הקטלני ביותר בעולם (דו"ח שחפת גלובלי 2019). מאז דרכי הנשימה הוא התוואי העיקרי של זיהום Mtb, מקרופאגים מכתש הם התאים המארחים המועדפים להיות נגועים Mtb ומייצגים הן את המחסומים העיקריים ואת המאגר זיהומיות עבור Mtb בריאות. קיטוב מקרופאג בתגובה לגירויים שונים נחקר בהרחבה לאורך השנים7 וברוב העבודה שפורסמה, M1 קיטוב של תרבויות מונוציטים במבחנה הוא המושרה על ידי גרנולוציטים-מקרופאג המושבה מגרה גורם (GM-CSF) יחד עם IFN-γ ו LPS8,9, בעוד קיטוב M2 הוא המושרה עם מקרופאג מושבה מגרה פקטור (M-CSF) ו IL-410,11. מקרופאגים M1 הם תאים משפיעים חזקים המתווכים תגובות מיקרוביאלית נגד פתוגנים תאיים ויש להם תפקיד חיוני בחסינות antitumor12. מקרופאגים M2, לעומת זאת, יש פונקציה אנטי דלקתית, יכולת phagocytic גבוהה מעורבים בעיקר ריפוי פצעים ותיקון רקמות, כמו גם בזיהומים טפיל12. בהתאם לכך, מקרופאגים M1 נתפסים כיעילים יותר בשליטה תאית של Mtb בהשוואה למאקרופאגים M213. עם זאת, חיידקי Mtb יש גם פוטנציאל לווסת קיטוב מקרופאג לחתור תחת חסינות מולדת14,15,16,17.
אמנם זה נפוץ ליצור מקרופאגים מהבחנה של מונוציטים המתקבלים מדם היקפי18, מקרופאגים יכולים להיווצר גם מתאי גזע פלוריפוטנטיים המושרים (iPSCs)19 או מקרופאגים שמקורם במח העצם מעכברים20,21. אלה הן טכניקות אפשריות ללמוד תאי מקרופאג ראשוניים המתקבלים מאבות מונוציטים/מקרופאגים שיהתרבותו ויתבדלו לאוכלוסייה הומוגנית של תאים דמויי מקרופאג' בוגרים. עם זאת, פרוטוקולים אלה לעתים רחוקות לספק ידע מעמיק על פנוטיפ ותפקוד של התאים שהושגו ולא להסביר את ההטרוגניות הטבעית שנצפו בקרב מקרופאגים שהושגו vivo. כמו Mtb הוא פתוגן אנושי קפדני, יש גם יתרון ללמוד Mtb במערכות מודל אנושי. זרימה cytometry היא טכנולוגיה רבת עוצמה המציעה את האפשרות להעריך מאפיינים פנוטיפיים ופונקציונליים מרובים של תאים בודדים בהשעיה22, משהו שיכול להיות מאתגר למדי עם תאים חסידיים כגון מקרופאגים הידועים גם להיות autofluorescent23,24. בנוסף לניתוק כימי של מקרופאגים חסידים היטב, זיהום Mtb עשוי להוות גורם לחץ משמעותי לתאים המוסיף רמה נוספת של מורכבות בניתוחים ציטומטריים זרימה של מקרופאגים נגועים Mtb.
בפרוטוקול ניסיוני זה, השתמשנו במודל זיהום מקרופאג אנושי שהוקם בעבר בהתבסס על קיטוב חיסוני של תאים ראשוניים המופקים מדם-דם-מונוציט הנגועים במעבדה הארסית Mtb strain H37Rv, ונותחו עם ציטומטריית זרימה באמצעות פאנל של 10 צבעים כולל ביטוי של סמני M1 ו- M2 נבחרים25. פרוטוקול זה מספק שיטה יעילה הניתנת לשחזור כדי ללמוד תגובות לזיהום Mtb במקרופאגים M1 או M2 מקוטבים שמקורם במונוציט. בנוסף, השימוש בציטומטריית זרימה על מקרופאגים נגועים Mtb חסידים מאפשר לנו ללמוד מגוון של סמני פני השטח הקשורים M1 ו M2 מקרופאגים קונבנציונאלי ואת התגובה האורך שלהם לזיהום Mtb. חשוב לציין, פרוטוקול זה יכול בקלות להיות מאומץ לחקירות של זיהומים עם פתוגנים אחרים, במחקרים נגד גידולים או במחקרים של תנאים דלקתיים, עבור הקרנת תרופות וכו ', והוא יכול גם להיות מנוצל להערכת קיטוב מקרופאז M1/M2 בדגימות קליניות אנושיות.
דם היקפי אנושי מתורמי דם אנונימיים בריאים התקבל מבנק הדם בבית החולים האוניברסיטאי קרולינסקה, Huddinge, שוודיה (אישור אתי Dnr 2010/603-31/4). כל הצעדים הניסיוניים הכרוכים ב-Mtb ארסי חי בוצעו במעבדת Biosafety Level-3 (BSL-3) בסוכנות לבריאות הציבור של שבדיה (FOHM), סולנה, שוודיה.
1. הכנת אמצעי תקשורת, חוצצים ותרביות חיידקים
הערה: פרטים על כל ריאגנטים וחומרים מתכלים מסופקים בטבלת החומרים.
2. בידוד תאים מונונוקולרי בדם היקפי ממעילים באפי
הערה: בצע את כל העבודה עם דם אנושי (מדבק) בתוך ארון biosafety מחלקה II. להשבית שאריות מוצרי דם עם חומרי חיטוי במשך 15 דקות לפני ההשלכה. דם הושג ממתנדבים בריאים במקרה זה. פרוטוקול בידול מקרופאז במבחנה זה הוגדר לכלול 10 x 106 מחשבים מבודדים/תורם/באר. מכל תורם, מעיל באפי אחד מכיל כ-50 מ"ל של מתלה לויקוציטים מרוכז שמקורו בדם שלם, אשר בדרך כלל מספק 500-800 x 106 מחשבים אישיים מהם ניתן לאחזר כ-10% או 50-80 x 106 מונוציטים.
3. בידול קיטוב של תאים שמקורם במונוציט
הערה: עבור בידול וקיטוב של תאים שמקורם במונוציט, פרוטוקול שקבענו בעבר עבור תאים דמויי M0, M1 ו- M2, כמו גם תאים מקוטבים M1 ו- M2 מלאים היה אחריו25. לפשטות, רק מקרופאגים מקוטבים לחלוטין M1 ו- M2 מתוארים כאן.
4. הכנת תרבויות Mtb
הערה: יש לבצע את השלבים הבאים במתקן BSL-3. עבור כל העבודה עם Mtb ארסי, השתמש ביגוד מגן, הגנה נשימתית, ואתנול כפפות עמידות.
5. זיהום Mtb של תאים שמקורם במונוציט
הערה: יש לבצע את השלבים הבאים במתקן BSL-3.
6. כתם ציטומטריה זרימה של תאים המונוציטטים הנגועים ב- Mtb
הערה: יש לבצע את השלבים הבאים במתקן BSL-3. הכתם cytometry זרימה יכול להתבצע בצלחת 96-באר במקום צינורות.
7. רכישת נתונים ציטומטריים זרימה וניתוח של תאים נגועים Mtb monocyte נגזר
הערה: יש לבצע את שלבים 7.1-7.2 לפני הכתם של ציטומטריית הזרימה המתואר לעיל. כדי למנוע בעיות עם גוש תאים וניתוק של צבעי טנדם לאחר קיבוע התא, רכישה מדגם של תאים נגועים Mtb ו נגועים מבוצעת בתוך 4-10 שעות לאחר כתמי נוגדן ראשוניים.
8. כתמי כשל חיסוני של תאים המונוצייטים הנגועים ב- Mtb
הערה: זיהום Mtb חייב להתבצע במתקן BSL-3.
איור סכמטי של גירויי הציטוקינים המשמשים לקיטוב תאים שמקורם במונוציטים ל-M0 (תאים דמויי M2), M1 (תאי M1 מקוטבים במלואם) ו- M2 (תאי M2 מקוטבים במלואם) מוצג באיור 1A, בעוד תמונות מייצגות של תרביות תאים M0, M1 ו- M2 וכן תרביות M1 ביום 0, 3 ו- 7, מוצגות באיור 1B. תאי M0 שאינם מושפעים שימשו להדגמת אסטרטגיית הג'ינג הבסיסית (איור 2A). בתחילה, התאים המיאלואידיים (~ 85%) היו מגודרים על פי תכונות הפיזור הקדמי (FSC) והפיזור הצדדי (SSC) שלהם, כולל התאים הגדולים יותר עם צפיפות גבוהה ולא כולל הפסולת בגודל קטן עם SSC ו- FSC נמוכים שנמצאים בפינה השמאלית התחתונה של חלקת הנקודות. בחלקה השנייה הוגדרו כפילויות (כלומר גושים בתאים) כשטח מוגבר אך גובה דומה בהשוואה לתאים בודדים והוחרגו מניתוח נוסף. לכן, רק תאים פרופורציונליים בין FSC-Area ו- FSC-Height (תאים בודדים) נכללו בתוך שער הצורה המשופע. לאחר מכן, צבע הכדאיות זומבי-UV שמכתים את החלבונים הציטופלזמיים בתוך התאים המתים, שימש כדי להוציא את התאים המתים מניתוח הבא. כצפוי, תאי M0 שאינם מושפעים קיימא היו שליליים עבור ביטוי Mtb-GFP דמיינו בערוץ FITC.
לאחר מכן, יישמנו את אותה אסטרטגיית גיתינג כדי לא נגועים, כמו גם מקרופאגים M1 ו- M2 נגועים Mtb ב 4 שעות לאחר ההדבקה (איור 2B, C). שתי אוכלוסיות משנה זוהו בשער FCS/SSC של מקרופאגים מקוטבים M1 לא נדבקו; אוכלוסייה אחת עם גודל קטן יותר (FCS) וצפיפות גבוהה יותר (SSC) והאוכלוסייה האחרת עם גודל גדול יותר וצפיפות נמוכה יותר (איור 2B),בעוד השער הראשי של תאי M2 שאינם מושפעים נראה הומוגני יותר (איור 2C). הן M1 והן M2 תאים נגזר מונוציט הציגו שינוי אנכי לצפיפות גבוהה יותר וגודל תא מופחת על זיהום Mtb, אשר עשוי לשקף מורכבות מוגברת בתוך התאים הנגרמת על ידי ספיגת חיידקי Mtb תאיים (איור 2B,C). יתר על כן, כתם הכדאיות חשף מוות תאי משופר (17-22%) בין תאי M1 ו- M2 הנגועים ב- Mtb ב- MOI של 5, בהשוואה לתאי M0 שאינם נגועים (99%) (איור 2A-C) או תאי M1 ו- M2 שאינם מושפעים (הנתונים אינם מוצגים). נתונים מייצגים הראו כי ביטוי Mtb-GFP (כלומר, זיהומיות Mtb) היה גבוה משמעותית ב- M2 (77% תאים חיוביים ל- GFP) בהשוואה לתאי M1 (19% תאים חיוביים ל- GFP) לאחר 4 שעות של זיהום (איור 2B,C). לאחר 24 שעות של זיהום, ביטוי Mtb-GFP היה 43% ו 85% בתאי M1 ו- M2 בהתאמה, מה שמרמז כי בתאי M1 הייתה עלייה גבוהה יחסית בביטוי GFP מ 4-24 שעות לאחר זיהום Mtb לעומת תאי M2, 126% לעומת 10.4% עלייה GFP-ביטוי בתאי M1 ו- M2 מ 4-24 שעות, בהתאמה.
כדי לאפיין את היעילות של קיטוב M1/M2 בתאים שאינם מושפעים מונוציטים נגזרים, התוויות נקודה שימשו לזיהוי תאי M1 שהיו חיוביים כפולים עבור CD64 ו- CD86 (CD64+CD86+) ותאי M2 שהיו חיוביים פעמיים עבור CD163 ו- CD200R (CD163+CD200R+; איור 3א',ב). הבחירה של סמני M1/M2 נעשתה בעיקר על סמך התוצאות מעבודתנו הקודמת25 אך גם ממחקרים אחרים26,27,28,29. הרבעים עבור התאים המוכתמים הוגדרו באמצעות שערים מתאימים לתאי M1/M2 לא מוכתמים (איור 3A). אף אחד מהסמנים הללו אינו מתבטא אך ורק בתאי M1 או M2, אך שיעור התאים החיוביים כמו גם עוצמת ביטוי פני השטח שונים. הדבר בא לידי ביטוי במיוחד בכתם M1 שבו כ-95% מתאי M1 ו-79% מתאי M2 היו CD64+CD86+, אך עוצמת הכתם הייתה גבוהה משמעותית בקבוצת המשנה M1 (איור 3A). בעוד ש-27% מתאי M1 היו חיוביים עבור CD200R של סמן M2, רק 1% היו חיוביים עבור CD163, וסיפקו 0.5% CD163+CD200R+ תאי M1 לעומת 63% CD163+CD200R+ תאי M2(איור 3A). לאחר 4 שעות של זיהום Mtb, עלייה בתדירות של CD200R+ תאים נצפתה בתאים מקוטבים M1 Mtb-GFP חיובי (16%), בעוד CD163-ביטוי הופחת בתאי M2 (איור 3B). מפת החום מדגימה עוצמה גבוהה של ביטוי GFP בתאי CD163+CD200R+ M2, אך גם בקבוצת המשנה CD64+CD86+ M2 בהשוואה לקבוצות המשנה המתאימות של תאי M1 (איור 3B). בסך הכל, השינוי בביטוי של סמני M1 ו- M2 המתאימים מוצג גם בהיסטוגרמות באיור 3C. יתר על כן, חיידקי Mtb-GFP הוצגו גם בתאי CD64+ M1 ובתאי CD163+ M2 על ידי מיקרוסקופיה קונפוקלית, שתמכה בספיגה תאית משופרת ו/או בצמיחה של Mtb בתוך M2 בהשוואה לתאי M1(איור 3D).
כדי לאמת את התוצאות של הגטינג הידני, יישמנו הפחתת ממדיות באמצעות קירוב והקרנה סעפת אחידים (UMAP). ניתוח UMAP הראה כי זיהום Mtb במשך 4 שעות לא היה מספיק כדי להשפיע על הקיטוב של מקרופאגים, לעומת 24 שעות של זיהום, אשר הביא אשכולות מופרדים בבירור של M1 ו M2 תאים נגועים(איור 4A). מקרופאגים M1 שאינם מושפעים הציגו ביטוי גבוה יותר של CD64, CD86, TLR2, HLA-DR ו- CCR7 בהשוואה למאקרופאגים M2, בעוד שתאי M2 שאינם מושפעים הציגו תקנה חזקה של סמני פנוטיפ M2 CD163, CD200R, CD206 ו- CD80 (איור 4B, C). בהסכמה ל gating ידני, זיהום Mtb לאחר 24 שעות גרם downregulation ברור של CD163, CD200R ו CD206 על תאים M2 ו upregulation של CD86 ו HLA-DR על תאים M1 (איור 4B,C),אשר מרמז כי Mtb יכול לווסת קיטוב מקרופאז. ניתוח פנוגרף עוקב (איור 4D-F) זיהה 24 אשכולות שונים בגדלים שונים שהופצו באופן ייחודי בין התאים M1 ו- M2 שאינם נגועים בתאים נגועים ב- Mtb כפי שמודגם בתרשימי UMAP (איור 4D), תרשימי עוגה (איור 4E) ומפות חום (איור 4F). בסך הכל, תוצאות אלה מראות יעילות מבטיחה של פרוטוקול זה כדי ליצור תאים מקוטבים M1 ו- M2 מגוונים מבחינה פנוטיפית ופונקציונלית במבחנה, כי הם מווסתים עוד יותר על ידי זיהום Mtb.
איור 1: איור סכמטי של התמיינות במבחנה וקיטוב של תאים אנושיים שמקורם במיאלואידים. (A)M0 (דמוי M2), M1 (מופעל קלאסית) ו M2 (מופעל לחילופין) תאים מתוארים. מונוציטים שהתקבלו מתורמי דם בריאים היו מקוטבים עם ציטוקינים שונים כמתואר בפרוטוקול ונדבקו בזן Mtb שכותרתו GFP, H37Rv, במשך 4 שעות לפני הניתוח עם ציטומטריית זרימה של 10 צבעים. תאים מקוטבים M1 מכילים בדרך כלל פחות חיידקים בהשוואה לתאים מקוטבים M2. (B)תמונות מיקרוסקופיות של תאים מקוטבים לחלוטין, לא מושפעים M0, M1 ו- M2 בלוחות 6-באר ביום 7, ותמונות מייצגות של הבחנה תא M1 ממונוציטים ביום 0, 3 ו -7. ההגדלה היא 20x (הלוח העליון) ו- 10x (הלוח התחתון). שים לב שתאי M1 מוארכים ומתוחים יותר בהשוואה לתאי M0 ו- M2 מעוגלו יותר (הלוח העליון). לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: אסטרטגיית גטינג של תאים מקוטבים מיאלואידיים מקוטבים באופן דיפרנציאלי. התוויות נקודה מייצגות המציגות (A) מאפייני פיזור קדימה (FSC) ופיזור צדדי (SSC) של מקרופאגים M0 שאינם מושפעים. ההתוויה FSC-A/FSC-H מציגה גיטינג ידני של תאים בודדים באופן פרופורציונלי עבור שטח וגובה. שער התא החי לא כלל תאים שהיו חיוביים עבור זומבי-UV (צבע הכדאיות). Mtb תאי זוהה על ידי ביטוי GFP בתאים חיים שנצפו בערוץ FITC. (B) Gating של M1 ו - (C) מקרופאגים M2 המציגים חלקות נקודה FCS / SSC של תאים נגועים והן בתאים נגועים Mtb 4 שעות ו 24 שעות לאחר ההדבקה. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: היעילות של פרוטוקול הקיטוב במבחנה M1/M2. התוויות נקודה מייצגות וגירית רבעים המציגים תדרי קבוצת משנה של תאים מקוטבים מסוג M1 ו- M2 באמצעות CD64 ו- CD86 (M1) או CD163 ו- CD200R (M2) ב- (A) תאים לא מוכתמים ומוכתמים שאינם נגועים ו -( B) תאים מוכתמים Mtb 4 שעות לאחר ההדבקה. התוויית הנקודות ב- (B) ממחישה את עוצמת הפלואורסצנטיות של ביטוי GFP (מפת חום) במקרופאגים מקוטבים M1 ו- M2 המתקבלים משערי משנה שונים. (C)ממוצע גיאומטרי של עוצמת פלואורסצנטיות (MFI) מוצג בהיסטוגרמות מתורם מייצג אחד לאחר 4 שעות של זיהום Mtb. ערכי MFI בתאי M1 (תכלת) ו- M2 לא נגועים (סגול בהיר) מוצגים בלוח העליון ותאי M1 נגועים Mtb (כחול עמוק) ותאי M2 (סגול עמוק) מוצגים בלוח התחתון. (D)מוצגות תמונות קונפוקל מייצגות של תאים מקוטבים M1 ו- M2 נגועים ב- Mtb. תאי M1 ו- M2 הוכתמו עבור ביטוי CD64 ו- CD163, בהתאמה, באמצעות כשל חיסוני. כתמי משטח חיוביים מוצגים בחיידקים תאיים מבטאים אדום ו- GFP מוצג בירוק. גרעינים מוכתמים ב- DAPI מוצגים בצבע כחול. סולם – 10 מיקרומטר. הגדלת התמונות מימין היא 350x. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: הפחתת ממדיות עם קירוב והקרנה סעפת אחידים (UMAP) וניתוח פנוגרף של תאי M1 ו- M2 שאינם נגועים ב- Mtb. (A)UMAP, נוצר על ידי שרשור 11000 תאים חיים מתרביות תאים M1 ו- M2 נגועים Mtb משני תורמי דם מייצגים, 4 שעות (גרפים שמאליים) או 24 שעות (גרפים ימניים) לאחר ההדבקה. מפת החום עבור ביטוי GFP (הלוח התחתון) מציינת תאים נגועים ו- Mtb נגועים. (B-C) MFI של סמנים לידי ביטוי בתאי M1 ו- M2 נגועים Mtb 24 שעות לאחר ההדבקה, מוצג כמו (B) מפת חום או (C) חלקות בר. (D-F) ניתוח פנוגרף זיהה 24 אשכולות המופצים באופן דיפרנציאלי בין תרבויות M1 ו- M2 שאינן נגועות ב- Mtb. אשכולות 8-13 הם ייחודיים בתאי M1 נגועים, אשכולות 1-7 הם ייחודיים בתאי M1 נגועים Mtb, אשכולות 20-24 הם ייחודיים בתאי M2 נגועים אשכולות 14-19 הם ייחודיים בתאי M2 נגועים Mtb. ה- MFI של כל סמן בכל אשכול פנוגרף מוצג ב- (F). הנתונים מוצגים כתאי M1 (תכלת) ו-M2 לא נגועים (סגול בהיר) ותאי M1 נגועים ב-Mtb (כחול עמוק) ותאי M2 (סגול עמוק). לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
טבלה 1: רשימת הנוגדנים המשמשים לציטומטריית זרימה.
לייזר | מסנן | פלואורוכרום (פלואורוכרום) | פנוטיפ (פנטוטיפ) | פונקציה | שיבוט | מס' קטלוג | החברה |
639 | 670/30 | AF647 | TLR2 | קולטן זיהוי פתוגן | TL2.1 | 309714 | ביולגנד (שם ומלגן) |
639 | 780/60 | APC-Cy7 | CD206 | קולטן מנוז | 15-2 | 321120 | ביולגנד (שם ומלגן) |
405 | 610/20 | BV605 | CD163 | קולטן נבלות | GHI/61 | 333616 | ביולגנד (שם ומלגן) |
405 | 670/30 | BV650 | CD80 | מולקולה מגרה שותפה | 2D10 | 305227 | ביולגנד (שם ומלגן) |
405 | 710/50 | BV711 | CCR7 | קולטן כימוקין | G043H7 | 353228 | ביולגנד (שם ומלגן) |
405 | 780/60 | BV785 | CD86 | מולקולה מגרה שותפה | IT2.2 | 305442 | ביולגנד (שם ומלגן) |
488 | 530/30 | Gfp | הר(ר) | חיידקים תאיים | |||
561 | 586/15 | Pe | CD200R | קולטן מעכב | OX-108 | 329306 | ביולגנד (שם ומלגן) |
561 | 620/14 | PE/מסנוור 594 | CD64 | קולטן גמא Fc-I של IgG | 10.1 | 305032 | ביולגנד (שם ומלגן) |
561 | 661/20 | PE-Cy5 (PC5) | HLA-DR | מולקולה מסוג II של MHC | L243 | 307608 | ביולגנד (שם ומלגן) |
355 | 450/50 | BUV395 | צבע הכדאיות | סמן תא חי/מת | זומבי UV | 423108 | אינוויטרוגן |
פרוטוקול ניסיוני זה מתאר קיטוב יעיל של תאים שמקורם במיאלואידים לתוך פנוטיפים M1 או M2 כולל הערכה עם פאנל cytometry זרימה 10 צבעים המאפשר הדמיה ואפיון עמוק של Mtb GFP שכותרתו בתת-קבוצות מקרופאגים מגוונות. למרות שחפת היא מחלה אנושית עתיקה, אין כיום מודל תקן הזהב ללמוד אינטראקציות Mtb-macrophage, ו cytometry זרימה מרובת צבעים של מקרופאגים יכול להיות מסובך בהשוואה לניתוחים של תגובות לימפוציטים. פרוטוקולים זמינים מעטים לבידול במבחנה של מונוציטים אנושיים למאקרופאגים מציגים ידע עמוק על סוג המקרופאגים הנוצרים. פרוטוקול בסיסי לקיטוב מקרופאז' והערכה ציטומטרית זרימה של הפעלת מקרופאג' באמצעות פאנל מוצק של סמנים עשוי להקל על אפיון כזה ולהציע הזדמנויות לחקור תכונות נוספות של תאים מקוטבים שטופלו בתנאים שונים. זה כולל ניתוחים של תאים בתרבית במבחנה, כמו גם ניתוחים של תאים vivo בדגימות קליניות, כלומר, הן PBMC והן מתלים חד-תאיים מנוזלי גוף (כלומר, שטיפת סימפונות) או רקמה הומוגנית. לפיכך, בידול ו/או מצב הפעלה של מונוציטים ומאקרופאגים המתקבלים מחולים עשויים להיות קשורים לתוצאות המחלה. הרחבה של CD16+CD163+ מונוציטים בדם היקפי דווחו בחולי שחפת ריאות30. תדירות מוגברת של CD163+ תאים זוהתה גם בעור מודלק של חולי אטופיק דרמטיטיס31. באופן דומה, CD206+ מקרופאגים דמויי M2 הוכחו לעכב התפשטות ובידול של תאים microenvironment של רקמת adipocyte32 ולהיות מועשר בדגימות מח עצם מחוות עצם מחולים עם לוקמיה מיאלואידית חריפה (AML)29. יחס גבוה של CD64 (M1) לתאי CD163 (M2) בדם שלם של חולים עם דלקת מפרקים ניוונית נמצאה קשורה לחומרת המחלה33. מחקר אחר השתמש CD86 (M1) ו CD163 (M2) כדי להדגים כי ביטוי M1 גבוה ברקמה בקורלציה לתוצאה גרועה יותר בקבוצה משנה של גידולים ממאירים במוח34.
ישנם מספר יתרונות משמעותיים של פרוטוקול ציטומטריית זרימה M1/M2 ניסיוני זה. מודל זה מספק את ההזדמנות ללמוד תגובות חיסוניות מולדות לזיהום Mtb ארסי וניתן לפתח אותו כך שיכיל מחקרים של תגובות חיסוניות אדפטיביות על ידי הוספת תאי T אוטולוגיים יחד עם מקרופאגים M1 או M2 בתגובות מעורבות לימפוציטים (MLRs). הפרוטוקול מתאים גם להקרנת תרופות ובדיקות של תרכובות אימונומודולטוריות ומיקרוביאליות שונות. כאן, חקרנו בעבר את ההשפעות של ויטמין D ואת מעכבי deacetylase histone פנילבוטיראט על תאים שמקורם מיאלואידית לאחר זיהום Mtb25,35. Cytometry זרימה M1/M2 יכול לשמש גם כדי להעריך הפעלת מקרופאג לאחר מיזוג עם supernatants תרבות התא או פלזמה המטופל. בעוד במחקרים vivo של זיהום משותף שחפת עם HIV או helminths או שחפת סוכרת שיתוף תחלואה יכול להיות מאתגר, מודל M1/M2 מורכב פחות עשוי להקל על מחקרים של תחלואה משותפת במבחנה. כמו כן, הפרוטוקול יכול להיות מנוצל למחקרי שידור כדי לבחון את זיהומיות Mtb של תאים או לחקור phagocytic, כמו גם קיבולת הצגת אנטיגן של תאים בודדים M1/M2. ציטומטריית זרימה M1/M2 היא גם אטרקטיבית לשימוש במחקרי סמנים ביולוגיים וחיסונים, לעקוב אחר פרוגנוזה של מחלות במהלך הטיפול ולבדוק טיפולים המכוונים לתאים שמקורם במיאלואידים. חשוב לציין, ניתן ליישם מספר שיטות שונות במקביל לזרימה ציטומטריה להערכה בו זמנית של פנוטיפים של קיטוב מקרופאז' ותגובות תפקודיות באמצעות מיקרוסקופיה קונפוקלית (איור 3D), PCR בזמן אמת, כתם מערבי, מבחני מולטיפלקס ו ELISA של גורמים מסיסים בתרבות supernatant, כמו גם הערכה של זיהומיות חיידקים תאיים וצמיחה באמצעות ביטוי GFP (cytometry זרימה מיקרוסקופיה confocal) ויחידות להרכיב מושבה (CFU). זיהום של תאי M1 או M2 עם חיידקי Mtb-GFP מאפשר גם מיון התאים שאינם נגועים ו- Mtb נגועים מאותה מדגם לניתוח רצף תא יחיד-RNA.
לפרוטוקול המתואר יש גם כמה מגבלות כולל חסרונות טכניים ומדעיים כאחד. החיסרון בשימוש במקרופאגים שמקורם במונוציט מתורמי דם אנושיים הוא שהשונות בין התורמים לעתים קרובות גבוהה והעובדה שהתאים אינם מקוטבים בסביבה הפיזיולוגית של רקמות אנושיות. שונות גדולה ביעילות הקיטוב M1/M2 או Mtb-infectivity בין תורמים עלולה לגרום לבעיות עם וריאציות תוך-מקצועיות ובין-מקצועיות, כוח סטטיסטי נמוך וצורך לכלול תורמים רבים כדי להשיג תוצאות אמינות. בנוסף, הדבקות בפלסטיק של מונוציטים ממחשבי PCBMCs גורמת למספר תלוי תורם של מונוציטים /well שעשויים בסופו של דבר לספק MOI שרירותי שעלול להשפיע על קיטוב המקרופאג' ועל הכדאיות של התאים לאחר זיהום Mtb. שלבים קריטיים בפרוטוקול כרוכים בכביסה נכונה כדי למנוע מסוגי תאים אחרים לזהם את תרביות התאים שעלולות להשפיע גם על קיטוב מקרופאגים. בעוד MOI נמוך מדי עשוי לחקות זיהום שחפת סמוי, MOI גבוה מדי יהרוג את התאים, הדגשת החשיבות של שימוש MOI מתאים. יתר על כן, זה יכול להיות קשה לאחזר תאים חסידים בתקיפות על ניתוק, אשר עלול לגרום ייצוג מוטה של קבוצות משנה מסוימות מקרופאגים המשמשים לניתוחי cytometry זרימה. שלב מכריע בניתוח cytometry זרימה כרוך בשימוש נכון של מטריצת פיצוי חרוזים ופקדים שליליים כגון תאים מוכתמים או FMO (פלואורסצנטיות מינוס אחד) פקדים כדי להבטיח גטינג ידני נכון.
מגבלה נוספת כרוכה בקיטוב של מונוציטים שמקורם בדם ולא מסביבת הרקמות המקומית. סימן ההיכר של שחפת אנושית הוא היווצרות של גרנולומות ברקמות נגועות Mtb ולכן, אימונופתולוגיה בשחפת צריך להיות למד באופן מועדף באתר הרקמה המקומית. עם זאת, מונוציטים מגויסים לריאה מדם היקפי על דלקת / זיהום, שבו תאים יכולים להבדיל למקרופאגים בנוכחות ציטוקינים דלקתיים כגון GM-CSF12. חשוב לציין, במילייה הפיזיולוגי של הרקמה ב vivo, סביר להניח שיש הטרוגניות גדולה של קיטוב מקרופאז כולל תערובת ויחסים שונים של אוכלוסיות מקרופאגים מגוונות דמויות M1 ו- M2 התורמות לגורל זיהום שחפת36. פיתחנו בעבר מודל רקמת ריאה organotypic אנושי המאפשר 3D-מחקרים של היווצרות גרנולומה בתיווך מקרופאג ב TB37. זה יכול להיות מעניין לנצל את פרוטוקול הקיטוב הנוכחי M1/M2 בשילוב עם מודל רקמת הריאה כדי להמשיך לחקור היווצרות גרנולומה שחפת, פונקציות אפקטים ויחס M1/M2 ברקמה ניסיונית.
פרוטוקול זה M1/M2 flowcytometry יכול בקלות להיות מותאם לכלול פאנל מורחב של סמנים מיאלואידים שימושי להערכת תכונות הקשורות מעכבות, כמו גם תגובות דלקתיות. יש עניין מחקרי רב במולקולות נקודת ביקורת חיסונית מעכבות כגון PD-1, SIRP-α, IDO וארגינאזות שיכולות לווסת תגובות מקרופאז'38. בהקשר זה, קיטוב של תאים מיאלואידיים יכול לכלול גם גירויים אחרים המקדמים מקרופאגים אימונורגולטוריים (Mreg) או תאים מדכאים שמקורם במיאלואידים (MDSC) שהוכחו כמעורבים במספר מחלות כולל שחפת38. לוחות ציטומטריה זרימה מתקדמים יותר של תת-קבוצות מקרופאג M1/M2/Mreg עשויים לכלול גם כתמים תאיים של ציטוקינים/כימוקינים IL-1β, TNF-α, IL-10 ו- MCP-1 או גורמים מסיסים אחרים או מולקולות אפקט כגון תחמוצת חנקן בלתי ניתנת להכנה (iNOS) ופפטידים אנטי-מיקרוביאליים. זה יכול לשפר את האפשרויות ללמוד תגובות מקרופגות רב תכליתיות, בדומה למה שתואר בהרחבה עבור תאי T39.
נכון לעכשיו, לוחות הכתמת ציטומטריה זרימה יכולים לכלול עד 30-40 צבעים, אשר מספק את היכולת immunophenotype תת-קבוצות תאים מרובים ומולקולות בו זמנית. ההגדרה הניסיונית הבסיסית של פרוטוקול cytometry זרימה M1/M2 זה יכולה לשמש כעמוד שדרה התואם לרוב סיטומטרים ישנים וחדשים של זרימה וניתן לבנות עליהם ולהתאים אותם בהתאם לצרכים האישיים, כולל האתגרים שמציבה העבודה עם Mtb הארסי בסביבת BSL-3. כיום, טכניקות להפחתת ממדיות כגון UMAP זמינות בגירסאות החדשות של תוכנת cytometry זרימה, המאפשר ניתוח של מספר רב של פרמטרים שנוצרו במחקרים חד-תאיים החיוניים להדמיה משופרת ופרשנות של נתונים מימדיים גבוהים40. השיפורים הטכנולוגיים המתמידים בציטומטריית זרימה צפויים להימשך בשנים הקרובות, כולל השילוב של פנוטיפים רב-פרמטריים יחד עם יכולות מיון תאים מודרניות, שם פרוטוקול זה עשוי להיות שימושי במספר מבחני זיהום Mtb מבוססי מקרופאג'.
למחברים אין מה לחשוף.
אנו מודים לעמיתינו בסוכנות לבריאות הציבור של שבדיה, מטילדה סוונסון וסולומון גברמייקל על הסיוע במעבדת BSL-3.
עבודה זו נתמכה על ידי מענקים מקרן הלב והריאות השוודית (HLF) (2019-0299 ו-2019-0302 ל-SB), מועצת המחקר השוודית (VR) (2014-02592, 2019-01744 ו-2019-04720 עד SB), הקרן למניעת עמידות לאנטיביוטיקה (התנגדות), קרנות מכון קרולינסקה ו-KID ל-SB (מימון חלקי של חינוך לדוקטורט למרקו לורטי) ממכון קרולינסקה. ML נתמכה על ידי הקרן השוודית לסרטן ילדים (TJ2018-0128 ויחסי ציבור 2019-0100).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
8-well chamber slides | Lab-Tek | 154534 | |
BD Comp bead plus | BD | 560497 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma-Aldrich | A7906 | |
DAPI Mounting media | Vector Laboratories | H-1200-10 | |
EDTA (0.5 M) | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Falcon 6-well Flat Bottom plates | Corning Life Sciences | 353046 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Sigma-Aldrich | F7524 | |
Formaldehyde | Sigma-Aldrich | F8775 | |
Glycerol (70%) | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
GM-CSF | Peprotech | 300-03 | |
Goat anti-mouse IgG Alexa Fluor 594 secondary antibody | Invitrogen | R37121 | Secondary antibody for CD64 |
Goat anti-Rabbit IgG Alexa Fluor 594 secondary antibody | Invitrogen | A-11037 | Secondary antibody for CD163 |
HEPES | GE Healthcare Life Sciences | SH30237.01 | |
IFN-γ | Peprotech | 300-02 | |
IL-4 | Peprotech | 200-04 | |
L-Glutamine | GE Healthcare Life Sciences | SH30034.01 | |
LPS (Escherichia coli O55:B5) | Sigma-Aldrich | L6529 | |
Lymphoprep | Alere Technologies AS | 11508545 | |
M-CSF | Peprotech | 300-25 | |
Middle Brook 7H10 agar plates | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Middle Brook 7H9 media | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Mouse anti-human CD64 primary antibody | Bio-Rad | MCA756G | Clone: 10.1 |
Na-pyruvate | GE Healthcare Life Sciences | SH300239.01 | |
Normal goat serum | Jackson ImmunoResearch | 005-000-121 | |
Rabbit anti-human CD163 primary antibody | GeneTex | GTX81526 | Polyclonal |
RPMI 1640 | Life Technologies Corporation | SH30096.01 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X-100 | |
TubeSpin bioreactor tubes | TPP Techno Plastic Products AG | 87050 | |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P9416 | |
Tween-80 | Sigma-Aldrich | P4780 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved