変異体全マウス胚のシングルセルRNAシーケンシング:胚盤葉上から胃腸終末まで

私たちは、胚性幹細胞の分化における初期の細胞運命決定を制御するメカニズムを、in vitroおよびマウスモデルの両方で解読することに焦点を当てています。複雑な制御ネットワークは、発生中の分化を導き、シグナル伝達経路、転写因子、およびエピジェネティックな制御因子の相互作用がどのように異なる細胞運命を促進するかを調査します。マウスの原腸陥入の動的かつ迅速な過程を研究することは、胚あたりの細胞数が少なく、同腹仔あたりの所望の遺伝子型を持つ胚の数が限られているため、技術的に困難です。

野生型または蛍光活性化細胞で選別された胚集団を用いた単一細胞の研究は、文献で広く示されていますが、系統変異を持つ胚の包括的な解析はまだ限られています。私たちのプロトコルは、系統変異を持つ原腸陥入胚からシングルセルオミクスデータセットを生成する可能性を提供します。これは、マウスの取り扱い経験がない、または経験が限られている科学者や、初期胚の操作やシングルセルアプローチを学びたい科学者に役立ちます。

私たちのプロトコルは、原腸陥入と心臓の発達を含む初期の器官形成における新しい科学的質問に答えるのに役立ちます。私たちは、系統特異的な変異胚を単一細胞分解能で解析するパイプラインを提供し、系統コミットメントにおける特定の遺伝子の役割の解析を容易にします。この方法論を使用して、原腸陥入の迅速かつ動的なプロセスにおける細胞運命決定の制御メカニズムを理解したいと考えています。