In vitro Mapeo químico de estructuras de ADN G-cuádruple por bis-3-cloropiperidinas

Los G-cuádruples son estructuras secundarias de ácidos nucleicos que normalmente se forman dentro de secuencias de ADN ricas en guanina. El mapeo químico de G4 por B-CePs tiene como objetivo la caracterización in vitro de G4 y permite la identificación de las guaninas específicas que forman las G-tétradas. La identificación y validación experimental de G4s dentro de posibles secuencias de formación de G-cuádruples es un tema biológicamente relevante, que actualmente se aborda principalmente a través de herramientas computacionales.

Para respaldar tales predicciones y detectar el G4 no predicho, el mapeo químico por B-CePs representa un método accesible para identificar G4 en secuencias de ADN. El mapeo químico por B-CePs es una alternativa conveniente al protocolo de huella de dimetilsulfato ampliamente utilizado para la caracterización de G-quadruplex. La ventaja clave de los B-CeP es que reduce el número de pasos en el protocolo y reduce la cantidad inicial del sustrato de ADN.

El mapeo químico por B-CeP se describe aquí con la secuencia TBA como prueba de concepto. El protocolo conducirá a nuevos experimentos aplicables a cualquier otra secuencia potencial de formación de G-quadruplex que explore las construcciones de ADN y ARN.