Author Spotlight: A Selective Based Assay for Monitoring ATG4B 27 activity in cells

המטרה העיקרית של המחקר במעבדה שלי היא להבין את הרגולציה של אוטופגיה ובמיוחד של פרוטיאן ציסטאין ATG4 ולהשתמש בידע הזה כדי לפתח מעכבי מולקולות קטנות המכוונים למסלול זה במיוחד למחלות כגון סרטן הלבלב. אנו משתמשים בתוכן גבוה, טכנולוגיות סינון בתפוקה גבוהה כדי לזהות מטרות לתרופות כמו גם מועמדים לתרופה, ואנו מתמקדים במשפחת פרוטאז ציסטאין ATG4 מכיוון שאנו חושבים שזו מטרה טובה מאוד לתרופות עבור סוגים שונים של סרטן. אנחנו חוקרים את בני משפחת ATG4 כבר די הרבה זמן.

גילינו תגליות משמעותיות לגבי תפקוד לקוי של משפחת החלבונים והתאים האלה. זיהינו גם מנגנוני ויסות פוסט-תרגומיים חדשים של בני משפחת ATG4 וכיום אנו מפתחים מעכבי מולקולות קטנות וגם מפעילים של משפחות ATG4 למחלות כגון סרטן וניוון עצבי. אין הרבה בדיקות לניטור פעילות פרוטאז ATG4 בתאים.

אז היינו בין הראשונים לפתח בדיקה מבוססת לוציפראז כדי לפקח על פעילות זו. והבדיקה שלנו היא די יוצאת דופן מכיוון שהיא משתמשת בביטוי מופרש, נניח, ולכן אנחנו לא צריכים רישיון לתאים ואנחנו יכולים להתאים את הפרוטוקול הזה בקלות לשיטות סינון בתפוקה גבוהה ואוטומציה במעבדה. התמקדנו בפרוטאז של חלבון ATG4 B כבר די הרבה זמן.

יצרנו שורות תאי נוקאאוט של בני משפחת ATG4. זיהינו מנגנוני ויסות פוסט-תרגומיים חדשים של ATG4, ובסופו של דבר זיהינו גם כמה תרכובות חדשות של מולקולות קטנות שיכולות לעכב ואפילו להפעיל את פרוטאז ATG4 B. בעתיד, נרצה להמשיך את עבודתנו על בני משפחת ATG4.

אנחנו חושבים שזה די הרבה דברים שכרגע לא ידועים ועדיין צריכים להיחשף. לדוגמה, האופן שבו חלבונים אלה מווסתים אוטופגיה בנוירונים אינו מובן כיום לחלוטין. ברצוננו גם למקד את עבודתנו בתיקוף של תרכובות מולקולות קטנות אלה שזיהינו ואולי להשתמש במפעילים במחלות נוירודגנרטיביות.