Tradicionalmente, a cultura celular é realizada em substratos planares que imitam mal o ambiente natural das células in vivo. Aqui descrevemos um método para produzir substratos de cultura celular com geometrias curvas fisiologicamente relevantes e proteínas extracelulares micropatteradas, permitindo investigações sistemáticas sobre o sensoriamento celular dessas pistas extracelulares.
A matriz extracelular é um importante regulador da função celular. As pistas ambientais existentes no microambiente celular, como distribuição de ligantes e geometria tecidual, têm sido cada vez mais demonstradas para desempenhar papéis críticos no fenótipo e comportamento das células governantes. No entanto, essas pistas ambientais e seus efeitos sobre as células são frequentemente estudados separadamente usando plataformas in vitro que isolam pistas individuais, uma estratégia que simplifica fortemente a complexa situação in vivo de múltiplas pistas. Abordagens de engenharia podem ser particularmente úteis para preencher essa lacuna, desenvolvendo configurações experimentais que capturam a complexidade do microambiente in vivo , mas retêm o grau de precisão e manipulabilidade de sistemas in vitro .
Este estudo destaca uma abordagem que combina padronização de proteínas baseadas em ultravioleta (UV) e microfabização de substrato à base de litografia, que, juntas, permitem a investigação de alto rendimento sobre comportamentos celulares em ambientes multicue. Por meio de fotopatterning UV sem máscara, é possível criar distribuições complexas e adesêsivas de proteínas em substratos de cultura celular tridimensional (3D) em chips que contêm uma variedade de pistas geométricas bem definidas. A técnica proposta pode ser empregada para substratos de cultura feitos de diferentes materiais poliméricos e combinados com áreas padronizadas com adesivos de uma ampla gama de proteínas. Com essa abordagem, células únicas, assim como monocamadas, podem ser submetidas a combinações de pistas geométricas e dicas de orientação de contato apresentadas pelos substratos padronizados. Pesquisas sistemáticas usando combinações de materiais de chip, padrões de proteínas e tipos de células podem, assim, fornecer insights fundamentais sobre as respostas celulares a ambientes multicue.
In vivo, as células são submetidas a uma grande variedade de pistas ambientais que podem ser de natureza mecânica, física e bioquímica que se originam da matriz extracelular (ECM). Inúmeras pistas ambientais têm sido identificadas para desempenhar papéis vitais na regulação do comportamento celular, como a proliferação, a diferenciação e a migração 1,2,3,4,5. Um dos fenômenos mais investigados é a orientação de contato, descrevendo o alinhamento celular mediado pela adesão ao longo de padrões bioquímicos ou topográficos anisotrópicos presentes no substrato extracelular 6,7,8,9,10,11. Além de direcionar o alinhamento das células, também foram mostrados sinais de orientação de contato para influenciar outras propriedades celulares, como migração celular, organização de proteínas intracelulares, forma celular e destino celular 12,13,14,15. Além disso, a arquitetura geométrica do ambiente celular 3D também foi reconhecida por sua influência regulatória no comportamento celular16,17. No corpo humano, as células são expostas a uma gama de geometrias curvas, que vão desde fibras de colágeno de microescala, capilares e glomeruli, até alvéolos de mesocala e artérias18,19. Curiosamente, estudos in vitro recentes mostraram que as células podem sentir e responder a tais sinais físicos, da nano-escala 20,21,22,23.
Até o momento, a maioria dos estudos que investigam a resposta celular a sinais ambientais tem sido realizada em grande parte usando configurações experimentais que isolam pistas únicas. Embora essa abordagem tenha permitido um tremendo progresso na compreensão dos mecanismos básicos por trás do sensoriamento celular de pistas ambientais, ela recapitula mal o ambiente in vivo que apresenta simultaneamente múltiplas pistas. Para preencher essa lacuna, é útil desenvolver plataformas culturais pelas quais várias pistas ambientais podem ser controladas de forma independente e simultânea. Esse conceito ganhou tração crescente ultimamente24,25, com estudos que combinam rigidez matricial e densidade de ligantes 26,27,28,29, rigidez de substrato e porosidade30, rigidez do substrato e volume de microniche31, topografia superficial e dicas de orientação de contato 32,33,34 e pistas de orientação de contato nanoescala com as dicas de orientação de curvatura de mesoescala23. No entanto, continua sendo desafiador combinar pistas de orientação de contato com uma variedade de geometrias 3D de forma controlada e de alto rendimento.
Este protocolo de pesquisa aborda esse desafio e introduz um método para criar substratos de cultura celular com uma combinação controlada de áreas adesivas padronizadas de proteínas ECM (pistas de orientação de contato) e curvatura de substrato (pistas geométricas). Essa abordagem permite a dissecção da resposta celular em um ambiente multicue biomimético de forma sistemática e de alto rendimento. O conhecimento adquirido pode auxiliar na compreensão do comportamento celular em ambientes complexos e pode ser usado para projetar materiais instrutivos com propriedades que direcionam as respostas celulares para um desfecho desejado.
Fotopatterning de proteína 3D
A criação de áreas adesivas de proteínas ECM (sinais de orientação de contato) em materiais de cultura celular pode ser realizada utilizando uma variedade de técnicas, por exemplo, por padronização de ultravioleta profunda (deep-UV) ou impressão demicrocontatos 35,36. A padronização profunda-UV faz uso de luz UV que é projetada através de uma máscara em um material polimérico para degradar polímeros de passivação em locais específicos do substrato de cultura celular. O substrato padronizado é então incubado com um ligante de interesse, resultando em áreas adesivas que suportam o apego celular e a cultura em locais predefinidos 12,37,38. Uma maneira alternativa de introduzir padrões proteicos é por meio da impressão de microcontatos, onde selos elastoméricos contendo uma forma desejada são revestidos com uma proteína de escolha e são pressionados em um substrato de cultura celular, transferindo assim o revestimento proteico ao qual as células podem aderir 35,37,39,40 . Infelizmente, uma vez que ambas as técnicas dependem da preparação da máscara e dos métodos de litografia suave, os experimentos são demorados e intensivos em mão-de-obra, bem como limitados em termos de flexibilidade de padrão. Além disso, tanto a padronização UV profunda quanto a impressão de microcontatos são mais adequadas para materiais planares e são tecnicamente difíceis, se não impossíveis, para ligarntes de padronagem em um ambiente 3D.
Para melhorar esses métodos convencionais, Waterkotte et al. combinaram litografia sem máscara, deposição de vapor químico e termoformação para gerar substratos poliméricos 3D micropatterados41. No entanto, essa técnica conta com o uso de filmes de polímeros termoformáveis e oferece baixa resolução de padrão proteico (7,5 μm), enquanto as células têm sido relatadas para responder a padrões de proteínas geométricas tão pequenos quanto 0,1 μm 2,42. Sevcik et al. descreveram outro método promissor para nanopattern ligantes ECM em substratos contendo topografias de nano e micímetro43. Utilizando impressão de microcontato, as proteínas ECM foram transferidas de selos de polidimetilsiloxano (PDMS) para um substrato termoresponsivo de poli(N-isopropylacrylamida) (pNIPAM). Posteriormente, a propriedade termoresponsiva da rede pNIPAM permitiu que transferissem o padrão de proteína bidimensional (2D) para um substrato PDMS topográfico (ranhuras profundas de 10-100 μm), controlando assim a localização de locais de adesão em características topográficas. No entanto, nem todas as microtopografias possíveis podem ser padronizadas, uma vez que problemas de wettability reduzidos tornam mais difícil padronizar substratos topográficos mais profundos. Trincheiras com uma proporção de profundidade para largura de 2,4 foram relatadas como sendo o limite final para transferir com sucesso o padrão para o substrato topográfico43. Além disso, a flexibilidade de padrões variados e a resolução dos padrões gerados são ruins devido à exigência de impressão de microcontatos.
Este artigo descreve um método que supera os gargalos acima mencionados e oferece um método flexível e de alto rendimento para criar substratos multicue que podem ser usados para a cultura celular (ver Figura 1). Geometrias fisiologicamente relevantes (cilindros, cúpulas, elipses e superfícies de sela) com curvaturas que variam de ĸ = 1/2500 a ĸ = 1/125 μm-1 são pré-assinadas e microfabridas em chips PDMS. Posteriormente, as pistas de orientação de contato são criadas em cima das geometrias 3D usando uma variedade de desenhos de padrões digitais, empregando uma técnica de fotopatterning com uma resolução tão pequena quanto 1,5 μm44. Para isso, os chips PDMS são inicialmente passivados para evitar que células e proteínas adunizassem; esta camada de passivação pode então ser removida por combinação do fotoinitiador 4-benzoylbenzyl-trimethylammonium cloreto (PLPP) e exposição à luz UV45. Uma máscara digital foi projetada para especificar os locais de exposição uv e, assim, a área onde a camada de passivação é removida. As proteínas podem posteriormente aderir a essas áreas, permitindo o apego celular. Uma vez que a padronização é realizada usando uma máscara digital (em vez de física), uma variedade de padrões pode ser criada rapidamente sem o incômodo e o custo associado ao desenho e fabricação de fotomasks adicionais. Além disso, uma variedade diversificada de proteínas ECM (por exemplo, colágeno tipo I, gelatina e fibronectina) pode ser padronizada no substrato. Embora este protocolo seja realizado utilizando chips de cultura celular feitos de PDMS, o princípio pode ser aplicado a qualquer outro material de interesse46.
Nos estudos descritos neste protocolo, foram utilizados ceratocitos humanos primários. Esta pesquisa foi realizada em conformidade com os princípios da Declaração de Helsinque. Os ceratocitos primários foram isolados das sobras de tecidos cetroclerales cadavéricos humanos da cirurgia de ceratoplastia endotelial da membrana descemet, que foram obtidos do Departamento de Córnea do Centro Multi-tecido ETB-BISLIFE (Beverwijk, Países Baixos) após obter o consentimento dos parentes mais próximos de todos os doadores falecidos.
NOTA: Consulte a Tabela de Materiais para obter detalhes sobre todos os materiais, reagentes, equipamentos e softwares utilizados neste protocolo.
1. Fabricação de substratos de cultura celular 3D
2. Fabricação de amostras PDMS planas (amostras de controle)
3. Passivação de substratos de substratos de cultura celular 3D
4. Armazenamento de substratos de cultura celular padronizados
NOTA: Substratos de cultura celular 3D podem ser armazenados durante diferentes etapas do processo.
5. Design de máscaras digitais usadas para fotopatterning
NOTA: A padronização de substratos 3D pode ser realizada usando um único ou múltiplos planos focais (ver Figura 3). Um único plano focal pode ser usado em recursos que não são maiores que um dispositivo espelho digital (DMD, aproximadamente 300 μm x 500 μm) e que não são muito altos (50-100 μm). Nesse caso, projete um padrão digital usando o modo TIFF. Para características que excedem as dimensões de um DMD e são relativamente altas, divida a padronização do substrato em múltiplas etapas. Neste caso, vários padrões são projetados usando o modo PDF que todos se concentram individualmente em planos focais únicos.
6. Fotopatterning UV de substratos de cultura celular 3D
7. Incubação de proteínas
NOTA: É aconselhável usar substratos recém-incubados por proteínas para a cultura celular. Só prossiga para esta parte do protocolo se a semeadura celular (etapa 8) for feita diretamente depois.
8. Semeadura celular
NOTA: Este protocolo usa ceratocitos primários humanos e fibroblastos dérmicos humanos. Os ceratocitos foram colhidos a partir de tecido córnea humano de pacientes, em consonância com as diretrizes holandesas para uso secundário de materiais, e anteriormente caracterizados como ceratocitos47. Essas células são cultivadas em DMEM suplementadas com 5% de soro bovino fetal (FBS), 1% penicilina/estreptomicina (P/S) e 1 mM de ácido L-ascórbico 2-fosfato sesagnequimsium hidratado sal (vitamina C) a 37 °C para um máximo de quatro passagens. Os fibroblastos dérmicos humanos foram adquiridos e cultivados no DMEM complementados com 10% de FBS e 1% P/S a 37 °C para um máximo de 15 passagens. Para a semeadura de ceratocitos e fibroblastos dérmicos no chip de cultura celular fotopatterada, foram utilizadas 20.000 células por chip.
9. Coloração, aquisição de imagens e análise
Por meio do protocolo descrito, substratos de cultura celular 3D PDMS podem ser fotopatterados UV para criar áreas adesivas precisas e de alto rendimento adequadas para o apego celular. Desta forma, as células são submetidas a geometrias substrato relevantes e padrões de ligantes adesivos simultaneamente. Propriedades celulares como orientação, área celular e número de aderências focais podem ser facilmente monitoradas e usadas para entender melhor o comportamento celular em ambientes complexos e in vivo.
Para verificar os eventos de padronização nos substratos 3D PDMS, as composições de superfície atômica do material em diferentes estágios do protocolo foram medidas utilizando espectroscopia de fotoeletrões atômicas de raios-X (XPS)48. Em resumo, as medições do XPS mostraram a presença de cadeias de PEG com um aumento do sinal de carbono em amostras passivadas, que foi reduzida após a fotopattersão. A incubação com fibronectina resultou em um aumento do sinal de carbono, indicando novamente a adesão proteica bem sucedida na superfície do chip de cultura celular. Em seguida, a resolução de padrões e o alinhamento em características 3D foram caracterizados em uma variedade de poços côncavas padronizados em círculos (ĸ = 1/250 μm-1, ĸ = 1/1.000 μm-1, e ĸ = 1/3.750 μm-1, ver Figura 6). A partir das projeções de intensidade máxima, pode-se concluir que o padrão proteico foi padronizado com sucesso em todas as três características 3D. O perfil de intensidade na Figura 6A mostra alta resolução de padrão com transições acentuadas entre áreas padronizadas e não padronizadas. Além disso, obteve-se uma intensidade proteica consistente em todo o padrão completo no poço.
O poço côncavo com ĸ = 1/250 μm-1 foi padronizado utilizando-se o método plano focal único (um padrão), enquanto os poços com ĸ = 1/1.000 μm-1 e ĸ = 1/3.750 μm-1 foram padronizados usando dois e três focal (padrões), respectivamente. Como pode ser visto nas projeções de intensidade máxima na Figura 6, ambos os métodos resultam em alinhamento perfeito dos padrões em cima das características. Não podem ser observadas transições desalinhadas entre os dois planos focais diferentes e padrões.
Usando o protocolo descrito, uma ampla gama de desenhos de padrões proteicos pode ser aplicada a uma variedade de geometrias (ver Figura 7 e Vídeo 1). Para ilustrar a versatilidade deste método, semiciclinders (convexo e côncavo), uma superfície de sela e poço foram padronizados usando linhas e círculos de várias larguras. Os materiais fotopatterados podem ser posteriormente usados para cultura celular (ver Figura 7, Figura 8, Vídeo 2, Vídeo 3 e Vídeo 4). Um exemplo de fibroblastos dérmicos cultivados em um padrão (linhas de fibronectina, vermelho, 5 μm de largura e 5 μm de lacunas) é mostrado na Figura 8, Figura 9 e Vídeo 4. Durante o experimento, as células sentem e aderem ao substrato da cultura celular multicue e permanecem viáveis ao longo do tempo. Como pode ser visto a partir da coloração imunofluorescente na Figura 8, as células formam aderências focais (aglomerados de vinculina) principalmente nas linhas de fibronectina.
Outro exemplo de estudo que fez uso desses materiais de cultura celular foi publicado recentemente pelo nosso grupo48. Neste estudo, miofibroblasts humanos e células endoteliais foram submetidos à combinação de pistas de orientação de contato e topografias geométricas. In vivo, ambos os tipos de células experimentam sinais de curvatura e orientação de contato em tecidos nativos, como na vasculatura humana. Ao submeter as células in vitro a um ambiente que combina ambas as pistas ambientais, a situação in vivo pode ser recapitulada, proporcionando uma compreensão mais profunda do papel do microambiente no comportamento celular. Myofibroblasts humanos mostraram-se alinhados com pistas de orientação de contato (linhas paralelas de fibronectina) em substratos cilíndricos côncavos48. No entanto, em estruturas convexas com curvaturas crescentes, os sinais geométricos anularam as pistas bioquímicas, sugerindo que os miofibroblasts podem sentir tanto o grau quanto o sinal de curvatura. Curiosamente, as células endoteliais só podiam aderir aos substratos multicues côncavos e não aos substratos convexos PDMS. Em substratos côncavas e padronizados por proteínas, as células endoteliais são orientadas na direção da sugestão de orientação de contato. Esse conhecimento in vitro fundamental tem relevância fisiológica no campo da engenharia de tecidos vasculares e pode eventualmente auxiliar na concepção de construções de engenharia de tecidos inteligentes.
Figura 1: A linha do tempo experimental da aplicação de dicas de orientação de contato em substratos de cultura celular 3D. Em primeiro lugar, chips de cultura celular positivo são produzidos a partir de um molde PDMS negativo contendo uma gama de geometrias. PDMS não curado é derramado no molde e curado por 3h a 65 °C. Posteriormente, o PDMS é tratado com O2-plasma e incubado com PLL e mPEG-SVA (azul, rotulado) para passivar a superfície do substrato de cultura celular. Após a lavagem, o substrato é virado de cabeça para baixo em uma gotícula de fotoinitiador (PLPP, verde, rotulado) e fotopatterado UV usando a abordagem LIMAP. Aqui, uma máscara digital com um padrão definido pelo usuário é usada para cortar a camada de passivação em locais definidos. Em seguida, uma solução proteica (vermelha, rotulada) pode ser incubada e só vai aderir aos locais onde a camada de passivação é removida. As células semeadas no substrato são submetidas tanto a padrões de geometria quanto de proteínas, o que permite a pesquisa sobre o comportamento celular em ambientes complexos e imitadores in vivo. Abreviaturas: PDMS = polidimimetilsiloxano; mPEG-SVA = metoxioxilotileno glicol-succinimidyl valerate; PLPP = 4-benzoilbenzyl-trimetilamônio cloreto; LIMAP = Adsorção Molecular Induzida por Luz de Proteínas. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 2: Diferentes estágios durante a produção e passivação do substrato de cultura celular 3D. O molde de vidro negativo (#1) é projetado com software de design assistido por computador e produzido usando uma técnica de escrita direta femtosegundo-laser. Este molde é utilizado para produzir o chip PDMS positivo intermediário (#2) e o molde PDMS negativo (#3), que são posteriormente usados para produzir o chip de cultura celular final (#4). Abreviação: PDMS = polidimtilsiloxano. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 3: Ilustração esquemática dos dois métodos de padronização. Esquerda: O fotopatterning UV é realizado em características menores (aproximadamente um DMD) usando um único plano focal e padrão. Como resultado, o recurso completo é padronizado de uma só vez. Certo: Quando características maiores são usadas (maiores que um DMD), a padronização é dividida em vários planos e padrões focais. Abreviação: DMD = dispositivo espelho digital. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 4: Um exemplo típico de um substrato normal e seco incubado por proteínas. Projeções de intensidade máxima (XY) e vistas ortogonais (XZ) de substratos normales e secos incubados por proteínas. Ao lavar um substrato de cultura celular padronizada após a incubação com uma solução proteica, é crucial manter sempre a amostra molhada. Embora o padrão seja idêntico em todas as imagens das características (ĸ = 1/1.000 μm-1), a gelatina-fluoresceína (verde) agregado formando um grande clump quando a amostra foi deixada para secar por alguns segundos. Se a amostra permanecer sempre molhada, padrões de proteínas corretos podem ser observados. Barras de escala = 100 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 5: Imagens de Brightfield após a semeadura. Ceratócitos primários (esquerda) e fibroblastos dérmicos (direita) 4h após semeadura em características geométricas 3D (poço côncavo de ĸ = 1/1.000 μm-1 e semiciclinders de ĸ = 1/500, 1/375, 1/250, 1/175 e 1/125 μm-1). As pastilhas superiores representam o padrão de linha utilizado para a padronização das geometrias. Setas brancas indicam a disseminação de células que já mostram alinhamento. Barras de escala = 250 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 6: Caracterização de padrões circulares em poços côncavos. (A) A projeção de intensidade máxima (XY) e visão ortogonal (XZ) do poço de aconcava (ĸ = 1/250 μm-1) padronizadas usando LIMAP (largura de linha: 20 μm, largura de lacuna: 20 μm) e incubadas com gelatina fluoreceina (verde). O perfil de intensidade ao longo da linha branca é traçado contra a distância, mostrando uma qualidade e resolução padrão consistentes. (B) Padronização adicional realizada em poços côncavos com ĸ = 1/1.000 μm-1 e ĸ = 1/3750 μm-1, mostrando flexibilidade em termos de características geométricas que podem ser utilizadas para padronização. Novamente, tanto as projeções de intensidade máxima (XY) quanto as vistas ortogonais (XZ) são visualizadas. Barras de escala = 100 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 7: dados de microscopia 3D de estruturas padronizadas. Exemplos típicos de materiais de cultura celular padronizados em 3D após fotopatterning e cultura celular, visualizados usando software de renderização 3D. (A) Semiciclídeo convexo padronizado com linhas largas de 10 μm (rhodamina-fibronectina, vermelho) e 10 μm de largura. Barra de escala = 5 μm. (B) Fibroblastos dérmicos manchados para F-actin (verde) cultivados em semiciladura côncavo padronizado com linhas wide de 20 μm (rhodamina-fibronectina, vermelho) e 20 μm de largura gaps. Barra de escala = 5 μm. (C) Superfície de sela padronizada com linhas largas de 20 μm (romuma-fibronectina, vermelha) e 20 μm de largura. Barra de escala = 5 μm. (D) Poço côncavo padronizado com círculos concêntricos de linhas largas de 20 μm (gelatin-fluoresceína, verde) e 20 μm de largura. O citoesqueleto F-actin dos queratócitos humanos é manchado usando falooidina e visualizado em vermelho. Barra de escala = 200 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 8: Mancha imunofluorescente de fibroblastos dérmicos humanos em um fotopatterado, semiciladôdula côncavo. (A) Projeção de intensidade máxima (XY) e seções ortogonais (XZ e YZ) de fibroblastos dérmicos humanos cultivados por 24 h em um semiciclídeo padronizado (linhas de fibronectina, vermelho, 5 μm de largura e 5 μm de distância) semicilas côncavas. As células estão manchadas para F-actin (magenta), vinculina (verde) e núcleos (azul). Barra de escala = 100 μm. (B) Zoom-in de uma célula aderindo ao ambiente multicue. Barras de escala = 50 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 9: Imagens de timelapse de Brightfield de fibroblastos dérmicos humanos em um cilindro côncavo padronizado. O semiciclar concavo (ĸ = 1/250 μm-1) foi padronizado com linhas paralelas (5 μm de largura e 5 μm de lacunas) e incubado com rhodamina-fibronectina antes da semeadura celular. A imagem timelapse é iniciada 1h após a semeadura inicial de células (esquerda, 0 min), quando as células ainda estão arredondadas e não aderentes (setas). Após aproximadamente 24 horas (médio, 1.420 min), as células aderiram ao substrato multicue e mostram uma resposta de alinhamento de acordo com o padrão de orientação de contato. Tanto a resposta de alinhamento quanto a viabilidade celular são mantidas durante toda a duração da cultura (à direita, 3.180 min). Barras de escala = 200 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Vídeo 1: Exemplo de padrão em um substrato cilíndrico 3D. Representação 3D de um cilindro convexo padronizado com rhodamina-fibronectina (vermelho). Clique aqui para baixar este vídeo.
Vídeo 2: Representação 3D de fibroblastos dérmicos cultivados em um substrato cilíndrico 3D padronizado (ĸ = 1/500 μm-1). Fibroblastos dérmicos cultivados por 24 h em um semiciclídeo padronizado (linhas de fibronectina, vermelho, 10 μm de largura e 10 μm de lacunas) convexo semiciclídeo. As células estão manchadas para F-actin (magenta), vinculina (verde) e núcleos (azul). Clique aqui para baixar este vídeo.
Vídeo 3: Representação 3D de ceratocitos humanos cultivados em um poço 3D padronizado (ĸ = 1/3.750 μm-1). Representação 3D de ceratocitos humanos cultivados por 24 h em um poço côncavo e padronizado (círculos de gelatina, verde, 20 μm de largura e 20 μm de lacunas). As células estão manchadas para F-actin (vermelho). Clique aqui para baixar este vídeo.
Vídeo 4: Imagens de timelapse brightfield de fibroblastos dérmicos humanos em um cilindro côncavo padronizado. O semiciclar concavo (ĸ = 1/250 μm-1) foi padronizado com linhas paralelas (5 μm de largura e 5 μm de lacunas) e incubado com rhodamina-fibronectina antes da semeadura celular. A imagem timelapse é iniciada 1h após a semeadura inicial de células, quando as células mostram a adesão inicial ao ambiente multicue. Durante o timelapse completo, as células predominantemente orientam ao longo das pistas de orientação de contato, enquanto a viabilidade celular é mantida. Clique aqui para baixar este vídeo.
Atualmente, o comportamento celular é frequentemente estudado em substratos de cultura plana que não têm a complexidade do microambiente celular nativo. Ambientes 3D como andaimes e hidrogéis são usados como alternativa. Embora esses ambientes de cultura celular melhorem a relevância in vivo, tanto os estudos sistemáticos do comportamento celular quanto a viabilidade dos métodos de leitura permanecem desafiadores. Para investigar sistematicamente o comportamento celular em substratos de cultura representativa, são necessários substratos multicue consistentes que permitem leitura microscópica. Portanto, neste protocolo, descrevemos um método para criar substratos de cultura celular multicue com geometrias fisiologicamente relevantes e proteínas ECM padronizadas. O principal desafio na combinação de pistas ambientais, como geometria tecidual e dicas de orientação de contato em plataformas in vitro, é em grande parte de natureza tecnológica. Métodos convencionais para aplicar pistas de orientação de contato (por exemplo, litografia macia, padronização UV profunda e impressãode microcontatos 35,36) em materiais de cultura celular foram otimizados para substratos planares. A necessidade de materiais de cultura celular 3D combinados com dicas de orientação de contato destacou diversos desafios tecnológicos, como alinhamento de padrões, resolução e flexibilidade. Para superar esses desafios, um método de padronização de alto rendimento, sem máscaras e à base de luz pode ser usado45,49. Aqui, um microscópio óptico permite um alinhamento preciso do padrão e uma resolução na ordem dos micrômetros (ver Figura 6). Além disso, o uso de uma máscara digital permite que os pesquisadores estudem o comportamento celular em uma ampla gama de padrões sem a necessidade de fabricar máscaras físicas intensivas em mão-de-obra.
A abordagem de fotopatterning UV pode ser usada em combinação com uma variedade de geometrias 3D (por exemplo, cilindros, selas, cúpulas, poços) produzidos a partir de uma gama de materiais48. Os substratos de cultura celular 3D utilizados neste estudo são feitos de PDMS; no entanto, outros materiais também podem ser usados. Isso pode exigir diferentes passos para produzir o substrato final da cultura celular contendo as características de interesse. Uma vez que as células têm se mostrado sensíveis à rugosidade superficial dos materiais de cultura celular, é importante criar os chips de cultura celular com uma superfície lisa para que a resposta das células observadas possa ser totalmente atribuível à geometria 3D e aos sinais de orientação de contato50,51. Métodos de medição como profilometria óptica, microscopia eletrônica de varredura ou microscopia de força atômica podem ser usados para medir a rugosidade superficial. Após a fabricação do material de cultura celular, pode-se selecionar um método de padronização baseado em um ou múltiplos planos focais dependentes das dimensões específicas do recurso de interesse (ver Figura 3). Normalmente, um único plano focal é usado para padronizar uma área dentro de um alcance Z de aproximadamente 50 μm. A resolução do padrão mostrou-se consistente usando esta regra de ouro (ver Figura 6). No entanto, uma desvantagem deste método é o aumento do tempo de padronização com a introdução de múltiplos planos e padrões focais. Em nossa mão, usando vários planos focais, características geométricas 3D de até 16 mm x 16 mm x 0,17 mm (X x Y x Z) foram padronizadas com sucesso com alta qualidade de padrão.
Além disso, é importante mencionar que a altura (eixo Z) das características geométricas que podem ser usadas em combinação com este protocolo é limitada. Uma vez que tanto o uv-fotopatterning quanto muitas leituras celulares dependem de uma configuração de microscopia, a distância de trabalho dos objetivos determina a altura máxima de um recurso. Em nossa mão, geometrias superiores a uma altura de 300 μm ainda podem ser fotopatriadas por UV, e leituras foram realizadas usando um microscópio confocal com objetivos de 40x. Assim, pesquisas mecanobiológicas que vão de escalas intracelulares a celulares e tecidos são possíveis utilizando o protocolo descrito.
Outro fator que precisa ser levado em conta é o risco de as amostras secarem durante ou após o49 fotopatterning UV. Isso é especialmente relevante ao usar geometrias 3D, pois convexidades são frequentemente expostas fora de materiais de cultura celular. Como mostrado na Figura 4, isso pode resultar em padrões desiguais com agregados proteicos se formando em cima da característica de interesse. A lavagem dos chips de cultura celular após a incubação de proteínas e durante a cultura celular é fundamental para o revestimento adequado de geometrias 3D. Por isso, é aconselhável sempre deixar pequenos volumes de uma solução de trabalho (PBS, PLPP, solução proteica, meio de cultura celular) em cima do chip de cultura celular.
Até agora, vários revestimentos proteicos (fibronectina, colágeno tipo I e IV, gelatina, FNC) e tipos de células (células estrômicas de medula óssea humana, miofibroblasts humanos, células endoteliais humanas, ceratocitos humanos e fibroblastos dérmicos) têm sido usados em combinação com a abordagem fotopatterning descrita em materiais estruturados de cultura celular. Como mostrado em um estudo anterior48, a otimização dos parâmetros de incubação de proteínas é fundamental para a investigação sistemática em novos tipos celulares. Portanto, antes de realizar um novo experimento com novas proteínas ou células, é aconselhável testar uma série de concentrações proteicas, temperaturas de incubação e tempos de incubação. Comparando a morfologia celular após a adesão inicial em áreas planas homogêneas e padronizadas com morfologia celular em condições de cultura celular 'normal', um conjunto otimizado de parâmetros experimentais pode ser obtido. Além disso, cada tipo de célula pode exigir uma quantidade diferente de tempo após a semeadura para mostrar uma morfologia de adesão reconhecível em um ambiente multicue específico (ver Figura 5). Para isso, é fundamental otimizar o tempo necessário por tipo de célula para apresentar eventos de contato na área padronizada durante a lavagem na etapa 8.4. Por exemplo, observamos que em padrões de linha, os ceratocitos humanos apresentam morfologias alongadas nos primeiros 30 minutos após a semeadura, enquanto as células endoteliais e os fibroblastos dérmicos requerem várias horas antes de mostrar uma mudança na morfologia da adesão. Os parâmetros experimentais necessários para a incubação de proteínas (etapa 7) e a semeadura celular (etapa 8) podem, portanto, depender do tipo de proteína e célula de escolha.
A abordagem apresentada para aplicar dicas de orientação de contato sobre geometrias 3D pode ajudar a criar uma compreensão mais profunda do comportamento celular em ambientes multicue complexos. Isso pode incluir investigações sobre componentes intracelulares, como aderências focais e núcleos, e também pode envolver experimentos realizados em uma escala maior, celular ou tecidual usando o método proposto. Eventualmente, prevê-se que o conhecimento adquirido possa ser usado no projeto de aplicações de engenharia de tecidos, onde ambientes celulares complexos são projetados para direcionar o comportamento celular para um desfecho desejado.
Os autores não têm conflitos de interesse para divulgar.
Agradecemos ao Dr. Nello Formisano (Instituto MERLN de Medicina Regenerativa Inspirada em Tecnologia) por fornecer ceratocitos primários humanos. Este trabalho foi apoiado pelo Chemelot InSciTe (projeto BM3.02); o Conselho Europeu de Pesquisa (bolsa 851960); e o Ministério da Educação, Cultura e Ciência para o Programa gravitação 024.003.013 "Regeneração Orientada por Materiais". Os autores gostariam de agradecer a Alvéole por sua correspondência, ajuda e solução de problemas.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Anti-vinculin antibody, mouse monoclonal IgG1 | Sigma | V9131 | Dilution: 1/600 |
Bovine Serum albumin, Fraction V | Roche | 10735086001 | |
DMEM, high glucose, pyruvate | Gibco | 41966029 | |
DMEM/F-12 + GlutaMAX (1x) | Gibco | 10565018 | |
DMi8 epifluorescent microscope | Leica Microsystems | ||
Ethanol | Biosolve | 0005250210BS | |
Fetal Bovine Serum | Serana | 758093 | |
Fiji/ImageJ, version v1.53k | www.imageJ.nih.gov | ||
Fluorescent highlighter | Stabilo | 4006381333627 | |
Fluorescin-labeled gelatin | Invitrogen | G13187 | Concentration: 0.01% |
Formaldehyde solution | Merck | F8775 | |
Glass coverslips 24 x 60 mm, #1 | VWR | 631-1575 | |
Glass coverslips, ø = 32 mm, #1 | Menzel-Gläser | ||
HCX PL fluotar L 20X/0.40na microscope objective | Leica | 11506242 | |
HEPES | Gibco | 15630080 | |
Human dermal fibroblasts | Lonza | CC-2511 | |
Human primary keratocytes | MERLN Institute for Technology-Inspired Regenerative Medicine | ||
Illustrator, Version 26.0.1 | Adobe | ||
Laboratory oven | Carbolite | ||
L-Ascorbic acid 2-phosphate sesquimagnesium salt hydrate | Sigma-Aldrich | A8960 | |
Leica Application Suite X software, version 3.5.7.23225 | Leica Microsystems | ||
Leonardo software, version 4.16 | Alvéole | ||
Micro-manager, version 1.4.23 | Open imaging | ||
Mowiol 4-88 | Sigma-Aldrich | 81381 | mounting medium |
mPEG-succinimidyl valerate MW 5,000 Da | Laysan Bio | MPEG-SVA-5000 | Concentration: 50 mg/mL |
Negative glass mold | FEMTOprint | ||
NucBlue Live Readyprobes Reagent (Hoechst 33342) | Invitrogen | R37605 | 2 drops/mL |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Gibco | 15140163 | |
Petri dish (ø=100 mm) | Greiner Bio-one | 664160 | |
Phalloidin Atto 647N | Sigma | 65906 | Dilution: 1/250 |
Phosphate Buffered Saline | Sigma | P4417 | |
Plasma asher | Emitech | K1050X | |
PLPP (photoinitiator) | Alvéole | ||
Poly-L-lysine, sterile-filtered | Sigma-Aldrich | P4707 | Concentration: 0.01% |
PRIMO | Alvéole | ||
Rhodamine-labeled fibronectin | Cytoskeletn, Inc. | FNR01 | Concentration: 10 µg/mL |
Secondary antibody with Alexa 488, Goat anti-mouse IgG1 (H) | Molecular Probes | A21121 | Dilution: 1/300 |
Secondary antibody with Alexa 555, Goat anti-mouse IgG1 (H) | Molecular Probes | A21127 | Dilution: 1/300 |
Spin coater | Leurell Technologies Corporation | model WS-650MZ-23NPPB | |
SYLGARD 184 Silicone Elastomer Kit | DOW | 1673921 | |
TCS SP8X confocal microscope | Leica Microsystems | ||
tridecafluoro(1,1,2,2-tetrahydrooctyl)trichlorosilane | ABCR | AB111444 | |
TrypLE Express Enzyme (1x), no phenol red | Gibco | 12604013 | |
Trypsin-EDTA (0.05%), phenol red | Gibco | 25300054 |
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