이 작품은 국립 과학 재단 NSF-IOS 부여 # 1144391에 SHB에 의해 지원되었다.

1. 식물의 준비 <ol><li> 애기 씨는 주로 토양이나 MS의 접시에 발아 할 수 있습니다. 12 시간 광주 (22 ° C 일, 15 ° C 밤 14)와 함께 성장 챔버 네 개의 주에서 6 주간 식물을 성장. 수초 한 번에 일주일에 두 번. 물에 대한 하단 용지함을 사용, 위로부터 물이 아닌 식물 않는다 트레이 다시 물을 전에 건조 할 수 있습니다. 식물은 수확의 시간에 잘 수화되어 있는지 확인하십시오. </li></ol> 2. 솔루션 및 요리 준비 <ol><li> K 2-EDTA 용액 : 냉장고에 보관 할 수있는 100 밀리미터 K 2-EDTA 용액 원액을합니다. 컬렉션의 날에 1 ~ 다섯 (한 부분 EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) 솔루션, 네 부분으로 물) 20 mM의 K 2-EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) 솔루션을 얻기 위해 솔루션을 희석. </li><li> 반 K 2-EDTA 용액 20 mm 인 유리 또는 페트리 접시 (직경 7~15cm)를 입력합니다. 만약 다른 처리 (예 대한에서 샘플을 수집충분한 제어 및 염분 스트레스 식물 또는 다른 유전자형), 각 치료를 위해 별도의 요리를 준비합니다. </li><li> 20 mM의 K 2-EDTA 용액 1.4 ml의 1.7 ML 반응 관의 원하는 번호를 입력합니다. 1.4 ml의 반응 관의 동일한 번호를 기입 탈이나 소동 물을 압력 가마로 소독. </li><li> 에 식물을 설정하는 벤치에 종이 타월을 넣어 하나의 새로운 면도날을 장갑에 넣어. </li></ol> 3. 사부 삼출물의 모음 (그림 1의 순서도에 묘사 된) <ol><li> 수확 장미는 장미의 중앙에 잎자루 주변의 기지에 면도날을 절단하여 4~6주 된 식물에서 잎. </li><li> 즉시 2-EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) K 20 밀리미터를 포함하는 요리에 잎을 배치합니다. 잎자루의 단면 (그림 2) 용액에 침수되어 있는지 확인합니다. </li><li> 일단 15 잎은 부드럽게 서로 같은 t의 상단에 나뭇잎 스택 (ca. 3-4 식물) 수집 된모자 컷 잎자루가 서로 정렬됩니다. 잎자루 (ca. 1mm)의 기본을 연마 가공하고 즉시 K 2-EDTA 용액 20 mm 인 반응 튜브 중 하나에 잎을 전송합니다. 그들은 약간 롤업하는 경우 잎은 쉬운 맞습니다. 이 세포의 손상, 따라서 잎 셀 내용의 컬렉션에 리드를 일으킬 수 있으므로에 잎을 압박하지 마십시오. </li><li> 더 많은 자료가 필요하면, 부드럽게 젖은 종이 타월로 샘플을 커버. 만약 다른 처리 또는 유전자형에서 샘플 수집을 위해 요리의 새로운 집합을 사용합니다. </li><li> 일단 모든 샘플은 하나 어둠이나 빛의 삼출물을 수집, 반응 관에 배치됩니다. </li><li> 어둠, 선 젖은 종이 타월로 대형 얕은 접시의 바닥 수집합니다. 잎 가득한 반응 접시에 튜브 및 젖은 종이 타월로 커버 하나와 함께 랙을 배치하거나 폭기 슬릿 검은 플라스틱 백에 넣어. 캐비닛의 전체 설치 또는 어두운 방 배치. </li><li> 빛 수집을 위해 젖은 종이 타월로 명확한 플렉시 유리 용기의 바닥을 일렬로. 컨테이너의 잎 가득한 반응 튜브 랙을 배치하고 닫습니다. </li><li> 1 시간 후에 제거는 컨테이너와 반응 관에서 부드럽게 잎 모두 EDTA를 제거하기 위해 증류수 탈이나 소동 물로 씻는다. 이 단계는 세 가지 목적을 수행합니다 : (1) 그것은 세포에 최소화 손상 EDTA를 제거합니다 (2)는 SDS-PAGE 및 크로마토 그래피와 EDTA의 간섭을 제거, (3) 컷에서 축적 된 / 손상된 않은 화합물을 제거 세포. 즉시 멸균 물을 포함하는 준비된 반응 튜브에 전송하고 삼출물의 수집을위한 가습 용 컨테이너로 돌아갑니다. 삼출물이 RNA 추출을 위해 사용해야하는 경우이 시점에서, RNA 분해 효소 억제제를 추가합니다. 옵션 : 단백질 분석이 필요한 경우 단백 분해 효소 억제제를 추가 할 수 있습니다. </li><li> 의도 수집 시간 후 꺼내 discaRD 잎과 추가 사용 액체 N 2 체관의 삼출물을 동결. 확장 저장이 필요한 경우, -80 샘플 및 저장 ° C.를 냉동 건조 </li><li> 애기 장대의 경우, 대사는 이미 1 시간 동안 삼출물를 수집 한 후 검색 할 수 있습니다. 덜 풍부한 구성 요소의 분석이 예정되어있는 경우 그러나 5-8 시간 동안 컬렉션 좋습니다. 들깨와 같은 큰 식물을 위해, 더 이상 수집 시간 (8 시간)이 권장됩니다. 15 잎에서 수집 한 삼출물은 mRNA의 추출을위한 SDS-PAGE 젤 (단백질), GC-MS (당분과 대사 산물)의 한 차선을 위해 일반적으로 충분하다. 지질 분석을 위해 2-3 샘플 풀링 (30-45 잎에서 삼출물) 추천 선명 결과에 이르게한다. </li></ol> 4. 이후의 분석 (비디오의 경우 우리는 4.4 표시) <ol><li> 단백질 분석을 위해, 15 μL 물 30 μL Lämmli 버퍼를 Resuspend 샘플은, 95 열 ° C 5 분, 신속하게 피를 스핀 다운recipitates 및 SDS-PAGE 젤 (45 μL 로딩 주머니)에 전체 샘플을로드합니다. 단백질 풍부 매우 낮기 때문에 샘플은 콜로이드 쿠 매시 또는 기타 민감한 얼룩 염색을해야한다. </li><li> 설탕과 작은 대사 산물 분석을 위해 문헌 14에 설명 된대로 건조 된 시료에 에이전트를 유도체 추가합니다. </li><li> 발현은 RT-PCR, microarray의 또는 RNA-시퀀서 분석을 사용하여 분석 할 수 있습니다. </li><li> 지질 분석을 위해 즉시 풀 2-3 샘플 및 클로로포름에 대한 파티션을 다음과 같이 흄 후드에서 메탄올 (1:1) : 4 분 동안 각 시료에 메탄올, 몇 초 동안 소용돌이, 원심 분리 : 동일한 클로로포름의 양을 추가 400 X g에서. 테플론 캡과 최고 위상 반복 파티션을 세 번와 유리 튜브의 바닥 (유기) 단계를 수집합니다. N 2의 흐름에 따라 결합 된 유기 단계 건조 (박층 크로마토 그래피 추가 분석에 제출 : TLC 14, 37, 액체 크로마토 그래피 - 질량 분석법 : LC-MS 14). </li></ol>

우리는 공개 아무것도 없어.

사부 삼출물의 EDTA-촉진 컬렉션은 매우 간단합니다, 최소한의 장비를 필요로하고, 대부분의 식물에 적용됩니다. 전반적으로,이 방법은 더 많은 종 사부 삼출물을 분석 할 수있는 능력을 확장합니다. 삼출물이 희석되어 있지만, 그것은 물질의 다량을 확장 할 여러 가지 샘플을 수집하거나 많은 식물에서하기 쉽다. 이는 매우 낮은 풍부하고 간과 될 새로운 화합물의 검출을 할 수 있습니다. 이 방법은 여러 식물 종에 사용이 원고에 나와있는 것들에 대한 설명으로 작동 할 수 있습니다. 새로운 종을 탐구하는 경우 수정해야 할 두 가지 측면 사용되는 나뭇잎과 삼출물의 시간의 번호입니다. 대부분의 경우, 주 5 일 8 시간 삼출물이 적합해야합니다. 새로운 종의 식물이 메서드를 사용하는 방법을 확인하려면, 삼출물 프로토콜 제 4 N에 설명 된대로 수집 이후 분석 중 하나 이상을해야합니다eeds을 수행 할 수 있습니다. 관찰 된 신호의 강도에 따라 수집 볼륨은 최대 크기를 조정해야 할 수도 있습니다. 전자는 사부의 삼출물 덜 풍부하기 때문에 일반적으로, 지질 및 단백질 분석은 설탕과 대사 산물 분석보다 더 많은 자료가 필요합니다. EDTA-촉진 삼출물 컬렉션 잘라 표면뿐만 아니라 EDTA의 잠재적 손상 효과를 포함하기 때문에, 여러 가지 점을 고려 할 수있다 : (1) EDTA와 함께 한 시간 배양 한 후, 잎자루는 철저하게 세척해야합니다. 이 상처 입은 세포뿐만 아니라 세포를 손상 시키거나 추출을 방해 할 수 EDTA 자체에서 얻은 화합물을 제거한다. (2) 긍정적이고 부정적인 컨트롤 얻은 데이터가 체관부 수액에서 파생되도록 포함될 필요하지 손상된 세포 (아래 중요한 단계 참조). (3) 체관부 수액 삼출물 수집하는 동안 활성화 될 수있는 몇 가지 효소를 포함한다. 따라서, 어떤 경우에는 FO를 수집하는 것이 유용 할 수 있습니다시간의 R 다른 양. 방법은 물에 스며 나옴을 포함하기 때문에 (4), 화합물의 절대 정량 할 수 없습니다. 중요한 단계 (. REF 참조 14) 해당 컨트롤의 세포뿐만 아니라 사용을 손상하지 않는 샘플을 처리하는 동안이 메서드의 성공적인 사용의 핵심은주의를 사용하는 것입니다. 한 적절한 컨트롤은 EDTA와 사전 처리없이 사부의 삼출물의 모음입니다. 이 경우 체관 자체를 밀봉하고 더 삼출물을 수집 할 수 없습니다. 상처 입은 세포에서 나오는 모든 오염 물질이 여기에 감지됩니다. 두 번째 컨트롤은 삼출물에있는 설탕의 분석 될 것이다. 애기 장대에서, 자당는 1:4 1시 8분 (REF 8, 14) 사이의 크로스 비율 과당, 체관부 수액에서 주된 대사 산물이어야한다. RNA 추출을위한 RNA 분해 효소 억제제의 사용이 필요합니다. 이전 describ의 또한, 양성 대조군ED 사부 현지화 발현 (UBC9 : 유비퀴틴 결합시키는 효소 9 At4g27960, 8, 14) 예를 들면의 부정적인 제어 엽록체의 mRNA (Rubisco LSU)가 바람직하다. 삼출물이 활성 효소를 포함하고 있기 때문에, 시간 코스 수집 시간의 변화에​​ 단순히 때문이 사부 프로필에서 확인을 변경하는 것이 좋습니다. 경우에 따라서는 단백질 분해 효소 억제제를 사용하는 것이 도움이 될 수 있습니다. 그러나 연구자는 수집 된 삼출물이 집중 추가 된 화합물은 주로 집중 될 것이라는 될 것을 명심해야합니다. 프로토콜에서 두 번째 중요한 단계는 EDTA 아래 잎자루의 다시합시다입니다. 이 단계는 이중 목적을 제공합니다 : 새로운 따라서 체관부 수액의 자유로운 흐름을 허용하는 플러그의 형성을 방지하면서 첫째, 어떤 밀봉 체 플레이트를 제거합니다. 둘째, 절단 동안 생성 된 목부에서 캐비테이션 거품을 제거하기 때문에 목부 전송 할 수 있습니다. 두 번째 컷의 크기는 좌우사용되는 식물에의. 큰 잎자루를 가진 식물은 애기 장대 같은 식물에서 첫 번째 컷, 위의 몇 밀리미터 (최대 1cm)이어야한다 1-2 MM은 충분하다. 이 방법의 사용은 개발 또는 생명 영향을 신호 수도 사부 삼출물에있는 새로운 화합물의 발견으로 이어질 수 있습니다. 그것은 사부에 대한 접근의 부족으로 인해 식물 과학에서 거의 연구 된 분야였다 장거리 지질 신호,에서 깊이있는 모습 더하라는 메시지가있다.

식물은 불리한 조건을 탈출 이동할 수 없습니다. 결과적으로, 그들은 환경 스트레스를 감지하는 메커니즘을 개발 유도 및 공장 전반에 걸쳐 관련 신호를 전송하고 그에 따라 개발을 조정했습니다. 두 전송 시스템은 물, 영양분 및 기타 (신호) 화합물의 분포 존재한다. 첫 번째는 목부이며, 일반적으로 물을 수송과 미네랄은 식물 전체에 뿌리에 의해 흡수하는. 두 번째는 사부입니다. 사부의 뷰가 RNA에 대한 간단한 동화 교통 시스템에서 도관으로 변경, 단백질, 바이러스, 지질 및 다른 작은 분자. 그것은에 중요한 역할을 동화 양분 교통, 생물 및 비 생물 적 스트레스에 대한 반응뿐만 아니라 식물의 성장과 발전에서와 같이. 그것은 지금 공장 18의 &quot;정보 고속도로&quot;라고합니다. 사부 실질뿐만 아니라, 전문적인 동반자 CE : 사부는 여러 종류의 세포로 구성되어 있습니다LLS 및 체 요소입니다. 체 요소는 장거리 이동 사이트입니다. 방해 세로 흐름을 허용하기 위해 체 요소뿐만 아니라 핵 대부분의 세포 소기관을 누락하고 최상의 제한된 번역 기계 21, 33를 포함하는 것으로 생각되고 있습니다. 그것은 동반자 세포가 단백질과 체관 스트림 여행 다른 화합물을 합성하는 것으로 생각됩니다. 이 화합물은 다음의 원형질을 통해 체 요소에 전송되는 장거리 신호 4,16으로 작동 할 수 있습니다. 화합물의 여러 그룹이 사부의 삼출물에서 찾을 수 있습니다 : <ul><li> 설탕은 종종 광합성의 제품입니다 및 저장을위한 식물의 다른 부분에 &quot;에너지를 운반하는 &#39;분자 나 빌딩 블록으로 운반된다. 그러나, 그들은 또한 부동액이나 화합물을 신호로 작동 할 수 있습니다. </li><li> 단백질은 사부의 삼출물에서 찾을 수 있습니다. 그들은 신진 대사 효소를 포함뿐만 아니라 기능을 신호했다. 한 examp발달 신호 역할을하는 단백질의 르 꽃의 유도뿐만 아니라 식물 계절 잎 절단 신호를 꽃 궤적 T 단백질이다. 6 </li><li> 핵산 발현, 작은​​ 마이크로 RNAs를, 그리고 바이러스의 RNA 형태로 체관 분비물에 존재한다. 그들은 주로 신호 27, 28, 39에 관련된 것으로 나타납니다. 동시에, rRNA의 거의 모든 아미노산 tRNAs를은 조롱박 (42)의 체관부 수액에서 관찰되었다. 그들은 선택적 체 튜브 시스템으로 전송 될 것으로 보인다. tRNAs를가 번역 장치에 아미노산을 전송하는 기능에 필요한 수정 사항을 보여줍니다. 그러나, 오히려 번역에 참여하는 것보다, 그들은이 과정을 억제하기 위해 나타납니다. 또한, 그들은 토카이 닌의 원천 역할을하거나 식물 (42)의 대사 상태를 신호 수 있습니다. </li><li> 지방산, oxylipins 및 기타 지질은 사부 삼출물 3, 13, 14, 23에서 발견되었습니다. JasmoNIC 산, 병원균 감염 22, 29, 31, 32에 대한 응답의 일환으로 체관을 통해 oxylipin 이동합니다. 대부분의 사부 지질의 역할은 아직 불분명하지만, 그들 중 일부는 가능성이 기능 4 신호했다. </li></ul> 식물 체관부와 협력의 과제는 상처를 입기에 자신을 봉인하는 능력에 달려있다. 이 사부의 삼출물을 수집하는 데 사용되는 네 가지 주요 방법이 있습니다, 그러나 그들은 선택 종에서만 작동합니다 : 1) 조롱박으로는 잎자루의 인하를 통해 사부의 삼출물의 합리적인 금액을 얻을 수있다. 손상된 세포의 오염과 초기 드롭이 제거되면, 그것은 순수한 체관부 수액 1, 15의 합리적 많은 양을 얻을 수있다. 그러나 증가 수집 시간, 액체 크로마토 그래피 방법 (미발표)에 대한가 점점 부적합이 삼출물이 두껍게 만들기. 최근 출판물은 종에 따라이 체관부 수액을 eithe에서 파생 된 것으로, 제안그것은 체 요소 (FP)에서 &quot;모바일&quot;체관부 수액을 포함 수행하는 동안 R fascicular (FP) 또는 extrafascicular 사부 (EP)와 그, 그것은 또한 목부 (40)을 포함 다른 세포 유형, 41 오염 경향이있다 . 2) 두 번째 방법은 줄기 나 잎자루 얕은 상처 나 구멍을 통해 체관부 수액을 얻을 수있다. 이 방법은 피나 17, 25, 조롱박 36, 그리고 브라 시카 napus 12에서 성공적으로 사용되었습니다. 여기에 부상 세포의 오염을 최소화하고 매우 순수한 삼출물. 그러나 식물은 매우 선택적으로 구멍을 막 체 요소에 도전하기 때문에 건강하고 잘 급수 할 필요가있다. 목부 혈관이 다친 경우, 모든 삼출물이 목부 스트림으로 그려집니다. 이것은 매우 허약하거나 매우 lignified 잎자루 또는 줄기를 가진 식물에 적합하지 않은 방법을합니다. 3) 진딧물 stylectomy는 진딧물이 체 요소로 자신의 탐침을 삽입 할 수 있습니다N 레이저 진딧물을 제거. 체관부 수액은 나머지 탐침 2, 9, 10, 35, 38을 통해 발산된다. 이론적으로는 진딧물에 의해 감염 될 수있는 공장이 방법을 사용할 수 있습니다. 그러나, 대부분의 온실 또는 성장 챔버 관리자는 병원체의 사용을 지원하지 않습니다. 또한, 진딧물은 침 19, 33과 체관에 여러 단백질을 소개합니다. 이 30 프로그래밍 제한된 전사에 이르게과 체관 구성 26 변경 가능성이 있습니다. 4) 여기에서 설명하는 방법은 체관부 수액 EDTA-촉진 삼출물이다. 이 방법은 체관 (20)의 바다 표범 어업을 방지하기 위해 EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산)을 사용합니다. EDTA는 칼슘 2 + 그렇지 않으면 체관을 밀봉하는 과정에 참여하는 것이 이온을 킬레이트. EDTA는 세포 손상 30로 이어질 수 있지만, 몇몇 그룹은 세포의 미세 구조 또는 phloe 20 mm까지이 방법을 사용하고 10 MM에서 EDTA 농도의 부정적인 영향을 관찰 한M 적재 및 운송 5, 24. 어떤 파괴적인 효과뿐만 아니라 크로마토 그래피 및 겔 전기 영동과 EDTA의 간섭을 줄이기 위해 식물은 1 시간 후 물에 이동되고 삼출물 만 후반부는 14 사용됩니다. 따라서, 오히려 EDTA로 스며 나옴보다, 사부 물 (EDTA-촉진 스며 나옴)로 exudated 있습니다. 그것은 사부의 삼출물의 수집을위한 똑 바른 앞으로, 낮은 비용, 낮은 기술 방법입니다. 체관부 수액이 방법은 단백질, 작은 분자, 지질 및 RNA를 분석하는 데 사용할 수 있습니다 얻고 많은 식물에서 성공적으로 사용되었습니다. 실험의 제한된 양의 외떡잎 11에서 수행하고있는 동안,이 메소드는 dicots (들깨 17, 20, 애기 장대 8, 13, 14, 포플러 7)에 더 적합 할 것으로 보인다. 삼출물의 컬렉션 증산을 통해 삼출물의 손실을 피하기 위해 다습 한 환경에서 발생합니다. 식물에 따라 1 ~ 2 시간 EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산)의 배양은사부 / 체 요소의 바다 표범 어업을 방지하기에 충분. 이 컬렉션은 다음 물에 발생할 수 있습니다. 이 EDTA 세포의 구조와 안정성에 미치는 부정적인 영향을 방지하는 이점을 갖고있다. 또한 HPLC 또는 SDS-PAGE와 같은 방법으로 EDTA의 간섭을 제거합니다. 이 애기 장대에 적용이 표시됩니다. 큰 식물, EDTA 및 삼출물 컬렉션의 배양은 최대 크기를 조정해야합니다 오히려 1.7 ML 반응 관에 비해 커에 수행됩니다.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="638">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:153px;">K2-EDTA</td>
			<td style="width:152px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:111px;">ED2P-500G</td>
			<td style="width:223px;"></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:153px;">Shallow Glass or plastic Petri Dish (7-15 cm)</td>
			<td>PYREX or Corning</td>
			<td></td>
			<td>Any clean, shallow dish will work</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Chloroform</td>
			<td>EMD</td>
			<td>CX1054-1</td>
			<td style="width:223px;">Only open containers in fume hood</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Methanol</td>
			<td style="width:152px;">J.T.Baker</td>
			<td style="width:111px;">9070-03</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:153px;">Screw cap tubes</td>
			<td style="width:152px;">VWR International</td>
			<td style="width:111px;">53283-800</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:153px;">Screw cap tubes</td>
			<td style="width:152px;">Sun Sri</td>
			<td style="width:111px;">13-425</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:153px;">Eppendorf tubes</td>
			<td style="width:152px;">Denville</td>
			<td style="width:111px;">C2170</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

collection and analysis of arabidopsis phloem exudates using the edta-facilitated method

식물의 체관의 장거리 수송 (사진)과 생물 또는 비 생물 적 스트레스를 전달하는 신호로 동화 필수적입니다. 그것은 설탕, 아미노산, 단백질, RNA, 지질 및 기타 대사 산물이 포함되어 있습니다. 따라서 구성과 기능 사부의 이러한 분자의 많은 역할과 이해에 큰 관심이 있지만, 식물의 개발과 스트레스의 중요성이 반응은 아직 결정되지 수 있습니다. 사부 분석 한 장벽시 체관부 씰 자체가 상처를 입는 있다는 사실에있다. 그 결과로, 체관부 수액을 얻을 수있는 식물의 수는 제한됩니다. 추가 장비없이 여러 식물 종 체관의 삼출물의 수집을 허용 한 가지 방법은 EDTA-촉진 사부 삼출물 수집이 여기에 설명되어 있습니다. 사용하기 쉬운 반면, 그것은 세포의 상처를 입기에 이르게 손질이 손상된 세포의 내용을 제거하기 위해 수행 할 수있다. 또한, 몇 가지 컨트롤은 삼출물의 순결을 증명하기 위해필요합니다. 오히려 그 내용만을 기준으로 정량화가 발생할 수 있습니다 체관부 수액 (많은 종 불가능합니다)의 직접 수집보다 삼출물 때문이다. 다른 사람을 통해이 방법의 장점은 많은 초본 또는 목본 식물 종 (들깨, 애기 장대, 포플러 등)에 사용되는 최소한의 장비와 훈련을 필요로 할 수 있다는 것입니다. 그것은 단백질, 당, 지질, RNA, 바이러스 및 대사 산물의 후속 분석을 위해 사용할 수있는 삼출물 합리적으로 다량 발생합니다. 그것은이 두 연구뿐만 아니라 교육 실험실에서 사용할 수있을만큼 간단합니다.

그것은 체관부 수액의 복잡성 식물이 최적의 응답 발달과 스트레스 신호를 다양한 전송 방법의 질문에 대한 해답이 될 수 있다는 것을 지난 몇 년 동안 분명되고있다. EDTA-촉진 사부의 삼출물을 사용하면 다른 방법에 적합하지 않습니다 만, 경제적 또는 생리 학적 관심의 대상이 될 수 있습니다 식물의 체관 삼출물을 분석 할 수있는 기회를 제공 할 수 있습니다. 충분히 사부의 수확 사부 지역화 된 단백질을 확인하고 (그림 3) 개발 또는 스트레스에 대한 응답 수준의 변화를 감지하는 삼출물이 방법은 있습니다. 그림 쇼는 단백질이 매우 낮은 풍부이기 때문에, 아직 그 수준은 LC-MS/MS를 사용하여 후속 프로테오믹스 실험이나 서양 얼룩 분석을위한 충분한 높다. 조롱박의 연구 결과는 줄기의 절단 물 잠재적 인 균형의 붕괴와 물 후속 유입에 이르게 및 제안apoplast 41에서 가능한 오염 물질. : 아직 하나에서 8 시간까지 시간을위한 컬렉션 체관 단백질 프로파일 / 작곡 애기 장대에서 (. 만 절대 금액이 Guelette 등 변화), 수집 된 단백질의 양과 발견 단백질의 패턴에 영향을주지 않습니다 것은 종 (Arabidopsis의 사이에 차이가 에서, 들깨, 레인 I 및 NI) 및 치료 (들깨 다른 하루의 길이로 성장, 차선 I 및 NI). 결과 단백질 성 신호를 시각화 할 수있는 식별 및 따랐다. mRNA의 마이크로 RNA를도이 방법으로 사부의 삼출물에서 확인하실 수 있습니다. 그러나 RNA 분해 효소 억제제 치료는 확장 삼출 시간 동안 발현의 저하를 방지 할 필요가있다. 체 요소가 작동 엽록체, Rubisco 작거나 큰 소단위 (각각 적혈구 또는 RbcL,)를 포함하지 않기 때문에 사부 알려진 동안의 mRNA는 부정적인 컨트롤로 사용할 수 있습니다지역화 유비퀴틴 결합시키는 효소와 같은 발현은 양성 대조군 (그림 4)로 사용할 수 있습니다. 마찬가지로, 설탕 또는 작은 대사는 GC-MS 또는 LC-MS를 사용하여 분석 할 수 있습니다. 여기가 사부의 분비물은 거의 모든 당분 경로 12 등의 기능 효소의 큰 숫자를 포함하는 언급해야한다. 따라서, 여러 시간 지점을 사용하여 삼출물를 수집하는 동안 신진 대사 과정을 보여줄 수 있습니다. 예는 그림 5에 표시되어 모든 삼출물에서 자당이 가장 풍부한 대사 산물이며,이는 1 시간 동안 수집 한 후 가장 명백하다. 그러나 다섯 시간 후에 과당 비율 자당가 약간 줄어 듭니다. 같은 삼출물이 다음 4 시간 동안 한 시간 동안 수집 벤치에 남아있는 경우, 비율 과당 자당은 사부의 활성 효소 객실 TEM에서 자당의 저하로 이어질 삼출물 것을 제안, 훨씬 더 큰 범위로 감소온도 (더 피크 해석 14 참조). 이 시스템이 생명력 34 잃을 때까지 사부로드 및 체 요소에 동반자 세포 분자의 수송 삼출 동안 계속할 수있는 결과와 일치한다. 사부의 삼출물의 지질과, 확장, 장거리 지질 신호 식물 과학에 대한 관심이 비교적 최근의 필드입니다. 자신의 소수성 지질로 인해 낮은 농도에서만 존재하고 가용화 다른 분자에 바인딩 할 수 있습니다. 그러나, EDTA-촉진 삼출물 시각화 할 수있는 충분한 자료 수집을 할 수 있습니다 (TLC, 그림 6)과 (LC-MS, 그림 7)를 식별 여러 종의 식물에서 사부 지질합니다. 그림에서와 같이 그것은 여러 가지 지질 종을 식별하고 분리 할 수​​ 있습니다. LC-MS는 서로 다른 지질 종을 식별하고 differe에의 지질 프로파일에서 변경 사항을 모니터링 할 수 있습니다NT 유전자형이나 치료. 이 공장 개발 및 스트레스 반응 중 지질의 역할을 연구 할 수 있습니다. <img alt="그림 1" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51111/51111fig1.jpg" width="600px" /> 그림 1. 애기 장대 나 들깨의 체관의 삼출물의 컬렉션의 흐름도. 다른 경로는 파란색으로 표시됩니다 다른 최종 제품으로 이어질. RNA, RNA 분해 효소 억제제 (100 U / ㎖, 로슈)의 준비를 위해 사부의 삼출물이 수집되는에 물에 추가됩니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51111/51111fig1highres.jpg" target="_blank">큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img alt="그림 2" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51111/51111fig2.jpg" width="600px" /> 그림 2. 수집 사부의 삼출물에 대한 자료의 설정이온. 설정 프로토콜 단계 3.1-3.4에 필요한 모든 자료를 표시합니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51111/51111fig2highres.jpg" target="_blank">큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img alt="그림 3" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51111/51111fig3.jpg" width="600px" /> . 분자량 마커 (레인 2) : MW; 체관부에있는 그림 3 단백질은 두 개의 서로 다른 식물 종, 애기 장대 (시)와 들깨 (, 다른 날 길이 I와 NI)의 삼출물. 단백질은 20 % 기울기 SDS-PAGE를 이용하여 분리 하였다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51111/51111fig3highres.jpg" target="_blank">큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img alt="그림 4" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51111/51111fig4.jpg" width="600px" /> 그림 4. 분석Rubisco 크고 작은 소단위에 대한 발현 (각각 적혈구 및 RbcL)와 유비퀴틴 결합시키는 효소 (UBC)의 존재. 발현은 애기 장대 잎 (L), 잎자루 (P), 그리고 사부의 삼출물 (수소 이온 농도)에서 수집, PCR을 사용하여 시각 전사 특정 성적표를 역으로 수행하십시오. 그림은 Guelette 등으로부터 바뀌 었습니다. 14. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51111/51111fig4highres.jpg" target="_blank">큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img alt="그림 5" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51111/51111fig5.jpg" width="600px" /> 사부의 그림 5. GC-MS 프로파일은 시간의 다른 금액에 대한 수집 삼출물. 참고 어떻게 수집 시간 (B) 5 시간 1 시간 컬렉션 (A)에서 자당 변화의 상대적인 양. 룸에서 &quot;보육&quot;다음에 1 시간 동안 수집 한 후 프로필을 삼출물<html> 4 시간 동안 온도 (RT) (C). 잎 대사 산물 프로파일 (D). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51111/51111fig5highres.jpg" target="_blank">큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img alt="그림 6" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51111/51111fig6.jpg" width="600px" /> 그림 6. 얇은 층 들깨 (왼쪽)와 애기 장대 (오른쪽) 잎과 체관의 삼출물에서 지질을 비교 크로마토 그램. 별표 사부의 분비물에 대한 특정 지질을 나타냅니다. DGDG : digalactosyldiacylglycerol, PG : phosphatidylglycerol; MGDG : monogalactosyldiacyglycerol, 애기 장대 지질를 표시하는 그림의 일부가 Guelette 등에서 수정되었습니다 14.. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51111/51111fig6highres.jpg" target="_blank">큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . NT &quot;FO : 유지 - together.within 페이지 =&quot;항상 &quot;&gt; <img alt="그림 7" fo:content-width="5in" src="/files/ftp_upload/51111/51111fig7.jpg" width="600px" /> 그림 7. LC-MS / 마이너스 이온 모드를 사용하여 애기 장대의 체관의 삼출물 (클로로포름 단계)의 지질. 상단에 그래프 (돌연변이)과 하단 (야생 형, B)는 두 개의 서로 다른 유전자형 (화살표로 표시) 사이의 지질 프로파일의 차이를 보여줍니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51111/51111fig7highres.jpg" target="_blank">큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오</a> .

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Collection and Analysis of Arabidopsis Phloem Exudates Using the EDTA-facilitated Method

체관부 수액의 조성뿐만 아니라 로딩 및 장거리 전송 메커니즘의 지식은 식물의 개발과 스트레스 / 병원균 응답 및 전송 동화의 장거리 신호의 이해를 위해 필수적이다. 이 원고는 EDTA-촉진 방법을 사용하여 체관의 삼출물의 컬렉션을 설명합니다.

의 수집과 분석<em&gt; 애기 장대</em&gt; 사부는 EDTA-촉진 방법을 사용하여 삼출물

The plant phloem is essential for the long-distance transport of (photo-) assimilates as well as of signals conveying biotic or abiotic stress. It ...

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Collection and Analysis of Arabidopsis Phloem Exudates Using the EDTA-facilitated Method

Complexometric Titration, Precipitation Titration, and Gravimetry

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24.3K 조회수.  Michigan State Universtiy.  체관부 수액의 조성뿐만 아니라 로딩 및 장거리 전송 메커니즘의 지식은 식물의 개발과 스트레스 / 병원균 응답 및 전송 동화의 장거리 신호의 이해를 위해 필수적이다. 이 원고는 EDTA-촉진 방법을 사용하여 체관의 삼출물의 컬렉션을 설명합니다. 

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A Simple Method for Imaging Arabidopsis Leaves Using Perfluorodecalin as an Infiltrative Imaging Medium

The problem of acquiring high-resolution images deep into biological samples is widely acknowledged1. In air-filled tissue such as the spongy mesophyll of plant leaves or vertebrate lungs further difficulties arise from multiple transitions in refractive index between cellular components, between cells and airspaces and between the biological tissue and the rest of the optical system. Moreover, refractive index mismatches lead to attenuation of fluorophore excitation and signal emission in fluorescence microscopy. We describe here the application of the perfluorocarbon, perfluorodecalin (PFD), as an infiltrative imaging medium which optically improves laser scanning confocal microscopy (LSCM) sample imaging at depth, without resorting to damaging increases in laser power and has minimal physiological impact2. We describe the protocol for use of PFD with Arabidopsis thaliana leaf tissue, which is optically complex as a result of its structure (Figure 1). PFD has a number of attributes that make it suitable for this use3. The refractive index of PFD (1.313) is comparable with that of water (1.333) and is closer to that of cytosol (approx. 1.4) than air (1.000). In addition, PFD is readily available, non-fluorescent and is non-toxic. The low surface tension of PFD (19 dynes cm-1) is lower than that of water (72 dynes cm-1) and also below the limit (25 - 30 dyne cm-1) for stomatal penetration4, which allows it to flood the spongy mesophyll airspaces without the application of a potentially destructive vacuum or surfactant. Finally and crucially, PFD has a great capacity for dissolving CO2 and O2, which allows gas exchange to be maintained in the flooded tissue, thus minimizing the physiological impact on the sample. These properties have been used in various applications which include partial liquid breathing and lung inflation5,6, surgery7, artificial blood8, oxygenation of growth media9, and studies of ice crystal formation in plants10. Currently, it is common to mount tissue in water or aqueous buffer for live confocal imaging. We consider that the use of PFD as a mounting medium represents an improvement on existing practice and allows the simple preparation of live whole leaf samples for imaging.

A Simple Method for Imaging Arabidopsis Leaves Using Perfluorodecalin as an Infiltrative Imaging Medium

We describe the use of perfluorodecalin as an infiltrative mounting medium. This is a simple method for improving depth of imaging in Arabidopsis thaliana leaf tissue with minimal physiological impact.

이미징을위한 간단한 방법 Arabidopsis는 Infiltrative 영상 매체로 Perfluorodecalin를 사용하여 잎

The problem of acquiring high-resolution images deep into biological samples is widely acknowledged1. In air-filled tissue such as the spongy mesophyll of ...

연구

생물학

Blood Collection for Biochemical Analysis in Adult Zebrafish

The zebrafish has been used as an animal model for studies of several human diseases. It can serve as a powerful preclinical platform for studies of molecular events and therapeutic strategies as well as for evaluating the physiological mechanisms of some pathologies1. 
There are relatively few publications related to adult zebrafish physiology of organs and systems2, which may lead researchers to infer that the basic techniques needed to allow the exploration of zebrafish systems are lacking3. Hematologic biochemical values of zebrafish were first reported in 2003 by Murtha and colleagues4 who employed a blood collection technique first described by Jagadeeswaran and colleagues in 1999. Briefly, blood was collected via a micropipette tip through a lateral incision, approximately 0.3 cm in length, in the region of the dorsal aorta5. Because of the minute dimensions involved, this is a high-precision technique requiring a highly skilled practitioner. The same technique was used by the same group in another publication in that same year6. In 2010, Eames and colleagues assessed whole blood glucose levels in zebrafish7. They gained access to the blood by performing decapitations with scissors and then inserting a heparinized microcapillary collection tube into the pectoral articulation. They mention difficulties with hemolysis that were solved with an appropriate storage temperature based on the work Kilpatrick et al.8. When attempting to use Jagadeeswaran's technique in our laboratory, we found that it was difficult to make the incision in precisely the right place as not to allow a significant amount of blood to be lost before collection could be started. 
Recently, Gupta et al.9 described how to dissect adult zebrafish organs, Kinkle et al.10 described how to perform intraperitoneal injections, and Pugach et al.11 described how to perform retro-orbital injections. However, more work is needed to more fully explore basic techniques for research in zebrafish.
The small size of zebrafish presents challenges for researchers using it as an experimental model. Furthermore, given this smallness of scale, it is important that simple techniques are developed to enable researchers to explore the advantages of the zebrafish model.

This paper presents a technique for collection of blood from the dorsal aorta of Zebrafish. It also provides instructions for obtaining serum for use in biochemical analyses, such as tests for determining cholesterol and triglyceride levels.

성인 Zebrafish의 생물 화학 분석을위한 혈액 수집

The zebrafish has been used as an animal model for studies of several human diseases. It can serve as a powerful preclinical platform for studies of ...

Cell Specific Analysis of Arabidopsis Leaves Using Fluorescence Activated Cell Sorting

After initiation of the leaf primordium, biomass accumulation is controlled mainly by cell proliferation and expansion in the leaves1. However, the Arabidopsis leaf is a complex organ made up of many different cell types and several structures. At the same time, the growing leaf contains cells at different stages of development, with the cells furthest from the petiole being the first to stop expanding and undergo senescence1. Different cells within the leaf are therefore dividing, elongating or differentiating; active, stressed or dead; and/or responding to stimuli in sub-sets of their cellular type at any one time. This makes genomic study of the leaf challenging: for example when analyzing expression data from whole leaves, signals from genetic networks operating in distinct cellular response zones or cell types will be confounded, resulting in an inaccurate profile being generated.
To address this, several methods have been described which enable studies of cell specific gene expression. These include laser-capture microdissection (LCM)2 or GFP expressing plants used for protoplast generation and subsequent fluorescence activated cell sorting (FACS)3,4, the recently described INTACT system for nuclear precipitation5 and immunoprecipitation of polysomes6.
FACS has been successfully used for a number of studies, including showing that the cell identity and distance from the root tip had a significant effect on the expression profiles of a large number of genes3,7. FACS of GFP lines have also been used to demonstrate cell-specific transcriptional regulation during root nitrogen responses and lateral root development8, salt stress9 auxin distribution in the root10 and to create a gene expression map of the Arabidopsis shoot apical meristem11. Although FACS has previously been used to sort Arabidopsis leaf derived protoplasts based on autofluorescence12,13, so far the use of FACS on Arabidopsis lines expressing GFP in the leaves has been very limited4. In the following protocol we describe a method for obtaining Arabidopsis leaf protoplasts that are compatible with FACS while minimizing the impact of the protoplast generation regime. We demonstrate the method using the KC464 Arabidopsis line, which express GFP in the adaxial epidermis14, the KC274 line, which express GFP in the vascular tissue14 and the TP382 Arabidopsis line, which express a double GFP construct linked to a nuclear localization signal in the guard cells (data not shown; Figure 2). We are currently using this method to study both cell-type specific expression during development and stress, as well as heterogeneous cell populations at various stages of senescence.

Cell Specific Analysis of Arabidopsis Leaves Using Fluorescence Activated Cell Sorting

A method for producing Arabidopsis leaf protoplasts that are compatible with fluorescence activated cell sorting (FACS), allowing for studies of specific cell populations. This method is compatible with any Arabidopsis line that expresses GFP in a subset of cells.

의 세포 구체적인 분석<em&gt; Arabidopsis</em&gt; 형광 활성화 셀 정렬을 사용하여 잎

After initiation of the leaf primordium, biomass accumulation is controlled mainly by cell proliferation and expansion in the leaves1. However, the ...

Collection, Isolation and Enrichment of Naturally Occurring Magnetotactic Bacteria from the Environment

Magnetotactic bacteria (MTB) are aquatic microorganisms that were first notably described in 19751 from sediment samples collected in salt marshes of Massachusetts (USA). Since then MTB have been discovered in stratified water- and sediment-columns from all over the world2. One feature common to all MTB is that they contain magnetosomes, which are intracellular, membrane-bound magnetic nanocrystals of magnetite (Fe3O4) and/or greigite (Fe3S4) or both3, 4. In the Northern hemisphere, MTB are typically attracted to the south end of a bar magnet, while in the Southern hemisphere they are usually attracted to the north end of a magnet3,5. This property can be exploited when trying to isolate MTB from environmental samples.
One of the most common ways to enrich MTB is to use a clear plastic container to collect sediment and water from a natural source, such as a freshwater pond. In the Northern hemisphere, the south end of a bar magnet is placed against the outside of the container just above the sediment at the sediment-water interface. After some time, the bacteria can be removed from the inside of the container near the magnet with a pipette and then enriched further by using a capillary racetrack6 and a magnet. Once enriched, the bacteria can be placed on a microscope slide using a hanging drop method and observed in a light microscope or deposited onto a copper grid and observed using transmission electron microscopy (TEM).
Using this method, isolated MTB may be studied microscopically to determine characteristics such as swimming behavior, type and number of flagella, cell morphology of the cells, shape of the magnetic crystals, number of magnetosomes, number of magnetosome chains in each cell, composition of the nanomineral crystals, and presence of intracellular vacuoles.

We demonstrate a method to collect magnetotactic bacteria (MTB) that can be applied to natural waters. MTB can be isolated and enriched from sediment samples using a relatively simple setup that takes advantage of the bacteria's natural magnetism. Isolated MTB can then be examined in detail using both light and electron microscopy.

당연히 환경에서 Magnetotactic 박테리아를 발생의 수집, 절연 및 강화

Magnetotactic bacteria (MTB) are aquatic microorganisms that were first notably described in 19751 from sediment samples collected in salt marshes of ...

An Efficient Method for Quantitative, Single-cell Analysis of Chromatin Modification and Nuclear Architecture in Whole-mount Ovules in Arabidopsis

In flowering plants, the somatic-to-reproductive cell fate transition is marked by the specification of spore mother cells (SMCs) in floral organs of the adult plant. The female SMC (megaspore mother cell, MMC) differentiates in the ovule primordium and undergoes meiosis. The selected haploid megaspore then undergoes mitosis to form the multicellular female gametophyte, which will give rise to the gametes, the egg cell and central cell, together with accessory cells. The limited accessibility of the MMC, meiocyte and female gametophyte inside the ovule is technically challenging for cytological and cytogenetic analyses at single cell level. Particularly, direct or indirect immunodetection of cellular or nuclear epitopes is impaired by poor penetration of the reagents inside the plant cell and single-cell imaging is demised by the lack of optical clarity in whole-mount tissues.
Thus, we developed an efficient method to analyze the nuclear organization and chromatin modification at high resolution of single cell in whole-mount embedded Arabidopsis ovules. It is based on dissection and embedding of fixed ovules in a thin layer of acrylamide gel on a microscopic slide. The embedded ovules are subjected to chemical and enzymatic treatments aiming at improving tissue clarity and permeability to the immunostaining reagents. Those treatments preserve cellular and chromatin organization, DNA and protein epitopes. The samples can be used for different downstream cytological analyses, including chromatin immunostaining, fluorescence in situ hybridization (FISH), and DNA staining for heterochromatin analysis. Confocal laser scanning microscopy (CLSM) imaging, with high resolution, followed by 3D reconstruction allows for quantitative measurements at single-cell resolution.

An Efficient Method for Quantitative, Single-cell Analysis of Chromatin Modification and Nuclear Architecture in Whole-mount Ovules in Arabidopsis

We provide here an efficient and reliable protocol for immunostaining, Fluorescence in&#160;situ Hybridization, DNA staining followed by quantitative, high-resolution imaging in whole-mount Arabidopsis thaliana ovules. This method was successfully used to analyze chromatin modifications and nuclear architecture.

전체 마운트 난자에있는 염색질 수정 및 핵 구조의 정량, 단일 세포 분석을위한 효율적인 방법<em&gt; 애기 장대</em

In flowering plants, the somatic-to-reproductive cell fate transition is marked by the specification of spore mother cells (SMCs) in floral organs of the ...

Detection and Analysis of DNA Damage in Mouse Skeletal Muscle In Situ Using the TUNEL Method

Terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) deoxyuridine triphosphate (dUTP) nick end labeling (TUNEL) is the method of using the TdT enzyme to covalently attach a tagged form of dUTP to 3&#8217; ends of double- and single-stranded DNA breaks in cells. It is a reliable and useful method to detect DNA damage and cell death in situ. This video describes dissection, tissue processing, sectioning, and fluorescence-based TUNEL labeling of mouse skeletal muscle. It also describes a method of semi-automated TUNEL signal quantitation. Inherent normal tissue features and tissue processing conditions affect the ability of the TdT enzyme to efficiently label DNA. Tissue processing may also add undesirable autofluorescence that will interfere with TUNEL signal detection. Therefore, it is important to empirically determine tissue processing and TUNEL labeling methods that will yield the optimal signal-to-noise ratio for subsequent quantitation. The fluorescence-based assay described here provides a way to exclude autofluorescent signal by digital channel subtraction. The TUNEL assay, used with appropriate tissue processing techniques and controls, is a relatively fast, reproducible, quantitative method for detecting apoptosis in tissue. It can be used to confirm DNA damage and apoptosis as pathological mechanisms, to identify affected cell types, and to assess the efficacy of therapeutic treatments in vivo.

Detection and Analysis of DNA Damage in Mouse Skeletal Muscle In Situ Using the TUNEL Method

This video describes dissection, tissue processing, sectioning, and fluorescence-based TUNEL labeling of mouse skeletal muscle. It also describes a method for semi-automated analysis of TUNEL labeling.

마우스 골격근에있는 검색, 탐지 DNA 손상 분석<em&gt; 현장에서</em&gt; TUNEL 방법을 사용하여

Terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) deoxyuridine triphosphate (dUTP) nick end labeling (TUNEL) is the method of using the TdT enzyme to covalently ...

Standardized Method for High-throughput Sterilization of Arabidopsis Seeds

Arabidopsis thaliana (Arabidopsis) seedlings often need to be grown on sterile media. This requires prior seed sterilization to prevent the growth of microbial contaminants present on the seed surface. Currently, Arabidopsis seeds are sterilized using two distinct sterilization techniques in conditions that differ slightly between labs and have not been standardized, often resulting in only partially effective sterilization or in excessive seed mortality. Most of these methods are also not easily scalable to a large number of seed lines of diverse genotypes. As technologies for high-throughput analysis of Arabidopsis continue to proliferate, standardized techniques for sterilizing large numbers of seeds of different genotypes are becoming essential for conducting these types of experiments. The response of a number of Arabidopsis lines to two different sterilization techniques was evaluated based on seed germination rate and the level of seed contamination with microbes and other pathogens. The treatments included different concentrations of sterilizing agents and times of exposure, combined to determine optimal conditions for Arabidopsis seed sterilization. Optimized protocols have been developed for two different sterilization methods: bleach (liquid-phase) and chlorine (Cl2) gas (vapor-phase), both resulting in high seed germination rates and minimal microbial contamination. The utility of these protocols was illustrated through the testing of both wild type and mutant seeds with a range of germination potentials. Our results show that seeds can be effectively sterilized using either method without excessive seed mortality, although detrimental effects of sterilization were observed for seeds with lower than optimal germination potential. In addition, an equation was developed to enable researchers to apply the standardized chlorine gas sterilization conditions to airtight containers of different sizes. The protocols described here allow easy, efficient, and inexpensive seed sterilization for a large number of Arabidopsis lines.

The objective of this study was to determine the effects of bleach and chlorine gas sterilization on seed germination of a range of Arabidopsis genotypes grown on sterile media. Optimized sterilization protocols have been developed to prevent the growth of microbial contaminants while providing satisfactory seed survival.

애기 씨의 높은 처리 살 균에 대 한 표준화 된 방법

Arabidopsis thaliana (Arabidopsis) seedlings often need to be grown on sterile media. This requires prior seed sterilization to prevent the growth of ...

Analysis of Arabidopsis thaliana Growth Behavior in Different Light Qualities

Plant biologists often need to observe the growth behavior of their chosen species. To this end, the plants need constant environmental and stable light conditions, which are preferably variable in quantity and quality so that studies under different setups can be conducted. These requirements are met by climatic chambers featuring light emitting diodes (LED) lights, which can &#8211; in contrast to fluorescent lights &#8211; be set to different wavelengths. LEDs are energy conserving and emit virtually no heat even at light intensities, which often constitutes a problem with other light sources. The presented protocol provides a step-by-step guidance of how to program a climatic chamber equipped with variable LED lights as well as describing several approaches for in depth analysis of growth phenotypes. Depending on the experimental set-up various characteristics of the growing plants can be observed and analyzed. Here we describe how to determine fresh weight, leaf area, photosynthetic activity, and stomatal density. We demonstrate that in order to obtain reliable data and draw valid conclusions it is mandatory to use a sufficient number of individuals for statistical evaluation. Taking too few plants for this kind of analysis results in high statistical errors and consequently in less clear interpretations of the data.

Analysis of Arabidopsis thaliana Growth Behavior in Different Light Qualities

Here, we present a protocol for studying plant growth behavior and especially phenotypes in a reproducible manner. We show how to provide variable and at the same time stable light conditions. Proper analyses depend on sufficient sample numbers and valid statistical evaluations.

다른 빛 자질에 애기 thaliana 성장 행동의 분석

Plant biologists often need to observe the growth behavior of their chosen species. To this end, the plants need constant environmental and stable light ...

A Versatile Method for Mounting Arabidopsis Leaves for Intravital Time-lapse Imaging

The plant immune response associated with a genome-wide transcriptional reprogramming is initiated at the site of infection. Thus, the immune response is regulated spatially and temporally. The use of a fluorescent gene under the control of an immunity-related promoter in combination with an automated fluorescence microscopy is a simple way to understand spatiotemporal regulation of plant immunity. In contrast to the root tissues that have been used for a number of various intravital fluorescent imaging experiments, there exist few fluorescent live-imaging examples for the leaf tissues that encounter an array of airborne microbial infections. Therefore, we developed a simple method to mount leaves of Arabidopsis thaliana plants for live-cell imaging over an extended period of time. We used transgenic Arabidopsis plants expressing the yellow fluorescent protein (YFP) genefused to the nuclear localization signal (NLS) under the control of the promoter of a defense-related marker gene, Pathogenesis-Related 1 (PR1). We infiltrated a transgenic leaf with Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 (avrRpt2) strain (Pst_a2) and performed in vivo time-lapse imaging of the YFP signal for a total of 40 h using an automated fluorescence stereomicroscope. This method can be utilized not only for studies on plant immune responses but also for analyses of various developmental events and environmental responses occurring in leaf tissues.

A Versatile Method for Mounting Arabidopsis Leaves for Intravital Time-lapse Imaging

We report a simple and versatile method for performing fluorescent live-imaging of Arabidopsis thaliana leaves over an extended period of time. We use a transgenic Arabidopsis plant expressing a fluorescent reporter gene under the control of an immunity-related promoter as an example for gaining spatiotemporal understanding of plant immune responses.

Intravital 시간 경과 영상에 대 한 애기 를 장착 하는 다양 한 방법을 나뭇잎합니다

The plant immune response associated with a genome-wide transcriptional reprogramming is initiated at the site of infection. Thus, the immune response is ...

Two-layered Membrane Sandwich Method for Laodelphax striatellus Saliva Collection

Rice stripe virus (RSV), which causes significant economic loss of agriculture in East Asia, entirely depends on insect vectors for its effective transmission among host rice. Laodelphax striatellus (small brown planthopper, SBPH) is the primary insect vector that horizontally transmits RSV while sucking sap from the phloem. Saliva plays a significant role in insects' feeding behavior. A convenient method that will be useful for research on insects' saliva with piercing-sucking feeding behavior is described here. In this method, insects were allowed to feed on an artificial diet sandwiched between two stretched paraffin film layers. The diet containing the saliva was collected each day, filtered, and concentrated for further analysis. Finally, the quality of collected saliva was examined by protein staining and immunoblotting. This method was exemplified by detecting the presence of RSV and a mucin-like protein in the saliva of SBPH. These artificial feeding and saliva collection method will lay a foundation for further research on factors in insect saliva related to feeding behavior and virus transmission.

Two-layered Membrane Sandwich Method for Laodelphax striatellus Saliva Collection

The present protocol describes a method to collect sufficient saliva from piercing-sucking insects using an artificial medium. This is a convenient method for collecting insect saliva and studying salivary function on insect feeding behavior and vector-borne virus transmission.