אנו מודים דיק פולי ליי קימבל עבור תפקידי מפתח שלהם לצלם ווידאו הייצור.

1. דם היקפיים mononuclear תאים (PBMC) בידוד <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> להשיג דגימת דם - הדם צריך להיות שנאספו מזרקים או מבחנות דם קרוש אנטי עם הפרין (01:50 יחס) כדי למנוע קרישה. מצפים לתשואה של כ - 1 × 10 6 PBMC לכל מ&quot;ל של דם - כ -40% אשר יהיה חיובי CD4 (CD4 +) ותאי T. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Aliquot הדם לתוך צינורות חרוטי 50 מ&quot;ל, 25 מ&quot;ל לכל צינור. אם יש דם מופרדים, מערבבים בעדינות לפני aliquoting להפיץ את הפלזמה </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף PBS, מביא את סך נפח 40 מ&quot;ל ו ביסוד ידי ציור של עד 11 מ&quot;ל Ficoll, החדרת צינור לתוך הדם, בזהירות הסרת סיוע pipet מן פיפטה. Ficoll יהיה לאט לנקז לתוך החלק התחתון של הצינור. לאחר הרמה יש להשוות, לאט להסיר את פיפטה מהצינור דם וזורקים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שווי צינורות הדם לעבור את המכלים Aerosolve. לסגור היטב את המכלים ו צנטריפוגות ב × 900 גרם במשך 20 דקות - לא בלם. זה קריטי, כי לא בלם מוחל בסוף הסיבוב הזה כמו כוח הבלימה יפריע את שכבת התאים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אחרי ספין, PBMCs צריך ליצור שכבה לבנה ברורים בין פלזמה הצהוב (לעיל) ficoll שקוף (להלן). בעדינות יגרוף כדוריות דם לבנות שכבה באמצעות פיפטה העברה להעביר צינור חדש. חלק פלזמה ו Ficoll ניתן משוכות עם PBMCs, אבל למנוע עריכת כל שכבת תאים אדומים. בדרך כלל שני צינורות דם יכול להיות משולב לתוך צינור תא אחד בשלב זה להגדיל את גודל גלולה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף PBS, מביא את סך נפח 50 מ&quot;ל ו - 500 צנטריפוגות ב × גרם במשך 15 דקות - בלם נמוך בלוני aerosolve. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשאוב נוזלים באמצעות פיפטה פסטר, נזהרת שלא להפריע גלולה </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> פנקו עם חיץ המוליטית ידי הוספת 5-6 מ&quot;ל לצינור כל ערבוב בעדינות כדי להסיר גושים. דגירה של לא יותר מ 5 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף PBS, מביא את סך נפח 50 מ&quot;ל ו - 230 צנטריפוגות ב × גרם במשך 10 דקות - בלם נמוכה. בלוני Aerosolve אין עוד צורך אלה ספינים איטי יותר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף פעמיים: נוזל לשאוב בעזרת פיפטה פסטר, למלא צינור עם PBS ו צנטריפוגות ב × 230 גרם במשך 10 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לפני השלב הסופי לשטוף, להסיר aliquot מחדש מושעה תאים, לדלל עם trypan כחול, לספור באמצעות hemocytometer. זה לספור תא יכתיבו את הכרכים מגיב המשמשים את הצעד ההפרדה תא T. </li></ol> 2. הפרדה מסוג CD4 + T * תא <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשאוב נוזלים להוסיף למאגר רץ להביא את הנפח הכולל של עד 40 UL לכל 10 מיליון תאים. בדרך כלל זה דורש 30 UL של חיץ בתוספת נפח שיורית גלולה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העברה זו נפח צינור חרוטי 15 מ&quot;ל. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף קוקטייל נוגדנים מתיק CD4 הבידוד - 10 UL לכל 10 מיליון תאים, צינור כובע, ומניחים על קרח במשך 10 דקות </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסרת הצינור מן הקרח, להסיר את המכסה, ולהוסיף 30 UL של הפעלת המאגר לכל 10 מיליון תאים </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף חרוזים מגנטיים מתיק CD4 הבידוד - 20 UL לכל 10 מיליון תאים, צינור כובע, ומניחים על קרח במשך 15 דקות </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוספת עשרה כרכים של הפעלת המאגר לכבס צנטריפוגות ב × 230 גרם במשך 10 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> במהלך הסיבוב, להגדיר את מגנט צינור פוליפרופילן 5 מ&quot;ל העבודה שלך </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשאוב נוזל מתוך התא גלולה, להוסיף 2 מ&quot;ל חיץ ריצה להסיר גושים בעזרת פיפטה להעביר </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעזרת פיפטה להעביר אותו, להעביר תאים לתוך הצינור 5 מ&quot;ל ו - דגירה של המגנט במשך 15 דקות </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בזהירות למזוג CD4 + חלק התא לתוך שפופרת 15 מ&quot;ל מסומן על ידי המגנט היפוך וריקון כל אבל הטיפה האחרונה </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף עוד 2 מ&quot;ל של ריצה חיץ צינור 5 מ&quot;ל ולהסיר מגנט </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בעדינות ולשטוף את CD4 תאים את הצדדים של הצינור להעביר צינור 15 מ&quot;ל מסומנים </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 2 מ&quot;ל בינוני T לתא צינור אחד, להסיר aliquots עבור ספירת התאים צנטריפוגות ב × 230 גרם במשך 10 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מדולל aliquots תא עם trypan כחול לספור באמצעות hemocytometer. ספירת תאים אלה יכתיבו את מספר בארות המשמשים צעד התרבות הרחבה. </li></ol> * לחילופין, MACS עמודות וחרוזים (Miltenyi BIOTEC), מפריד תא AutoMACS (Miltenyi BIOTEC), או מפריד Robosep תאים (Cell Technologies גזע) ניתן להשתמש בו על פי הוראות מייצרת במקום צעדים 2.2-2.11. 3. בתרבות הרחבה חוץ גופית <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשאוב נוזל מסוג CD4 + ו-CD4 ו - תא כדורי, המבוססת על ספירת התאים, להוסיף מדיה ותרבות (בדרך כלל 3,000,000 תאים מסוג CD4 + לכל מ&quot;ל ו - 10,000,000 CD4 תאים מ&quot;ל לכל עובד היטב עבור הגדרת התרבות). התרבות דורשת הרחבה 3-5000000 CD4 תאים לכל היטב 2-3000000 CD4 + תאים לכל היטב בהיקף כולל של 1 מ&quot;ל תרבות התקשורת בצלחת 48 תרבות היטב. בדרך כלל, תאים מסוג CD4 + הם מגבילים את האוכלוסייה </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> אם תרצה, מקרינים CD4 תאים (5000 ראד<html> ים). Aliquot CD4 תאים למספר המתאים של בארות בצלחת 48 היטב על ידי הוספת 300-500 μL זה. מניחים את צלחת 37 ° C בחממה במשך שעה 1. חסיד CD4 תאים ישמש התאים המציגים אנטיגנים בתרבות הרחבה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את צלחת מן החממה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף את הבארות על ידי הוספת 500 UL התקשורת טריים pipetting בעדינות מעלה ומטה 12-20 פעמים באמצעות pipet העברה והסרה של כל הנוזל. לשטוף את זה ישאיר שכבת התאים המציגים אנטיגנים חסיד. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כאשר הכביסה תושלם, להוסיף מדיה מספיק רק כדי להרטיב את החלק התחתון של כל טוב (בערך 100 UL) - אחרת התאים חסיד יתייבש </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 2-3000000 CD4 + התאים היטב כל אחד. במידת הצורך, להוסיף מדיה נוסף כדי להביא את הנפח הכולל של כל מ&quot;ל עד 1 היטב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מוסיפים את הפפטיד הרצוי היטב כל אחד. ריכוז אופייני לגירוי הוא 10 UG / mL הסופי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מניחים צלחת בתוך 37 ° C החממה למשך 7 ימים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לאחר 7 ימים, להוסיף 50 UL Hemogen של IL-2 (או שווה ערך, כגון רקומביננטי IL-2, 10 IU / mL) זה טוב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ביום אחד לאחר מכן, לפקח גדילת התאים באמצעות מיקרוסקופ. פיד בארות שעדיין אינן ומחוברות על ידי הסרת מחצית התקשורת, והוסיף התקשורת טריים 50 UL של IL-2. פיצול בארות ומחוברות על ידי resuspending התאים, העברת מחצית התאים היטב ריק, הוספת מדיה טריים 50 UL של IL-2. חזור התאים חממה. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> התאים הרחבת יהיה מוכן tetramer לאחר 13-15 ימים של תרבות. </li></ol> 4. לדמיין שתאי T על ידי מכתים tetramer <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> רכישה או להרכיב tetramers כדי להתאים את הפפטיד / MHC השילובים המתאימים מגורה CD4 + T תאים (ראה דיון על מקורות tetramer ריאגנטים). Tetramers יש ~ 0.5 מ&quot;ג / מ&quot;ל ​​פתרון. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הסר את צלחת של חממה </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בזהירות לצייר את חצי התקשורת מכל טוב </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> העברת aliquot של תאים מכל טוב - בדרך כלל 75 μL או כ -50,000 תאים - לתוך צינור קלקר 5 מ&quot;ל FACS </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף tetramer - בדרך כלל 1 μL לפי נפח 50 סך μL - ו - מקום 37 ° C חממה 1-2 שעות. כמו כן, מומלץ להכתים aliquot השני של התאים היטב עם כל tetramer תואמים כביקורת שלילית. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תאים עם תווית אנטי CD3, אנטי CD4, אנטי CD25 נוגדנים על ידי הוספת 3-10 μL של נוגדן זה. סמנים נוספים נוגדן או אלטרנטיבה ניתן להשתמש. עם זאת, אין להשתמש נוגדנים PE שכותרתו מאז הערוץ הזה צריך להיות שמור tetramers. בשלב זה, אף אחד צבע התווית או אלוטיפ שולטת באמצעות תאים עודפים. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> דגירה תאים נוגדן הנקרא עבור 15-30 דקות על הקרח או 4 ° C. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> לשטוף כל צינור עם 0.5-2 מ&quot;ל ריצה חיץ צנטריפוגות ב × 230 גרם במשך 10 דקות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בזהירות למזוג נוזל מתוך צינורות FACS. אחסן את כל צינורות במיכל מכוסה (רצוי על קרח) לניתוח FACS הבאים. </li></ol> 5. Cytometer תזרים רכישת וניתוח <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כייל את Cytometer זרימה באמצעות חרוזים התייחסות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> בדיקת הגדרות המכשיר: <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש בתאי לשלוט בלא כתם או פקדים אלוטיפ, להתאים את המיקום של השער הלימפוציטים קיימא (FSC מול SSC). הסרה אוטומטית של הקרינה מן כל הערוצים על ידי מרכוז של האוכלוסייה (על ידי שינוי הגדרות רווח) להלן בעשור הראשון על כל ציר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שימוש יחיד מלאה שפופרות צבע, מרכז אירועים בתוך הרביעים הנכון עבור כל צבע בודד (על ידי שינוי הגדרות פיצוי). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> האם הסתגלות קנס של הגדרות המכשיר באמצעות צינור מוכתם tetramer רלוונטי. בהגדרות במיוחד עבור ערוץ PE ייתכן שיהיה צורך הסתגלות כי tetramers לעתים קרובות כתם בהיר יותר לשלוט נוגדן. Tetramer רלוונטי צריך כתם &lt;0.5% CD4 + תאים. </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> רוכשת את הנתונים עבור כל שפופרת <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> איסוף אירועים עבור כל שפופרת מדגם צינור בקרה שלילית </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> רוכשת ולשמור לפחות 20,000 אירועים Analysys </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ניתוח נתונים <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> נתוני ייבוא ​​קבצים לתוך תוכנת ניתוח FACS (למשל תוכנה CellQuest, WinMDI, או FlowJo). התחל את הניתוח שלך באמצעות צינור מוכתם באמצעות tetramer רלוונטי. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מגרש FSC מול SSC וצייר השער סביב לימפוציטים חיים (איור 1, פאנל למעלה משמאל). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מגרש מול CD3 CD4 (מגודרת להראות לימפוציטים לחיות בלבד) ולהסיק השערים סביב + CD3 ו CD4 + אוכלוסיות (1 איור הפאנל הימנית העליונה). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> CD4 מגרש מול Tetramer (מגודרת להראות CD3 לימפוציטים + בלבד) ולהגדיר את גבולות ברבע כך CD4 + + Tetramer האוכלוסייה הוא פחות מ 0.5% (1 איור הפאנל התחתון משמאל). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> מגרש CD25 לעומת Tetramer (מגודרת להראות לימפוציטים מסוג CD4 + בלבד) ולהגדיר את גבולות ברבע כך + CD25 האוכלוסייה Tetramer + הוא פחות מ -0.5% (1 איור הפאנל התחתון מימין). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ניתוח של כל דוגמיות מבלי לשנות את השערים. </li></ol></li></ol>% 1167/JOVE 20FIGURE% 201.png &quot;alt =&quot; איור 1 &quot;רוחב =&quot; 600 &quot;גובה =&quot; 342 &quot;/&gt; באיור 1. הנציג שלילי tetramer לשלוט בתוצאות מכתים. הפאנל השמאלי העליון מראה קדימה פסוקים פיזור בצד פיזור השער גודל הלימפוציטים (R1). הפאנל הימנית העליונה היא מגודרת עבור R1 ומראה נמלים CD4 לעומת אנטי CD3 ואת CD3 + (R2) ו CD4 + (R3) שערים. לוח השמאלית התחתונה היא מגודרת עבור R2 ומראה אנטי CD4 לעומת tetramer. הפאנל הימנית התחתונה היא מגודרת עבור R3 ומראה אנטי CD25 לעומת tetramer. הרביעים עבור שתי חלקות tetramer נקבעו על 0.5%. 6. נציג תוצאות <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> התאים tetramer חיובית צריכה להיות ברורה בקרב האוכלוסייה CD4 + מורחבת התאים (איור 2). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> תאים Tetramer חיובי בדרך כלל CD25 + CD4 גבוה ולעיתים קרובות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> במקרים מסוימים, שילוב MHC / פפטיד יכול לתת רקע מכתים (לעיתים קרובות נגרמת על ידי הפפטיד עם מסיסות עניים). מכתים רקע כאלה ניתן להבדיל בין חיובי נכון כי &quot;חיובית כוזבת&quot; התאים אינם אוכלוסיה שונים אחד על אחד מול Tetramer CD4 או CD25 לעומת חלקות Tetramer (איור 3). </li></ol><img src="/files/ftp_upload/1167/JOVE%20FIGURE%202.png" alt="" width="600" height="362" /> איור 2. הנציג חיובי מכתים תוצאות tetramer. פריסת פאנל אסטרטגיה gating זהים באיור 1. התאים tetramer חיובי להופיע אוכלוסייה שונות CD4 גבוה על אנטי CD4 מול פאנל tetramer ואוכלוסייה ברורים + CD25 על אנטי CD25 מול פאנל tetramer. <img src="/files/ftp_upload/1167/JOVE%20FIGURE%203.png" alt="איור 3" width="600" height="336" /> איור 3. נציג &quot;חיובית כוזבת&quot; מכתים תוצאות tetramer. פריסת פאנל אסטרטגיה gating זהים באיור 1. אנטי CD4 מול פאנל tetramer מראה ברור מכתים &quot;תלוליות&quot;. אנטי CD25 לעומת tetramer גם מראה מכתים &quot;תלוליות&quot;, ללא מגמה ברורה כלפי להיות CD25 +.

<ol>
	<li>Novak, E. J., Liu, A. W., Nepom, G. T., Kwok, W. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MHC+Class+II+tetramers+permit+detection+and+characterization+of+peptide-specific+human+CD4++T+cells+proliferating+to+influenza+A+antigen.">MHC Class II tetramers permit detection and characterization of peptide-specific human CD4+ T cells proliferating to influenza A antigen.</a> J. Clin. Invest. 104, R63-R67 (1999).</li><li>Novak, E. J., Liu, A. W., Gebe, J. A., Falk, B., Nepom, G. T., Falk, B., Koelle, D. M., Kwok, W. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tetramer-guided+epitope+mapping:+rapid+identification+and+characterization+of+immunodominant+CD4++T+cell+epitopes+from+complex+antigens.">Tetramer-guided epitope mapping: rapid identification and characterization of immunodominant CD4+ T cell epitopes from complex antigens.</a> J. Immunol. 166, 6665-6670 (2001).</li></ol>

הבנת התפקיד של תאים מסוג CD4 + T בחסינות חשוב ביסודו. עם זאת, אנטיגן ספציפי CD4 + T תאים יכול להיות קשה לזהות ולבודד בשיטות מסורתיות. לעומת זאת, בכיתה tetramers MHC II לאפשר הדמיה ישירה של תאים מסוג CD4 + T עם סגוליות את האנטיגן הרצוי. וידאו זה מדגים את הבידוד, טיהור, וכן הגברה במבחנה של...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Class 2 Laminar flow biosafety cabinet</td>
<td>equipment</td>
<td>Thermo Forma</td>
<td>1200</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>50 mL conical Tube</td>
<td>equipment</td>
<td>VWR</td>
<td>47747-182</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>1X PBS (Ca/Mg free)</td>
<td>Reagent</td>
<td>HyClone</td>
<td>SH30028.02</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Ficoll-paque PLUS</td>
<td>Reagent</td>
<td>GE Healthcare</td>
<td>17-1440-03</td>
<td>foil wrapped to protect from light</td>
</tr>
<tr>
<td>Pipet Aid XP</td>
<td>equipment</td>
<td>Drummond</td>
<td>4-000-101</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>10 mL pipet</td>
<td>equipment</td>
<td>Corning/Costar</td>
<td>CLS4492</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Aerosolve Canisters</td>
<td>equipment</td>
<td>Beckman</td>
<td>359481</td>
<td>with 50 mL inserts</td>
</tr>
<tr>
<td>Centrifuge</td>
<td>equipment</td>
<td>Beckman</td>
<td>GS-6R</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Transfer pipets </td>
<td>equipment</td>
<td>Samco</td>
<td>202-20S</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Pasteur pipets</td>
<td>equipment</td>
<td>VWR</td>
<td>14672-200</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Hemolytic Buffer</td>
<td>Reagent</td>
<td>N/A</td>
<td>N/A</td>
<td>8.3 g/L NH4Cl, 1.0 g/L NaHCO3, 0.04 g/L disodium EDTA</td>
</tr>
<tr>
<td>Trypan blue</td>
<td>Reagent</td>
<td>Sigma</td>
<td>T6146</td>
<td>0.2% in PBS</td>
</tr>
<tr>
<td>Hemocytometer</td>
<td>equipment</td>
<td>VWR </td>
<td>15170-208</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>15 mL conical tube</td>
<td>equipment</td>
<td>VWR</td>
<td>05-527-90</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Running Buffer</td>
<td>Reagent</td>
<td>N/A</td>
<td>N/A</td>
<td>PBS + 2mM EDTA + 5g/L BSA</td>
</tr>
<tr>
<td>MACS CD4+ T Cell Isolation Kit II</td>
<td>Reagent</td>
<td>Miltenyi Biotec</td>
<td>130-091-155</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>EasySep&reg; Magnet</td>
<td>equipment</td>
<td>Stem Cell Technologies</td>
<td>18000</td>
<td>		</td>
</tr>
<tr>
<td>5 mL polypropylene tube</td>
<td>equipment</td>
<td>Falcon</td>
<td>352063</td>
<td>		</td>
</tr>
<tr>
<td>RPMI 1640</td>
<td>Reagent</td>
<td> Invitrogen</td>
<td>22400-089</td>
<td>with 25 mM HEPES</td>
</tr>
<tr>
<td>Pooled human serum</td>
<td>Reagent</td>
<td>N/A</td>
<td>N/A</td>
<td>drawn from healthy donors, heat inactivated and filtered</td>
</tr>
<tr>
<td>Pen Strep</td>
<td>Reagent</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>1570-063</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>500mL 0.22 micron bottle top filter</td>
<td>equipment</td>
<td>Nalgene</td>
<td>595-3320</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>48-well plate</td>
<td>equipment</td>
<td>Costar</td>
<td>3548</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>37&deg;C CO2 incubator</td>
<td>equipment</td>
<td>Sanyo Scientific</td>
<td>MCO-18AIC</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>20 mg/mL synthetic peptide</td>
<td>Reagent</td>
<td>N/A</td>
<td>N/A</td>
<td>Custom synthesis from any peptide vendor</td>
</tr>
<tr>
<td>5 mL FACS tube</td>
<td>equipment</td>
<td>Falcon</td>
<td>352008</td>
<td>Polystyrene</td>
</tr>
<tr>
<td>Peptide loaded class II tetramer (as described)</td>
<td>Reagent</td>
<td>N/A</td>
<td>N/A</td>
<td>Prepared by the BRI tetramer core</td>
</tr>
<tr>
<td>Anti-CD3</td>
<td>Reagent</td>
<td>BD pharmingen</td>
<td>347344</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Anti-CD4</td>
<td>Reagent</td>
<td>eBioscience</td>
<td>17-0049-73</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Anti-CD25</td>
<td>Reagent</td>
<td>eBioscience</td>
<td>11-0259-73</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>
<tr>
<td>Facs Calibur Flow Cytometer</td>
<td>equipment</td>
<td>BD Biosciences</td>
<td>342975</td>
<td>Or equivalent</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

visualizing antigen specific cd4+ t cells using mhc class ii tetramers

סרן מורכב histocompatibility (MHC) בכיתה tetramers השנייה לאפשר להדמיה ישירה של אנטיגן ספציפי CD4 + T תאים על ידי cytometry הזרימה. שיטה זו מסתמכת על האינטראקציה בין פפטיד ספציפי מאוד טעון MHC לבין הקולטן המתאים T-cell. למרות הזיקה של מולקולת MHC / פפטיד בודד הוא נמוך, cross-linking קומפלקסים MHC / פפטיד עם streptavidin מגביר את הלהיטות של האינטראקציה, המאפשרת את השימוש בהם כמו מכתים ריאגנטים. בגלל בתדרים נמוכים יחסית של תאים מסוג CD4 + T (~ 1 ב 300.000 עבור סגוליות אחת) assay זה מנצל בשלב הגברה חוץ גופית כדי להגדיל את סף של גילוי. תאים mononuclear הם מטוהרים מן הדם ההיקפיים על ידי ביסוד Ficoll. CD4 + תאים מופרדים ולאחר מכן על ידי סלקציה שלילית באמצעות קוקטייל נוגדנים biotinylated ואנטי ביוטין חרוזים מגנטיים שכותרתו. שימוש בתאי חסיד מן חלק CD4 תאים כמו תאים הצגת אנטיגן, ותאי T מסוג CD4 + מורחבות בתקשורת ידי הוספת הפפטיד antigenic ו IL-2. התאים מורחבת מגואלות בכיתה המקבילה II tetramer ידי דוגרים ב-C 37 למשך שעה אחת ומוכתמת לאחר מכן באמצעות נוגדנים משטח כגון אנטי CD4, אנטי CD3, אנטי CD25. לאחר תיוג, התאים ניתן לנתח באופן ישיר על ידי cytometry הזרימה. התאים tetramer חיובי בדרך כלל בצורה ברורה בקרב האוכלוסייה CD4 + תאים מורחבת. תאים Tetramer חיובי בדרך כלל CD25 + CD4 גבוה ולעיתים קרובות. בגלל רמת מכתים tetramer הרקע יכול להשתנות, מכתים תוצאות חיוביות תמיד צריך להיות לעומת צביעה של התאים אותו דבר עם tetramer רלוונטי. וריאציות מרובות של assay בסיסי זה אפשרי. תאים Tetramer חיובי עשוי להיות מיון לניתוח פנוטיפי נוספת, הכללה ELISPOT או מבחני שגשוג, או מבחני משנה נוספים. מספר קבוצות הראו גם שיתוף מכתים באמצעות tetramers ואו אנטי ציטוקינים או אנטי FoxP3 נוגדנים.

Watch this Scientific Journal Video about Visualizing Antigen Specific CD4+ T Cells using MHC Class II Tetramers at JoVE.com

Visualizing Antigen Specific CD4+ T Cells using MHC Class II Tetramers

הליך זה מדגים את טיהור בהרחבת במבחנה של אנטיגן ספציפי CD4 + T תאים מדם היקפי שלם להדמיה שלהם באמצעות MHC בכיתה tetramers השנייה. Tetramers לאפשר הדמיה ישירה של תאים T עם סגוליות לאנטיגן יחיד ומוגדר הגבלה MHC Class II.

Antigen CD4 + הדמיה ספציפיות תאים T באמצעות MHC Class II Tetramers

Major histocompatibility complex (MHC) class II tetramers allow the direct visualization of antigen specific CD4+ T cells by flow cytometry.  This method ...

visualizing-antigen-specific-cd4-t-cells-using-mhc-class-ii-tetramers

Research

JoVE Journal

Biology

21.6K Views.  Benaroya Research Institute. הליך זה מדגים את טיהור בהרחבת במבחנה של אנטיגן ספציפי CD4 + T תאים מדם היקפי שלם להדמיה שלהם באמצעות MHC בכיתה tetramers השנייה. Tetramers לאפשר הדמיה ישירה של תאים T עם סגוליות לאנטיגן יחיד ומוגדר הגבלה MHC Class II.

Video: Visualizing Antigen Specific CD4+ T Cells using MHC Class II Tetramers

CD4+ T-Lymphocyte Capture Using a Disposable Microfluidic Chip for HIV

CD4 + T-לימפוציטים לכידת באמצעות שבב Microfluidic פנויה ל-HIV

Isolation of CD4+ T cells from Mouse Lymph Nodes Using Miltenyi MACS Purification

Isolation of cells from the primary source is a necessary step in many more complex protocols. Miltenyi offers kits to isolate cells from several organisms including humans, non-human primates, rat and, as we describe here, mice. Magnetic bead-based cell separation allows for either positive selection (or cell depletion) as well as negative selection. Here, we demonstrate negative selection of untouched or na ve CD4+ helper T cells. Using this standard protocol we typically purify cells that are &#8805; 96% pure CD4+/CD3+. This protocol is used in conjunction with the protocol Dissection and 2-Photon Imaging of Peripheral Lymph Nodes in Mice published in issue 7 of JoVE, for purification of T cells and other cell types to adoptively transfer for imaging purposes. Although we did not demonstrate FACS analysis in this protocol video, it is highly recommended to check the overall purity of isolated cells using the appropriate antibodies via FACS. In addition, we demonstrate the non-sterile method of T cell isolation. If sterile cells are needed for your particular end-user application, be sure to do all of the demonstrated procedures in the tissue culture hood under standard sterile conditions. Thank you for watching and good luck with your own experiments!

Isolation of lymphocytes using the Miltenyi MACs kit is a reliable way to purify cells from whole lymphoid tissue homogenates. Cells purified using the Miltenyi system are typically &#8805; 96% pure. Here, we demonstrate the steps taken to isolate CD4+ T cells, one of the many kits offered by Miltenyi.

בידוד של תאים מסוג CD4 + T מ בלוטות לימפה עכבר באמצעות טיהור Miltenyi MACS

Isolation of cells from the primary source is a necessary step in many more complex protocols. Miltenyi offers kits to isolate cells from several ...

A Technique to Simultaneously Visualize Virus-Specific CD8+ T Cells and Virus-Infected Cells In situ

The numbers and locations of virus-specific CD8+ T cells relative to the numbers and locations of their infected cell targets is thought to be critical in determining outcomes that range from clearance to chronic persistent infections. We describe here a method for assessing the spatial and quantitative relationships between immune effector (E) virus-specific CD8+ T cells and infected targets (T) that combines in situ tetramer (IST) staining to detect virus-specific CD8+ T cells and in situ hybridization (ISH) to detect viral-RNA+ cells in the tissues where the battle between immune defenses and infection takes place. The combination of IST staining and ISH, abbreviated ISTH, enables visualization and mapping of the locations of immune effector cells and targets, and facile determination of E:T ratios.  These parameters in turn can then be used to determine the relationships between spatial proximity, and the timing and magnitude of the immune response that predict outcomes in early infection.

A Technique to Simultaneously Visualize Virus-Specific CD8+ T Cells and Virus-Infected Cells In situ

A technique combining in situ tetramer staining and in situ hybridization (ISTH) enables visualization, mapping and analysis of the spatial proximity of virus-specific CD8+ T cells to their virus-infected targets, and determination of the quantitative relationships between these immune effectors and targets to infection outcomes.

טכניקה במקביל דמיינו ספציפיות וירוס CD8 + T ו-תאים הנגועים בווירוס תאים באתרו</em

The numbers and locations of virus-specific CD8+ T cells relative to the numbers and locations of their infected cell targets is thought to be critical in ...

Cell Specific Analysis of Arabidopsis Leaves Using Fluorescence Activated Cell Sorting

After initiation of the leaf primordium, biomass accumulation is controlled mainly by cell proliferation and expansion in the leaves1. However, the Arabidopsis leaf is a complex organ made up of many different cell types and several structures. At the same time, the growing leaf contains cells at different stages of development, with the cells furthest from the petiole being the first to stop expanding and undergo senescence1. Different cells within the leaf are therefore dividing, elongating or differentiating; active, stressed or dead; and/or responding to stimuli in sub-sets of their cellular type at any one time. This makes genomic study of the leaf challenging: for example when analyzing expression data from whole leaves, signals from genetic networks operating in distinct cellular response zones or cell types will be confounded, resulting in an inaccurate profile being generated.
To address this, several methods have been described which enable studies of cell specific gene expression. These include laser-capture microdissection (LCM)2 or GFP expressing plants used for protoplast generation and subsequent fluorescence activated cell sorting (FACS)3,4, the recently described INTACT system for nuclear precipitation5 and immunoprecipitation of polysomes6.
FACS has been successfully used for a number of studies, including showing that the cell identity and distance from the root tip had a significant effect on the expression profiles of a large number of genes3,7. FACS of GFP lines have also been used to demonstrate cell-specific transcriptional regulation during root nitrogen responses and lateral root development8, salt stress9 auxin distribution in the root10 and to create a gene expression map of the Arabidopsis shoot apical meristem11. Although FACS has previously been used to sort Arabidopsis leaf derived protoplasts based on autofluorescence12,13, so far the use of FACS on Arabidopsis lines expressing GFP in the leaves has been very limited4. In the following protocol we describe a method for obtaining Arabidopsis leaf protoplasts that are compatible with FACS while minimizing the impact of the protoplast generation regime. We demonstrate the method using the KC464 Arabidopsis line, which express GFP in the adaxial epidermis14, the KC274 line, which express GFP in the vascular tissue14 and the TP382 Arabidopsis line, which express a double GFP construct linked to a nuclear localization signal in the guard cells (data not shown; Figure 2). We are currently using this method to study both cell-type specific expression during development and stress, as well as heterogeneous cell populations at various stages of senescence.

Cell Specific Analysis of Arabidopsis Leaves Using Fluorescence Activated Cell Sorting

A method for producing Arabidopsis leaf protoplasts that are compatible with fluorescence activated cell sorting (FACS), allowing for studies of specific cell populations. This method is compatible with any Arabidopsis line that expresses GFP in a subset of cells.

ניתוח ספציפי של תא<em&gt; ארבידופסיס</em&gt; עלים באמצעות מיון תא הופעל פלואורסצנטי

After initiation of the leaf primordium, biomass accumulation is controlled mainly by cell proliferation and expansion in the leaves1. However, the ...

Visualizing Bacteria in Nematodes using Fluorescent Microscopy

Symbioses, the living together of two or more organisms, are widespread throughout all kingdoms of life. As two of the most ubiquitous organisms on earth, nematodes and bacteria form a wide array of symbiotic associations that range from beneficial to pathogenic 1-3. One such association is the mutually beneficial relationship between Xenorhabdus bacteria and Steinernema nematodes, which has emerged as a model system of symbiosis 4. Steinernema nematodes are entomopathogenic, using their bacterial symbiont to kill insects 5. For transmission between insect hosts, the bacteria colonize the intestine of the nematode's infective juvenile stage 6-8. Recently, several other nematode species have been shown to utilize bacteria to kill insects 9-13, and investigations have begun examining the interactions between the nematodes and bacteria in these systems 9.
We describe a method for visualization of a bacterial symbiont within or on a nematode host, taking advantage of the optical transparency of nematodes when viewed by microscopy. The bacteria are engineered to express a fluorescent protein, allowing their visualization by fluorescence microscopy. Many plasmids are available that carry genes encoding proteins that fluoresce at different wavelengths (i.e. green or red), and conjugation of plasmids from a donor Escherichia coli strain into a recipient bacterial symbiont is successful for a broad range of bacteria. The methods described were developed to investigate the association between Steinernema carpocapsae and Xenorhabdus nematophila 14. Similar methods have been used to investigate other nematode-bacterium associations 9,15-18and the approach therefore is generally applicable.
The method allows characterization of bacterial presence and localization within nematodes at different stages of development, providing insights into the nature of the association and the process of colonization 14,16,19. Microscopic analysis reveals both colonization frequency within a population and localization of bacteria to host tissues 14,16,19-21. This is an advantage over other methods of monitoring bacteria within nematode populations, such as sonication 22or grinding 23, which can provide average levels of colonization, but may not, for example, discriminate populations with a high frequency of low symbiont loads from populations with a low frequency of high symbiont loads. Discriminating the frequency and load of colonizing bacteria can be especially important when screening or characterizing bacterial mutants for colonization phenotypes 21,24. Indeed, fluorescence microscopy has been used in high throughput screening of bacterial mutants for defects in colonization 17,18, and is less laborious than other methods, including sonication 22,25-27and individual nematode dissection 28,29.

To study the mutualism between Xenorhabdus bacteria and Steinernema nematodes, methods were developed to monitor bacterial presence and location within nematodes. The experimental approach, which can be applied to other systems, entails engineering bacteria to express the green fluorescent protein and visualizing, using fluorescence microscopy bacteria within the transparent nematode.

Visualizing חיידקים בנמטודות באמצעות מיקרוסקופיה פלורסנט

 
Symbioses, the living together of two or more organisms, are widespread throughout all kingdoms of life. As two of the most ubiquitous organisms on ...

A High Throughput MHC II Binding Assay for Quantitative Analysis of Peptide Epitopes

Biochemical assays with recombinant human MHC II molecules can provide rapid, quantitative insights into immunogenic epitope identification, deletion, or design1,2. Here, a peptide-MHC II binding assay is scaled to 384-well format. The scaled down protocol reduces reagent costs by 75% and is higher throughput than previously described 96-well protocols1,3-5. Specifically, the experimental design permits robust and reproducible analysis of up to 15 peptides against one MHC II allele per 384-well ELISA plate. Using a single liquid handling robot, this method allows one researcher to analyze approximately ninety test peptides in triplicate over a range of eight concentrations and four MHC II allele types in less than 48 hr. Others working in the fields of protein deimmunization or vaccine design and development may find the protocol to be useful in facilitating their own work. In particular, the step-by-step instructions and the visual format of JoVE should allow other users to quickly and easily establish this methodology in their own labs.

Biochemical assays with recombinant human MHC II molecules can provide rapid, quantitative insights into immunogenic epitope identification, deletion, or design. &#160;Here, a peptide-MHC II binding assay scaled to 384-well plates is described. This cost effective format should prove useful in the fields of protein deimmunization and vaccine design and development.

Assay עקידת התפוקה גבוה MHC II לניתוח כמותי של פפטיד אפיטופים

Biochemical assays with recombinant human MHC II molecules can provide rapid, quantitative insights into immunogenic epitope identification, deletion, or ...

Detection of Intracellular Gene Expression in Live Cells of Murine, Human and Porcine Origin Using Fluorescence-labeled Nanoparticles

The reprogramming of somatic cells to induced pluripotent stem cells (iPS) has successfully been performed in different mammalian species including mouse, rat, human, pig and others. The verification of iPS clones mainly relies on the detection of the endogenous expression of different pluripotency genes. These genes mostly represent transcription factors which are located in the cell nucleus. Traditionally, the proof of their endogenous expression is supplied by immunohistochemical staining after fixation of the cells. This approach requires replicate cultures of each clone at this early stage to preserve validated clones for further experiments. The present protocol describes an approach with gene-specific nanoparticles which allows the evaluation of intracellular gene expression directly in live cells by fluorescence. The nanoparticles consist of a central gold particle coupled to a capture strand carrying a sequence complementary to the target mRNA as well as a quenched reporter strand. These nanoparticles are actively endocytosed and the target mRNA displaces the reporter strand which then start to fluoresce. Therefore, specific target gene expression can be detected directly under the microscope. In addition, the emitted fluorescence allows the identification, isolation and enrichment of cells expressing a specific gene by flow cytometry. This method can be applied directly to live cells in culture without any manipulation of the target cells.

This manuscript describes a novel technique which allows the detection of intracellular gene expression after endocytosis of fluorescence-labeled nanoparticles directly in live cells. The method does not require manipulation of the cells and is not restricted with respect to the target gene or species.

זיהוי של ביטוי גנים בתאים תאיים חיים של Murine, אדם וחזירי מקור באמצעות חלקיקים שכותרתו פלואורסצנטי

The reprogramming of somatic cells to induced pluripotent stem cells (iPS) has successfully been performed in different mammalian species including mouse, ...

Tracking and Quantifying Developmental Processes in C. elegans Using Open-source Tools

Quantitatively capturing developmental processes is crucial to derive mechanistic models and key to identify and describe mutant phenotypes. Here protocols are presented for preparing embryos and adult C. elegans animals for short- and long-term time-lapse microscopy and methods for tracking and quantification of developmental processes. The methods presented are all based on C. elegans strains available from the Caenorhabditis Genetics Center and on open-source software that can be easily implemented in any laboratory independently of the microscopy system used. A reconstruction of a 3D cell-shape model using the modelling software IMOD, manual tracking of fluorescently-labeled subcellular structures using the multi-purpose image analysis program Endrov, and an analysis of cortical contractile flow using PIVlab (Time-Resolved Digital Particle Image Velocimetry Tool for MATLAB) are shown. It is discussed how these methods can also be deployed to quantitatively capture other developmental processes in different models, e.g., cell tracking and lineage tracing, tracking of vesicle flow.

Tracking and Quantifying Developmental Processes in C. elegans Using Open-source Tools

Here it is shown how to track and quantify developmental processes in C. elegans. The methods presented are based on open-source tools that can be easily implemented. It is demonstrated how to reconstruct 3D cell-shape models, how to manually track subcellular structures, and how to analyze cortical contractile flow.

מעקב וכימות תהליכים התפתחותיים ב<em&gt; C. elegans</em&gt; שימוש בכלי קוד פתוח

Quantitatively capturing developmental processes is crucial to derive mechanistic models and key to identify and describe mutant phenotypes. Here ...

Isolation of CD4+ T-cells and Analysis of Circulating T-follicular Helper (cTfh) Cell Subsets from Peripheral Blood Using 6-color Flow Cytometry

Aberrant T-follicular helper (Tfh) cell activity is detectable in autoimmune conditions and their presence is associated with clinical outcomes when the lymph node microenvironment in B-cell non-Hodgkin&#39;s lymphoma is analyzed. Subsets of circulating T-follicular helper cells (cTfh), the circulating memory compartment of Tfh cells in the blood, are also perturbed in disease and therefore represent potential novel predictive biomarkers. Peripheral blood-based testing is advantageous because it is relatively non-invasive and allows simple serial monitoring.This article describes a method for isolating CD4+ T-cells from human blood, and further analysis by flow-cytometry to enumerate cTfh cells and the proportions of their various subsets (cTfhPD-1-/+/hi, cTfh1,2,17 and cTfh1/17). The level of these subsets was then compared between normal subjects and patients with lymphoma. We found that the method was robust enough to obtain reliable results from routinely collected patient material. The technique we describe for the analysis can be easily adapted to cell sorting and downstream applications such as RT-PCR.

Isolation of CD4+ T-cells and Analysis of Circulating T-follicular Helper cTfh Cell Subsets from Peripheral Blood Using 6-color Flow Cytometry

Here, a protocol for the isolation and characterization of CD4+ T-cell subsets from human peripheral blood is described. Purified CD4+ T-cells are analyzed by flow cytometry to determine proportions of T-follicular helper cell subsets.

בידוד של CD4+ תאי-T וניתוח של מחזורי Helper T-הזקיקים (cTfh) קבוצות משנה תא מ באמצעות דם היקפיים של Cytometry זרימה 6-צבע

Aberrant T-follicular helper (Tfh) cell activity is detectable in autoimmune conditions and their presence is associated with clinical outcomes when the ...

Visualizing and Quantifying Endonuclease-Based Site-Specific DNA Damage

Cells are continuously exposed to various DNA damaging agents, inducing different cellular responses. Applying biochemical and genetic approaches is essential in revealing cellular events associated with the recruitment and assembly of DNA repair complexes at the site of DNA damage. In the last few years, several powerful tools have been developed to induce site-specific DNA damage. Moreover, novel seminal techniques allow us to study these processes at the single-cell resolution level using both fixed and living cells. Although these techniques have been used to study various biological processes, herein we present the most widely used protocols in the field of DNA repair, Fluorescence Immunostaining (IF) and Chromatin Immunoprecipitation (ChIP), which in combination with endonuclease-based site-specific DNA damage make it possible to visualize and quantify the genomic occupancy of DNA repair factors in a directed and regulated fashion, respectively. These techniques provide powerful tools for the researchers to identify novel proteins bound to the damaged genomic locus as well as their post-translational modifications necessary for their fine-tune regulation during DNA repair.

This article introduces essential steps of immunostaining and chromatin immunoprecipitation. These protocols are commonly used to study DNA damage-related cellular processes and to visualize and quantify the recruitment of proteins implicated in DNA repair.

הדמיה וכימות נזק DNA ספציפי לאתר מבוסס אנדונוקלאז

Cells are continuously exposed to various DNA damaging agents, inducing different cellular responses. Applying biochemical and genetic approaches is ...