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Riepilogo

Questo protocollo presenta un metodo per generare organoidi vascolari utilizzando cellule staminali pluripotenti umane.

Abstract

Gli organoidi vascolari derivati da cellule staminali pluripotenti indotte umane (hiPSC) ricapitolano la diversità dei tipi cellulari e la complessa architettura delle reti vascolari umane. Questo modello tridimensionale (3D) ha un notevole potenziale per la modellazione della patologia vascolare e lo screening dei farmaci in vitro . Nonostante i recenti progressi, rimane una sfida tecnica fondamentale per la generazione riproducibile di organoidi con una qualità costante, che è fondamentale per i saggi e le applicazioni a valle. Qui viene presentato un protocollo modificato che migliora sia l'omogeneità che la riproducibilità della generazione di organoidi vascolari. Il protocollo modificato incorpora l'uso di micropozzetti e del cocktail CEPT (chroman 1, emricasan, poliammine e l'inibitore integrato della risposta allo stress, trans-ISRIB) per migliorare la formazione del corpo embrioide e la sopravvivenza cellulare. Gli organoidi vascolari maturi e differenziati generati utilizzando questo protocollo sono caratterizzati dalla microscopia a immunofluorescenza 3D a montaggio intero per analizzarne la morfologia e la vascolarizzazione complessa. Questo protocollo consente la produzione di organoidi vascolari di alta qualità in modo scalabile, facilitando potenzialmente il loro utilizzo nella modellazione delle malattie e nelle applicazioni di screening dei farmaci.

Introduzione

Nell'ultimo decennio sono emersi modelli microfisiologici in vitro, inclusi organoidi e sistemi tissue-on-a-chip 1,2,3. Questi sistemi tridimensionali (3D) derivati da cellule umane affrontano i limiti delle colture cellulari bidimensionali convenzionali (2D) e dei modelli animali, come la mancanza di molti componenti nel microambiente fisiologico e le differenze genetiche tra le specie, rispettivamente. Forniscono più informazioni fisiologiche e sono più adatti per la modellazione delle malattie e lo screening dei farmaci rispetto ai modelli convenzionali. Tra i modelli microfisiologici, è stato dimostrato che gli organoidi derivati da cellule staminali pluripotenti indotte umane (hiPSC) ricapitolano efficacemente le caratteristiche architettoniche dei tessuti umani nativi e sono stati sviluppati per imitare diversi organi umani, tra cui il cervello 4,5, il rene6, il fegato 7,8 e la retina9. Qui, ci concentriamo in particolare sulla generazione di organoidi vascolari da hiPSC e delineiamo un protocollo semplificato che mira a ridurre al minimo le variazioni tra diversi campioni e lotti di organoidi, migliorando così la riproducibilità complessiva.

La vascolarizzazione svolge un ruolo cruciale nel mantenimento dell'omeostasi fisiologica in tutti gli organi umani. La formazione del sistema vascolare coinvolge i processi di vasculogenesi e angiogenesi, orchestrati attraverso le interazioni tra cellule endoteliali e murali (ad esempio, periciti e cellule muscolari lisce vascolari) e influenzati da vari stimoli10. Penninger, Wimmer e colleghi hanno sviluppato il primo metodo di generazione di organoidi vascolari11,12 che imita questi due processi. Con gli organoidi generati da questo metodo, il loro gruppo12 e noi13,14 hanno dimostrato il potenziale degli organoidi vascolari per la modellazione di disfunzioni vascolari nelle malattie. Ad esempio, nei nostri recenti lavori 13,14, sono stati osservati fenotipi distinti, come la germinazione dei vasi e le variazioni della composizione cellulare murale, tra gli organoidi vascolari che imitano la malattia e le loro controparti wild-type. Questi esempi evidenziano che il modello di organoide vascolare potrebbe fungere da piattaforma per lo screening dei farmaci imitando i malfunzionamenti vascolari correlati alla malattia.

Costruito sui lavori iniziali di generazione di organoidi vascolari11,12, viene presentato un protocollo rivisto che include l'uso di micropozzetti per facilitare la formazione di corpi embrioidi omogenei (EB), un fattore critico per ridurre al minimo le variazioni spesso osservate all'interno dello stesso lotto di generazione di organoidi. Inoltre, il cocktail CEPT, una combinazione di cromo 1, emricasan, poliammine e l'inibitore integrato della risposta allo stress (trans-ISRIB)15, viene impiegato per migliorare la vitalità delle hiPSC e delle cellule differenziate durante il processo di formazione dell'EB. Questa modifica serve principalmente a ridurre le variazioni tra i diversi campioni e lotti di organoidi. Con questo protocollo della durata di circa due settimane, è possibile produrre organoidi vascolari uniformi, in cui la vasculogenesi viene indotta per aiutare l'endotelio a organizzarsi in reti tubulari primitive il giorno 1, seguita dall'induzione dell'angiogenesi il giorno 5 per sviluppare reti vascolari complesse negli organoidi. Nei giorni 12-15, gli organoidi generati dovrebbero mostrare reti vascolari mature composte sia da endotelio che da cellule murali.

Protocollo

La Figura 1 presenta una panoramica dei passaggi coinvolti in questo protocollo. Informazioni dettagliate sui reagenti e sui materiali utilizzati in questo protocollo sono riportate nella Tabella dei materiali. Si consiglia di preriscaldare tutti i fluidi a 37 °C prima dell'uso, se non diversamente specificato. Tutti i materiali e le forniture per la coltura cellulare devono essere sterilizzati in autoclave o sterili e la manipolazione delle cellule deve essere effettuata in una cabina di biosicurezza. Inoltre, il valore del pH della miscela di collagene I deve essere attentamente regolato a pH 7,3 per evitare possibili problemi di solidificazione.

1. Mantenimento dell'iPSC umana

  1. Scongelare l'estratto della matrice della membrana basale con ghiaccio, agitare delicatamente il flacone per miscelare la soluzione e preparare aliquote da 0,5 mL in provette per microcentrifuga da 1,5 mL utilizzando una pipetta P1000 e puntali pre-refrigerati. Conservare le aliquote a -20 °C per un massimo di 1 anno.
  2. Scongelare un'aliquota di estratto di matrice (0,5 mL) con ghiaccio. Miscelare con 49,5 mL di terreno DMEM/F12 pre-raffreddato in una provetta da 50 mL. Distribuire la miscela in ciascun pozzetto (1,5 ml/pozzetto) in piastre a 6 pozzetti, quindi agitare delicatamente la piastra per assicurarsi che la soluzione liquida copra l'intero pozzetto. Sigillare le piastre con pellicola di paraffina e conservarle a 4 °C per un massimo di 1 settimana.
  3. Preparare il mezzo di espansione hiPSC come descritto nella Tabella 1. Prelevare aliquote dell'intero terreno (40 mL/provetta) e conservare a -20 °C per un massimo di 1 anno.
  4. Mettere una piastra pre-rivestita nell'incubatore a 37 °C per 1 ora prima della coltura hiPSC.
  5. Preriscaldare il terreno di espansione hiPSC (40 mL) a 37 °C e preparare il terreno di semina hiPSC come descritto nella Tabella 2.
  6. Trasferire la piastra rivestita dall'incubatore a 37 °C alla camera di biosicurezza. Sostituire il terreno nella piastra rivestita con il terreno di semina hiPSC (1 mL/pozzetto).
  7. Scongelare una fiala crioconservata di hiPSC dal crioserbatoio in un bagno d'acqua a 37 °C per 1 minuto.
  8. Trasferire le cellule in una provetta da 15 mL e quindi aggiungere 5 mL di terreno DMEM/F12, seguito da centrifugazione a 100 x g per 3 minuti a temperatura ambiente per raccogliere le cellule.
  9. Aspirare il surnatante e risospendere le cellule con 1,5 mL di terreno di semina hiPSC. Risospendere delicatamente le cellule nella provetta da 15 mL.
  10. Aliquotare 10 μl della sospensione cellulare e miscelare con 10 μl di soluzione di blu di tripano. Trasferire 10 μL di miscela nel vetrino dell'ematocitometro e coprirla con un vetrino coprioggetti.
  11. Montare la slitta sul supporto e inserirla nel contatore automatico di celle. Attendere che lo strumento trovi la messa a fuoco o regolare manualmente la messa a fuoco premendo il pulsante di messa a fuoco +/- sullo schermo. Successivamente, utilizzare l'impostazione predefinita e premere il pulsante Capture . Utilizzare la lettura della densità cellulare LIVE come concentrazione della sospensione hiPSC preparata dal punto 1.9.
  12. Seminare 2 × 105 celle in ogni pozzetto e assicurarsi che le cellule siano distribuite uniformemente nel pozzetto.
  13. Coltivare le cellule a 37 °C con CO2 al 5% e sostituire il terreno con un terreno di espansione hiPSC (1,5 mL/pozzetto) dopo 24 ore.
  14. Cambiare il terreno ogni giorno fino a quando le celle raggiungono una confluenza dell'80%. Controllare regolarmente la morfologia cellulare e le dimensioni della colonia per garantire l'assenza di differenziazione spontanea. Scartare la coltura e ricominciare con un nuovo lotto di hiPSC se si osserva un'ampia differenziazione spontanea (>5%).

2. Formazione EB (Giorno 0)

  1. Il giorno 0, preparare e preriscaldare il terreno DMEM/F12, il terreno di semina hiPSC e la soluzione di distacco cellulare a 37 °C per 20-30 minuti.
  2. Rimuovere il terreno di coltura dalla piastra a 6 pozzetti e aggiungere la soluzione di distacco cellulare preriscaldata (1,5 mL/pozzetto). Incubare la piastra a 37 °C per 5-7 minuti.
  3. Trasferire la piastra nella cabina di biosicurezza, picchiettare la piastra per staccare le colonie di hiPSC e rompere gli aggregati.
  4. Trasferire la sospensione cellulare in una provetta da 15 mL. Aggiungere 4,5 mL di terreno DMEM/F12. Pipettare delicatamente la miscela su e giù utilizzando una pipetta sierologica da 10 mL cinque volte per dissociare le cellule in una sospensione a cellula singola. Evita di generare bolle.
  5. Centrifugare a 100 x g per 3 minuti a temperatura ambiente per raccogliere le cellule.
  6. Aspirare il surnatante e risospendere delicatamente le cellule con 1 mL di terreno di semina hiPSC utilizzando una pipetta P1000.
  7. Miscelare 10 μl di sospensione cellulare con 10 μl di soluzione di blu di tripano per la conta cellulare. Trasferire 10 μl della miscela nel vetrino dell'ematocitometro e coprirlo con un vetrino coprioggetti. Montare la slitta sul supporto e inserirla nel contatore automatico di celle. Dopo che lo strumento ha trovato il fuoco, premere il pulsante Capture e utilizzare la lettura della densità cellulare LIVE per determinare la concentrazione della sospensione hiPSC.
  8. Seminare le cellule nella piastra per micropozzetti a fondo tondo a bassissimo attaccamento con una densità di 2,7 × 105 cellule/pozzetto per ottenere 500-1.000 cellule per EB.
  9. Aggiungere 2 mL di terreno di semina hiPSC in ciascun pozzetto e mescolare delicatamente la soluzione per distribuire uniformemente le cellule.
  10. Coltivare le cellule a 37 °C con il 5% di CO2 per 24 ore.

3. Differenziazione vascolare (Giorno 1 - 5)

  1. Il giorno 1, preparare il mezzo di induzione del mesoderma (MIM) come descritto nella Tabella 3 e nella Tabella 4 e preriscaldarlo a 37 °C per 20 minuti. Il mezzo MIM deve essere preparato fresco.
  2. Utilizzare una pipetta P200 per aspirare con cura il terreno dalla piastra a micropozzetti senza disturbare gli EB sul fondo.
  3. Aggiungere lentamente 2,5 mL di MIM utilizzando una pipetta P200. Coltivare gli EB in MIM a 37 °C con il 5% di CO2 per 2 giorni.
  4. Il giorno 3, sostituire delicatamente il terreno con 2,5 mL preriscaldati e appena preparati del terreno di differenziazione vascolare 1 (VDM1, Tabella 5) senza disturbare gli EB sul fondo del micropozzetto. Coltivare le cellule a 37 °C con il 5% di CO2 per altri 2 giorni.

4. Inclusione di idrogel (giorno 5)

  1. Preparare la miscela di collagene I come descritto nella Tabella 6. Posizionare una provetta da 50 ml sul ghiaccio e aggiungere successivamente la soluzione di collagene I, H2O, 10× DMEM/F12, bicarbonato di sodio e HEPES. Mescolare accuratamente agitando delicatamente il tubo. Aggiungere 1 soluzione di NaOH M goccia a goccia agitando la soluzione miscelata per regolare il valore del pH a 7,3 e controllare il valore del pH della miscela con un pHmetro.
    NOTA: Tutte le soluzioni devono essere pre-raffreddate con ghiaccio prima dell'uso. Eseguire sempre la procedura sul ghiaccio nella cabina di biosicurezza. L'aggiunta della soluzione di NaOH è fondamentale ed è necessaria una rapida dispersione per ottenere una soluzione omogenea per evitare la polimerizzazione locale del collagene I. Il volume di NaOH può variare in base al numero di lotto della soluzione di collagene I utilizzata. Non pipettare energicamente per la miscelazione, poiché lo sforzo di taglio potrebbe causare una pre-polimerizzazione indesiderata.
  2. Preparare la miscela di collagene I-matrice della membrana basale come descritto nella Tabella 7. Aggiungere 1,25 mL di matrice della membrana basale alla miscela di collagene I da 5 mL preparata dal passaggio 4.1. Mescolare delicatamente la soluzione agitando il tubo.
  3. Mettere una piastra a 12 pozzetti sul ghiaccio per 2 minuti.
  4. Aggiungere lentamente la miscela di matrice della membrana del basamento al collagene nella piastra a 12 pozzetti (1,5 mL/pozzetto) utilizzando le punte a foro largo. Assicurati che il composto sia distribuito uniformemente.
  5. Mettere la piastra nell'incubatore a 37 °C per 2 ore per solidificare il primo strato di idrogel.
  6. Conservare la restante miscela di collagene I-basement membrane matrix sul ghiaccio per un uso successivo.
  7. Trasferire ~60 aggregati cellulari in una provetta per microcentrifuga da 1,5 mL e raffreddare la provetta con ghiaccio per 5 minuti. Rimuovere con cautela il terreno con un puntale per pipetta P200.
    NOTA: Iniziare questo passaggio 1,5 ore dopo il passaggio 4.5.
  8. Goccia a goccia, aggiungere 1,5 mL di miscela di collagene I-membrana basale agli aggregati e mescolarli delicatamente utilizzando puntali per pipette P200 a foro largo.
  9. Trasferire la piastra con il primo strato di idrogel dall'incubatore (passaggio 4.5) alla cappa di biosicurezza.
  10. Aggiungere 1,5 mL della sospensione aggregata sullo strato polimerizzato. Agitare delicatamente la piastra per distribuire uniformemente gli aggregati. Evitare di generare bolle.
  11. Incubare la piastra a 37 °C con CO2 al 5% per altre 2 ore.
  12. Preparare il mezzo di differenziazione vascolare 2 (VDM2; Tabella 8) e preriscaldare il fluido in un bagno d'acqua a 37 °C per 20 minuti prima dell'uso.
  13. Aggiungere 2 mL di VDM2 a ciascun pozzetto e coltivare le cellule a 37 °C con il 5% di CO2.
  14. Cambiare il fluido ogni 3 giorni con VDM2 preriscaldato e appena fatto.
    NOTA: (Opzionale) Gli organoidi vascolari possono essere rilasciati dalla miscela di gel rimuovendo il gel con un ago da siringa. Gli organoidi vascolari recuperati dal gel possono essere conservati singolarmente in una piastra a 96 pozzetti con VDM2 (200 μL/pozzetto). Cambia il mezzo ogni 2-3 giorni.

5. 3D Saggio di immunofluorescenza

  1. Gli organoidi vascolari dovrebbero diventare maturi all'incirca il giorno 13. Per gli organoidi incorporati nell'idrogel, aspirare accuratamente il terreno e lavare con 2 mL di PBS tre volte (10 min ogni volta). Per gli organoidi recuperati dal gel (dopo il passaggio 4.14), raccogliere 6-10 organoidi in una provetta da microcentrifuga da 2 mL, aspirare il terreno e lavare con 2 mL di PBS tre volte (10 min ciascuna).
  2. Aggiungere 2 mL di paraformaldeide (PFA) al 4% al campione e incubare a 4 °C per una notte con sigillatura con film di paraffina.
  3. Rimuovere la soluzione di PFA e lavare il campione con 2 mL di PBS quattro volte (15 minuti ogni volta).
  4. Aggiungere 2 mL di tampone bloccante (Tabella 9) e incubare a temperatura ambiente per 2 ore.
  5. Rimuovere il tampone bloccante e aggiungere 1,5 mL di anticorpi primari (vedere la Tabella dei materiali per informazioni sugli anticorpi; gli anticorpi devono essere diluiti nel tampone bloccante). Incubare il campione con anticorpi primari a 4 °C per 2 giorni agitando delicatamente.
    NOTA: Si consiglia di diluire l'anticorpo primario (CD31, PDGFRβ ed ERG1) nel tampone bloccante con un rapporto di 1:400 (per ulteriori informazioni, vedere la Tabella dei materiali ).
  6. Rimuovere la soluzione di anticorpi primari e lavare con 2 mL di PBST per 1 ora sei volte.
  7. Aggiungere 2 mL di anticorpi secondari (vedere la Tabella dei materiali per le informazioni sugli anticorpi; gli anticorpi devono essere diluiti in PBST) al campione. Avvolgere la piastra con un foglio di alluminio e incubare a 4 °C per 2 giorni agitando delicatamente.
    NOTA: Si raccomanda di diluire l'anticorpo secondario in PBST in un rapporto di 1:1000 (per ulteriori informazioni, vedere la Tabella dei materiali ). Tenere la piastra lontana dalla luce durante l'incubazione e lavare da questo passaggio successivo.
  8. Rimuovere la soluzione di anticorpi secondari e lavare con 2 mL di TBST sei volte (1 ora ogni volta). Se è necessaria la colorazione dei nuclei, aggiungere DAPI (1 μg/mL) nel tampone di lavaggio utilizzato per l'ultima fase di lavaggio.
  9. Per questi organoidi incorporati nel gel, tagliare il gel in 4 pezzi e trasferirli con cura in provette da microcentrifuga da 2 ml con una spatola. Per gli organoidi recuperati, rimuovere il tampone di lavaggio.
  10. Utilizzare salviette per assorbire la soluzione rimanente senza toccare il gel o gli organoidi.
  11. Aggiungere 2 mL di reagente idrosolubile per la pulizia dei tessuti (indice di rifrazione = 1,49) in ciascuna provetta. Incubare i campioni con il reagente chiarificante a temperatura ambiente al buio fino a quando gli organoidi non diventano limpidi (di solito durante la notte). Non agitare i campioni.
  12. Trasferire con cura gli organoidi con il reagente chiarificante al centro del piatto con fondo di vetro utilizzando una spatola.
  13. Coprire gli organoidi o il pezzo di gel con un vetrino coprioggetti da 24 mm × 24 mm.
  14. Spingere delicatamente il vetrino coprioggetti verso il basso fino a quando non si appiattisce e inserire i campioni con il fondo di vetro.
  15. Rimuovere il reagente di pulizia ridondante nel piatto e sigillare il vetrino coprioggetti con lo smalto per unghie.
  16. Per l'imaging 3D, utilizzare un microscopio confocale con un obiettivo da 10×. Utilizza la scansione tile e la scansione Z-stack per ottenere immagini a montaggio intero di organoidi.

Risultati

La Figura 1A presenta lo schema di questo protocollo, compresi i componenti chiave utilizzati in ogni fase. La differenziazione è iniziata con la formazione di EB, seguita dall'induzione del mesoderma e dalla specificazione del lignaggio vascolare (Figura 1B-D). Gli aggregati sono diventati più grandi e meno sferici nel tempo. Gli organoidi hanno iniziato a mostrare spigoli vivi il giorno 5. D...

Discussione

Il protocollo descritto include due modifiche chiave per la generazione omogenea e riproducibile di organoidi vascolari di alta qualità. La prima modifica è l'uso di una piastra a micropozzetti per consentire un migliore controllo dell'uniformità EB. Come punto di partenza della differenziazione vascolare, la dimensione degli EB è fondamentale in quanto regola il destino delle cellule staminali e l'efficacia della differenziazione verso diversi lignaggi. Le variazioni nelle dimension...

Divulgazioni

Gli autori dichiarano di non avere alcun interesse finanziario concorrente.

Riconoscimenti

Ringraziamo il supporto tecnico della Confocal and Specialized Microscopy Shared Resource dell'Herbert Irving Comprehensive Cancer Center della Columbia University, finanziato in parte attraverso il NIH Center Grant (P30CA013696). Questo lavoro è sostenuto da NIH (R21NS133635, Y.-H.L.; UH3TR002151, K. W. L.). La Figura 1A è stata creata utilizzando BioRender.

Materiali

NameCompanyCatalog NumberComments
2-Mercaptoethanol (1000x)Gibco21985023
AccutaseSigma-AldrichA6964
Alexa Fluor 488 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L)Jackson Immuno Research Labs711-546-152reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol,  store at -20 °C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000
Alexa Fluor 647 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Goat IgG (H+L) Jackson Immuno Research Labs705-606-147reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol,  store at -20°C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000
B27 supplement minus vitamin A (50x)Gibco12587010thaw at 4 °C, aliquot and store at -20 °C, avoid freeze-thaw cycle
BMP4ProSpecCYT-081reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C
CD31 antibody abcamab28364dilution ratio: 1:400
CentrifugeEppendorf022626001
CHIR99021Tocris Bioscience4423/10make the stock solution at 12 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year.
Chroman 1Tocris7163/10make the stock solution at 100 µM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year.
Collagen I Corning40236
Confocal MicroscopeNikonAXRMP/Ti2
Corning Elplasia PlatesCorning4441
Countess II FL automated cell counterThermo FisherAMQAF1000
DMEM/F-12, GlutaMAX supplementGibco10565018
DMEM/F-12, powderGibco12500062make 10x stock solution with biograde ddH2O and sterilize it with a 0.2 µm filter. Store at 4 °C.
Edi042ACedars Sinai
EmricasanMedchemexpress LLCHY1039610MGmake the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year.
ERG antibodyCell Singali Technology97249dilution ratio: 1:400
Fetal Bovine Serum - PremiumAtlanta BiologicalsS11150thaw at 4 °C  and aliquot, store at  -20 °C for up to five years, or store at 4 °C for up to a month
FGF2ProSpecCYT557reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C
Fluorodish Cell Culture DishWorld Precision InstrumentsFD35-100
ForskolinTocris Bioscience1099reconstitute with DMSO at a concentration of 12 mM, aliquot and store at -20 °C
Gentamicin (50 mg/mL)Gibco15710064
GlutaMAX supplement (100x)Gibco35050061
Heparin, 100 kUMilliporeSigma375095100KUreconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 4 kU/mL
HEPES (1 M)Gibco15630080
IncubatorThermo Scientific13998123
Knockout Serum ReplacementGibco10828028thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle
Matrigel, GFR Basement Membrane MatrixCorning356230thaw at 4 °C, aliquot and store at -80°C, avoid freeze-thaw cycle
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (NEAA, 100x)Gibco11140050
Molecular Biology Grade WaterCorning46000CV
mTeSR plus kitSTEMCELL Technologies1001130thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle
N2 supplement (100x)Gibco17502048thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle
NaOH solution (1 M)Cytiva HyCloneSH31088.01
NeuroBasal mediumGibco21103049
NIS-Elements, ver 5.42Nikon
Normal Donkey SerumJackson Immuno Research Labs17000121reconstitute with 10 mL sterile ddH2O, store at 4 °C for up to two weeks
paraformaldehyde, 20%Electron Microscopy Sciences15713Sdilute with PBS
PBST, 20xThermofisher28352
PDGFRβ antibodyR&DAF385dilution ratio: 1:400
polyamine supplement (1000x)Sigma-AldrichP8483
Rapiclear clearing reagent, 1.49SUNJIN LABRC149001
Sodium Bicarbonate (7.5%)Gibco25080094
Sodium deoxycholate monohydrateThermofisherJ6228822dissolve with ddH2O for 1% (wt/v) stock solution
TBST, 20xThermofisher28360
trans-ISRIBTocris Bioscience5284/10make the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20°C for up to 1 year.
Tritin X-100Sigma-AldrichT8787-50ML
Trypan Blue Stain (0.4%)Thermo Fisher15250061
Tween 20Sigma-AldrichP7949-100ML
VEGF-AProSpecCYT-116reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20°C

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