El reemplazo del tejido muscular sano con grasa intramuscular es una característica prominente de las enfermedades y afecciones humanas. Este protocolo describe cómo visualizar, visualizar y cuantificar la grasa intramuscular, lo que permite el estudio riguroso de los mecanismos subyacentes a la formación de grasa intramuscular.
Los progenitores fibroadipogénicos (FAP) son células del estroma mesenquimal que desempeñan un papel crucial durante la homeostasis y regeneración del músculo esquelético. Los FAP construyen y mantienen la matriz extracelular que actúa como un andamio molecular de miofibra. Además, los FAP son indispensables para la regeneración de miofiberes, ya que secretan una multitud de factores beneficiosos detectados por las células madre musculares (MuSC). En estados enfermos, sin embargo, los FAPs son el origen celular de la grasa intramuscular y el tejido cicatricial fibrótico. Esta fibrosis grasa es un sello distintivo de la sarcopenia y las enfermedades neuromusculares, como la distrofia muscular de Duchenne. Una barrera importante para determinar por qué y cómo los FAP se diferencian en grasa intramuscular es la preservación efectiva y la posterior visualización de los adipocitos, especialmente en las secciones de tejido congelado. Los métodos convencionales de procesamiento del tejido muscular esquelético, como la congelación instantánea, no preservan adecuadamente la morfología de los adipocitos individuales, lo que impide una visualización y cuantificación precisas. Para superar este obstáculo, se desarrolló un riguroso protocolo que preserva la morfología de los adipocitos en las secciones del músculo esquelético, lo que permite la visualización, la obtención de imágenes y la cuantificación de la grasa intramuscular. El protocolo también describe cómo procesar una porción de tejido muscular para RT-qPCR, lo que permite a los usuarios confirmar los cambios observados en la formación de grasa al ver las diferencias en la expresión de genes adipogénicos. Además, se puede adaptar para visualizar adipocitos mediante inmunofluorescencia de montaje completo de muestras musculares. Finalmente, este protocolo describe cómo realizar el rastreo genético del linaje de los FAPs que expresan Pdgfrα para estudiar la conversión adipogénica de los FAPs. Este protocolo produce consistentemente imágenes inmunofluorescentes de alta resolución y morfológicamente precisas de adipocitos, junto con la confirmación por RT-qPCR, lo que permite una visualización y cuantificación robustas, rigurosas y reproducibles de la grasa intramuscular. En conjunto, la línea de análisis descrita aquí es el primer paso para mejorar nuestra comprensión de cómo los FAP se diferencian en grasa intramuscular, y proporciona un marco para validar nuevas intervenciones para prevenir la formación de grasa.
La infiltración de tejido muscular sano con fibrosis grasa es una característica prominente de la distrofia muscular de Duchenne (DMD) y otras enfermedades neuromusculares, así como la sarcopenia, la obesidad y la diabetes 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10 . Aunque el aumento de la infiltración de grasa en estas condiciones está fuertemente asociado con la disminución de la función muscular, nuestro conocimiento de por qué y cómo se forma la grasa intramuscular sigue siendo limitado. Los FAPs son una población multipotente de células del estroma mesenquimal presente en la mayoría de los órganos adultos, incluido el músculo esquelético11,12. Sin embargo, con la edad y en las enfermedades crónicas, los FAP producen tejido cicatricial fibrótico y se diferencian en adipocitos, que se encuentran entre las miofibras individuales y forman grasa intramuscular 13,14,15,16,17,18,19,20.
Para comenzar a combatir la formación de grasa intramuscular, es necesario definir los mecanismos de cómo los FAP se convierten en adipocitos. PDGFRα es el marcador "estándar de oro" en el campo para identificar FAPs dentro del músculo de múltiples especies 13,16,17,18,20,21,22,23,24,25,26,27. Como resultado, se han generado varias líneas de Cre inducibles con tamoxifeno murino, bajo el control del promotor Pdgfrα, lo que permite manipular genéticamente faPs in vivo utilizando el sistema Cre-LoxP 27,28,29. Por ejemplo, al combinar esta línea cre inducible con un reportero genético, se puede realizar el rastreo de linaje de FAPs, una estrategia que hemos aplicado con éxito al mapa de destino FAPs en músculo y tejido adiposo blanco 20,30. Además del rastreo de linaje, estas líneas cre proporcionan herramientas valiosas para estudiar la conversión de FAP a grasa.
Un obstáculo importante en la definición del mecanismo de la conversión adipogénica de los FAP en grasa intramuscular es la capacidad de cuantificar de manera rigurosa y reproducible la cantidad de grasa intramuscular que se ha formado en diferentes condiciones. La clave es equilibrar la preservación del tejido muscular y graso y hacer coincidir esto con los métodos de tinción disponibles para visualizar los adipocitos. Por ejemplo, el músculo esquelético a menudo se congela sin fijación previa, preservando las miofibras pero interrumpiendo la morfología de los adipocitos (Figura 1). Por el contrario, la fijación seguida de la incrustación de parafina, al tiempo que muestra la mejor histología tisular, incluidos los adipocitos, elimina todos los lípidos, lo que hace que la mayoría de los tintes lipofílicos, como el tinte oil red O comúnmente utilizado, sean inutilizables.
Figura 1: Imágenes representativas de la grasa intramuscular en tejidos musculares congelados frente a tejidos musculares fijos. (A) Descripción general esquemática de la configuración experimental. Imágenes inmunofluorescentes que muestran adipocitos (amarillo), miofibras (gris) y núcleos (cian) dentro de los TA (B) congelados al presión y (C) fijos a los 21 días después de la lesión por glicerol. Barras de escala: 50 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
El protocolo descrito aquí preserva la morfología de miofibra y adipocitos y permite la visualización y el análisis de múltiples tipos de células. Este enfoque se basa en la tinción por inmunofluorescencia de adipocitos en tejido muscular fijo de paraformaldehído (PFA), lo que permite la tinción conjunta con múltiples anticuerpos. También se puede adaptar fácilmente para mostrar espacialmente la grasa intramuscular en el tejido intacto utilizando imágenes de montaje completo, proporcionando así información sobre el microambiente celular de la grasa dentro del músculo. Además, este protocolo se puede combinar con nuestro enfoque recientemente publicado para determinar el área transversal de las miofiberes en tejidos musculares fijos31, una medida importante para evaluar la salud muscular. La combinación de este enfoque con el rastreo del linaje genético para mapear el destino, la diferenciación de los FAP en adipocitos también se describe aquí. Por lo tanto, el protocolo versátil descrito aquí permite una evaluación rigurosa y reproducible de los FAPs y su diferenciación en grasa intramuscular en secciones de tejido y tejidos intactos.
Figura 2: Descripción general del protocolo esquemático. Descripción general esquemática del procesamiento de tejidos en el que se extrae un tercio de la AT, se congela al instante y se homogeneiza para el posterior aislamiento de ARN y el análisis de transcripción a través de RT-qPCR. Los otros dos tercios de la AT se fijan con PFA y se procesan para inmunotinción en secciones congeladas o fibras de montaje completo. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Todos los protocolos de animales fueron aprobados por el Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales (IACUC) de la Universidad de Florida.
1. Rastreo genético del linaje de los FAPs
NOTA: Si no se desea el rastreo genético del linaje de los FAP, se puede omitir el paso 1.
2. Lesión del músculo tibial anterior (TA)
NOTA: Para estudiar la grasa intramuscular, se recomienda utilizar un modelo de lesión a base de glicerol (50% de glicerol en solución salina estéril), lo que resulta en la formación masiva de grasa intramuscular 34,35,36,37.
3. Cosecha de tejidos
Figura 3: Resumen de la cosecha de tejidos. (A) La piel se corta en la base de la pierna y (B) los músculos de las extremidades posteriores están expuestos. (C) Una vez que se retira el epimisio de la AT, (D) se utilizan fórceps para separar parcialmente el músculo y garantizar que el epimisio se haya eliminado por completo. (E) La TA se corta de la pierna con un bisturí y se retira después de cortar el tendón. (G) Después de cortar el TA en una pieza de un tercio y dos tercios, (H) un tercio se congela a presión en nitrógeno líquido para el análisis RT-qPCR y (I) los otros dos tercios se fijan en PFA al 4% para histología. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
4. Incrustación
5. Seccionamiento
6. Tinción inmunofluorescente (IF) de secciones de tejido
NOTA: Como las concentraciones de anticuerpos pueden variar entre lotes y fabricantes, se recomienda la optimización mediante la evaluación de varias concentraciones diferentes de los anticuerpos en las diapositivas de prueba antes de teñir las diapositivas de interés.
7. Tinción inmunofluorescente de montaje completo
8. Imágenes de grasa intramuscular
9. Cuantificación de los adipocitos
10. Análisis de expresión génica adipogénica mediante RT-qPCR
Visualización inmunofluorescente de la grasa intramuscular
Siguiendo los pasos anteriores y viendo la Figura 1A, se recolectaron secciones de tejido de TA de una lesión posterior al glicerol de 21 días que se congelaron inmediatamente después de la recolección en isopentano enfriado con LN2 o se fijaron en PFA al 4% durante 2,5 h. Después de crioseccionar y teñir ambas muestras, se tomaron imágenes en la mitad del vientre, el área más grande de la AT. Los adipocitos PERILIPIN+ de las AATT no fijadas (Figura 1B) han alterado significativamente la morfología en comparación con las secciones fijas (Figura 1C), lo que hace que su identificación, visualización y posterior cuantificación sean mucho más difíciles y potencialmente inexactas. A tener en cuenta, las primeras gotas lipídicas de PERILIPIN+ se detectaron alrededor de los 5 días posteriores a la lesión, y la mayoría de los adipocitos se formaron en el día 7. A los 21 días después de la lesión, los adipocitos habían madurado completamente.
Como la cantidad de grasa por TA se correlaciona fuertemente con la gravedad de la lesión inducida, los TA deben lesionarse significativamente para observar y estudiar eficazmente la formación de grasa intramuscular. Practicar inyecciones con tinta en los AATT de cadáveres es una excelente manera de mejorar la gravedad de las lesiones. Las lesiones exitosas tienden a estar por encima del 50% del músculo. Para tener en cuenta, las áreas lesionadas del músculo representan áreas desprovistas de fibras musculares o áreas que están pobladas por fibras musculares que contienen al menos un núcleo ubicado centralmente, un sello distintivo conocido de una fibra muscular regeneradora.
Este protocolo se puede adaptar fácilmente para manchar para FAPs y grasa en 3D. Para esto, múltiples miofibras de la TA posterior a la fijación se separaron cuidadosamente, seguidas de inmunofluorescencia de montaje completo. La clave es asegurar adecuadamente las fibras al portaobjetos de vidrio y, al mismo tiempo, evitar la compresión excesiva del tejido. Mediante el uso de pies de arcilla moldeables, el usuario puede ajustar el grosor requerido y asegurar el deslizamiento a la corredera, incluso permitiendo el uso de un microscopio invertido (Figura 4A). Este método se utilizó con éxito para etiquetar PDGFRα+ FAPs, Fiberas de faloidina+ y adipocitos que expresan PERILIPIN (Figura 4B, Video Suplementario 1 y Video Suplementario 2). Después de obtener imágenes en múltiples planos z que abarcan hasta 150 μm de espesor, se utilizó el módulo de renderizado 3D dentro del software del microscopio para crear una reconstrucción 3D.
Figura 4: Tinción inmunofluorescente de montaje completo. (A) Vista superior y lateral de cómo montar la muestra y agregar una cubierta para la tinción de montaje completo. (B) Reconstrucciones 3D representativas de FAPs (verde; izquierda) y adipocitos (rojo; derecha) junto con miofibras (gris) y núcleos (azul). Barras de escala: 50 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Cuantificación de la grasa intramuscular
Una vez que se han tomado imágenes de grasa intramuscular, se utilizó la función de contador celular en ImageJ/FIJI para contar manualmente el número de adipocitos PERLIPIN+ (Figura 5A). A continuación, se determinó el área total de la sección muscular, así como el área lesionada, definida por núcleos ubicados centralmente dentro de las miofiberes. Para controlar la gravedad de la lesión, el número total de adipocitos se dividió por el área lesionada, lo que resultó en el número de células grasas por 1 mm2 de músculo lesionado. Por lo general, las AATT que muestran un daño <30% se excluyen de las cuantificaciones. A tener en cuenta, aunque los adipocitos son raros sin lesión, oscilando entre cero y ocho por área transversal, el número total de adipocitos todavía está normalizado por área total. Como se destaca en la Figura 5B, una lesión por glicerol causa cantidades masivas de grasa intramuscular en comparación con un músculo TA no lesionado. Alternativamente, como la tinción de perilipina es muy limpia con una alta relación señal-ruido, también es posible utilizar la función Analizar partícula para determinar el área total ocupada por perilipina. Sin embargo, este método no podrá distinguir entre adipocitos más pequeños y menos. Se tomaron imágenes y cuantificaron hasta tres secciones de un mínimo de cuatro animales individuales, y se informó el número promedio de células grasas presentes por ratón.
Figura 5: Cuantificaciones de la grasa intramuscular. (A) Imagen representativa de cómo contar los adipocitos PERILIPIN+ (blanco) utilizando la función Contador Celular en ImageJ. Barra de escala: 50 μm. (B) Cuantificaciones de adipocitos TA enteros 21 días después de la inyección de glicerol normalizadas a 1 mm2 del área lesionada. Cada punto representa el promedio de un ratón. Barras de error mostradas como SEM. **** = p < 0,0001. (C) La capa de ARN después de la homogeneización y la posterior separación de fases por cloroformo se está utilizando para el análisis RT-qPCR. (D) Cambios en los niveles de expresión de Pparg y Cepbα, genes adipogénicos tempranos, y Plin1 y Adipoq, dos marcadores de adipocitos maduros, en diferentes puntos de tiempo después de la lesión por glicerol. Cada punto representa el promedio de un ratón. Barras de error que se muestran como SEM. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Para confirmar de forma independiente la cantidad de grasa intramuscular presente, se pueden determinar los niveles de expresión génica de varios marcadores adipogénicos. Para esto, el ARN se puede aislar de una porción del mismo músculo TA utilizado para la inmunofluorescencia (ver pasos arriba) en diferentes puntos después de la lesión. Se utilizó un batidor de cuentas en combinación con tiocianato de guanidio para homogeneizar el tejido. Después de agregar cloroformo seguido de centrifugación, la capa superior que contiene ARN se extrajo cuidadosamente y se utilizaron mini columnas de espín para la limpieza de ARN (Figura 5C). Este método produce rutinariamente alta calidad y cantidad de ARN adecuado para todos los análisis posteriores, como RT-qPCR y RNAseq. Para RT-qPCR, se determinaron los niveles de expresión relativos de los genes adipogénicos a los de limpieza, y se evaluaron los cambios relativos siguiendo el método ΔΔCT38. Como se describe en la Figura 5D, en comparación con el músculo TA no lesionado, la lesión por glicerol induce la expresión de marcadores adipogénicos tempranos como Pparg y Cebpα tan pronto como 3 días después de la lesión. Los marcadores maduros, como la adiponectina (Adipoq) y la perilipina (Plin1), se pueden detectar tan pronto como 5 días después de la lesión por glicerol.
Rastreo genético del linaje de los adipocitos
El protocolo de tinción de adipocitos presentado aquí se puede adaptar fácilmente para incluir el rastreo genético del linaje de los FAP para mapear y seguir su destino en adipocitos. Por ejemplo, hemos demostrado previamente que la recombinación podría inducirse mediante la administración de tamoxifeno en PdgfrαCreERT2; RatonesRosa26 EYFP 2 semanas antes de la lesión, eliminando efectivamente la codificación de parada floxed y activando indeleblemente la expresión de EYFP en FAPs (Figura 6A). Logramos altas eficiencias de recombinación con el régimen de tamoxifeno presentado aquí, con ~ 75% de PDGFRα + FAPs expresando EYFP20, similar a lo que otros laboratorios han reportado 27,39,40. Demostrando que los FAP son de hecho el origen celular de la grasa intramuscular, la mayoría de los FAP se han convertido en adipocitos que expresan EYFP + PERILIPIN 7 días después de la lesión por glicerol (Figura 6B).
Figura 6: Trazado de linaje de FAPs. (A) Visión general esquemática de la configuración experimental. (B) Imágenes inmunofluorescentes representativas que muestran una recombinación y activación exitosas de EYFP (amarillo) dentro de los FAPs PDGFRα+ (rojo, puntas de flecha) y los adipocitos PERILIPIN+ (rojo, asteriscos). Barras de escala: 25 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Detección de múltiples tipos de células
Este protocolo también se puede utilizar para visualizar el compartimento miogénico. Usando anticuerpos contra PAX7 y MYOD1, las células madre musculares (MuSC) y los mioblastos, respectivamente, se pueden detectar fácilmente 5 días después de la lesión por glicerol incluso en la sección de tejido muscular fijado por PFA (Figura 7). Por lo tanto, el protocolo presentado es versátil y adaptable no solo a los adipocitos de etiqueta e imagen y a los FAPs, sino también a otros tipos de células del linaje miogénico.
Figura 7: Tinción inmunofluorescente de células madre musculares y mioblastos. (A) Descripción general esquemática de la configuración experimental. (B) Imágenes inmunofluorescentes representativas que muestran una tinción exitosa de células madre musculares (MuSC) (amarillo, izquierda) con PAX7 y mioblastos (amarillo, derecha) con MYOD1. LAMININ delinea las miofibras (blancas), y los núcleos están en cian. Barras de escala: 50 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Video suplementario 1: Renderizado 3D de FAPs. Reconstrucción tridimensional de miofibras, FAPs y núcleos teñidos para PHALLOIDIN (gris), PDGFRα (verde) y DAPI (azul), respectivamente, 21 días después de la lesión. Haga clic aquí para descargar este video.
Video suplementario 2: Representación 3D de grasa intramuscular. Representación volumétrica de haces de miofiber (gris, FALOIDINA) y grasa intramuscular (rojo, PERILIPINA), que ha reemplazado a una miofibra 21 días después de la lesión por glicerol. Haga clic aquí para descargar este video.
Este protocolo describe un protocolo extenso y detallado que permite una visualización eficiente y una cuantificación rigurosa de la grasa intramuscular. Al dividir el mismo músculo en dos partes, una que se utiliza para la inmunofluorescencia y la otra para el análisis RT-qPCR, este protocolo también es muy versátil. También se puede combinar con el rastreo del linaje genético de los FAP para estudiar su conversión en adipocitos bajo ciertas condiciones y es altamente adaptable para etiquetar e imaginar múltiples tipos de células adicionales.
Las formas más utilizadas para visualizar la grasa intramuscular son las secciones de parafina seguidas de tinción de hematoxilina y eosina o las secciones congeladas teñidas para colorantes lipofílicos como Oil Red O (ORO). Sin embargo, mientras que los tejidos procesados con parafina mantienen la mejor histología, el mismo proceso también extrae todos los lípidos impidiendo el uso de colorantes lipofílicos. Aunque los métodos de tinción lipofílica funcionarán tanto en secciones de tejido fijas como no fijadas con PFA, las gotas de lípidos se desplazan fácilmente aplicando presión a la cubierta, distorsionando así la distribución espacial de la grasa intramuscular. Para evitar esto, un estudio reciente estableció un protocolo riguroso para visualizar los adipocitos ORO + utilizando un enfoque de montaje completo. Para ello, los autores descelularizaron la AT para visualizar la distribución espacial de la grasa intramuscular a lo largo de toda la AT41. Tan poderosa como es esta técnica, también evita el uso de otras co-manchas para marcar estructuras celulares adicionales. Todo el enfoque de inmunofluorescencia de montaje presentado aquí se puede utilizar para teñir conjuntamente los adipocitos con una variedad de marcadores que permiten un mapeo fino del entorno celular. Un desafío importante, sin embargo, es la penetración tisular de los anticuerpos. Cuantas más fibras se mantengan juntas, más difícil será para los anticuerpos penetrar y unirse por igual a todos los antígenos disponibles. Por lo tanto, este método es más efectivo cuando se observan pequeños grupos de fibras. Al mismo tiempo, esto también es una limitación, ya que la ubicación anatómica general de la grasa intramuscular se está perdiendo cuando se enfoca solo en pequeños haces de fibra pelados. Sin embargo, con el desarrollo actual de nuevos métodos de limpieza de tejidos más la nueva tecnología de imágenes, será posible una mayor penetración y visualización de tejidos en el futuro 42,43,44.
Si bien la fijación previa del tejido muscular preserva la morfología de los adipocitos, también crea un desafío para evaluar el tamaño de las miofiberes, una medida importante de la salud muscular. El tamaño de miofibra se determina midiendo el área de sección transversal de las miofiberes. Hemos informado previamente que la fijación previa del tejido muscular hará que la mayoría de los marcadores disponibles para delinear las miofibers fallen31. Para superar este obstáculo, hemos desarrollado una novedosa tubería de segmentación de imágenes, que permite la medición del tamaño de miofiber incluso en secciones musculares fijas31. Por lo tanto, hemos establecido una tubería de procesamiento de tejidos robusta y eficiente que, combinada con este protocolo, supera la mayoría de las desventajas causadas por la fijación previa del tejido muscular.
Otra ventaja importante de este enfoque es la versatilidad. Al dividir la AT en dos partes, se maximiza la cantidad de información que se puede obtener de un músculo. Esto no solo reduce el número de animales, sino que también agrega una capa adicional de control al confirmar la histología a través de la expresión génica y viceversa. Además, se pueden examinar muchos genes diferentes más allá de los genes adipogénicos. El ARN aislado también se puede utilizar para un experimento de RNAseq de músculo completo. Finalmente, la pieza muscular congelada al chasquido también se puede usar para el trabajo con proteínas. Una limitación de este protocolo es la posibilidad de que la lesión no sea consistente en toda la longitud de la AT. Esto podría conducir a un escenario en el que las dos partes musculares divergen en la cantidad de grasa intramuscular que contienen y puede justificar la exclusión de dicha muestra de cualquier análisis posterior. Por lo tanto, se recomienda no simplemente confiar en RT-qPCR para sacar conclusiones importantes sobre la cantidad de grasa intramuscular, sino más bien como datos de apoyo a las cuantificaciones histológicas.
Juntos, este protocolo describe una línea de procesamiento de tejidos robusta, eficiente y rigurosa que permitirá la visualización y cuantificación de la grasa intramuscular, el primer paso en el desarrollo de nuevas opciones de tratamiento para combatir la fibrosis grasa. Al mismo tiempo, es versátil y se puede adaptar a muchos tipos de células diferentes dentro del músculo, así como adipocitos en otros tejidos.
Los autores no declaran intereses contrapuestos.
Agradecemos a los miembros del laboratorio Kopinke por ayudar con la recopilación de datos y la lectura crítica del manuscrito. También agradecemos a los miembros del Instituto de Miología de la Universidad de Florida por su valiosa contribución sobre el manuscrito. El trabajo fue apoyado por la subvención de los NIH 1R01AR079449. La Figura 2 fue creada con Biorender.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
16% PFA (Pack of 12, 10 mL bottles) | Electron Miscroscopy Sciences | 15710 | |
2.0 mL Microcentrifuge Tubes | Fisher Scientific | 05-408-138 | microcentrifuge tubes for snapfreezing/bead beating |
2-Methylbutane (4 L) | Fisher Chemical | O3551-4 | isopentane |
Absolute Ethanol (200 proof) | ThermoFisher Scientific | BP2818100 | |
AffiniPure Fab fragment donkey anti-mouse | Jackson ImmunoResearch | 715-007-003 | mouse-on-mouse blocking |
Alexa Fluor 488 donkey anti-chicken secondary antibody | Jackson ImmunoResearch | 703-545-155 | |
Alexa Fluor 488 donkey anti-mouse secondary antibody | Invitrogen | A21202 | |
Alexa Fluor 488 donkey anti-rabbit secondary antibody | Invitrogen | A21206 | |
Alexa Fluor 568 donkey anti-goat secondary antibody | Invitrogen | A11057 | |
Alexa Fluor 568 donkey anti-rabbit secondary antibody | Invitrogen | A11037 | |
Alexa Fluor 568 Phalloidin antibody | Invitrogen | A12380 | Dissolved in 1.5 mL methanol (~66 µM working solution) |
BioLite 24-well Multidishes | ThermoFisher Scientific | 930186 | 24 well plate for PFA tissue incubation |
Biometra TOne | analytikjena | 8462070301 | Thermal cycler |
Chicken anti-GFP antibody | Aves Labs | GFP-1020 | |
Chloroform/isoamyl alcohol 24:1(v/v) for molecular biology, DNAse, RNAse, and Protease free | ThermoFisher Scientific | AC327155000 | |
Corn oil | Sigma Aldrich | C8267 | |
DAPI stain | Invitrogen | D1306 | 150 µM working solution in dH2O |
Donkey Serum (100 mL) | Millipore Sigma | 5058837 | for blocking solution |
Dumont #5 Forceps | Fine Science Tools | 11251-20 | sharp-tipped tweezers |
Fine Scissors Straight 9 cm | Fine Science Tools | 14060-09 | |
Fluoromount-G | SouthernBiotech | 0100-01 | mounting medium |
Glycerol, 99.5%, for molecular biology (500 mL) | Acros Organics | 327255000 | |
Goat anti-PDGFRα antibody | R&D | AF1062 | |
Hybridization Oven | VWR | 230301V | for Tamoxifen incubation |
ImmEdge Hydrophobic Barrier PAP Pen | Vector Laboratories | H-4000 | hydrophobic pen |
Insulin Syringe with Micro-Fine IV needle (28 G) | BD | 329461 | |
Insulin Syringe with Slip Tip, 1 mL | BD | 329654 | Insulin syringe without needle, for oral gavaging |
iScript cDNA Synthesis Kit | Bio-Rad | 1708890 | |
Isoflurane | Patterson Veterinary | 78938441 | |
Leica DMi8 inverted microscope | Leica | micrscope used for widefield IF and confocal imaging | |
Micro Slides | VWR | 48311-703 | positively charged microscope slides |
mouse anti-MYOD antibody | Invitrogen | MA1-41017 | |
mouse anti-PAX7 antibody (supernatant) | DSHB | AB 428528 | |
MX35 Premier+ Microtome blades | ThermoFisher Scientific | 3052835 | microtome blades |
NanoDrop 2000 Spectrophotometer | ThermoFisher Scientific | ND2000 | spectrophotometer for RNA yield |
Play-Doh | Hasbro | modeling compound | |
PowerUp SYBR Green Master Mix | ThermoFisher Scientific | A25742 | green dye PCR master mix |
Puralube Vet Ointment | Puralube | 17033-211-38 | vet ophthalmic ointment |
QuantStudi 6 Flex Real-Time 384-well PCR System | Applied Biosystems | 4485694 | qPCR machine |
Rabbit anti-perilipin antibody | Cell Signaling Technology | 9349S | |
Red-Rotor Shaker | Hoefer Scientific | PR70-115V | shaker for IF staining |
Richard-Allan Scientific Slip-Rite Cover Glass | ThermoFisher Scientific | 152460 | coverslips |
RNeasy Mini Kit | QIAGEN | 74106 | contains mini spin columns |
Safe-Lock Tubes 1.5 ml, natural | Eppendorf | 22363204 | |
Sample Tubes RB (2 mL) | QIAGEN | 990381 | |
Sodium azide | Alfa Aesar | 14314 | |
Stainless Steel Beads, 2.8 mm | Precellys | KT03961-1-101.BK | small beads |
Stainless Steel Beads, 5 mm | QIAGEN | 69989 | medium beads |
Stainless Steel Beads, 7 mm | QIAGEN | 69990 | large beads |
Stainless Steel Disposable Scalpels | Miltex | 327-4102 | scalpel |
Stainless steel feeding tube, 20 G x 38 mm, straight | Instech Laboratories | FTSS-20S-3 | gavage needle |
Tamoxifen | Toronto Research Chemicals | T006000 | |
Tissue Plus O.C.T. Compound | Fisher HealthCare | 4585 | embedding medium |
TissueLyser LT | QIAGEN | 85600 | bead beater |
TissueLyser LT Adapter, 12-Tube | QIAGEN | 69980 | |
Tissue-Tek Cryomold | Sakura | 4566 | specimen molds |
Triton X-100 | Alfa Aesar | A16046 | |
TRIzol Reagent | ThermoFisher Scientific | 15596026 | guanidium thiocyanate |
Tween20 (500 mL) | Fisher BioReagents | BP337-500 | |
VWR Micro Slides - Superfrost Plus | VWR | 48311703 | |
Wheaton Coplin staining jars | Millipore Sigma | S6016 | Coplin jar |
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