A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Abstract
Chemistry
Elektro spray ionisering (ESI) kan overføre en vandig fase peptid eller peptid kompleks til gas-fase samtidig bevare sin masse, samlede ladning, metal bindende interaktioner, og konformationel form. Kobling ESI med ion Mobility-massespektrometri (IM-MS) giver en instrumental teknik, der giver mulighed for samtidig måling af et peptid's Mass-to-Charge (m/z) og kollision tværsnit (CCS), der relaterer til sin støkiometri, protonation tilstand, og konformationel form. Den samlede ladning af et peptidkompleks styres af protonation af 1) peptid's sure og grundlæggende sites og 2) oxidations tilstanden af metal ion (s). Derfor er den samlede opladningstilstand for et kompleks en funktion af pH-værdien af opløsningen, som påvirker peptider metal ionbindende affinitet. For ESI-IM-MS-analyser fremstilles peptid-og metaliumiopløsninger ud fra vandige opløsninger med pH justeret med fortyndet vandig eddikesyre eller ammoniumhydroxid. Dette gør det muligt at fastgøre pH-afhængighed og metal ionselektiviteten for et specifikt peptid. Desuden kan m/z og CCS af et peptidkompleks anvendes med B3LYP/LanL2DZ Molekylær modellering til at skelne mellem bindingssteder af metal ionkoordineringen og den tertiære struktur i komplekset. Resultaterne viser, hvordan ESI-IM-MS kan karakterisere den selektive chelerende præstation af et sæt af alternative methanobactin peptider og sammenligne dem med kobber bindende peptid methanobactin.
ABOUT JoVE
Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved