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Method Article
Gli organoidi intestinali umani devono essere innervati per ricapitolare meglio la struttura e la funzione dell'intestino umano nativo. Qui, presentiamo un metodo per incorporare un sistema nervoso enterico in questi costrutti.
La complessità della citoarchitettura e della funzione intestinale pone sfide significative per la creazione dell'intestino tenue bioingegnerizzato. In precedenza sono state riportate tecniche per la generazione di organoidi intestinali umani (HIO) simili all'intestino tenue umano. Gli HIO contengono epitelio e mesenchima, ma mancano di altri componenti critici dell'intestino funzionale come il sistema nervoso enterico (ENS), le cellule immunitarie, il sistema vascolare e il microbioma. Due gruppi di ricerca indipendenti hanno pubblicato metodi distinti per innervare gli HIO con un ENS. Qui discutiamo un metodo unico per incorporare l'ENS in un intestino tenue bioingegnerizzato derivato da HIO, che utilizza i componenti di questi rapporti precedenti per ottimizzare l'identità delle cellule progenitrici e i tempi di sviluppo.
Le cellule staminali pluripotenti umane (hPSC) sono differenziate per generare in modo indipendente HIO e cellule della cresta neurale enterica (ENCC) mediante regolazione temporale dei marcatori di differenziazione per un periodo di diversi giorni secondo i protocolli pubblicati. Una volta che gli HIO raggiungono lo stadio di sferoide medio-intestinale (circa il giorno 8), gli sferoidi ENCC del giorno 15-21 vengono dissociati, co-coltivati con HIO e sospesi all'interno di goccioline di matrice di membrana basale tridimensionali (3D) chiare. Le co-colture HIO + ENCC vengono mantenute in vitro per 28-40 giorni prima del trapianto in topi immunodeficienti di >9 settimane per un ulteriore sviluppo e maturazione. Gli HIO trapiantati (tHIO) con ENS possono essere raccolti 4-20 settimane dopo. Questo metodo integra elementi di due tecniche precedentemente pubblicate utilizzando ENCC generati da hPSC e co-coltivandoli con HIO in una fase iniziale di sviluppo per massimizzare l'esposizione a segnali di sviluppo precoci che probabilmente contribuiscono alla formazione di una morfologia intestinale più matura.
L'intestino tenue umano è un organo complesso e multistrato che svolge numerose funzioni essenziali come la digestione, l'assorbimento dei nutrienti, la regolazione dei liquidi, la funzione di barriera immunitaria e la motilità. Numerose malattie cliniche, come la sindrome dell'intestino corto, le enteropatie o i disturbi della motilità, sono caratterizzate da una riduzione critica della massa intestinale o da interruzioni della normale fisiologia che portano a una significativa morbilità e mortalità 1,2,3,4. Le attuali opzioni di trattamento spesso includono la chirurgia per rimuovere l'intestino disfunzionale al costo di una diminuzione della lunghezza intestinale e, quindi, della capacità funzionale dell'intestino rimanente5. C'è bisogno di terapie rigenerative che siano di natura additiva, che aumentino la capacità funzionale intestinale e ripristinino la funzione intestinale in modi che gli attuali paradigmi terapeutici non sono in grado di raggiungere.
L'intestino tenue bioingegnerizzato è una soluzione promettente a queste sfide. Gli organoidi intestinali umani (HIO) derivati da cellule staminali pluripotenti umane (hPSC) sono un materiale di partenza per l'intestino tenue bioingegnerizzato. Nel 2011, Spence et al. hanno riportato per la prima volta il successo della creazione di moderne HIO da linee di hPSC, tra cui cellule staminali embrionali umane H1 e H9 (hESC) e linee multiple di cellule staminali pluripotenti indotte umane (hiPSC) 6,7. Il loro protocollo includeva una serie di incubazioni accuratamente programmate con fattori di crescita specifici per imitare lo sviluppo intestinale fetale umano. L'activina A, una molecola di segnalazione del TGFβ, guida la differenziazione delle hPSC verso il destino endodermico seguita da un patterning posteriore diretto con Wnt/FGF. In queste condizioni, le hPSC si auto-organizzano per formare sferoidi intestinali contenenti epitelio polarizzato e mesenchima. La coltura 3D all'interno di una matrice di membrana basale consente un ulteriore sviluppo che si traduce in organoidi con un lume interno, involuzioni di epitelio simili a villi e nicchie di cellule progenitrici autorigeneranti all'interno di strutture simili a cripte.
Sebbene gli HIO generati utilizzando questo protocollo originale del 2011 assomiglino strutturalmente all'intestino nativo, mancano della capacità di generare i neuroni o la glia del sistema nervoso enterico (ENS). Nel 2017, due importanti articoli hanno descritto metodi simili ma distinti per innervare gli HIO. I progenitori dell'ENS (cellule della cresta neurale enterica, ENCC) possono essere derivati dalle hPSC. In coltura, gli ENCC formano neurosfere 3D, che possono differenziarsi in neuroni enterici e glia in condizioni appropriate. Workman e Mahe et al. hanno modificato un protocollo esistente per derivare ENCC da hPSC e li hanno trattati con terreni arricchiti con FGF seguiti da acido retinoico per 2 giorni per la posteriorizzazione e la promozione del destino vagale 8,9. Le neurosfere del giorno 6 sono state incubate per altri 4 giorni senza AR, quindi le cellule migrate sono state raccolte dopo il distacco enzimatico. Circa 20.000-50.000 ENCC sono stati aggregati con sferoidi dell'intestino medio precoce e questi sferoidi intestinali seminati con ENCC sono stati coltivati in vitro in una matrice di membrana basale 3D trasparente per 28 giorni fino all'attecchimento in vivo nella capsula renale di topi immunodeficienti per 6-10 settimane. L'HIO + ENS risultante ha dimostrato una maturazione significativa dei componenti epiteliali e mesenchimali, nonché di strutture neurogliali simili ai gangli, anche se con una densità corporea cellulare inferiore rispetto all'intestino nativo, l'assenza di alcuni sottotipi neuronali clinicamente rilevanti (ad esempio, neuroni CHAT-positivi in HIO + ENS dopo il trapianto) e caratteristiche generali simili al feto.
Lo stesso anno, Schlieve et al. hanno pubblicato un metodo alternativo che coinvolge una miscela di 40-60 neurosfere ENCC intatte, giorno 15 con HIO più mature al momento del trapianto in vivo nell'omento di topi immunodeficienti per 3 mesi senza precedente co-coltura in vitro 10. I loro costrutti, chiamati ENCC-HIO-TESI (intestino tenue ingegnerizzato in tessuto), sembravano contenere un fenotipo ENS più maturo rispetto a quello di HIO + ENS di Workman e Mahe con una maggiore diversità di sottotipi neuronali e connessioni sinaptiche neuroepiteliali non osservate in HIO + ENS. È importante sottolineare che gli ENCC utilizzati negli esperimenti di Schlieve sono stati derivati con un metodo diverso, come descritto in precedenza da Fattahi et al.11. In breve, le hPSC (sia hESC che hiPSC) sono state sottoposte a induzione della cresta neurale in terreni arricchiti con FGF2. Anche queste cellule sono state trattate con AR per stabilire un destino vagale enterico, ma per 5 giorni (giorni 6-11), un aumento rispetto ai 2 giorni di Workman e Mahe (giorni 4-5). Nel 2019, Barber et al. hanno pubblicato una versione rivista del protocollo Fattahi che include una descrizione più approfondita delle condizioni di coltura e una transizione a terreni basali definiti per ridurre l'incoerenza e riflettere le mutevoli preferenze di coltura cellulare al momento12.
Il nostro metodo per innervare gli HIO, descritto in dettaglio di seguito, incorpora elementi di entrambi i protocolli Workman/Mahe e Schlieve. Mentre l'ENS nell'ENCC-HIO-TESI di Schlieve appariva più maturo con una maggiore diversità neuronale e integrazione neurogliale, entrambi i metodi hanno integrato con successo un ENS funzionale negli HIO con cambiamenti dimostrati nell'espressione trascrizionale gastrointestinale. HIO + ENS di Workman e Mahe ha indotto un aumento dell'espressione di diversi geni correlati alle cellule staminali intestinali e allo sviluppo delle cellule epiteliali, che non sono stati alterati in ENCC-HIO-TESI. Una possibile spiegazione di queste distinzioni è rappresentata dai diversi punti temporali in cui ENCC e HIO sono stati combinati tra i protocolli. Il nostro laboratorio ha osservato che la cocoltura precoce provoca l'aumento dell'espressione di più geni coinvolti nella differenziazione epiteliale e mesenchimale e che la tempistica della cocoltura influenza la diversità delle cellule epiteliali (dati non pubblicati). È possibile che l'esposizione precoce dei precursori dell'ENS allo sviluppo di HIO e viceversa fornisca il tempo per un crosstalk di segnalazione ancora indefinito che promuove la diversità epiteliale e altri processi di sviluppo precoce.
La linea H9 di cellule staminali embrionali umane (hESC) proviene da WiCell (Madison, WI) e tutti gli esperimenti che coinvolgono le hESC sono stati approvati dal Comitato di supervisione della ricerca sulle cellule staminali (SCRO) dell'UTHealth Houston (protocollo #SCRO-23-01). Per questo protocollo, tutti i riferimenti a piastre o pozzetti rivestiti si riferiscono a quelli preparati con matrice di membrana basale 3D qualificata hESC.
1. Preparazione della coltura cellulare
NOTA: Il nostro laboratorio utilizza hESC H9, ma più linee hPSC sono state utilizzate con successo da altri laboratori per generare HIO ed ENCC, tra cui H9 hESC 9,10,12, H1 hESCs9, linea hESC UCSF412 e più linee hiPSC come WTC1112, WTC11 AAVS1-CAG-GCaMP6f9, WTC10 9,10, WTC10 PHOX2B het (+/Y14X)9 e WTC10 PHOX2B null (Y14X/Y14X)9.
2. Generazione ENCC
NOTA: Il nostro metodo per la generazione di ENCC segue da vicino quello descritto dal laboratorio Fattahi e utilizzato da Schlieve et al.10. Utilizziamo una versione leggermente modificata dell'opzione B del protocollo attraverso le sezioni "Induzione della cresta neurale enterica (ENC) (giorni 0-12)" e "Formazione di sferoidi ENCC (giorni 12-15)" in Barber et al.10,12.
3. Generazione di HIO (fase sferoidale medio-posteriore)
NOTA: Il nostro metodo per la generazione di HIO è fondamentalmente lo stesso del protocollo originale descritto in dettaglio da McCracken et al. e altri dai laboratori di Spence e Wells 6,7. Il processo avviene in due fasi: induzione definitiva dell'endoderma (DE) e formazione dello sferoide medio-posteriore.
4. Co-coltura di sferoidi medio-intestinali con ENCC
NOTA: Un riepilogo grafico di questa sezione è fornito nella Figura 1.
L'ENS regola le funzioni essenziali dell'intestino tenue maturo, tra cui la peristalsi, l'assorbimento dei nutrienti, il trasporto dei liquidi e il mantenimento della barriera epiteliale. Pertanto, l'obiettivo dell'innervazione degli HIO è quello di fornire a questi costrutti gli elementi necessari per sviluppare funzionalità più mature e di livello superiore. A tal fine, il nostro laboratorio studia in modo specifico lo sviluppo dell'ENS all'interno delle HIO e i risultati funzionali...
Gli HIO sono stati utilizzati come sistema modello per lo sviluppo intestinale umano fin dai primi anni 2010 e da allora sono diventati sempre più complessi. È ora possibile dotare questi costrutti di un ENS, consentendo nuove opportunità nello studio dello sviluppo normale che possono essere applicate alla comprensione e al trattamento migliore di un certo numero di entità gastrointestinali cliniche.
Trapianto in vivo
Gli autori non hanno conflitti di interesse da rivelare.
Grazie ai nostri numerosi collaboratori e mentori, tra cui Noah Shroyer, Michael Helmrath, James Wells e Faranak Fattahi che ci hanno permesso di visitare i loro laboratori e ci hanno aiutato a perfezionare il nostro protocollo nel corso degli anni. Vorremmo anche ringraziare Chris Mayhew e Amy Pitstick della Pluripotent Stem Cell Facility e del Center for Stem Cell & Organoid Medicine (CuSTOM) presso il Cincinnati Children's Hospital Medical Center per aver fornito al nostro laboratorio formazione, guida e consulenza HIO. Questa ricerca è stata finanziata dal Texas Medical Center Digestive Diseases Center Pilot/Feasibility grant award (finanziato in parte da NIH/NIDDK P30DK056338) (Speer), NIDDK (NIH 1K08DK131326-01A1) (Speer), Men of Distinction award (Speer) e American Neurogastroenterology and Motility Society (ANMS) Transition Award (Speer).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
100x Non-Essential Amino Acids Solution (NEAA) | ThermoFischer Scientific | 11140050 | |
15 mL conical tubes | Thermo Scientific | 12565269 | |
Accutase | STEMCELL Technologies | 07920 | "enzymatic cell detachment reagent" |
B-27 Supplement (50x), minus vitamin A | ThermoFischer Scientific | 12587010 | For ENCC |
B-27 Supplement (50x), serum free | Gibco | 17504044 | For HIO |
Bright-Line Hemacytometer | Hausser Scientific | 3120 | |
Corning Costar Ultra-Low Attachment Microplates | Fisher Scientific | 07-200-601 | |
Corning Flat-Bottom Plate 24-well, TC treated | VWR | 29442-044 | |
Corning Flat-Bottom Plate 3516 6 well | VWR | 29442-042 | |
Essential 6 Media | Thermo Fischer | A1516401 | |
Essential 8 Media | Thermo Fischer | A2858501 | Alternative stem cell media, used for ENCC plates. |
Fine-tip forceps | Dumont | 11223-20 | |
Forma Steri-Cycle i160 | Thermo Scientific | 50145522 | |
Gibco Advanced DMEM/F12 | ThermoFischer Scientific | 12634-010 | |
Gibco HEPES 1 M | ThermoFischer Scientific | 15630-080 | |
Gibco Neurobasal Medium | ThermoFischer Scientific | 21103-049 | |
Glutagro, 200 mM, 100x | Corning | 25-015-CI | |
Glutamax | ThermoFischer Scientific | 35050061 | |
H9 human ESC | Wicell International Stem Cell Bank | N/A | |
HyCloneTM FBS Defined | VWR | 16777-002 | |
LabGard Biological Safety Cabinet | Nuaire | Nu-430-400 | |
Matrigel GFR Basement Membrane Matrix, Phenol Red-Free, LDEV-Free | Corning | 356231 | "Clear 3D basement membrane matrix" |
Matrigel hESC-Qualified Matrix, LDEV-Free | Corning | 354277 | "3D basement membrane matrix" |
Micropipettes | Eppendorf (100-1000, 20-200, 10-100, 2-20, 0.5-10, 0.1-2.5 uL) | 2231300008 | |
mTeSR 1 | STEMCELL Technologies | 85850 | "stem cell media" Catalog number includes the 5x supplement, to be added in bulk in advance. |
N-2 Supplement (100x) | Gibco | 17502048 | For HIO |
N-2 Supplement, CTS (Cell Therapy Systems) | Thermo Fisher | A1370701 | For ENCC. Slightly different formulation. |
Nikon DS-Fi2 TS-100 microscope | Nikon | TS100 | |
Noggin-conditioned media | Texas Medical Center Digestive Disease Center GEMS Core, Enteroid/Organoid Sub-core | N/A | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | ThermoFischer Scientific | 15140-122 | |
Recombinant Human Activin A | Cell Guidance Systems | GFH6-100 | |
Recombinant Human BMP-4 | Fisher Scientific | 314BP010 | |
Recombinant Human EGF Protein, CF | ThermoFisher Scientific | 236-EG-200 | |
Recombinant Human FGF basic/FGF2 (146 aa) Protein | ThermoFischer Scientific | 233-FB-010 | |
Recombinant Human FGF-4 | Peprotech | 100-31 | |
ReLeSR | STEMCELL Technologies | 5872 | "Stem cell dissociation reagent" |
Retinoic acid | SIGMA | R2625-50MG | |
Rnase-free Microfuge tubes, 2 mL | Thermo Scientific | AM12425 | |
RPMI 1640 Medium | ThermoFischer Scientific | 11875093 | |
R-Spondin conditioned media | Texas Medical Center Digestive Disease Center GEMS Core, Enteroid/Organoid Sub-core | N/A | |
SB 431542, Tocris Bioscience | Fisher Scientific | 16-141-0 | |
Sorvall ST 16R Centrifuge | Thermo Scientific | ||
Standard Wide Orifice Pipettor Tips | VWR | 89049-166 | |
Stemolecule Chir99021 in Solution | Stemgent | 04-0004-02 | |
Sterile filter pipette tips | VWR (1000uL, 200uL, 10uL) | 76322-154, 76322-150, 89174-520 | |
Vitronectin XF | Stem Cell Technologies | 7180 | Alternative 3D basement membrane matrix, used for ENCC plates. |
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