Nanopor Teknolojisi Kullanılarak Kuduz Virüsünün Hızlı Karakterizasyonu için Tüm Genom Dizilimi

Araştırmamız, düşük ve orta gelirli ülkelerde patojen sürveyansını geliştirmek için gelişmiş genomik kullanıyor. Bu da yerel araştırmacıları kim, ne, nerede, neden ve ne zaman olmak üzere beş büyük soruyu yanıtlamaları için güçlendirmemize yardımcı oluyor. Ve bu, sahadaki pratik çözümler hakkında bilgi verebilir.

Sıralamayı merkezden uzaklaştırmak için nanopor teknolojisini kullanıyoruz. Kullanım kolaylığı, taşınabilirliği ve diğer platformlara göre daha ucuz maliyetleri, onu düşük kaynak ayarları için ideal hale getirir. Ve numune kaynağında hızlı bir şekilde dizileme yeteneği, hayvan-insan çevre arayüzünde gözetim yapabileceğimiz anlamına gelir.

Farklı kalitedeki örneklerden tüm genomları elde etmede zorluklarla karşılaşıyoruz. Genellikle, uzak bölgelerden gelen gönderiler kötü depolama koşullarında taşınır. Ayrıca, verilerin yorumlanmasında faydalı olabilecek biyoinformatik araçlar konusunda sınırlı uzmanlığa sahibiz.

Yani bu aletler MADDOG ve drug-V GLUE gibi olurdu. Bu, kontrolü başlatmaya yardımcı olmak için verileri evrensel bir şekilde yorumlamada kullanılabilir. Protokolün hızlı diziler veya kuduzun tüm genomik dizilimleri için nasıl optimize edilebileceğini göstermeye çalışıyoruz ve kuduzun gerçekte nasıl dolaştığı, ne dolaştığı ve ne zaman dolaştığı hakkında farklı soruları cevaplamak için düşük gelirli ülkelerde kuduzun dizilimi için nasıl uyarlanabileceğini ve kullanılabileceğini görmeye çalışıyoruz.

Ve bu bilgiler kuduz eliminasyon stratejileri için gereklidir. Viral genomik sürveyans artık daha erişilebilir. Bununla birlikte, yerel kontrol çabaları için veri analizi ve yorumlama rehberliği daha sınırlıdır.

Protokolümüz, yerel bilim insanlarını ön saflarda gözetim yetenekleriyle güçlendiren uçtan uca bir boru hattı sunar. Viral genomların ve bu verileri yorumlama yöntemlerinin daha fazla kullanılabilirliği, araştırmacıların epidemiyolojik içgörüyü hükümet bakanlıkları veya hastalık kontrol programları için eyleme geçirilebilir bilgilere dönüştürmesine ve karar verme sürecine rehberlik etmesine olanak tanır.