Method Article
Bu makale, yarı klonlanmış embriyoların yapımında sperm yerine partenogenetik haploid embriyonik kök hücrelerin kullanımını göstermeyi amaçlamaktadır.
Cinsel üremeye sahip organizmalarda, mikrop hücreleri yeni bireylere dönüşen totipotent hücrelerin kaynağıdır. Farelerde, bir oositin bir spermatozoon tarafından döllenmesi totipotent bir zigot oluşturur. Son zamanlarda, birkaç yayın haploid embriyonik kök hücrelerin (hemECS) gametik genomların yerini tutabileceğini ve farelere dönüşen embriyolara katkıda bulunabileceğini bildirmektedir. Burada, oositlere intrasitoplazmik enjeksiyon ile embriyo oluşturmak için sperm yerine partenogenetik hemECC'lerin uygulanması için bir protokol sunuyoruz. Bu protokol, haESC'lerin sperm replasmanı olarak hazırlanması, haESC kromozomlarının oositlere enjeksiyonu ve yarı klonlanmış embriyo kültürü için adımlardan oluşur. Embriyolar embriyo transferinden sonra verimli yarı klonlanmış fareler verebilir. Sperm replasmanı olarak HESC'lerin kullanılması mikrop hattında genom düzenlemesini, embriyonik gelişim çalışmalarını ve genomik baskıların araştırılmasını kolaylaştırır.
Memelilerde, gametler genetik bilgileri bir sonraki nesle ileten tek hücrelerdir. Bir oosit ve spermatozonun füzyonu, yetişkin bir hayvana dönüşen bir diploid zigot oluşturur. Gametik genomlardaki mutasyonlar böylece yavrular tarafından kalıtsaldır ve türlerde genetik varyasyonu yönlendirmektedir1. Mikroptaki mutasyonların tanıtılması, gen fonksiyonunun karakterizasyonu ve hastalık modellemesi de dahil olmak üzere çeşitli biyolojik çalışmalar için genetiği değiştirilmiş hayvanlar üretmek için uygulanmıştır. Hem oositler hem de spermatozoa, çoğalma sona eren ölümcül farklılaşmış ve son derece uzmanlaşmış hücrelerdir. Bu nedenle, gametlerin doğrudan modifikasyonu teknik olarak zordur ve özel yaklaşımlar geliştirilmiştir. Genetik değişiklikler, genetiği değiştirilmiş ESC'lerin gelişmekte olan embriyoya entegre oldukları ve germline kolonileştikleri blastosistlere enjekte edilmesiyle fare germline sokulabilir. Ek olarak, CRISPR/ Cas9 sistemi de dahil olmak üzere genom düzenleme yaklaşımlarını kullanan zigotların genetik modifikasyonu yaygın olarak benimsenmiştir2.
Son zamanlarda, bir gametik genom 3 , 4,5,6,7,8yerine haESC'leri uygulayan olağanüstü bir yaklaşımbildirilmiştir. HESC'ler, partenogenetik veya androgenetik haploid blastosistlerin iç hücre kütlesinden elde edilen kök hücre hatlarıdır ve tek bir kromozom kümesine sahiptir4,7,9,10. Hem partenogenetik hem de androgenetik hemECC'lerin oositlere intrasitoplazmik enjeksiyondan sonra yarı klonlanmış farelerin genomuna katkıda bulunabileceği gösterilmiştir. Diğer yaklaşımların aksine, hemAC'lerin genomları, kendi kendini yenileme kapasiteleri nedeniyle kültürde doğrudan değiştirilebilir. Spermin yerine hemESK'ler konarak mikrop hattına genetik modifikasyonların getirilmesi biyolojik çalışmalar için önemli bir yöntemdir. Sırasıyla partenogenetik veya androgenetik hemECS'lerden türetilen anne veya baba genomlarını ayrı ayrı kültüre etme ve manipüle etme imkanı sağlar. Daha sonra HESC'ler, özellikle genomik baskı, alel özgü ifade ve ebeveyne özgü süreçler için avantajlı olan gametik genom replasmanı olarak kullanılabilir.
Farelerde normal embriyo gelişimi için hem anne hem de baba genomik bilgi gereklidir11. Bu nedenle, sperm genom5,8yerine vahşi tip partenogenetik hemECS (faESC) enjekte edildiğinde tam süreli yavrular elde edilemedi. Gelişimsel bloğun üstesinden gelmek için, partenogenetik hemECC'lerin maternal genomunun genomik baskısının bir baba yapılandırmasına düzeltilmesi gerekir. Bu, farklı metillenmiş bölgelerin (DMR' ler) manipülasyonu ile elde edilebilir. Bugüne kadar, H19-DMR, Gtl2-Dlk1 IG-DMR ve Rasgrf1-DMR'nin hedeflenen silmeleri, 3 ,5,8,12falclerinde doğumla ifade edilen genleri bastırmak için çalışılmıştır. Bu çalışmalar, hem H19-DMR hem de IG-DMR'nin silinmelerinin, bir anneyi sperm kromozomlarının yerini tutabilecek bir baba künyesi yapılandırmasına dönüştürmek için yeterli olduğunu göstermiştir. İki DMR delesyonlarını oositlere taşıyan fazEZ'lerin intrasitoplazmik enjeksiyonu, transfer edilen 2 hücreli embriyoların% 5.1 ila% 15.5'i arasında bir frekansa sahip yarı klonlanmış yavrular verdi.
Bu protokol, çift nakavtlı fadeskler (DKO-phaESC) olarak adlandırdığımız hem H19-DMR hem de IG-DMR silmeleri olan fakların uygulanmasına dayanmaktadır. DKO-phaESC hatları kurmak için faesklerde genomik baskı modifikasyonu, sperm genomunun yerine Oositlere DKO-faesk enjeksiyonu, yarı klonlanmış embriyoların blastosistlere kültürü ve yarı klonlanmış fareler elde etmek için ayrıntılı talimatlar sunuyoruz. Bu protokol, baba genomunun kesin ve doğrudan manipülasyonu ve yarı klonlanmış embriyo ve farelerin üretilmesini gerektiren araştırmacılar için bir referanstır.
Tüm hayvan deneyleri, Kanton Etik Komisyonu Zürih ve ETH Zürih Moleküler Sağlık Bilimleri Enstitüsü'ndeki EPIC hayvan tesisinin standartlarına ve yönetmeliklerine uygun olarak ZH152/17 lisansı altında gerçekleştirildi.
NOT: Bu protokol, H19- ve IG-DMR'lerin fazEZ'lerde silinmesiyle başlar. PhaESC hatlarının nasıl oluşturulana ilişkin ayrıntılar için lütfen yayınlananraporlar 10,13'e bakın. Şekil 1A'dabu protokole genel bir bakış ve zaman dilimi (adım 1–14) verilmiştir; ortam, çözümler ve arabellekler Tablo 1'de listelenmiştir. DKO-phaESC hatları kurma prosedürü (adım 1–6) Şekil 1B'degösterilmiştir ve yarı klonlanmış embriyolar oluşturma stratejisi (adım 7-14) Şekil 1C'degösterilmiştir.
1. Fagislerde H19-DMR ve IG-DMR'nin silinmesi için plazmidlerin transfeksiyonu
2. Bir akış sitometresi kullanarak transfected fadesklerin tek hücreli kaplaması
3. Transfected phaESC'lerin alt klonlama
4. MEF'lerle alt klonlanmış phaESC hatlarının ilk genotipletimi
5. Alt klonlanmış fazESC hatlarının haploid hücre saflaştırılması
6. MEF'ler olmadan alt klonlanmış phaESC hatlarının ikinci genotiplemesi
NOT: Alt klonlanmış fazESC çizgilerinin hem H19hem de IG-DMR'lerin silmelerine sahip olduğunu ve MET'lerin çıkarılmasından sonra wildtype alellerinin bulunmadığını doğrulamak için ikinci bir genotipleme turu gerçekleştirilir.
7. Farelerin süper yumurtlama
8. Oosit koleksiyonu
9. DKO-phaESC'lerin tedavisi ve toplanması
10. M fazlı DKO-fako-fakoların saflaştırılması
11. Tutma ve mikroenjeksiyon pipetlerinin hazırlanması
NOT: İntrasitoplazmik enjeksiyonun (adım 12) gerçekleştirilmesi için birkaç tutma ve mikroenjeksiyon pipeti gereklidir (Şekil 4A). Bu pipetler ticari bir tedarikçiden özel talep üzerine satın alınabilir veya bir mikropipette çekme ve bir mikroforge kullanılarak uygun cam kılcal damarlardan yapılabilir.
12. DKO-fakesklerin intrasitoplazmik enjeksiyonu
13. yapılı yarı klonlanmış embriyoların aktivasyonu
14. İnşa edilmiş yarı klonlanmış embriyoların geliştirilmesi
Bu protokolün amacı, yarı klonlanmış embriyo ve fare elde etmek için sperm yerine HESK'leri uygulamaktır. Bu amaçla, CAG-EGFP transgene taşıyan bir DKO-phaESC hattı üretildi ve MII oositlerine intrasitoplazmik enjeksiyon için kullanıldı. Baba künye konfigürasyonu ile uygun bir fazESC hattı elde etmek için Cas9 çekirdeklerini kullanarak genetik mühendisliği gerçekleştirdik. Bir haploid ESC hattı, diploidizasyon için haploid ESC'lerin doğal eğilimi nedeniyle ortaya çıkan haploid ve diploid hücreleri içerir10. Haploid kromozom seti, sperm genomunun başarılı bir şekilde değiştirilmesi için bir ön koşuldur. Akış sitometrisine göre DNA içerik analizi, haploid ve diploid hücrelerin G0/G1-, S-ve G2/M fazlarındaki dağılımını göstermektedir (Şekil 2A).
DKO-phaESC hatlarını kurmak için, wildtype phaESC hatları stabil transgenik EGFP ekspresyonu için piggyBac transposon yapıları ve H19ve IG-DMR'lerin silinmesi için CRISPR / Cas9 plazmidleri ile trans enfekte edildi. Diploid ESC'leri dışlamak ve sadece EGFP'yi ifade eden haploid ESC'leri izole etmek için belirli bir sıralama kapısı tanımlanmıştır (Şekil 2A). Tek haploid EGFP pozitif hücreler daha sonra alt klonlar elde etmek için 96 kuyu plakalı bireysel kuyulara kaplandı. MEF besleyiciler, transfected fakların kaplama verimliliğini ve hayatta kalmasını artırmak için kullanıldı. Kültürlerin genişlemesinden sonra, pcr tarafından her iki DMR'nin silinmelerini taşıyan alt klonları tanımlamak için ilk genotipleme turu gerçekleştirildi. MEF besleyiciler kültürlerden çıkarıldıktan sonra, H19ve IG-DMR'lerde wildtype alellerinin yokluğunu doğrulamak için ikinci bir genotipleme yapıldı (Şekil 2B). Toplam 135 alt klondan, silinen alelleri taşıyan ve hem H19-DMR hem de IG-DMR'nin wildtype alellerinden arındırılmış 5 haploid DKO-phESC hattı elde ettik.
Mikroskop altında yeşil floresan görselleştirmesi yapılarak yarı klonlanmış embriyolara katkılarını incelemek üzere DKO-fazlere cag-EGFP transjeni sokuldu (Şekil 3A). İntrasitoplazmik enjeksiyon için, DKO-fakeskler M fazında tutuklanmaları için demekolsin ile tedavi edildi. Böylece, DKO-fazEZ'lerin hücre döngüsü MII oositlerininkiyle senkronize edildi. Akış sitometrisi analizi, demekolin ile tedaviden sonra G2/M fazı tutuklu haploid (2n) ve diploid hücrelere (4n) karşılık gelen 2 popülasyon göstermiştir (Şekil 3B). 1n haploid zirvesinin yokluğu, hücre döngüsü durmasının büyük ölçüde tamamlandığını gösterdi. M fazlı haploid ESC'ler daha sonra sıralandı ve oositlere enjekte edildi. Bunun için, mikroenjeksiyon pipetine tek bir DKO-phaESC yüklendi ve bir MII oosit sitoplazmına enjekte edildi (Şekil 3C). DKO-phaESC'nin plazma zarı mikroenjeksiyon pipetinin ucuna pipetle sokularak yırtıldı.
Enjeksiyondan sonra, DKO-phaESC'lerin sitoplazma oositin büyük sitoplazmında dağıldığı için, inşa edilen yarı klonlanmış embriyolarda EGFP ekspresyolü nadiren tespit edildi (Şekil 3D). Nadir durumlarda, ooplazm içinde yoğun EGFP ekspresyonunun yuvarlak bir noktası gözlenebilir. Bu gözlem muhtemelen bozulmamış DKO-fazların yanlışlıkla enjektelenmesinden kaynaklanmıştır. DKO-phaESC hücre zarın yırtılmaması muhtemelen daha fazla embriyo gelişimi ile uyumlu değildir ve kaçınılmalıdır. Enjeksiyondan bir saat sonra, embriyolar stronsiyum klorür18ile tedavi ile aktive edildi. Aktivasyonun başlatılmasından altı saat sonra, mikroskop altında en fazla 3 kutup cisimleri gözlenmiştir (Şekil 3E). Bu kutup cisimleri, oositlerin birinci ve ikinci kutup gövdelerine ve DKO-phaESC7'densahte bir kutup gövdesine karşılık gelir. Ek olarak, sperm ile normal döllenmeden sonra zigotların pronükleer aşamasına benzeyen diferansiyel girişim kontrast mikroskobu altında iki pronüklei gözlendi.
Gelişimsel yeterliliği göstermek için yarı klonlanmış embriyolar blastosist aşamasına kültürlendi (Şekil 5A). Ayrıca, yarı klonlanmış 2 hücreli evre embriyoların alıcı bir dişinin yumurtalıklarına aktarılmasından sonra tam süreli bir fare elde edildi (Şekil 5B). Beklendiği gibi, yarı klonlanmış bir embriyodan elde edilen fare, ne oositler ne de oosit türevi faklar Y kromozomu taşımazken dişiydi. Yarı klonlanmış fare aşırı derecede normaldi ve vahşi bir İsviçre Webster erkeğiyle çiftleştiğinde sağlıklı yavrular üretti. Şimdiye kadar, yarı klonlanmış fare 600 günden fazla bir süredir belirgin bir sağlık sorunu olmadan hayattaydı.
Şekil 1: DKO-fakesklerin sperm replasmanı olarak uygulanmasına genel bakış. (A) Protokolün prosedürlerinin bir zaman dilimi. (B) Şema, DKO-phaESC hatları oluşturma adımlarını gösterir (adım 1-6). (C) Şema, bir DKO-phaESC'nin mii oosit içine intrasitoplazmik enjeksiyonu ile yarı klonlanmış embriyoları oluşturma adımlarını gösterir (adım 7-14). Kısaltmalar: DKO = çift nakavt; phaESC = parthogenetik haploid embriyonik kök hücre; FACS = floresanla etkinleştirilen hücre sıralama; MEF = fare embriyonik fibroblast. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 2: H19ve IG-DMR'ların CRISPR/Cas9 aracılı silmeleri ile DKO-phaESC hatlarının kurulması. (A) Stabil EGFP ekspresyonu için piggyBac plazmidleri ve 4 CRISPR/Cas9 plazmidleri ile transfeksiyondan sonra fadeklerin akış sitometri analizi. Transfected olmayan fades'ler kontrol olarak gösterilir. DNA profili (üstte) haploid ve diploid hücrelerin hücre döngüsü dağılımını gösterir. EGFP'yi ifade eden G1/S fazlı haploid hücreler yeşil kapı (alt, sağ) ile gösterilir. (B) MEF'lerde yetişen phaESC alt klonlarının genotiplenimi (ilk genotipleme) ve MOF'ların çıkarılmasından sonra (ikinci genotipleme). Alt klonlanmış fazESC çizgileri 1, 2, 3 ve 4, sırasıyla wildtype hücrelerini, H19-DMR silmeli hücreleri, IG-DMR silme ve birleşik H19- ve IG-DMR silmeleri ile temsil eder. 5–8 DKO-phaESC hatları hem H19-DMR hem de IG-DMR silmelerine sahiptir ve wildtype alellerinden arındırılmıştır. Kısaltmalar: DKO = çift nakavt; phaESC = parthogenetik haploid embriyonik kök hücre; DMR = diferansiyel metillenmiş bölge; MEF = fare embriyonik fibroblast; EGFP = gelişmiş yeşil floresan protein; WT = wildtype. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 3: Miyotik olarak tutuklanan DKO-phaESC'lerin MII oositlerine enjeksiyonu. (A) H19 ve IG-DMR'lerin CAG-EGFP transgene ve silmelerini taşıyan bir DKO-phaESCkültürünün morfolojisi; ölçek çubuğu = 50 μm. (B) DKO-fazezlerin 8 saat boyunca demecolcine ile tutuklandıktan sonra temsili akış sitometri analizi, demekolsin tedavisi olmayan DKO-fazler kontrol olarak gösterilmiştir. (C) Mikroenjeksiyon pipetinde DKO-fadezlerin morfolojisi. Plazma zarını pipetleme ile yırtmadan önce (solda) ve sonra (sağda) tek bir bozulmamış DKO-phaESC gösterilir; ölçek çubuğu = 20 μm. (D) MII oositlerine DKO-phaESC enjekte edildikten sonra 1 saat içinde embriyolar inşa edildi. EGFP floresan ve parlak alanın birleştirilmiş görüntüsü gösterilmiştir. Siyah ok uçları, kaçınılması gereken sağlam DKO-phaESC enjeksiyonundan sonra yoğun EGFP ekspresyonunun yuvarlak noktalarını gösterir; ölçek çubuğu = 50 μm. (E) Stronsiyum klorür ile aktivasyonun başlatılmasından 6 saat sonra yarı klonlanmış embriyoların diferansiyel girişim kontrast görüntüsü gösterilmiştir. Beyaz ok uçları, enjekte edilen DKO-phaESC'den bir sahte kutup gövdesi de dahil olmak üzere 3 kutup gövdesine sahip embriyoları gösterir; ölçek çubuğu = 50 μm. Kısaltmalar: DKO = çift nakavt; phaESC = parthogenetik haploid embriyonik kök hücre; EGFP = gelişmiş yeşil floresan protein. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 4: DKO-phaESC'lerin oositlere intrasitoplazmik enjeksiyonu için kurulumun şeması. (A) Enjeksiyon odasında bir enjeksiyon pipeti, bir tutma pipeti ve bir oosit düzenlenmesi gösterilmiştir. α, mikroenjeksiyon pipetinin büküm açısı. (B) İntrasitoplazmik enjeksiyon için mikromanipülasyon kabındaki damlaların düzeni. Kısaltmalar: DKO = çift nakavt; phaESC = parthogenetik haploid embriyonik kök hücre. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 5: Yarı klonlanmış embriyoların gelişimi. (A) Yarı klonlanmış embriyoların in vitro preimplantasyon gelişimi. EGFP ekspresyasyonu ilk olarak intrasitoplazmik enjeksiyondan sonra 2. günde dört hücreli embriyolarda gözlenir. 4. günde, blastosistlerde yoğun EGFP ekspresyolü görülebilir; ölçek çubuğu = 100 μm. (B) Alıcı bir kadına 2 hücreli embriyo transferinden sonra elde edilen yarı klonlanmış bir fare. 74 dpp'de, yarı klonlanmış fare (ok ucu), vahşi bir İsviçre Webster erkeğiyle çiftleştikten sonra ilk yavrularını (yıldız işareti) doğal doğumla teslim etti. Yarı klonlanmış embriyolar ve bu şekilde gösterilen yarı klonlanmış fare, Aizawa ve ark.3'te bildirilenlerle aynıdır. Kısaltmalar: EGFP = gelişmiş yeşil floresan protein; .dpp, doğum sonrası günler. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Jelatin çözeltisi | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
Su | - | 500 mL | - |
Jelatin | - | 1 g | 0.2% |
Haploid embriyonik kök hücre (HaESC) ortamı | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
NDiff 227 | - | 10 mL | - |
CHIR 99021 | 10 mM | 3 μL | 3 μM |
PD 0325901 | 10 mM | 1 μL | 1 μM |
Lıf | 1 x 106 IU/mL | 10 μL | 1.000 IU/mL |
Penisilin-Streptomisin | 100x | 100 μL | 1x |
HaESC bakım tamponu | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
HaESC ortamı | - | 1 mL | - |
HEPES çözümü | 1 M | 20 μL | 20 mM |
Yıkama arabelleği | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
DMEM / F-12 | - | 100 mL | - |
BSA kesir | 7.5% | 7,1 mL | 0.5% |
MEF ortamı | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
DMEM | - | 500 mL | - |
Fbs | - | 56 mL | 10% |
β-Mercaptoethanol | 14.3 mol/L | 3,9 μL | 100 μM |
Penisilin-Streptomisin | 100x | 5,6 mL | 1x |
Lizis arabelleği | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
Su | - | 8,25 mL | - |
Tris-HCl (pH 8.5) | 1 M | 1 mL | 100mm |
Edta | 0,5 M | 100 μL | 5 mM |
SDS çözümü | 10% | 200 μL | 0.2% |
Nacl | 5 M | 400 μL | 200 mM |
Proteinaz K | 20 mg/mL | 50 μL | 100 μg/mL |
Etkinleştirme ortamı | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
KSOM | - | 1 mL | - |
Stronsiyum klorür | 1 M | 5 μL | 5 mM |
EGTA | 0,5 M, pH 8,0 | 4 μL | 2 mM |
PVP çözümü | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
M2 orta | - | 5 mL | - |
Pvp | - | 0,6 g | 12% |
PMSG çözümü | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
Pbs | - | 450 μL | - |
PMSG | 500 IU/mL | 50 μL | 50 IU/mL |
hCG çözümü | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
Pbs | - | 450 μL | - |
Hcg | 500 IU/mL | 50 μL | 50 IU/mL |
Hyaluronidaz ortamı | |||
Bileşen | Stok konsantrasyonu | Hacim / ağırlık | Son konsantrasyon |
M2 orta | - | 380 μL | - |
Hyaluronidaz | 10 mg/mL | 20 μL | 0,5 mg/mL |
Kısaltmalar: LIF = lösemi inhibitör faktörü; MEF = fare embriyonik fibroblast; | |||
FBS = fetal sığır serumu; DMEM = Dulbecco'nun Modifiye Kartal Ortası; BSA = sığır serum albümin; | |||
EDTA = etileniamintetraasetik asit; SDS = sodyum dodecylsulfate; EGTA = etilen-bis(oksitilennitrilo)tetraasetik asit; | |||
PBS = fosfat tamponlu salin; PVP = poliviniliptirolidon; hCG = insan koryonik gonadotropin; | |||
PMSG = hamile kısrak serum gonadotropin. |
Tablo 1: Orta, tampon ve çözelti tarifi.
Adı | Sıra (5' ila 3') | Uygulama | |
H19-DMR-P1 | GTG GTT AGT TCT ATA TGG GG | Genotipleme | |
H19-DMR-P2 | AGA TGG GGT CAT TCT TTT CC | Genotipleme | |
H19-DMR-P3 | TCT TAC AGT CTG GTC TTG GT | Genotipleme | |
IG-DMR-P1 | TGT GCA GCA GCA AAG CTA AG | Genotipleme | |
IG-DMR-P2 | CCA CAA AAA CCT CCC TTT CA | Genotipleme | |
IG-DMR-P3 | ATA CGA TAC GGC AAC CAA CG | Genotipleme | |
H19-DMR-gRNA1-F | CAC CCA TGA ACT CAG AAG AGA CTG | gRNA | |
H19-DMR-gRNA1-R | AAA CCA GTC TCT TCT GAG TTC ATG | gRNA | |
H19-DMR-gRNA2-F | CAC CAG GTG AGA ACC ACT GCT GAG | gRNA | |
H19-DMR-gRNA2-R | AAA CCT CAG CAG TGG TTC TCA CCT | gRNA | |
IG-DMR-gRNA1-F | CAC CCG TAC AGA GCT CCA TGG CAC | gRNA | |
IG-DMR-gRNA1-R | AAA CGT GCC ATG GAG CTC TGT ACG | gRNA | |
IG-DMR-gRNA2-F | CAC CCT GCT ETIKETI AGG TAC TAC GCT | gRNA | |
IG-DMR-gRNA2-R | AAA CAG CGT AGT ACC TCT AAG CAG | gRNA |
Tablo 2: Oligonükleotidlerin listesi.
Memelilerin somatik hücre nükleer transferi (SCNT) ile klonlaması 1990'larda19,20,21'deöncü olmuştur. Bu gelişmeler amfibilerde 30 yıl önce yapılan klonlama çalışmalarının ardından22. Önemli gecikme, memelilerde embriyoloji ve genomik baskı zorliğini yansıtır. Memeli SCNT'nin gelişimi, bu protokolde ayrıntılı olarak açıklanan sperm yerine haESC uygulamasının temelidir.
Hücre döngüsü senkronizasyonu SCNT23'ünbaşarısı için önemli bir faktördür. Bu protokolde haESC enjeksiyonu için de durum böyledir. Bir alıcıya donör genomu sokulması, embriyo gelişimini bozacak kromozomal kırılmayı veya aneuploidileri önlemek için hücre döngüsü aşamalarının eşleşmesini gerektirir. Yarı klonlama, iki genom ve bir sitoplastın uyumlu olması gereken ek karmaşıklığa sahiptir. Daha önceki bir rapor, M fazlı tutuklanmış androgenetik hESC'lerin enjeksiyonunun, yarı klonlanmış embriyoların G1 fazlı hESC'lerin oositlere enjeksiyonundan daha iyi gelişimsel oranlar sağladığını göstermiştir7. Bu rapor, yarı klonlama için uygun bir eşitleme noktası olarak M fazı önermektedir. Buna göre, fakihler metatatozda demekolsin ile mitotik olarak tutuklandı ve doğal olarak meiosis II metafazında tutuklanan MII oositlerinin ooplazmına enjekte edildi. Daha da önemlisi, M fazlı arrest, donör ve alıcı hücre döngüleri arasında mükemmel senkronizasyon sağlayan yüksek verimli fare ESC'lerinde elde edilebilir.
Mitoz sırasında, nükleer zar parçalanır ve çoğaltılan kromozomların bağlandığı bir mil oluşur. M fazlı DKO-fadezlerin enjeksiyonundan sonra, kardeş kromatlar sahte bir kutup gövdesine ve zigot7'ye (Şekil 3E) ayrılmıştır. Sonuç olarak, bir DKO-phaESC'den tek bir kromozom kümesi yarı klonlanmış embriyoya katkıda bulunur. DKO-phaESC kromozomlarının kardeş kromatlarının enjeksiyondan sonra doğru bir şekilde ayrıştırılabilmesi önemlidir. Sağlam bir DKO-phaESC'nin plazma zarı, sahte bir kutup gövdesine ayrımı önler. DKO-fazesklerin plazma zarının yırtılmadığı ve embriyoların enjeksiyondan sonra ooplazmada bozulmamış DKO-fakESC'ler sergilediği nadir vakaları gözlemledik (Şekil 3D). Bu nedenle DKO-fazesklerin plazma zarının pipetleme ile çıkarılmasına özen gösterilmelidir. Enjeksiyon sırasında, kromozom ayrım kusurlarına yol açabilecek ve aneuploidiye de neden olabilecek oosit meiotik milinin bozulmasını önlemek eşit derecede önemlidir.
Memelilerde, genomik baskı sperm replasmanı olarak fadezlerin uygulanmasını sınırlar. Partenogenetik hemECC'ler genomik izlerin anne yapılandırmasına sahipken, sperm bir baba yapılandırmasına sahiptir. Bu nedenle, tam süreli yavruların üretimi, sperm replasmanı olarak wildtype faesklerin enjekte edildikten sonra gerçekleşmedi. Bu sınırlamanın üstesinden gelmek için, IG- ve H19-DMR'lerin silinmesi faklarda tasarlanmıştır. Maternal Igf2-H19 ve Gtl2-Dlk1 loci'deki baskılı ifadenin değiştirilmesi, aktarılan 2 hücreli embriyolara dayanarak% 5,1'in üzerinde bir frekansa sahip yarı klonlanmış farelerin üretilmesine izin vermek için genomik baskıların yapılandırmasını değiştirmek için yeterlidir. Bu gözlemler, iki baskılı genin hedeflenmesi, fadeslerin genomunun farelerdeki spermlerin yerini alan işlevsel bir baba yapılandırmasına geçtiğini göstermektedir. Bununla birlikte, bu strateji için fadeslerin kalıcı bir genetik modifikasyonu gereklidir. Alternatif bir strateji olarak androgenetik haESC düşünülebilir. Androgenetik hESC'ler sperm genomundan türetilir ve baba izlerine sahiptir. Wildtype androgenetik hESC'lerin, transfer edilen embriyoların% 1.3 ila% 1.9'u arasında bir sıklıkta tam süreli yavrular üretmek için sperm replasmanı olarak katkıda bulunduğuna dair raporlar vardır4,7,24. Tam süreli yavrular ayrıca,transfer edilen 2 hücreli embriyoların% 20.2'si oranında IG ve H19-DMR'lerin silinmesi ile androgenetik hESC'lerin enjekte ederek elde edilmiştir24. Modifiye androgenetik hESC'ler kullanılarak yarı klonlamanın artan verimliliği, künyelerin kültürde kararsız hale gelebilmesinden muhtemeldir. Baskı kusurları kritik DMR'lerin genetik silmeleri ile düzeltilir.
Genetik modifikasyonların doğrudan oosit veya sperm genomlarına sokulmasındaki zorluk göz önüne alındığında, hESC'ler ebeveyn genomlarını ayrı ayrı manipüle etmek için değerli bir araçtır. Sperm yerine HESC'leri kullanmak, fare mikrop hattında genom düzenleme için olağanüstü bir avantaj sağlar. Yeni bir çalışma CRISPR/ Cas9 tabanlı genom düzenlemeyi embriyonik gelişim için kritik olan baskı bölgelerinin karakterizasyonu için HESK'lerin uygulanması ile birleştirdi12. Bu çalışma, Rasgrf1-DMR'nin bimaternal farelerin gelişiminde H19ve IG-DMR'lerle birlikte rolünü ve biipaternal farelerin gelişiminde 7 farklı DMR'nin işlevini analiz etti. Sperm için HESC'lerin ikame edilmesi yöntemi, ilkel mikrop hücresi gelişiminde DND1 proteini içindeki anahtar amino asitleri tanımlamak ve kemik gelişimindeki genleri tanımlamak için genetik tarama yaklaşımlarının temelini oluşturmuştur24,25,26. Embriyonik gelişimdeki temel faktörleri belirlemek için genomik baskı ve genetik tarama üzerine yapılan çalışmalar, HESC'lerin gametik genom olarak uygulanması için önemli yaklaşımlardır.
Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.
PhaESC hatlarının türeyen dr. Giulio Di Minin'e ve akış sitometrisi operasyonu için Dr. Remo Freimann'a teşekkür ederiz. Ayrıca Bayan Michèle Schaffner ve Bay Thomas M. Hennek'i embriyo transferi konusunda teknik destek için kabul ediyoruz. Bu çalışma İsviçre Ulusal Bilim Vakfı (grant 31003A_152814/1) tarafından desteklendi.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5 mLTube | Eppendorf | 0030 125.150 | haESC culture |
15 ml Tube | Greiner Bio-One | 188271 | haESC culture |
12-well plate | Thermo Scientific | 150628 | haESC culture |
24-well plate | Thermo Scientific | 142475 | haESC culture |
6-well plate | Thermo Scientific | 140675 | haESC culture |
96-well plate | Thermo Scientific | 167008 | haESC culture |
β-Mercaptoethanol | Merck | M6250 | haESC culture |
BSA fraction | Gibco | 15260-037 | haESC culture |
CHIR 99021 | Axon | 1386 | haESC culture |
Demecolcine solution | Merck | D1925 | haESC culture |
DMEM | Gibco | 41965-039 | haESC culture |
DMEM / F-12 | Gibco | 11320-033 | haESC culture |
DR4 mouse | The Jackson Laboratory | 3208 | haESC culture |
EDTA | Merck | E5134 | haESC culture |
FBS | biowest | S1810-500 | haESC culture |
Freezing medium | amsbio | 11897 | haESC culture |
Gelatin | Merck | G1890 | haESC culture |
Hepes solution | Gibco | 15630-056 | haESC culture |
Irradiated MEF | Gibco | A34966 | haESC culture |
LIF (Leukemia inhibitory factor) | (Homemade) | - | haESC culture |
Lipofection reagent | Invitrogen | 11668019 | haESC culture |
NDiff 227 | Takara | Y40002 | haESC culture |
PD 0325901 | Axon | 1408 | haESC culture |
Pen Strep | Gibco | 15140-122 | haESC culture |
piggyBac plasmid carrying a CAG-EGFP transgene | Addgene | #40973 | haESC culture |
piggyBac transposase plasmid | System Biosciences | PB210PA-1 | haESC culture |
pX330 plasmid | Addgene | #42230 | haESC culture |
pX458 plasmid | Addgene | #48138 | haESC culture |
Trypsin | Gibco | 15090-046 | haESC culture |
DNA polymerase | Thermo Scientific | F549S | Genotyping |
dNTP Mix | Thermo Scientific | R0192 | Genotyping |
Ethanol | Merck | 100983 | Genotyping |
Hydrochloric acid | Merck | 100317 | Genotyping |
Isopropanol | Merck | 109634 | Genotyping |
Proteinase K | Axon | A3830 | Genotyping |
SDS | Merck | 71729 | Genotyping |
Sodium chloride | Merck | 106404 | Genotyping |
ThermoMixer | Epeendorf | 5384000012 | Genotyping |
Tris | Merck | T1503 | Genotyping |
5 mL Tube | Falcon | 352063 | Flow cytometry |
5 mL Tube with cell strainer cap | Falcon | 352235 | Flow cytometry |
Hoechst 33342 | Invitrogen | H3570 | Flow cytometry |
MoFlo Astrios EQ | Beckman Coulter | B25982 | Flow cytometry |
1 mL syringe | Codan | 62.1640 | Superovulation |
30-gauge 1/2 inch needle | Merck | Z192362-100EA | Superovulation |
B6D2F1 mouse | The Jackson Laboratory | 100006 | Superovulation |
hCG | MSD animal health | 49451 | Superovulation |
PBS | Gibco | 10010015 | Superovulation |
PMSG | Avivasysbio | OPPA1037 5000 IU | Superovulation |
10-cm dish | Thermo Scientific | 150350 | Embryo manipulation |
4-well plate | Thermo Scientific | 179830 | Embryo manipulation |
50 mL tube | Greiner Bio-One | 227261 | Embryo manipulation |
6 cm dish | Thermo Scientific | 150288 | Embryo manipulation |
Center-well dish | Corning | 3260 | Embryo manipulation |
Digital rocker | Thermo Scientific | 88880020 | Embryo manipulation |
EGTA | AppliChem | A0878 | Embryo manipulation |
Hyaluronidase | Merck | H4272 | Embryo manipulation |
KSOM | Merck | MR-020P-5F | Embryo manipulation |
M16 medium | Merck | M7292 | Embryo manipulation |
M2 medium | Merck | M7167 | Embryo manipulation |
Mineral oil | Merck | M8410 | Embryo manipulation |
Glass capillary | Merck | P1049-1PAK | Embryo manipulation |
Stereomicroscope | Nikon | SMZ745 | Embryo manipulation |
Strontium chloride | Merck | 13909 | Embryo manipulation |
5ml syringe | Codan | 62.5607 | Microinjection |
Borosilicate glass cappilary | Science product | GB100T-8P | Microinjection |
CellTram 4r Oil | Eppendorf | 5196000030 | Microinjection |
Fluorinert FC-770 | Merck | F3556 | Microinjection |
Holding pipette | BioMedical Instruments | - | Microinjection |
Inverted microscope | Nikon | Eclipse Ti-U | Microinjection |
Microforge | Narishige | MF-900 | Microinjection |
Microinjection pipette | BioMedical Instruments | - | Microinjection |
Microlaoder tips | Eppendorf | 5252 956.003 | Microinjection |
Micromanipulaor arms | Narishige | NT-88-V3 | Microinjection |
Micropipette puller | Sutter Instrument | P-1000 | Microinjection |
PiezoXpert | Eppendorf | 5194000016 | Microinjection |
PVP (Polyvinylpyrrolidine) | Merck | PVP360 | Microinjection |
Syringe filter | SARSTEDT | 83.1826.001 | Microinjection |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır