O principal objetivo da pesquisa em meu laboratório é entender a regulação da autofagia e, em particular, da proteína cisteína ATG4 e usar esse conhecimento para desenvolver inibidores de pequenas moléculas que visam essa via em particular para doenças como o câncer de pâncreas. Usamos tecnologias de triagem de alto conteúdo e alto rendimento para identificar alvos de drogas, bem como candidatos a medicamentos, e nos concentramos na família de proteases de cisteína ATG4 porque achamos que é um alvo de drogas muito bom para várias formas de câncer. Temos estudado os membros da família ATG4 há algum tempo.
Fizemos descobertas significativas sobre a disfunção dessa família de proteínas e células. Também identificamos novos mecanismos pós-traducionais de regulação dos membros da família ATG4 e atualmente estamos desenvolvendo inibidores de pequenas moléculas e também ativadores das famílias ATG4 para doenças como câncer e neurodegeneração. Não há muitos ensaios para monitorar a atividade da protease ATG4 em células.
Então, fomos um dos primeiros a desenvolver um ensaio baseado em luciferase para monitorar essa atividade. E nosso ensaio é bastante incomum porque usa segredo, digamos frase, portanto, não precisamos licenciar as células e podemos adaptar esse protocolo facilmente a métodos de triagem de alto rendimento e automação de laboratório. Temos nos concentrado na protease da proteína ATG4 B há algum tempo.
Geramos linhagens celulares nocaute dos membros da família ATG4. Identificamos novos mecanismos de regulação pós-traducional do ATG4 e, finalmente, também identificamos vários novos compostos de pequenas moléculas que poderiam inibir e até ativar a protease ATG4 B. No futuro, gostaríamos de continuar nosso trabalho nos membros da família ATG4.
Achamos que é muita coisa que é atualmente desconhecida e ainda precisa ser descoberta. Por exemplo, como essas proteínas regulam a autofagia em neurônios atualmente não é completamente compreendido. Também gostaríamos de focar nosso trabalho na validação desses compostos de pequenas moléculas que identificamos e potencialmente usar ativadores em doenças neurodegenerativas.