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Method Article
We provide a detailed description of a protocol for flow cytometric analysis of surface antigens and/or intracellular antigens in neural cell types. Critical aspects of experimental planning, step-by-step methodological procedures, and fundamental principles of flow cytometry are explained in order to enable neurobiologists to exploit this powerful technology.
Flow cytometry has been extensively used to define cell populations in immunology, hematology and oncology. Here, we provide a detailed description of protocols for flow cytometric analysis of the cluster of differentiation (CD) surface antigens and intracellular antigens in neural cell types. Our step-by-step description of the methodological procedures include: the harvesting of neural in vitro cultures, an optional carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE)-labeling step, followed by surface antigen staining with conjugated CD antibodies (e.g., CD24, CD54), and subsequent intracellar antigen detection via primary/secondary antibodies or fluorescently labeled Fab fragments (Zenon labeling). The video demonstrates the most critical steps. Moreover, principles of experimental planning, the inclusion of critical controls, and fundamentals of flow cytometric analysis (identification of target population and exclusion of debris; gating strategy; compensation for spectral overlap) are briefly explained in order to enable neurobiologists with limited prior knowledge or specific training in flow cytometry to assess its utility and to better exploit this powerful methodology.
Citometria a flusso è stato ampiamente sfruttato in immunologia, ematologia e oncologia per definire popolazioni di cellule con proprietà intrinseche scatter, espressione dell'antigene di superficie cellulare, e altri parametri di fluorescenza 1-3. Le nostre intuizioni sviluppo linea di sangue e malattie sono il risultato di un notevole grado di raffinatezza continua di questa metodologia, dopo la sua iniziale 4,5 attuazione. Una maggiore consapevolezza delle potenzialità analitica quantitativa e globale della citometria a flusso ha recentemente incoraggiato il suo uso più diffuso nel campo della ricerca sulle cellule staminali e può consentire allo stesso modo profondo il progresso in un arco di tempo più breve 6. Tuttavia, l'applicazione di citometria a flusso per analizzare specificamente e isolare popolazioni neuronali è stata a lungo percepita come stimolante. Contrariamente alle cellule ematopoietiche che esistono naturalmente in sospensione, tipi di cellule neurali sono tipicamente raccolte da fonti eccessivamente complesse che possono includere glia e vari other cellule circostanti, nonché una intricata rete di neuroni processo fruttiferi. Di conseguenza, neurobiologia ha ancora attuare la versatilità di citometria a flusso per il suo potenziale completo in routine di ricerca quotidiana. Tuttavia, fintanto che una sospensione valida singola cellula può essere generato (e protocolli è stato ideato e ottimizzata a tale scopo 7), citofluorimetria e classificare fluorescenza delle cellule attivate (FACS) può essere considerato un prezioso elemento del repertorio analitico neurobiologia 8-11.
. Figura 1. Principio di citometria di flusso e componenti di un citofluorimetro a flusso citometri comprendono tre sistemi principali: fluidici, ottica ed elettronica. Un flusso semplificato di cellule in sospensione (preparata da tessuto primario o coltura in vitro) è compiuta dal flui guainad via focalizzazione idrodinamica, limitando il campione al suo nucleo centrale. Le parti ottiche sono composti di laser che illuminano il flusso di celle e filtri ottici che indirizzano il segnale ai rivelatori appropriati. I segnali luminosi rilevati sono convertiti in segnali elettronici, successivamente elaborati da un computer e visualizzati su un monitor per l'analisi dei dati e di gating. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Gli utenti di flusso di metodi di citometria a profitto di almeno una conoscenza di base dei fondamenti di base, tra cui blocchi di costruzione di un citometro (per la revisione cfr 12,13; vedi anche figura 1). Un fascio laser interseca con un flusso fluidico idrodinamico concentrato che contiene le cellule in sospensione, che a loro volta passano attraverso il fascio laser in 'singolo file' uno dopo l'altro. Il interceptisu di una cella (o qualsiasi altra particella, per questo) con i risultati laser nella diffusione della luce da questo punto di interrogazione. Luce diffusa può essere rilevato in continuazione della direzione laser (forward scatter, associato con la dimensione della particella), nonché perpendicolare alla sua direzione (lato scatter, riflettendo la granulosità della particella / cella). Queste proprietà scatter cui sopra non richiedono etichettatura specifica, che è il motivo per cui un campione senza etichetta (o anche detriti cellulari, bolle d'aria, ecc) genera un segnale (evento) sul forward scatter bivariato contro lato scatter plot comunemente usato per gating iniziale. Utilizzando i laser e filtri specifici per il corrispondente spettri di eccitazione ed emissione appropriati, una cella può essere analizzata per la sua positività, livello di intensità, o assenza di marcatori fluorescenti. La maggior parte delle applicazioni citometria di flusso sono concentrati sulla caratterizzazione via antigeni di superficie cellulare. A differenza del lineag ematopoietichee, il lignaggio neurale è rimasta meno ampiamente definita in base alle superfici modelli di espressione epitopi 5. Un vantaggio di sfruttare antigeni di superficie è che le cellule vive possono essere sottoposti a separazione delle cellule paradigmi come il FACS. Al contrario, l'antigene intracellulare colorazione richiede fissazione e permeabilizzazione passi per mediare l'interazione epitopo-anticorpo, precludendo applicazioni a valle che richiedono cellule vitali. Da segnalare, questi approcci permettono ancora di numerose analisi quantitative 14 nonché analisi a valle per RNA e proteine espressione 15. Ematologia, immunologia e oncologia hanno spesso usato più di una dozzina di marcatori in collaborazione per definire particolari sottopopolazioni 16. Inoltre, citometria di massa o CyTOF possono ora essere utilizzati per analizzare fino a 30 parametri simultaneamente 17,18.
Per le applicazioni di cellule staminali neurali e colture primarie 14,19,20 l'eterogeneità delle cellulevitro è un fenomeno comune 21-23. Le cellule non rappresentano la popolazione bersaglio di interesse incarnano un potenziale fattore confondente per la lettura sperimentale 24,25. Convenientemente, i differenti sottoinsiemi cellulari presenti all'interno di una sospensione cellulare eterogenea recano profili di espressione dell'antigene distinte (noti o ancora da decifrare), che possono essere utilizzati per definire queste diverse popolazioni. Citometria a flusso può quindi svolgere un ruolo cruciale nel risolvere eterogeneità cellulare e, di conseguenza, facilitare applicazioni biomediche (test in vitro, terapia cellulare) e ottimizzare la lettura quantitativa concentrandosi sul sottoinsieme più rilevante 24,26. Varie combinazioni di antigene di superficie sono stati identificati negli ultimi anni per consentire la quantificazione e l'isolamento di particolari tipi di cellule neuronali. Questo include CD133 per l'arricchimento delle cellule staminali neurali 27, una combinazione delle CD15 / CD24 / antigeni di superficie CD29 per l'isolamento delle NSC, differentiated neurone e cellule della cresta neurale 28 o CD15 / CD24 / CD44 / CD184 / CD271 di isolare neurali e gliali sottoinsiemi 25, tra le altre firme 29,30. Al di là di neuroni, marcatori gliali includono A2B5 31, CD44 25, NG2 32 e GLAST 33. Una recente pubblicazione ha sfruttato il mesencefalo marcatore precursore fondello CORIN 34,35 per arricchire di precursori dopaminergici nel trapianto di cellule Parkinson paradigmi 36. Molecole di CD non sono solo i marcatori, ma funzionalmente rilevanti mediatori delle interazioni cellula-cellula e di capacità delle cellule di rispondere ai segnali di molecole della matrice extracellulare e fattori di crescita 37. Una strategia di potenziare ulteriormente l'arsenale di antigeni CD combinatorie a caratterizzare lo sviluppo lignaggio neurale è quella di utilizzare noti markers intracellulari per lo screening e definire combinazioni di antigene CD per un particolare tipo di cellule di interesse. Abbiamo recentemente sfruttato tale approccio e identificato CD49F - / CD200 alti modelli di espressione combinatorie come un nuovo approccio per arricchire sottoinsiemi neuronali da neurally differenziati pluripotenti indotte sistemi di coltura delle cellule staminali 38. Qui, includiamo e discutere il secondo protocollo (e varianti opzionali loro), in cui la colorazione superficiale e la colorazione intracellulare possono essere utilizzati contemporaneamente per definire sottopopolazioni di cellule neurali in citometria a flusso.
Figura 2. Schema di flusso di opzioni protocollo sperimentale. La figura illustra una rappresentazione schematica dei principali fasi del protocollo. Passaggi facoltativi (CFSE dye o etichettatura antigene intracellulare) sono indicati da caselle di colore grigio chiaro. Dopo la raccolta, è fondamentale per valutare il numero di vitalità e di cellule di sospensioni cellulari neuronali prima della colorazione della superficie cellulare. Positivo comecosì come controlli negativi devono essere inclusi in aggiunta ai campioni di interesse. I campioni possono essere analizzati mediante citometria a flusso e / o utilizzati in separazione delle cellule paradigmi. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Mentre abbiamo precedentemente utilizzato anticorpo primario in combinazione con l'anticorpo secondario per la colorazione intracellulare 38, introduciamo ora etichettatura non covalente dell'anticorpo primario mediante frammenti Fab fluorescenti (etichettatura Zenon) come una lieve variazione, riducendo così le fasi di manipolazione cellulare 39. Inoltre, come ulteriore esempio della versatilità del protocollo, ci avvaliamo di una etichettatura facoltativa di un sottoinsieme sperimentale carbossifluoresceina estere succinimidyl (CFSE) prima superficie antigene colorazione. Tale CFSE pre-etichettatura consente confronto diretto immediato delle due linee cellulari o condizioni sperimentali (CFSE marcato vs. senza etichetta) all'interno di un unico tubo di esempio, la riduzione della varianza o sottili differenze di tempo di incubazione e di risparmio di anticorpi. CFSE è un colorante fluorescente stabilito che viene comunemente utilizzato per il monitoraggio delle cellule 40, in proliferazione 41,42 e codici a barre esperimenti 43,44. Infine, mentre passaggi effettivi (FACS, separazione immunomagnetica o immunopanning) non fanno parte di questo protocollo, in linea di principio, le modalità di raccolta e di etichettatura qui descritte fanno i campioni di rendimento che possono essere sottoposti a superficie antigene o intracellulari applicazioni di smistamento basate etichettatura- 15 25,28.
Con questo articolo, ci proponiamo di: sintesi di una superficie valida protocollo antigene colorazione 25,28, sintesi di un protocollo per la rivelazione di bersagli intracellulari e superficie combinata e intracellulare analisi dell'antigene 38, presenterà un intracellulare CFSE etichettatura tintura passo 41,45 come opzione sperimentale per comcomparata analisi di popolazioni di cellule neuronali, e riassumere approcci per l'analisi di citometria di flusso (controlli appropriati 13,46, gating strategia e dati presentazione 47).
1. Neural raccolta cellulare
2. intracellulare Dye Labeling Utilizzando CFSE (Figura 3)
Figura 3. Rilevamento di differenziale espressione dell'antigene di superficie CD tra due linee di cellule tramite cellule SH-SY5Y neuroblastoma CFSE tintura etichettatura. Sono pre-etichettati con CFSE per la successiva identificazione rispetto a fibroblasti BJ senza etichetta. Co-colorazione del campione misto (pannelli di destra) con marcatori di superficie CD24 o CD54 (sia coniugato con APC) dimostra che le linee cellulari sono facilmente distinguibili grazie alla colorazione CFSE (frecce = SH-SY5Y, punte di freccia = BJ fibroblasti). La maggior parte delle cellule SH-SY5Y esprimono CD24, ma non CD54 (ICAM-1). Al contrario, i fibroblasti BJ (CFSE-negativo) sono positivi per CD54, ma in gran parte negative per CD24.Target "https://www.jove.com/files/ftp_upload/52241/52241fig3highres.jpg" = "_ blank"> Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.
3. Cella Surface colorazione
Tubo no. | Nome del campione | Antigen-fluoroforo | Diluizione |
1 | Cellule senza macchia | - | |
2 | Macchiato singolo | CD24-APC | 01:50 |
3 | Macchiato singolo | TUJ1-Alexa 488 nm Fluor | 1: 2.000 |
4 | Doppia macchiato | CD24-APC | 01:50 |
TUJ1-Alexa 488 nm Fluor | 1: 2.000 | ||
5 | Macchiato singolo | Secondary solo: Alexa Fluor 488 nm | 1: 2.000 |
Tabella 1. L ist di tubi da includere in un tipico flusso citometria esperimento. La tabella mostra un insieme minimo di provette per campioni necessari per un esperimento di co-colorazione descritto in questo articolo video. Un esperimento ideale deve includere tutti i controlli necessari (positivi, così come controlli negativi) per compensazione accurata interpretazione dei risultati ottenuti.
Antigene | Tipo di cella | Riferimento |
CD15 | Le cellule staminali neurali | [28, 67] |
CD24 | Cellule neuronali | [28, 68] |
CD29 | Le cellule staminali neurali | [28, 69, 70] |
CD44 | Le cellule gliali | [25] |
CD49f | Le cellule staminali neurali | [38] |
CD56 (NCAM) | Cellule neuronali | [71] |
CD133 | Le cellule staminali neurali | [27] |
CD184 | Le cellule staminali neurali e cellule gliali | [25] |
CD200 | Cellule neuronali | [38] |
CD271 | Le cellule staminali della cresta neurale | [25] |
A2B5 | Le cellule gliali | [31] |
CORIN | Precursori dopaminergici | [35, 36] |
FORSE1 | Le cellule staminali neurali (NSC) | [72] |
GLAST | Le cellule gliali | [33] |
NG2 | Le cellule gliali | [32] |
Tabella 2. Selezione di antigeni di superficie neurali. Questa tabella fornisce un elenco di epitopi di superficie trovati ad essere espressa da vari tipi di cellule neurali per esemplificare la crescente gruppo di antigeni di superficie utilizzate per caratterizzare il lignaggio neurale. Si noti che questa selezione è lungi dall'essere completo e che la maggior parte di questi marcatori sono espressi anche da una serie di altre cellule neuronali e non neuronali. Di conseguenza, le combinazioni di diversi marcatori saranno tenuti a definire meglio e isolare i sottoinsiemi neurali indicati.
4. Fissazione e permeabilizzazione 38
5. intracellulare Antigen Staining 38 (Figura 4)
Figura 4. Co-colorazione di superficie e di proteine intracellulari. Citometria a flusso di dati esemplifica un confronto tra primaria + secondaria anticorpo-basata contro colorazione intracellulare a base di fluoresceina Zenon in combinazione con colorazione della superficie. Positività esclusiva on y (quadrante in alto a sinistra) e l'asse x (quadrante inferiore destro) mostra cellule colorate per MAP2 e CD24, rispettivamente. Dopo co-colorazione, MAP2 condiviso e di espressione CD24 può essere visto nel quadrante in alto a destra (pannelli di destra). Confronto di utilizzoAlexa Fluor 488. (Top; AF488) rispetto Zenon fluoresceina (in basso) per i rendimenti MAP2-etichettatura risultati simili Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
6. analisi citofluorimetrica
Il protocollo presentato qui permette approcci versatile sperimentali (Figura 2). Nella sua versione più breve (passi 1, 3 e 6), può essere considerato una guida per la semplice colorazione di antigeni di superficie. Nella sua forma più complessa, una serie di paradigmi co-etichettatura con una gamma di antigeni intracellulari può essere perseguito (fasi opzionali 2 e / o 4 a 5). Inoltre, la fase di...
Il protocollo presentato qui è ben definito per colture cellulari neuronali derivate da cellule staminali umane, ma può essere ugualmente applicata ad altre fonti di cellule neurali compreso il tessuto primario o linee cellulari neurali. Oltre alle fonti embrionali, le cellule staminali o progenitrici neurali possono essere estratti dalle regioni neurogenici del cervello adulto 27. Inoltre, citometria a flusso e FACS possono essere sfruttati per quantificare, analizzare e isolare diverse popolazioni di cell...
The authors declare no potential conflicts of interest.
Our research program is funded through the Emmy Noether-Program of the German Research Foundation (DFG), grant PR1132/3-1. Further support by the Müller-Fahnenberg Foundation of the University of Freiburg is gratefully acknowledged. This study was supported in part by the Excellence Initiative of the German Research Foundation (GSC-4, Spemann Graduate School).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM/F12 (1:1) (Dulbecco's Modified Eagle Medium/Nutrient Mixture F-12) | ![]() | 11330057 | |
DPBS without Ca2+ Mg2+ | ![]() | 14190169 | |
Fetal bovine serum, qualified, E.U.-approved, South America origin (FBS) | ![]() | 10270-106 | |
MEM Non-essential amino acids (100x) | ![]() | 11140035 | |
TrypLE Express | ![]() | 12604013 | |
Trypan blue solution, 0.4% | ![]() | 15250061 | |
Paraformaldehyde | ![]() | 335.3 | |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | ![]() | K41-001 | |
Tween-20 Detergent | ![]() | 655205 | |
Carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE) | ![]() | 65-0850-84 | |
DMSO | ![]() | A1584 | |
Bottle top filters express plus 0.22 µm, 250 ml | ![]() | SCGPU02RE | |
Cell culture treated flasks (T 25) | ![]() | 156367 | |
Cell culture treated flasks (T 75) | ![]() | 156499 | |
Conical tubes (15 ml) | ![]() | 188271 | |
Conical tubes (50 ml) | ![]() | 227261 | |
Pasteur pipet, glass (150 mm) | ![]() | S03710150 | |
Pipet tips (0.1-10 µl) | ![]() | 4125 | |
Pipet tips (1-200 µl) | ![]() | 4126 | |
Pipet tips (100-1000 µl) | ![]() | 4129 | |
Serological pipets, 5 ml | ![]() | 4051 | |
Serological pipets, 10 ml | ![]() | 4101 | |
Serological pipets, 25 ml | ![]() | 4251 | |
Microcentrifuge tubes (0.5 ml) | ![]() | 72,699 | |
Microcentrifuge tubes (1.5 ml) | ![]() | 616201 | |
Microcentrifuge tubes (2.0 ml) | ![]() | 72,695,500 | |
Anti-Human CD24 APC monoclonal antibody | ![]() | 17-0247-42 | Working dilution 1:50 |
Anti-Human CD54 PE monoclonal antibody | ![]() | 12-0549-42 | Working dilution 1:50 |
Neuronal Class III β-Tubulin (Tuj1) polyclonal antibody | ![]() | PRB-435P | Working dilution 1:2,000 |
Alexa Fluor 488 Donkey anti Rabbit | ![]() | A21206 | Working dilution 1:2,000 |
Zenon® Fluorescein Rabbit IgG Labeling Kit | ![]() | Z-25342 | |
Neubauer-Improved counting chamber | ![]() | 0640010 | |
Vortex | ![]() | G560E | |
Thermomixer comfort | ![]() | 5355 000.001 | |
Accuri C6 flow cytometer | ![]() | 653118 | |
Microcentrifuge refrigerated, PerfectSpin 24 R | ![]() | 91-PSPIN-24R | |
Orbital shaker, Unimax 1010 | ![]() | 543-12310-00 | |
Centrifuge refrigerated, Rotanta 96 RC | ![]() | 4480-50 | |
Class II Biological safety cabinet Safe 2020 | ![]() | 51026640 | |
CO2 Incubator, Heracell 240i | ![]() | 51026331 | |
Vacuum system, Vacusafe comfort | ![]() | 158320 | |
Microscope, Axiovert 40 CFL | ![]() | 451212 | |
Pipet controller, accu-jet pro | ![]() | 26303 | |
Micropipet, Pipetman neo P20N (2-20 µl) | ![]() | F144563 | |
Micropipet, Pipetman neo P200N (20-200 µl) | ![]() | F144565 | |
Micropipet, Pipetman neo P1000N (100-1000 µl) | ![]() | F144566 |
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