様々な研究分野でのモデル種としての汎用性が高いため、オオバコ(Plantago lanceolata)の遺伝子形質転換ツールキットが必要です。 ここでは、 アグロバクテリウム・ツメファシエンス媒介形質転換を用いて、形質転換効率20%の安定したトランスジェニック株をもたらすプロトコールを提示する。
プランタゴ属の種にはいくつかのユニークな形質があり、さまざまな研究分野でモデル植物として適応されています。しかし、遺伝子操作システムの欠如は、遺伝子機能の詳細な調査を妨げ、モデルとしてのこの属の多様性を制限します。ここでは、最も一般的に研究されているオオバコ種であるプランタゴランセオラータの形質転換プロトコルが提示されています。 アグロバクテリウム・ツメファシエンス媒介形質転換を用いて、無菌的に増殖したP. lanceolata植物の3週齢の根を細菌に感染させ、2〜3日間インキュベートした後、適切な抗生物質選択を伴うシュート誘導培地に移した。シュートは通常、1か月後に培地から出現し、シュートが根誘導培地に移されてから1〜4週間後に根が発達しました。次に、植物を土壌環境に順応させ、β-グルクロニダーゼ(GUS)レポーターアッセイを使用して導入遺伝子の存在を試験しました。現在の方法の形質転換効率は~20%で、根組織10個あたり2つのトランスジェニック植物が形質転換されます。オオバコの形質転換プロトコルを確立することで、様々な分野での新たなモデル種としての採用が促進されます。
モデル種を使用して植物生物学の複数の側面を調査するという概念は、シロイヌナズナ1の広範な使用とともに出現しました。シロイヌナズナは、他の多くの顕花植物と特徴を共有し、小型で世代サイクルが短いなど、実験室環境での研究に便利な複数の特性を持っているため、最初に選択されました。それを主題として発表された大量の研究論文は、その小さなゲノムサイズと遺伝子形質転換の容易さ2とともに、広く使用されている実験生物として存続することを可能にします。しかし、シロイヌナズナは、異なる特性や独特の形質を持つ種のモデルとして限定することができます3。これにより、単子葉植物の発生遺伝学にとって重要な植物であるトウモロコシ(Zea mays)4や、進化研究、果実の発育、生産の重要なモデルであり、野菜作物の優れた表現であるトマト(Solanum lycopersicum)などの新しいモデルシステムの開発が促進されました5。遺伝子形質転換の方法は、植物種がモデル生物として機能するための前提条件です2。 アグロバクテリウム・ツメファシエンスを介した形質転換は、植物生物学における信頼できるツールです。タバコ(Nicotiana tabacum)6、イネ(Oryza sativa)7、綿花(Gossypium hirsutum)8、大豆(Glycine max)9、ジャガイモ(Solanum tuberosum)10、キャノーラ(Brassica napus)11など、いくつかのモデル種や主要作物の形質転換に使用されています。 植物種は、A. tumefaciens感染にどれだけうまく反応するかにおいて非常に多様であり、形質転換プロトコルはしばしば種ごとに個別に調整する必要があります6,12。
プランタゴ属には合計256の植物種が含まれており、世界中に広く分布しています13。この属の種は、遺伝学、生態学、ストレス生理学、二次代謝産物、医薬品化学、植物と微生物の相互作用、植物の発生、進化を研究するためのモデル種として望ましい独特の特徴を持っていることがよくあります。ナローリーフまたはリブワートオオバコとも呼ばれるプランタゴランセオラータは、男性の不妊の現象を説明するために最初に使用された19世紀以来、人気のある興味深い植物でした14。その属の他の植物と同様に、それは様々な研究分野の研究に使用されてきました。最近では、血管組織を簡単に採取できるため、血管生物学のモデルとして提案されています15。P.ランセオラータは、プランタゴ属で最も一般的に研究されている種です。2021年の記事では、2022年12月9日に実施されたPubMed検索によると、当時この種を含む、または関連する>1,400の出版物があり16、2022年の初めからさらに102の記事が公開されていると報告されています。属の次に研究されている植物であるP. majorは、同じ日に同じ基準を使用して検索した場合、わずか414の記事の対象です。
P. lanceolataの研究関心にもかかわらず、特に遺伝子機能の特性評価に関する研究は、この種の遺伝子操作ツールキットの欠如によってしばしば制限されています。Pommerrienigらは、フローラルディップ法を用いてP.メジャーの形質転換プロトコルを開発するために努力した17。しかし、この方法は、この種の雄性不稔性の特徴のためにP. lanceolataには適用できない18,19。私たちの知る限り、P.ランセオラータの形質転換のための既存のプロトコルはありません。
この研究は、A.ツメファシエンスを介したP.ランセオラータの形質転換のための簡単なプロトコルを提示します。根組織を標的とすることにより、形質転換から3ヶ月以内に完全に成長したトランスジェニック植物を生成することができる。
注意: 手順1.4-1.8、2.3-2.5、3.3-3.6、4.1-4.6、5.1-5.7、および6.1-6.3は、汚染を防ぐために清潔なフードを使用して、無菌状態で実行する必要があります。
1. 形質転換のための植物材料増殖
2. プラスミド構築と 大腸菌 形質転換
注:正確なプラスミド構築手順は、目的の遺伝子によって異なります。この手順では、制限酵素HindIIIおよびSalIIを使用して、標準的なクローニング手順20を使用して、1.5kbのAtPP2プロモーターをGUSと共にバイナリプラスミドpBI101(材料表を参照)に挿入しました。AtPP2(師部タンパク質2)は、師部21に特異的に発現する遺伝子である。
3. A.プラスミドによるツメファシエンス の形質転換
4. A.ツメファシエンス の準備
5. オ オバコ の根の形質転換
6.選択と植物全体の再生
7.土壌移動
8.β-グルクロニダーゼ(GUS)組織化学染色
ここでは、A. tumefaciens媒介形質転換を用いてトランスジェニックP. lanceolata植物を得るための簡単なプロトコルを報告する。レポーター遺伝子GUS(β-グルクロニダーゼをコード)は、師部発現プロモーターであるAtPP2によって駆動され、A.ツメファシエンス株GV3101を介して3週齢のP.ランセオラータの根に形質転換されます(図2)。師部特異的プロモーターが選ばれたのは、植物血管組織、特に師部の機能ゲノミクスシステムを確立することに主な関心があったためです。この方法は、予備実験で根、葉、および葉柄組織でテストされました。カルスはすべての組織タイプで誘発される可能性がありますが、根の組織のみがSIMで1か月後にシュートイニシャル(図5A)を産生しました。葉と葉柄は茶色に変わり、死にました(図5B)。これは、根組織が形質転換法で使用するのに最適な組織タイプであるという結論につながりました。根を懸濁液(SS)に再懸濁した調製した細菌中で最低20分間インキュベートし(表1)、次に固体SSプレート上で室温で暗所で最大3日間インキュベートした(図3E)。次に、根をシュート誘導培地(SIM)に移し、プロトコルに示された条件でグローライトの下に保ちました(ステップ1.6)。図1および図3は、参考のためにプロトコルの各ステップの代表的な画像を示す。
図6は、根がSIM上に置かれた最初の日(図6A)から苗条が発根する準備ができたとき(図6D)までの、形質転換組織から出現する苗条のイニシャルの進行を示す。1週間後、根組織はカルスを形成し(図6B)、シュートイニシャルの始まりが観察されました(図6B1)。シュートは2週目と3週目の間も出現し続け(図6C)、4週間後、シュートは根誘導培地に移す準備ができていました(図6D)。
推定トランスジェニック植物の同定は、β-グルクロニダーゼ(GUS)組織化学的アッセイを使用して、芽の長さが約0.5 cmになった後に採取された葉のセグメントを使用して行われました。陽性トランスジェニック植物は、師部局在組織において予想される染色パターンを示し、図4に実証された。陽性のGUS染色苗条を根誘導培地に移し、4週間後に堅牢な発根系を発達させた(図1E)。その後、発根した植物を土壌に移しました。図4は、比較のために、AtPP2プロモーターとβグルクロニダーゼ(GUS)遺伝子で形質転換したナローリーフオオバコと、AtPP2プロモーターで形質転換した野生型とナローリーフオオバコで染色した結果を示しています。出現したすべての新芽はトランスジェニックであることが確認されました。形質転換効率は平均20%と決定され、形質転換された根10本ごとに約2つのシュートが出現した。確認されたトランスジェニック植物は、より大きな鉢に移され、成虫期に達するまで4〜8週間成長しました(図1F)。
図1:オオバコランセオラータ変換のタイムライン。プロトコルの各段階の代表的な画像。(A)MSプレートに播種した未発芽種子。(B)種子は1週間後に発芽し、マゼンタの箱に移す準備ができました。(C)3週間の成長後のMSボックス内の植物。根は緑色で健康的で、形質転換に理想的な段階にあります。(D)4週間後のシュート誘導培地中のシュートは、発根培地に移す準備ができています。この段階で、該当する場合、β-グルクロニダーゼ(GUS)組織化学的染色を行うことができます。(E)根誘導培地が入った箱に入った植物で、4週間の成長後に根が形成された。(F)トランスジェニック植物は、土壌中で4週間成長した後、全長まで成長する。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図2:師部特異的プロ モーターAtPP2を挿入したバイナリベクタープラスミドpBI101+β-グルクロニダーゼ(GUS)の図。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図3:変換の手順。 変換の各ステップの代表的な画像。(A)形質転換中に苗条から根を分離する。(B)根を細菌/ SS懸濁液に浸します。(C)ペーパータオルで根を乾かして、余分なバクテリアを取り除きます。(D)共培養培地に播種した根。(E)SSプレートをアルミホイルで包んだもの。植物を2〜3日間インキュベートした後、撮影培地に移した。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図4:GUS染色 。 β-グルクロニダーゼ(GUS)染色結果 狭葉オオバコ葉セグメントの。(A)野生型。(B) AtPP2 プロモーターを保持するプラスミド(空のベクター)で形質転換されたナローリーフオオバコ。(C) AtPP2 プロモーターとβ-グルクロニダーゼ(GUS)遺伝子を保持するプラスミドで形質転換されたナローリーフオオバコ。各葉をGUS組織化学染色プロトコルを用いて染色し、次いで顕微鏡カメラで画像化した。画像(B)および(C)は、GUS遺伝子の不在による染色パターンを示していません。右の画像は、静脈の明確な青色の染色パターンを示しており、植物が遺伝子組み換えであることを確認しています。バーは1 mmを表し、各葉のセグメントの長さは約1 cmです。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図5:撮影培地上で>1ヶ月インキュベートした後の異なる組織タイプの形質転換効率の比較 。 (A)1ヶ月以上の成長後の根組織。根は拡大したカルスを経験し、シュートのイニシャルが出現しました。形質転換されていないカルスは、抗生物質の選択に応答して死に始めています。(B)1ヶ月以上の成長後の葉および葉柄組織。組織はカルスの拡大を経験しましたが、抗生物質に反応してすぐに死亡しました。どちらの組織からも苗条は出なかった。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図6:形質転換組織上のカルスとシュートの出現。 異なる長さのインキュベーション後に撮影培地上に置かれた組織の代表的な画像。(A)撮影媒体に播種した直後の根組織。(B)撮影培地で1週間後の根組織。カルスの拡張が見られ、(B1)最初のシュートのイニシャルが出現し始めています。(C)撮影培地で3週間後の根組織。より多くのシュートイニシャルが登場しました。(C1)B1シュートのイニシャルから出てきたシュート。(D)4週間のインキュベーション後の根組織。形質転換されていない組織は黒/茶色に変わって死に始め、そして出現する新芽は成長し続けています。この段階で、芽は発根培地に移動する準備ができています。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
表1:培地調製レシピ。 変換のために媒体を準備する方法の説明。添加されるビタミンの量は、示された原液濃度に基づいて計算されます。ビタミンストック溶液の調製については 表2 を参照してください。すべての培地について、900 mLの二重蒸留H2Oに試薬を加え、pHを指示されたレベルまで加え、次に最終容量1,000 mLまで水を加えます。* =滅菌後に追加します。** = 1 M KOHのpH。= 1 M NaOHによるpH。 この表をダウンロードするには、ここをクリックしてください。
表2: プランタゴ 培地のビタミンストック。 すべてのビタミンは、保管前にフィルター滅菌し、正確にラベルを付ける必要があります。示されている場合は、最初に粉末を1 N NaOHに溶解し、次に二重蒸留H2Oで目的の容量を構成します。 この表をダウンロードするには、ここをクリックしてください。
プランタゴ属の植物の形質転換プロトコルの欠如は、特に研究者が遺伝子機能の探索に関心がある場合、モデルとしてのこれらの植物の使用を制限します。P. lanceolataは、その属の中で最も一般的に研究されている植物であるため、遺伝子形質転換プロトコルを開発するために選ばれました16。開発されたプロトコルは、血管生物学、生態学、植物と昆虫の相互作用、および非生物的ストレス生理学に関連する研究をさらに進めるためのツールとして使用される可能性があります。
提示されたプロトコルは、ユーザーがトランスジェニック植物を得ることを可能にするステップを明確に概説している。 P. lanceolata が組織培養環境で繁殖する能力に加えて、複数の要因が私たちの形質転換法の成功に貢献しました。第一に、形質転換のために高品質で無菌の植物根組織を使用することの重要性が観察された。根は、3〜4週齢の植物から採取したときに最も高い形質転換率を示し、緑色または淡白色に見えました。細菌や真菌の汚染がある程度の箱から採取された根は、しばしば汚染された射撃培養をもたらし、茶色に見える古い根は成功した形質転換をもたらさなかった。根組織は、葉と葉柄の組織が芽の発育に失敗したため、現在の方法を使用した形質転換に最も効率的な組織タイプでした。
もう一つの重要な観察は、形質転換のために根組織を収集するための最適な方法は、切りたての根の材料を滅菌水に入れることであるということでした。このステップにより、根は成長容器から取り出されるとすぐに乾く傾向があるため、残りの組織が収集されている間、根の材料は効果的に水和したままになります。このステップはまた、一度により多くの根を細菌内でインキュベートすることを可能にしたため、形質転換の成功率を高めるのに役立ちました。
このプロトコルは、根組織が共培養培地でインキュベートする時間を2日に短縮することで変更できます。シュートイニシャルをもたらす感染を可能にするには、2〜3日の潜伏期間で十分であることが観察されました。しかし、培地中に抗生物質阻害剤が存在しないと、 A. tumefaciensが 異常増殖し、出現組織を殺す可能性があることが観察されているため、より長いインキュベーション時間は推奨されません。
この研究の限界は、比較のためのP.ランセオラータ形質転換におけるA.ツメファシエンスの他の方法または種の性能に関する利用可能なデータの欠如です。私たちの知る限り、このプロトコルは斬新です。最初の試験では、A. tumefaciens GV3101で高い形質転換効率が認められ、他の菌株で実験するのではなく、この菌株を使用して技術を改良することに焦点を当てました。20%の形質転換効率は植物の形質転換にとって比較的高く、多くの従来の方法では>1%が成功すると考えています26,27,28。ただし、複数の種29,30,31で根の形質転換に使用することで知られているA.リゾゲネスなどのA.ツメファシエンスの別の株を使用すると、さらに高い成功率が得られる可能性があります。P. lanceolataの形質転換効率の向上を促進するために他の菌株を使用することの影響を評価するには、さらなる実験が必要です。
P. lanceolataの変換の成功は、多くの研究分野に利益をもたらす可能性があります。高い形質転換効率と組織培養培地での植物の急速な成長により、P. lanceolataは遺伝子機能研究の実行可能な候補となっています15。
著者は開示するものは何もありません。
この研究は、国立科学財団(EDGE IOS-1923557からC.Z.およびY.Z.)の支援を受けました。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
14 mL Round Bottom TubeA4A2:A34 | ThermoFisher Scientific | 150268 | |
1-Naphthylacetic acid | Gold Biotechnology | N-780 | |
3M Micropore Surgical Paper Tape | ThermoFisher Scientific | 19-027761 | |
50 mL Centrifuge Tubes | Research Products International Corp. | 163227LC | |
600 Watt High Pressure Sodium Lights | Plantmax | PX-LU600 | |
6-Benzylaminopurine (6-BAP) | Gold Biotechnology | B-110 | |
Aluminum Foil | ThermoFisher Scientific | 01-213-100 | |
Bacto Agar | Thermofisher Scientific | 214010 | |
Binary Plasmid pBI101 | Clontech, USA | 632522 | |
Cool White Grow Light Sylvania LLC | Home Depot | 315952205 | |
D-biotin | ThermoFisher Scientific | BP232-1 | |
ddH2O | |||
DH5a E. coli | Invitrogen, USA | 18258012 | |
Disposable Petri Dishes, Sterile 150 x 16 mm | ThermoFisher Scientific | FB0875712 | |
Disposable Petri Dishes, Sterile 95 x 15 mm | ThermoFisher Scientific | FB0875714G | |
Dissecting Scissors | Leica Biosystems | 38DI12044 | |
Ethanol 200 Proof | Decon Labs | 2705 | |
Folic Acid | Fisher Scientific | BP2519-5 | |
Forceps | Leica Biosystems | 38DI18031 | |
Gelrite | Research Products International Corp. | G35020-1000 | |
Glycerol | ThermoFisher Scientific | 17904 | |
Glycine | Sigma | 241261 | |
Incubated Tabletop Orbital Shaker | ThermoFisher Scientific | SHKE420HP | |
Indole-3-Acetic Acid (IAA) | Gold Biotechnology | I-110 | |
Indole-3-Butyric Acid (IBA) | Gold Biotechnology | I-180 | |
Kanamycin Monosulfate | Gold Biotechnology | K-120 | |
Macrocentrifuge | ThermoFisher Scientific | 75007210 | |
Magenta Boxes | ThermoFisher Scientific | 50255176 | |
Micro Pipet Tips 1000 µL | Corning | 4140 | |
Micro Pipet Tips 200 µL | Corning | 4138 | |
Micro Pipette Tips 10 µL | Corning | 4135 | |
Microcentrifuge | ThermoFisher Scientific | 75002410 | |
Micropipettor 0.5-10 µL | Corning | 4071 | |
Micropipettor 100-1000 µL | Corning | 4075 | |
Micropipettor 20-200 µL | Corning | 4074 | |
Micropipettor 2-20 µL | Corning | 4072 | |
Murashige & Skooge Basal Medium with Vitamins | PhytoTech | M519 | |
Murashige & Skooge Basal Salt Mixture | PhytoTech | M524 | |
myo-Inositol | Gold Biotechnology | I-25 | |
Nicotinic acid | Sigma | N0761-100g | |
Parafilm (paraffin film) | ThermoFisher Scientific | S37440 | |
Potassium Hydroxide (KOH) | Research Products International Corp. | P44000 | |
Pyridoxine HCl | Sigma | P6280-10g | |
Scalpel Blade Handle | Leica Biosystems | 38DI36419 | |
Scalpel Blades | Leica Biosystems | 3802181 | |
Sodium Chloride, Crystal (NaCl) | Mallinckrodt Chemicals | 7581-06 | |
Sodium Hydroxide (NaOH) | Research Products International Corp. | S24000 | |
Sodium Hypochlorite | Walmart | 23263068401 | |
Soil- Bark Mix | Berger, USA | BM7 | |
Square Pots (3.5 inches squared) | Greenhouse Megastore | CN-TRK-1835 | |
Sucrose | Research Products International Corp. | S24060 | |
Thermocycler | ThermoFisher Scientific | A24811 | |
Thiamine HCl | Sigma | T4625-5G | |
Timentin Ticarcillin/Clavulanate (15/1) (Timentin) | Gold Biotechnology | T-104 | |
trans-Zeatin Riboside (ZR) | Gold Biotechnology | Z-100 | |
Tryptone | Thermofisher Scientific | 211705 | |
Wild Type Plantago lanceolata seeds | Outsidepride Seed Source, OR, USA | F1296 | Outsidepride.com |
Yeast Extract Granulated | Research Products International Corp. | Y20025-1000 |
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