This work was supported by the European research council by a ERC starting/consolidator grant to RC and by the Dutch Foundation for research on matter (FOM) via a FOM program (10TM01).

시금치 잎에서 1 전체 안료 추출 <ol><li> 저온 분쇄 완충액 100ml에 시금치 잎 (~ 20g) 중 하나 소수 20 초 동안 균질화 믹서를 사용하여 (표 1 참조). </li><li> 4 ℃에서 10 분 동안 1,500 XG에 20 μm의 원심 여과 공경 나일론 헝겊이 층을 통해 용액을 필터. </li><li> 소프트 아티스트 엽록체를 포함하는 펠릿을 냉 세척 완충액 1 ㎖에 재현 탁 페인트 브러시 (표 1 참조). 펠릿을 재현 탁되면, 4 ℃에서 10 분 동안 10,000 XG에 세척 버퍼와 원심 분리기 50 ㎖ 솔루션을 추가합니다. </li><li> 세척 완충액 50 ㎖ 중의 펠릿 (틸라코이드)를 부드럽게 재현 탁 상등액을 제거하고 (표 1 참조). </li><li> 4 ° C에서 10 분 동안 10,000 XG에 솔루션을 원심 분리기 완전히 뜨는을 제거합니다. 이 시점에서, 안료 산화를 피하기 위하여, 어둠 속에서 다음 단계를 수행한다. </리&gt; <li> 나 2 CO 3와 버퍼링 80 % 아세톤 20 ㎖가 색소를 추출하는 (표 1 참조)에 추가 ~. 가끔 텍싱, 10 분 동안 얼음에 솔루션을 둡니다. </li><li> 4 ° C에서 15 분 동안 12,000 XG에서 원심 분리하여 세포 성분 펠렛. NOTE : 안료가 완전히 추출하지 않는 경우, 펠릿은 녹색 컬러가 1.6이 반복되어야 넘어 간다. </li><li> 분리 깔때기에 상층 액을 수집합니다. , 디 에틸 에테르의 0.4 볼륨을 추가 흔들어 및 가스를 배출하는 밸브를 엽니 다. </li><li> 0.33 M의 NaCl 0.8 볼륨을 추가하고 적극적으로 섞는다. 층을 분리하기위한 ~ 10 분을 허용합니다. 상단에있는 에테르 단계는 추출 된 안료가 포함되어 있습니다. 맑은 낮은 단계를 제거합니다. NOTE : 분리가 명확하지 않은 경우, 고정 및 상분리를 개선하기위한 해결책을 해동. </li><li> 적당한 유리 용기에 분리 깔때기의 위로부터 부어 에테르를 제거합니다. 할머니 한 숟가락을 추가하여 드라이신경근 무수 황산나트륨. 용액을 소용돌이 에테르로부터 수분을 흡수하는 건조제를 위해 ~ 5 분을 허용한다. 참고 : 황산 나트륨이 완전히 뭉쳐 나타나는 경우이 단계를 반복; 에테르가 충분히 건조 될 때 약간의 자유 부동의 결정이 있어야합니다. 수층을 형성하는 경우, 추가로 황산나트륨 무수물을 첨가하기 전에 파스퇴르 피펫으로이를 제거한다. </li><li> 뒤에 황산나트륨 고체 떠나 새로운 유리 용기에 에테르를 경사 분리한다. </li><li> 로터리를 Speedvac 또는 N 2 기류하에 에테르를 증발시키고. </li><li> 100 % 아세톤 10ml에 완전히 녹이고, 안료. </li><li> 80 % 아세톤 1 ㎖ 중에 소량 (~ 3 μL)으로 희석하고 흡수 스펙트럼을 측정하고 으악 등에 의해 기재된 방법에 엽록소 a / b를 비와 엽록소 농도를 결정한다. (1989) 15. </li><li> 아세톤 때까지 분취 액을 로터리를 Speedvac 또는 N 2 흐름하에 건조 안료완전히 증발. -80 ° C에서 건조 된 안료를 저장합니다. </li></ol> 시금치의 카로티노이드의 2 추출 <ol><li> 단계 1.5로 1.1을 따르십시오. 이 시점에서, 안료 산화를 피하기 위하여, 어둠 속에서 다음 단계를 수행한다. </li><li> 안료를 추출 나 2 CO 3 (표 1 참조)로 버퍼링 ~ 50 ㎖의 96 % 에탄올에서 틸라코이드 펠렛을 재현 탁. 5 분 동안 얼음에 솔루션을 둡니다. </li><li> 4 ° C에서 15 분 동안 12,000 XG에서 원심 분리하여 세포 성분 펠렛. NOTE : 안료가 완전히 추출하지 않는 경우, 펠릿은 녹색 컬러가 2.2이 반복되어야 넘어 간다. </li><li> 상층 액을 수집하고 (/ V w) 비누화을 시작하는 80 % KOH의 0.1 볼륨을 추가합니다. </li><li> 4 ° CO / N에 솔루션을 남겨 단단히 뚜껑을 닫고 빛으로부터 보호. </li><li> 분리 깔때기에 솔루션을 수집합니다. 디 에틸 에테르의 1 볼륨을 추가하고 부드럽게 섞는다. </li><li> 0.8 권 추가0.33 M의 NaCl을 메와 부드럽게 섞는다. 층을 분리하기위한 ~ 10 분을 허용합니다. 상단에 오렌지 에테르 단계는 비누화 된 카로티노이드가 포함되어 있습니다. 깔때기의 콕을 통해 배출하여 녹색 낮은 단계를 제거합니다. </li><li> 물 3 볼륨을 추가하고 수산화 칼륨을 제거하기 위해 부드럽게 섞는다. 층이 분리 할 수​​ 있습니다. NOTE : 상부 위상 흐린 나타나면 NaCl을 소량의 추가 (예 3 용액 200 ㎖의 염화나트륨 g) 및 부드럽게 소용돌이 용해. </li><li> 깔때기의 콕을 통해 배출하여 낮은 단계를 제거합니다. </li><li> 팔로우은 1.13에 1.10 단계를 반복합니다. </li><li> 80 % 아세톤 1 ㎖ 중에 소량 (~ 3 μL)을 희석하고 80 % 아세톤 440 nm에서 흡수 스펙트럼을 측정한다. 농도를 측정하기 위해, 카로티노이드의 평균 계수 멸종을 사용하여 다음과 같은 식 (16) (440 = 255 ε) : 승용차 [㎎ / ㎖] = (절대 440 나노 미터 / 225) X 11 (광로) = 1cm. </li><li> 나누어지는 및 carotenoi 건조를 Speedvac 또는 일부 디 에틸 에테르 때까지 N이 스트림에서 DS는 증발되고있다. -80 ° C에서 건조 된 안료를 저장합니다. </li></ol> 클라 미도 모나스에서 3 전체 안료 및 카로 티 노이드 추출 reinhardtii를 <ol><li> C. 성장 표면에 액체 배양의 작은 금액을 확산하여 배양 접시에 고체 TAP 매체 17 reinhardtii에서. 20 μmol의 사진 PSA의 m -2 초 연속 조명 속에서 성장 -1 세포의 녹색 층이 보일 때까지. </li><li> 무균 접종 루프를 사용하면, C. 소량 수확 고체 TAP 매체로부터 reinhardtii를하고 1 L 플라스크에 TAP 매체 (17)의 500 ML에 세포를 넣어. 20 μmol의 사진 PSA의 m -2 sec의 연속 조명 속에서 170 rpm에서 교반과 함께 25 ° C에서 문화를 성장 -1. </li><li> 5-6일 후, 배양은 대수 위상의 단부에 도달한다 (6 × 106 세포 / ㎖또는 750 nm에서 2-2.5 광학 밀도). 4 ° C에서 15 분 동안 4,000 XG에 문화를 원심 분리기. </li><li> 총 색소 추출의 경우, 단계 1.15에 1.6을 따릅니다. </li><li> C.의 전체 성장 배양 500ml의 전체 안료에서 시작 추출물의 수율 reinhardtii를는 + B / ㎖ 0.5 밀리그램 CHL의 농도와 용액의 약 5 ㎖이다. </li><li> 카로티노이드 추출의 경우, 단계 2.12에 2.2을 따릅니다. </li></ol> 봉입체의 4 정제 <ol><li> 표준 분자 생물학 방법을 사용하여 융합 된 C-말단 태그 그의 결과 발현 벡터에 관심 LHC 단백질의 코딩 서열을 복제. E.으로이 구조를 변환 같은 BL21 (DE3)와 같은 호스트 대장균 균주. </li><li> 준비 용해 완충액 세제 버퍼 트리톤 버퍼, TE (표 1), 1 M 이소 프로필 β-D-1-티오 갈 락토 피 라노 시드 (IPTG)과 적절한 항생제 LB 배지 18. </li><li> 자장 선택전자 E. 표준 절차 (6)를 사용하여 적절한 항생제 LB 배지 ~ 5 ㎖ 중에 갓 스트리킹 플레이트에서 발현 클론을 함유하는 대장균 콜로니. 적어도 16 시간 동안 220 rpm으로 교반과 함께 37 ° C에서 성장. </li><li> O의 2.5 ML을 추가 / 적절한 항생제로 보충 LB 250 ㎖와 1 L 삼각 플라스크에 넣고 N 문화. </li><li> 2 ~ 3 시간 동안 세포를 성장 220 rpm에서 37 ° C에서 (또는 OD 때까지 600 ~ 0.6)입니다. </li><li> 최종 농도 1mM IPTG 추가. 220 rpm으로 3 ~ 4 시간에 37 ° C에서 세포 성장을 계속합니다. </li><li> 미리 무게를 원심 분리 관에 4 ° C에서 5,000 XG에 10 분 동안 문화를 원심 분리기. 철저하게 뜨는을 취소하고 다시 무게와 원심 분리기 튜브의 무게를 뺀 무게에게 펠렛을 결정합니다. </li><li> E.을 재현 탁 0.8 ㎖ / 격렬하게 볼 텍싱에 의한 용해 완충액 g에서 대장균 세포 펠렛. NOTE : 대안 적으로, 세포 펠릿을 -80에서 냉동 될 수있다나중에 사용하기 위해 C. 동결 된 펠릿을 시작하는 경우, 용해 버퍼를 첨가하기 전에 완전 해동 할 수있다. </li><li> 세포의 g 당 라이소자임의 2 mg을 추가하고, 30 분 동안 가끔 소용돌이로 교반 젖은 얼음에 품어. </li><li> 20 μg / ml의 DNase를, 10 mM의 MgCl2를, 1 ㎜의 NaCl, 20 μg / ml의 RNAse가를 추가합니다. 소용돌이와 30 분 동안 얼음에 넣어. </li><li> 세포의 g 당 차가운 세제 버퍼의 두 ML을 추가합니다. 잘 혼합하고 5 분 동안 RT를 유지합니다. </li><li> 2 ㎖의 원심 분리기 튜브에 전송 (필요한 경우이 튜브로 분할). 4 ° C에서 12,000 XG에 10 분 동안 원심 분리기는 봉입체 펠렛. </li><li> 버퍼 차가운 트리톤의 1 mL를 넣고 완전히 음파에 의해 펠렛을 (20 초 간격으로 3 펄스 × 5 초 × 50 % 전력) 재현 탁. 참고 : 음파 동안 감기를 유지하기 위해 얼음 물에 둘러싸인 작은 비커에 튜브를하게한다. 다수의 튜브의 경우에는, 재 부유 한 후 튜브로 재현 탁 봉입체를 결합한다. </li><li> 12,000에서 10 분 동안 원심 분리기4 ° C에서 XG는 봉입체 펠렛. </li><li> 단계를 반복 4.13과 4.14 두 번. </li><li> 트리톤 버퍼를 제거하기위한 최종 세척 음파 감기 TE 1 ㎖에서 봉입체를 재현 탁. 4 ° C에서 12,000 XG에 10 분 동안 원심 분리기는 봉입체 펠렛. </li><li> 음파에 의한 냉간 TE 1 ㎖에 펠렛을 재현 탁. </li><li> 이러한 브래드 포드 분석법 (19)과 같은 표준 방법에 의해 단백질 농도를 평가한다. -20 ° C에서 봉입체의 저장 분취. </li></ol> (5)의 재구성 흡광도 QY 영역 (600-750 nm의)에서 측정 할 때이 프로토콜은 일반적으로 4 OD으로 재구성 단백질의 1-2 ML을 얻을 수 있습니다. 치료는 절차 중에 적절한 비율을 유지하기 위해 취해 져야한다하더라도 수량은 원하는대로 조정될 수있다. <ol><li> 배의 재구성 버퍼, 20 % OG, 2 M의 KCl, TE : 표 1에 설명 된대로 다음과 같은 솔루션을 준비합니다. 다음의를 수행희미한 빛 TEPS. </li><li> 2 ml의 미세 원심 분리 튜브에 400 ㎕의 TE의 총 LHC 봉입체의 800 μg을 재​​현 탁. 배의 재구성 버퍼와 소용돌이 짧게의 400 μl를 추가합니다. </li><li> 10 mm의 최종 농도를 가지고 β-메르 캅토 에탄올 (주 14.8 M)의 0.6 μl를 추가합니다. 98 ° C에서 1 분 동안 단백질을 가열. 3 분 동안 실온에서 소용돌이 짧게 장소. </li><li> 적극적으로 1 ~ 2 분 동안 목욕 초음파 분쇄기에 1 분 또는 장소를 텍싱 30 ㎕의 100 % EtOH로 총 건조 엽록소 안료의 500 μg 플러스 80 μg 카로티노이드 색소를 재현 탁. </li><li> 4 ° C에서 15,800 XG에서 ~ 30 초 안료 혼합 스핀 더 펠릿이 없음을 확인합니다. 펠릿이 있으면 텍싱 및 / 또는 초음파 처리를 반복한다. 중요 : 재 부유 스핀 후 즉시 단백질에 안료를 추가하거나 통합 할 수 있으며, 다시 재현 탁해야합니다. </li><li> 텍싱하면서 천천히 냉각 단백질 안료 믹스를 추가합니다. 소용돌이 5-10의 계속젖은 얼음에 EC와 장소 튜브. 단백질이 튜브의 상단을 오버 플로우 수도 적극적으로 와동하지 않도록주의하십시오. </li><li> 20 % 옥틸 β-D-글루 코피 라노 시드 (OG) (최종 농도 2 %), 소용돌이 짧게의 94 μl를 추가하고 얼음 10 분 계속. </li><li> 잠깐의 KCl이 M (최종 농도 150 ~ 200 밀리미터), 소용돌이의 90 μl를 추가하고 얼음 20 분 계속. 참고 : 열 준비 (6 절)는이 시간에 시작할 수 있습니다. </li><li> 4 ° C에서 15,800 XG에 10 분 동안 스핀. 10 ML 튜브에 (LDS 침전) 펠렛을 방해하지 않고 뜨는을 제거합니다. 추위와 빛으로부터 보호하십시오. </li></ol> (6) 니켈 열 정화 <ol><li> OG 버퍼, OG 린스 버퍼, 용출 버퍼 : 표 1에 설명 된대로 다음과 같은 솔루션을 준비합니다. </li><li> 공기는이 단계와 다음 단계에서 열 내부로 들어갈 없다는 것을 보장 연동 펌프에 니켈 - 세파 로즈 컬럼 (1 ㎖) 또는 이와 동등한를 연결합니다. </li><li> t의 속도를 설정그는 1 ml / 분으로 펌핑 및 저장 용액을 제거하기 위해 물 5-10 ml의 컬럼을 헹군다. </li><li> OG 버퍼의 3 ~ 4 mL를 열 평형. </li><li> 컬럼에 단백질 시료와 부하에 OG 버퍼의 3-4 ML을 추가합니다. 참고 : 단백질이 LDS 제거 후 이상 10 분 동안 얼음에 앉아 한 경우 1 분 추가 LDS 침전을 제거하기 위해, 4 ° C에서 15,800 XG에 다시 회전. </li><li> OG 버퍼 5 ㎖로 컬럼을 씻어. </li><li> OG 린스 버퍼의 두 ㎖로 컬럼을 씻어. </li><li> 3 ㎖의 용출 완충액으로 단백질을 용출 바인딩. 재구성 된 단백질을 포함하는 녹색 용출를 수집합니다. 참고 :이 일반적으로 총 약 1 ML입니다. </li></ol> 7 자당 기울기 원심 분리 <ol><li> 자당 용액, 0.06 %의 β-DM, 0.01 M HEPES, pH가 7.6 표 1에 설명 된대로 다음과 같은 솔루션을 준비합니다. </li><li> -20 ° CO / N 오에서 자당 용액 및 동결로 초 원심 분리기 튜브 채우기R -80 ° C에 대해 적어도 1 시간. </li><li> 냉장고에서 튜브를 제거하고 4 ° C에서 방해받지 않고 해동 할 수 있습니다. 참고 : 동결 / 해동 과정은 0.1 ~ 1 M 자당에 그라데이션을 만듭니다. 15 ML 튜브는 일반적으로 약 3 시간에 해동. </li><li> 조심스럽게 상단에서 단계 6.8에서 니켈 세파 로즈 컬럼에서 용출 녹색 부분과 동일한 볼륨을 제거합니다. 그런 다음 그라데이션을 방해하지 않도록 천천히 위쪽에 재구성 된 샘플을로드합니다. </li><li> 가속 및 브레이크없이 중지를 느리게 설정 18 시간 동안 SW-41 SW-60 스​​윙 버킷 로터를 사용하여 초 원심 분리기의 균형 튜브와 4 ° C에서 200,000 XG에 스핀. </li><li> 조심스럽게 집게로 튜브 홀더에서 구배를 꺼내. 상단에서 분획을 수집하는 무딘 개구가 긴 바늘과 주사기를 사용한다. 참고 : 다른 방법으로, 바늘로 튜브를 관통하고 방울을 수집하여 바닥에서 분수를 수집합니다. </li></ol>

The authors declare no conflict of interest

막 단백질은 공부를 너무 쉽게하지 않습니다. 기본 막 단백질의 분리는 단백질에 손상을 필수 보조 인자를 제거 할 수있는 세제와 지질 이중층을 가용화 할 필요성에 의해 복잡해진다. 이 단백질은 또한 생물학적 막에서 낮은 수준으로 존재할 수있는, 또는 하나의 어려운 착물 정제를 만든다 광 수확 복합체의 경우에서와 같이, 밀접하게 관련된 단백질과 혼합 될 수있다. E.에서 이종 단백질 발현 대장균 및 체외 재구성에 이러한 문제를 회피 할 수있는 가능성을 제공한다. 체외 균질성 (24)에 정제 할 수없는 복합체를 연구하기 위해 사용될 수있다 네이티브 착체 20,21,23 따라서의 것과 매우 유사한 특성을 가지고 착체의 재구성 및 접힌 단백질 결과 정화용 - 27. 이 방법은 attainab 쉽게이다 시금치를 사용총 안료 및 카로티노이드 준비를위한 소스로 제작 : 일년 내내. 조류 네이티브 단백질의 일부​​ reconstitutions 들어, 해조류로부터 정제 안료의 사용으로 인해 상이한 안료 조성물에 바람직하다. 엽록소 a / b를 비와 엽록소 / 차 안료 비율에 관계없이 소스 동일하게 남아있다. 그것은 재구성의 효율은 일반적으로 약 35 % 28 것을 깨닫는 것이 중요하다. 그러므로 그것은 재구성 후의 용액으로부터 비 바운드 안료 펼친 아포 단백질을 제거 할 필요가있다. 두 단계의 정제 프로토콜 (또한 결과 참조)이 프로토콜에 제시되어있다. 그러나 자당 구배 단계 apo- 및 홀로 - 단백질의 완전한 분리를 허용하지 않는다는 것을 주목해야한다. 아포 단백질을 측정 기능을 방해하지 않는, 따라서 안료를 함유하지 않으며, 대부분의 경우 이러한 분석은 문제가되지 않는다. 그러나, 케이스에 완전히 FR에서 아포 단백질을 제거 할 필요가있다재구성 된 복합체를 (예를 들어, 단백질의 화학 양론에 안료를 계산하기 위해) 함유 액션, 음이온 교환 칼럼 (참고 Passarini 외. 자세한 2009 29)이 사용될 수있다. 용량은 시험 관내에서 격리 안료 재조합 광 수확 단백질 접힘하기 때문에 생성 된 복합체의 특성을 변경하는 다양한 방법으로 재구성 &quot;환경&quot;을 변경하여 복합체를 &quot;조작&quot;할 기회를 제공한다. 예를 들어, 재구성시 안료 조성물을 변경하면 변경된 안료 조성물과 복합 될 수있다. 이 기능은 다양한 안료 복합체의 구조 및 안정성에 미치는 영향을 연구하기 위해 이용 될 수있다. 1과 2.9의 엽록소 / 차 비율 : 보통 시금치에서 얻어진 안료 (3)의 준비는 엽록소 A / B의 비율이 1. 이 비율은 일반적으로 N과 동일한 특성을 갖는 재구성 된 단백질을 생산하나를 극상. 33 - 그러나 정제하여 엽록소의 A 또는 B의 첨가에 의해 엽록소 A / B 비의 조정은 결합 부위 (30)의 선택도를 변화로 인해 다른 안료의 결합에 영향을 미칠 수있다. 안료 결합 부위의 대부분은 엽록소의 엽록소 또는 B에 대한 선택적 완전히 아니지만, 모두를 수용 할 수 있기 때문에, 가능하지만 서로 다른 친 화성으로 10,30,34. 38 - 유사한 방식으로, 카로티노이드 결합 부위는 하나 이상의 종 8,35 크 산토 필을 수용 할 수 있도록 도시 하였다. CP26, 각종 안료 조성물을 사용 고등 식물, 다른 안료 - 단백질 복합체의 다른 reconstitutions 39은 표 2에 나타낸다. reconstitutions 선택된 특정 안료 (39)에 대한 결합 부위의 친화도를 평가하기 위해 사용되었다. 그것은 동일한 안료와 C 복합체를 얻기 위해 그 흥미 롭다1 : 기본 하나 omposition는 안료 혼합의 엽록소 a / b를 비는 3이어야합니다. 이 고등 식물 20,40 모든 LHC 착물에 대한 경우 일 것 같다. 재구성 기술과 분자 생물학의 조합은 엽록소 결합 복합체의 특성을 더 자세히 연구 할 수 있습니다. 44 - 착물, 또는 단백질 - 단백질 상호 작용에 관여 그들의 안정성 및 접힘에 다른 단백질 도메인의 중요성은, 아포 단백질을 절단 또는 랜덤 돌연변이 유발 8,41보기를 수행하여 결정 하였다. 52 - 다른 안료의 코디에 중요한 단일 아미노산 잔기 개별 안료의 특성을 분석하거나 복잡한 10,28,29,45의 기능과 안정성에 대한 그들의 기여를 평가하기 위해 부위 특이 적 변이를 통해 변경 될 수있다. 그림 6은 함께 Lhcb4 (CP29)를 재구성위치 (216) (53)에서 히스티딘의 돌연변이. 야생형과 돌연변이 착체의 안료 조성물의 비교 돌연변이 표적 사이트 WT 복잡 엽록소의 수용을 나타내는, 분자 하나 엽록소의 손실을 유도하는 것을 나타낸다. WT 및 돌연변이의 흡수 스펙트럼의 차이는, 안료 함량에 따라 정규화, 또한 분실 된 안료의 흡수 특성을 나타낸다. 이 경우, 차이는 엽록소 His216에 의해 조정이 파장에서 흡수 (이 돌연변이에 대한 자세한 내용 및 분광 특성이 Mozzo 등. 2,008 53 참조)을 나타내는, 680 nm에서 주 피크에서 볼 수 있습니다. 돌연변이 분석은 또한 안료 (54)의 광학적 특성에 대한 환경의 영향을 결정하기 위해 사용될 수있다. 결론적으로, 광 수확 단백질 용이 안료 PROTEI 결과 시험 관내에서 재구성 될 수있다네이티브 단지와 매우 유사한 특성을 갖는 n 개의 단지. 또한 추가 연구에 대한 높은 수율 및 순도 단백질 준비를 제공하면서 이러한 방법으로, 기본 단백질을 분리하는 어려움이 제거된다. (3)의 중요성 : 정통 복합체의 제조 1 엽록소 A / B 비를 강조하고, 재구성 된 야생형 및 돌연변이 LHCs의 예는 기술의 애플리케이션을 예시하기 위해 제공된다.

식물과 조류의 광합성 장치는 세포막 (CHL) 엽록소를 결합 단백질, B (CHL의 b) 및 카로티노이드 (자동차)를 포함한다. 이러한 안료 단백질 복합체 수확 빛 에너지가 2 전하 분리를 촉진하기 위해 사용되는 반응 중심에 그 여기 에너지를 전송하는 활성이다. 그들은 또한 높은 광 손상 3,4에서 광합성기구를 보호 규제 피드백 메커니즘에 참여하고 있습니다. 광 수확 복합체 (LHCs)는 식물과 조류 5에 관련된 단백질의 큰 가족으로 구성되어있다. 가족의 각 구성원의 균일 한 정제 단지의 매우 유사한 화학적 및 물리적 특성에 의해 복잡하게되었습니다. 또한, 정제 절차는 종종 그러한 지질 등의 안료 또는 기타 보조 인자의 잠재적 인 손실이 발생할. 관내 재구성을 represenTS 강력한 방법은 이러한 문제점을 극복한다. 광계 II (LHC-II)와 관련된 LHC는 첫째 연구진은 식물 엽록체 별도로 delipidated 단백질과 색소를 추출 하였다. 1,987 일에 Plumley 슈미트에 의해 시험관 내에서 재구성 한 후 리튬의 존재 안료 열 변성 단백질을 결합했다 동결 융해 하나의 3주기 다음 도데 실 황산염 (LDS). 그들은 재구성 된 LHC 단지의 분광 특성은 식물에서 정제 단지와 매우 유사한 것으로 나타났다. 미생물에서 정제 된 복합체를 분리의 어려움과 함께 (때문에) 고유의 자기 조립 (self-assembly) 기능에 LHC 색소 단백질 복합체 가능성을 재구성의 용이성, 다른 연구자에 의한 방법의 빠른 채택되었다. 대장균 (E. 콜라이)에서 과발현 광합성 단백질의 재구성은 1990 년 6 폴슨과 동료들에 의해 달성되었다. E. 투표대장균 과발현 막 단백질은 전형적으로, 봉입체에 포함되는 기능들이 정제. 재구성은 단백질 폴딩을 개시 안료 첨가하여 LDS의 존재하에 포함하는 재조합 단백질을 봉입체의 열 변성을 통해 달성된다. LHCII 착체 접이식 두 단계 프로세스이다 : 첫째, 엽록소가 1 분 미만에 바인딩; 둘째, 엽록소 B는 몇 분 동안 7 바운드 및 안정화된다. 폴딩의 동력학에 대한 통찰력을 제공 할뿐만 아니라, 부위 특이 적 변이와 결합 관내 재구성 특정 아미노산의 안정성에 중요한 아미노산 (예를 들면, 8,9) 또는 안료 조정의 식별을 허용하고있다 (예를 들어, 10). 이러한 안료 조성물 또는 세제 등의 파라미터를 조절함으로써 리 폴딩 조건의 조작도 비판적 요소를 식별 한같은 LHCII 컴플렉스의 크 산토 필의 요구 사항으로 적절한 폴딩에 대한 리터 (예를 들어, 1,11). 또한, 상기 복합체에 결합 된 개별 안료의 특성의 조사는 생체 내에서 재구성 된 복합체를 사용하는 것이 가능하고있다 (예를 들어, 10). 여기에 설명 된 방법은 안료의 분리 (엽록소와 카로티노이드) 시금치에서와 녹조류 인 Chlamydomonas reinhardtii를 시작합니다. E.에서 LHC 단백질의 발현 및 정제를 봉입체의 형태로 대장균이어서 니켈 친 화성 칼럼에 의해 LHC의 재구성 및 후속 정제 한 후, 상술된다. 최종 단계에서, 상기 재구성 된 착체는 자유 염료 및 펼친 아포 단백질을 제거 할 수 크로스 구배 원심 분리에 의해 정제된다. 이 프로토콜을 통해 서로 다른 실험실에서 도입 된 몇 가지 수정 사항을 통합 최적화 된 절차를 나타냅니다시간 1,6,10,12 -14.

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			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Nylon cloth&#160;</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>20 &#956;m pores</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Soft artists paint brush&#160;</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">NONIDET P-40</td>
			<td style="width:115px;">Sigma</td>
			<td>74385</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Beta-DM</td>
			<td style="width:115px;">Sigma</td>
			<td>D4641</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">DNAase</td>
			<td style="width:115px;">ThermoScientific</td>
			<td>EN0525</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Milk Powders</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">RNAase</td>
			<td style="width:115px;">ThermoScientific</td>
			<td>EN0531</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Sonicator</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Octyl &#946;-D-glucopyranoside</td>
			<td style="width:115px;">Sigma</td>
			<td>O8001&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Ultracentrifuge XL</td>
			<td style="width:115px;">Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">TAP medium</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>see reference 17</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">LB medium</td>
			<td style="width:115px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td>see reference 19</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

in vitro reconstitution of light-harvesting complexes of plants and green algae

식물과 녹조류에서, 빛은 빛 수확 단지 (LHCs), 엽록소와 카로티노이드 좌표 세포막 단백질의 가족에 의해 캡처됩니다. 생체가,이 단백질이 틸라코이드 막에 삽입 복합체를 형성하는 안료로 접혀 엽록체의. 이들이 쉽게 분리 중에 안료를 잃을 수 있다는 사실과 가족의 구성원의 화학적 및 물리적 특성에 높은 유사성은, 기본 상태에서의 정제 도전한다. LHCs의 균질 한 제제를 얻는 다른 방법은 (는) 고유의 것과 매우 유사한 성질을 갖는 복합체의 결과 정제 된 안료 및 펼친 apoproteins에서부터 시험 관내에서 이러한 복합체를 재구성 할 수있다였다 보여준 1987 1 Plumley과 슈미트에 의해 개발되었다 단지. 이것은 생체 외 박테리아 발현 용 재조합 단백질의 사용 방법을 연 </em&gt; 재구성. 재구성 방법은 여러 가지 이유로 강력하다 : (1) 개인 착체의 순수한 제제가 얻어 질 수있다, (2) 안료 조성물은 구조와 기능에 대한 기여를 평가하기 위해 제어 될 수있다, (3) 재조합 단백질의 기능을 연구하기 위해 돌연변이 될 수있다 개개의 잔기 (예를 들어, 색소 결합 부위) 또는 단백질 도메인 (예를 들어, 단백질 - 단백질 상호 작용, 접이식)의 역할. 이 방법은 여러 실험실에서 최적화 광 수확 복합체의 대부분에 적용되어왔다. 여기에 설명 된 프로토콜은, 현재 우리 실험실에서 사용되는 시험 관내 광 수확 복합체를 재구성하는 방법을 자세히 상기 방법의 적용을 설명하는 예가 제공된다.

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In Vitro Reconstitution of Light-harvesting Complexes of Plants and Green Algae

This protocol details the reconstitution of light-harvesting complexes in vitro. These integral membrane proteins coordinate chlorophylls and carotenoids and are responsible for harvesting light in higher plants and green algae.

식물과 녹조류의 빛 수확 단지의 체외의 재구성에

In plants and green algae, light is captured by the light-harvesting complexes (LHCs), a family of integral membrane proteins that coordinate chlorophylls ...

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Research

JoVE Journal

Biology

In Vitro Reconstitution of Light-harvesting Complexes of Plants and Green Algae

18.1K 조회수.  VU University Amsterdam. This protocol details the reconstitution of light-harvesting complexes in vitro. These integral membrane proteins coordinate chlorophylls and carotenoids and are responsible for harvesting light in higher plants and green algae.

비디오: In Vitro Reconstitution of Light-harvesting Complexes of Plants and Green Algae

Biochemical Reconstitution of Steroid Receptor&#x2022;Hsp90 Protein  Complexes and Reactivation of Ligand Binding

Hsp90 is an essential and highly abundant molecular chaperone protein that has been found to regulate more than 150 eukaryotic signaling proteins, including transcription factors (e.g. nuclear receptors, p53) and protein kinases (e.g. Src, Raf, Akt kinase) involved in cell cycling, tumorigenesis, apoptosis, and multiple eukaryotic signaling pathways 1,2. Of these many 'client' proteins for hsp90, the assembly of steroid receptor&bull;hsp90 complexes is the best defined (Figure 1). We present here an adaptable glucocorticoid receptor (GR) immunoprecipitation assay and in vitro GR&bull;hsp90 reconstitution method that may be readily used to probe eukaryotic hsp90 functional activity, hsp90-mediated steroid receptor ligand binding, and molecular chaperone cofactor requirements. For example, this assay can be used to test hsp90 cofactor requirements and the effects of adding exogenous compounds to the reconstitution process. 
The GR has been a particularly useful system for studying hsp90 because the receptor must be bound to hsp90 to have an open ligand binding cleft that is accessible to steroid 3. Endogenous, unliganded GR is present in the cytoplasm of mammalian cells noncovalently bound to hsp90. As found in the endogenous GR&bull;hsp90 heterocomplex, the GR ligand binding cleft is open and capable of binding steroid. If hsp90 dissociates from the GR or if its function is inhibited, the receptor is unable to bind steroid and requires reconstitution of the GR&bull;hsp90 heterocomplex before steroid binding activity is restored 4 . GR can be immunoprecipitated from cell cytosol using a monoclonal antibody, and proteins such as hsp90 complexed to the GR can be assayed by western blot. Steroid binding activity of the immunoprecipitated GR can be determined by incubating the immunopellet with [3H]steroid. 
Previous experiments have shown hsp90-mediated opening of the GR ligand binding cleft requires hsp70, a second molecular chaperone also essential for eukaryotic cell viability. Biochemical activity of hsp90 and hsp70 are catalyzed by co-chaperone proteins Hop, hsp40, and p23 5. A multiprotein chaperone machinery containing hsp90, hsp70, Hop, and hsp40 are endogenously present in eukaryotic cell cytoplasm, and reticulocyte lysate provides a chaperone-rich protein source 6. 
In the method presented, GR is immunoadsorbed from cell cytosol and stripped of the endogenous hsp90/hsp70 chaperone machinery using mild salt conditions. The salt-stripped GR is then incubated with reticulocyte lysate, ATP, and K+, which results in the reconstitution of the GR&bull;hsp90 heterocomplex and reactivation of steroid binding activity 7. This method can be utilized to test the effects of various chaperone cofactors, novel proteins, and experimental hsp90 or GR inhibitors in order to determine their functional significance on hsp90-mediated steroid binding 8-11.

Biochemical Reconstitution of Steroid Receptor&amp;#x2022;Hsp90 Protein  Complexes and Reactivation of Ligand Binding

An in vitro method for preparing functional glucocorticoid receptor (GR)&#x2022;hsp90 protein complexes from purified proteins and cellular lysates is described. The method utilizes immunoadsorption of recombinant GR followed by salt-stripping and protein complex reconstitution. The importance of cofactors and buffer conditions are discussed, as are potential method applications.

스테로이드 수용체의 생화 학적 리간드의 Reconstitution • Hsp90 단백질 단지와 재가입 바인딩

Hsp90 is an essential and highly abundant molecular chaperone protein that has been found to regulate more than 150 eukaryotic signaling proteins, ...

연구

생물학

In Vitro Analysis of PDZ-dependent CFTR Macromolecular Signaling Complexes

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), a chloride channel located primarily at the apical membranes of epithelial cells, plays a crucial role in transepithelial fluid homeostasis1-3. CFTR has been implicated in two major diseases: cystic fibrosis (CF)4 and secretory diarrhea5. In CF, the synthesis or functional activity of the CFTR Cl- channel is reduced. This disorder affects approximately 1 in 2,500 Caucasians in the United States6. Excessive CFTR activity has also been implicated in cases of toxin-induced secretory diarrhea (e.g., by cholera toxin and heat stable E. coli enterotoxin) that stimulates cAMP or cGMP production in the gut7.
Accumulating evidence suggest the existence of physical and functional interactions between CFTR and a growing number of other proteins, including transporters, ion channels, receptors, kinases, phosphatases, signaling molecules, and cytoskeletal elements, and these interactions between CFTR and its binding proteins have been shown to be critically involved in regulating CFTR-mediated transepithelial ion transport in vitro and also in vivo8-19. In this protocol, we focus only on the methods that aid in the study of the interactions between CFTR carboxyl terminal tail, which possesses a protein-binding motif [referred to as PSD95/Dlg1/ZO-1 (PDZ) motif], and a group of scaffold proteins, which contain a specific binding module referred to as PDZ domains. So far, several different PDZ scaffold proteins have been reported to bind to the carboxyl terminal tail of CFTR with various affinities, such as NHERF1, NHERF2, PDZK1, PDZK2, CAL (CFTR-associated ligand), Shank2, and GRASP20-27. The PDZ motif within CFTR that is recognized by PDZ scaffold proteins is the last four amino acids at the C terminus (i.e., 1477-DTRL-1480 in human CFTR)20. Interestingly, CFTR can bind more than one PDZ domain of both NHERFs and PDZK1, albeit with varying affinities22. This multivalency with respect to CFTR binding has been shown to be of functional significance, suggesting that PDZ scaffold proteins may facilitate formation of CFTR macromolecular signaling complexes for specific/selective and efficient signaling in cells16-18.
Multiple biochemical assays have been developed to study CFTR-involving protein interactions, such as co-immunoprecipitation, pull-down assay, pair-wise binding assay, colorimetric pair-wise binding assay, and macromolecular complex assembly assay16-19,28,29. Here we focus on the detailed procedures of assembling a PDZ motif-dependent CFTR-containing macromolecular complex in vitro, which is used extensively by our laboratory to study protein-protein or domain-domain interactions involving CFTR16-19,28,29.

In Vitro Analysis of PDZ-dependent CFTR Macromolecular Signaling Complexes

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), an epithelial chloride channel, has been reported to interact with various proteins and regulate important cellular processes; among them the CFTR PDZ motif-mediated interactions have been well documented. This protocol describes methods we developed to assemble a PDZ-dependent CFTR macromolecular signaling complex in vitro.

PDZ-의존 CFTR의 Macromolecular 신호 단지의 체외 분석

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), a chloride channel located primarily at the apical membranes of epithelial cells, plays a ...

AFM-based Mapping of the Elastic Properties of Cell Walls: at Tissue, Cellular, and Subcellular Resolutions

We describe a recently developed method to measure mechanical properties of the surfaces of plant tissues using atomic force microscopy (AFM) micro/nano-indentations, for a JPK&#160;AFM. Specifically, in this protocol we measure the apparent Young&#8217;s modulus of cell walls at subcellular resolutions across regions of up to 100 &#181;m&#160;x 100 &#181;m in floral meristems, hypocotyls, and roots. This requires careful preparation of the sample, the correct selection of micro-indenters and indentation depths. To account for cell wall properties only, measurements are performed in highly concentrated solutions of mannitol in order to plasmolyze the cells and thus remove the contribution of cell turgor pressure.
In contrast to other extant techniques, by using different indenters and indentation depths, this method allows simultaneous multiscale measurements, i.e. at subcellular resolutions and across hundreds of cells comprising a tissue. This means that it is now possible&#160;to spatially-temporally characterize the changes that take place in the mechanical properties of cell walls during development, enabling these changes to be correlated with growth and differentiation. This represents a key step to understand how coordinated microscopic cellular changes bring about macroscopic morphogenetic events.
However, several limitations remain: the method can only be used on fairly small samples (around 100 &#181;m in diameter) and only on external tissues; the method is sensitive to tissue topography; it measures only certain aspects of the tissue&#8217;s complex mechanical properties. The technique is being developed rapidly and it is likely that most of these limitations will be resolved in the near future.

We describe a method to map mechanical properties of plant tissues using an atomic force microscope (AFM). We focus on how to record mechanical changes that take place in cell walls during plant development at wide-field mesoscale, enabling these changes to be correlated with growth and morphogenesis.

셀 벽의 탄성 특성의 AFM 기반의 매핑 : 조직, 세포 및 세포 이하의 해상도에서

We describe a recently developed method to measure mechanical properties of the surfaces of plant tissues using atomic force microscopy (AFM) ...

Reconstitution Of &#946;-catenin Degradation In Xenopus Egg Extract

Xenopus laevis egg extract is a well-characterized, robust system for studying the biochemistry of diverse cellular processes. Xenopus egg extract has been used to study protein turnover in many cellular contexts, including the cell cycle and signal transduction pathways1-3. Herein, a method is described for isolating Xenopus egg extract that has been optimized to promote the degradation of the critical Wnt pathway component, &beta;-catenin. Two different methods are described to assess &beta;-catenin protein degradation in Xenopus egg extract. One method is visually informative ([35S]-radiolabeled proteins), while the other is more readily scaled for high-throughput assays (firefly luciferase-tagged fusion proteins). The techniques described can be used to, but are not limited to, assess &beta;-catenin protein turnover and identify molecular components contributing to its turnover. Additionally, the ability to purify large volumes of homogenous Xenopus egg extract combined with the quantitative and facile readout of luciferase-tagged proteins allows this system to be easily adapted for high-throughput screening for modulators of &beta;-catenin degradation.

Reconstitution Of &amp;#946;-catenin Degradation In Xenopus Egg Extract

A method is described for analyzing protein degradation using radiolabeled and luciferase-fusion proteins in Xenopus egg extract and its adaptation for high-throughput screening for small molecule modulators of protein degradation.

β-catenin의 저하의 재구성<em&gt; Xenopus의</em&gt; 계란 추출

Xenopus laevis egg extract is a well-characterized, robust system for studying the biochemistry of diverse cellular processes. Xenopus egg extract has ...

Measuring Spatial and Temporal Ca2+ Signals in Arabidopsis Plants

Developmental and environmental cues induce Ca2+ fluctuations in plant cells. Stimulus-specific spatial-temporal Ca2+ patterns are sensed by cellular Ca2+ binding proteins that initiate Ca2+ signaling cascades. However, we still know little about how stimulus specific Ca2+ signals are generated. The specificity of a Ca2+ signal may be attributed to the sophisticated regulation of the activities of Ca2+ channels and/or transporters in response to a given stimulus. To identify these cellular components and understand their functions, it is crucial to use systems that allow a sensitive and robust recording of Ca2+ signals at both the tissue and cellular levels. Genetically encoded Ca2+ indicators that are targeted to different cellular compartments have provided a platform for live cell confocal imaging of cellular Ca2+ signals. Here we describe instructions for the use of two Ca2+ detection systems: aequorin based FAS (film adhesive seedlings) luminescence Ca2+ imaging and case12 based live cell confocal fluorescence Ca2+ imaging. Luminescence imaging using the FAS system provides a simple, robust and sensitive detection of spatial and temporal Ca2+ signals at the tissue level, while live cell confocal imaging using Case12 provides simultaneous detection of cytosolic and nuclear Ca2+ signals at a high resolution.

Measuring Spatial and Temporal Ca2+ Signals in Arabidopsis Plants

Ca2+ signaling regulates diverse biological processes in plants. Here we present approaches for monitoring abiotic stress induced spatial and temporal Ca2+ signals in Arabidopsis cells and tissues using the genetically encoded Ca2+ indicators Aequorin or Case12.

측정 공간적 칼슘<sup&gt; 2 +</sup애기 장대 식물에서&gt; 신호

Developmental and environmental cues induce Ca2+ fluctuations in plant cells. Stimulus-specific spatial-temporal Ca2+ patterns are sensed by cellular Ca2+ ...

Functional Reconstitution and Channel Activity Measurements of Purified Wildtype and Mutant CFTR Protein

The Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) is a unique channel-forming member of the ATP Binding Cassette (ABC) superfamily of transporters. The phosphorylation and nucleotide dependent chloride channel activity of CFTR has been frequently studied in whole cell systems and as single channels in excised membrane patches. Many Cystic Fibrosis-causing mutations have been shown to alter this activity. While a small number of purification protocols have been published, a fast reconstitution method that retains channel activity and a suitable method for studying population channel activity in a purified system have been lacking. Here rapid methods are described for purification and functional reconstitution of the full-length CFTR protein into proteoliposomes of defined lipid composition that retains activity as a regulated halide channel. This reconstitution method together with a novel flux-based assay of channel activity is a suitable system for studying the population channel properties of wild type CFTR and the disease-causing mutants F508del- and G551D-CFTR. Specifically, the method has utility in studying the direct effects of phosphorylation, nucleotides and small molecules such as potentiators and inhibitors on CFTR channel activity. The methods are also amenable to the study of other membrane channels/transporters for anionic substrates.

Described here is a rapid and effective procedure for functional reconstitution of purified wild-type and mutant CFTR protein that preserves activity for this chloride channel, which is defective in Cystic Fibrosis. Iodide efflux from reconstituted proteoliposomes mediated by CFTR allows studies of channel activity and the effects of small molecules.

정제 된 야생형과 돌연변이 체 CFTR 단백질의 기능의 재구성 및 채널 활동 측정

The Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) is a unique channel-forming member of the ATP Binding Cassette (ABC) superfamily of ...

Validation of a Mouse Model to Disrupt LINC Complexes in a Cell-specific Manner

Nuclear migration and anchorage within developing and adult tissues relies heavily upon large macromolecular protein assemblies called LInkers of the Nucleoskeleton and Cytoskeleton (LINC complexes). These protein scaffolds span the nuclear envelope and connect the interior of the nucleus to components of the surrounding cytoplasmic cytoskeleton. LINC complexes consist of two evolutionary-conserved protein families, Sun proteins and Nesprins that harbor C-terminal molecular signature motifs called the SUN and KASH domains, respectively. Sun proteins are transmembrane proteins of the inner nuclear membrane whose N-terminal nucleoplasmic domain interacts with the nuclear lamina while their C-terminal SUN domains protrudes into the perinuclear space and interacts with the KASH domain of Nesprins. Canonical Nesprin isoforms have a variable sized N-terminus that projects into the cytoplasm and interacts with components of the cytoskeleton. This protocol describes the validation of a dominant-negative transgenic mouse strategy that disrupts endogenous SUN/KASH interactions in a cell-type specific manner. Our approach is based on the Cre/Lox system that bypasses many drawbacks such as perinatal lethality and cell nonautonomous phenotypes that are associated with germline models of LINC complex inactivation. For this reason, this model provides a useful tool to understand the role of LINC complexes during development and homeostasis in a wide array of tissues.

Nuclear envelope proteins play a central role in many basic biological processes and have been implicated in a variety of human diseases. This protocol describes a new Cre/Lox-based mouse model that allows for the spatiotemporal control of LINC complexes disruption.

마우스 모델의 유효성 검사는 세포 고유의 방식으로 LINC 단지를 방해

Nuclear migration and anchorage within developing and adult tissues relies heavily upon large macromolecular protein assemblies called LInkers of the ...

Reconstitution of Basic Mitotic Spindles in Spherical Emulsion Droplets

Mitotic spindle assembly, positioning and orientation depend on the combined forces generated by microtubule dynamics, microtubule motor proteins and cross-linkers. Growing microtubules can generate pushing forces, while depolymerizing microtubules can convert the energy from microtubule shrinkage into pulling forces, when attached, for example, to cortical dynein or chromosomes. In addition, motor proteins and diffusible cross-linkers within the spindle contribute to spindle architecture by connecting and sliding anti-parallel microtubules. In vivo, it has proven difficult to unravel the relative contribution of individual players to the overall balance of forces. Here we present the methods that we recently developed in our efforts to reconstitute basic mitotic spindles bottom-up in vitro. Using microfluidic techniques, centrosomes and tubulin are encapsulated in water-in-oil emulsion droplets, leading to the formation of geometrically confined (double) microtubule asters. By additionally introducing cortically anchored dynein, plus-end directed microtubule motors and diffusible cross-linkers, this system is used to reconstitute spindle-like structures. The methods presented here provide a starting point for reconstitution of more complete mitotic spindles, allowing for a detailed study of the contribution of each individual component, and for obtaining an integrated quantitative view of the force-balance within the mitotic spindle.

The assembly and positioning of the mitotic spindle depend on the combined forces generated by microtubule dynamics, motor proteins and cross-linkers. Here we present our recently developed methods in which the geometrical confinement of spherical emulsion droplets is used for the bottom-up reconstitution of basic mitotic spindles.

구형 에멀젼 방울의 기본 유사 분열 스핀들의 재구성

Mitotic spindle assembly, positioning and orientation depend on the combined forces generated by microtubule dynamics, microtubule motor proteins and ...

Establishment of a Clonal Culture of Unicellular Conjugating Algae

It is essential to establish clonal cultures of microalgae for use in studies of various topics, such as physiology, genetics, taxonomy, and microbiology. Thus, it is extremely important to develop techniques to establish clonal cultures. In this article, we demonstrate the establishment of clonal cultures of a conjugating alga. Water samples are collected from the field. Subsequently, cells are isolated using a glass capillary pipette, placed in media, and grown under conditions suitable for generating a clonal culture.

In this article, we demonstrate the establishment of clonal cultures of unicellular conjugating algal species collected from a natural field site.

단 세포 변화 조류의 클론 문화 설립

It is essential to establish clonal cultures of microalgae for use in studies of various topics, such as physiology, genetics, taxonomy, and microbiology. ...

Simultaneous Live Imaging of Multiple Insect Embryos in Sample Chamber-Based Light Sheet Fluorescence Microscopes

Light sheet-based fluorescence microscopy offers efficient solutions to study complex processes on multiple biologically relevant scales. Sample chamber-based setups, which are specifically designed to preserve the three-dimensional integrity of the specimen and usually feature sample rotation, are the best choice in developmental biology. For instance, they have been used to document the entire embryonic morphogenesis of the fruit fly Drosophila melanogaster and the red flour beetle Tribolium castaneum. However, many available live imaging protocols provide only experimental frameworks for single embryos. Especially for comparative studies, such approaches are inconvenient, since sequentially imaged specimens are affected by ambient variance. Further, this limits the number of specimens that can be assayed within a given time. We provide an experimental framework for simultaneous live imaging that increases the throughput in sample chamber-based setups and thus ensures&#160;similar ambient conditions for all specimens. Firstly, we provide a calibration guideline for light sheet fluorescence microscopes. Secondly, we propose a mounting method for multiple embryos that is compatible with sample rotation. Thirdly, we provide exemplary three-dimensional live imaging datasets of Drosophila, for which we juxtapose three transgenic lines with fluorescently labeled nuclei, as well as of Tribolium, for which we compare the performance of three transgenic sublines that carry the same transgene, but at different genomic locations. Our protocol is specifically designed for comparative studies as it pro-actively addresses ambient variance, which is always present in sequential live imaging. This is especially important for quantitative analyses and characterization of aberrational phenotypes, which result e.g., from knockout experiments. Further, it increases the overall throughput, which is highly convenient when access to light sheet&#160;fluorescence microscopes is limited. Finally, the proposed mounting method can be adapted for other insect species and further model organisms, e.g., zebrafish, with basically no optimization effort.

Light sheet-based fluorescence microscopy is the most valuable tool in developmental biology. A major issue in comparative studies is ambient variance. Our protocol describes an experimental framework for simultaneous live imaging of multiple specimens and, therefore, addresses this issue pro-actively.