다양한 연구 분야에서 모델 종으로 다용도로 적용되기 때문에 좁은 잎 질경이 (Plantago lanceolata)의 유전자 변형 툴킷이 필요합니다. 여기에서 Agrobacterium tumefaciens 매개 형질전환을 사용하여 형질전환 효율이 20%인 안정적인 형질전환 계통을 생성하는 프로토콜이 제시됩니다.
Plantago 속의 종은 다양한 연구 분야에서 모델 식물로 채택 된 몇 가지 독특한 특성을 가지고 있습니다. 그러나 유전자 조작 시스템의 부족은 유전자 기능에 대한 심층 조사를 방해하여 모델로서의 이 속의 다양성을 제한합니다. 여기에서는 가장 일반적으로 연구되는 Plantago 종인 Plantago lanceolata에 대한 형질 전환 프로토콜이 제시됩니다. 아그로박테리움 투메파시엔스 매개 형질전환을 사용하여 무균적으로 자란 P. lanceolata 식물의 3주령 뿌리를 박테리아에 감염시키고 2-3일 동안 배양한 다음 적절한 항생제 선택과 함께 싹 유도 배지로 옮겼습니다. 새싹은 일반적으로 1개월 후에 배지에서 나오고 뿌리는 새싹이 뿌리 유도 배지로 옮겨진 후 1-4주 후에 발달합니다. 그런 다음 식물을 토양 환경에 적응시키고 β-글루쿠로니다아제(GUS) 리포터 분석을 사용하여 이식유전자의 존재 여부를 테스트했습니다. 현재 방법의 형질전환 효율은 ~20%이며, 형질전환된 뿌리 조직 10개당 2개의 형질전환 식물이 출현합니다. 협엽 질경이에 대한 형질 전환 프로토콜을 수립하면 이 식물을 다양한 영역에서 새로운 모델 종으로 채택하는 것을 촉진할 것입니다.
식물 생물학의 여러 측면을 조사하기 위해 모델 종을 사용한다는 개념은 Arabidopsis thaliana1의 광범위한 사용과 함께 나타났습니다. 애기장대는 다른 많은 꽃 피는 식물과 특징을 공유하고 작고 짧은 생성 주기와 같이 실험실 환경에서 연구하기 편리한 여러 특성을 가지고 있기 때문에 처음에 선택되었습니다. 게놈 크기가 작고 유전자 변형이 용이한 것과 함께 주제로 발표된 많은 양의 연구 논문2은 널리 사용되는 실험 유기체로 지속될 수 있게 한다. 그러나, 애기장대는 다른 특성이나 독특한 형질을 가진 종에 대한 모델로 제한될 수 있다3. 이로 인해 외떡잎식물4의 발달유전학에 중요한 식물인 옥수수(Zea mays)와 진화 연구, 과일 발달 및 생산에 중요한 모델인 토마토(Solanum lycopersicum)와 같은 새로운 모델 시스템의 개발이 촉진되었으며, 채소 작물5의 좋은 대표가된다. 유전자 변형을 위한 방법은 식물종이 모델유기체 역할을 하기 위한 전제 조건이다2. Agrobacterium tumefaciens 매개 형질전환은 식물 생물학에서 신뢰할 수 있는 도구입니다. 담배 (Nicotiana tabacum) 6, 쌀 (Oryza sativa) 7, 목화 (Gossypium hirsutum) 8, 콩 (Glycine max) 9, 감자 (Solanum tuberosum) 10 및 카놀라 (Brassica napus) 11. 식물 종은 A. tumefaciens 감염에 얼마나 성공적으로 반응하는지에 따라 매우 다양하며, 형질전환 프로토콜은 종종 각 종에 개별적으로 맞춰져야 합니다 6,12.
Plantago 속은 전 세계적으로 널리 분포하는 총 256 종의 식물 종을 포함합니다13. 이 속의 종은 종종 유전학, 생태학, 스트레스 생리학, 2차 대사 산물, 의약 화학, 식물-미생물 상호 작용, 식물 발달 및 진화를 연구하기 위한 모델 종으로 바람직한 고유한 특성을 가지고 있습니다. Narrowleaf 또는 ribwort 질경이라고도 불리는 질경이 란쾨라타(Plantago lanceolata)는 수컷의 불임 현상을 묘사하는 데 처음 사용된 19세기 이래로 인기 있는 식물이었다14. 그 속의 다른 식물과 마찬가지로 다양한 연구 분야의 연구에 사용되었습니다. 보다 최근에는, 혈관 조직을 쉽게 채취할 수 있기 때문에 혈관 생물학의 모델로 제안되었다15. P. lanceolata는 Plantago 속에서 가장 일반적으로 연구되는 종입니다. 2021년 기사에 따르면 2022년 12월 9일에 수행된 PubMed 검색에 따르면 당시 이 종을 포함하거나 관련된 출판물이1,400개 >16개 있었고 2022년 초부터 102개의 기사가 추가로 출판되었다고 보고했습니다. 속(genus)에서 다음으로 가장 많이 연구된 식물인 P. major는 같은 날짜에 동일한 기준을 사용하여 검색했을 때 414개의 기사의 주제입니다.
P. lanceolata에 대한 연구 관심에도 불구하고, 특히 유전자 기능 특성화에 대한 연구는 종종 종에 대한 유전자 조작 툴킷의 부족으로 인해 제한됩니다. Pommerrienig et al. 꽃 딥 기법17을 사용하여 P. major에 대한 형질전환 프로토콜을 개발하기 위해 노력했습니다. 그러나 이 방법은 이 종의 수컷 불임 특성 때문에 P. lanceolata에 적용할 수 없습니다18,19. 우리가 아는 한, P. lanceolata의 변형에 대한 기존 프로토콜은 없습니다.
이 연구는 P. lanceolata의 A. tumefaciens 매개 형질전환에 대한 간단한 프로토콜을 제시합니다. 뿌리 조직을 표적으로 삼음으로써 완전히 자란 형질전환 식물을 형질전환 후 3개월 이내에 생성할 수 있습니다.
알림: 1.4-1.8, 2.3-2.5, 3.3-3.6, 4.1-4.6, 5.1-5.7 및 6.1-6.3단계는 오염을 방지하기 위해 깨끗한 후드를 사용하여 무균 상태에서 수행해야 합니다.
1. 변형을 위한 식물 재료 번식
2. 플라스미드 구축 및 대장균 형질전환
참고: 정확한 플라스미드 구성 절차는 관심 유전자에 따라 다릅니다. 이 절차에서, 제한 효소 HindIII 및 SalII를 사용하여 표준 클로닝 절차20을 사용하여 GUS와 함께 이진 플라스미드 pBI101 (재료 표 참조)에 1.5kb AtPP2 프로모터를 삽입했습니다. AtPP2(체관 단백질 2)는 체관21에서 특이적으로 발현되는 유전자입니다.
3. A. 플라 스미드를 이용한 형질전환
4. A. tumefaciens 준비
5. 질경이 뿌리의 변형
6. 선택 및 전체 식물 재생
7. 토양 이송
8. β-글루쿠로니다아제(GUS) 조직화학적 염색
A. tumefaciens 매개 형질전환을 사용하여 형질전환 P. lanceolata 식물을 얻기 위한 간단한 프로토콜이 여기에 보고되었습니다. 리포터 유전자 GUS(β-글루쿠로니다아제를 암호화함)는 AtPP2의 체관부 발현 프로모터에 의해 구동되어 A. tumefaciens 균주 GV3101을 통해 3주령의 P. lanceolata 뿌리로 형질전환됩니다(그림 2). 체관 특이적 프로모터가 선택되었는데, 그 이유는 우리의 주요 관심사가 식물 혈관 조직, 특히 체관부의 기능적 유전체학을 위한 시스템을 확립하는 것이었기 때문입니다. 상기 방법은 예비실험에서 뿌리, 잎, 잎자루 조직에 대해 시험하였다. 굳은살은 모든 조직 유형에서 유도될 수 있지만 SIM에서 1개월 후에 뿌리 조직만이 싹 이니셜(그림 5A)을 생성했습니다. 잎과 잎자루는 갈색으로 변하여 죽었습니다(그림 5B). 이것은 뿌리 조직이 형질전환 방법에 사용하기에 최적의 조직 유형이라는 결론으로 이어졌습니다. 뿌리를 현탁액 용액(SS)에 재현탁된 준비된 박테리아(표 1)에서 최소 20분 동안 배양한 다음, 실온에서 암실에서 최대 3일 동안 고체 SS 플레이트에서 배양했습니다(그림 3E). 그런 다음 뿌리를 싹 유도 배지(SIM)로 옮기고 프로토콜(단계 1.6)에 표시된 조건에서 성장광 하에 보관했습니다. 그림 1과 그림 3은 참조를 위해 프로토콜의 각 단계를 대표하는 이미지를 보여줍니다.
도 6은 뿌리가 SIM에 놓인 첫날(도 6A)부터 새싹이 뿌리를 내릴 준비가 되었을 때(도 6D)까지 형질전환된 조직으로부터 나오는 새싹 이니셜의 진행을 보여준다. 1주일 후, 뿌리 조직은 캘러스를 형성했고(그림 6B), 싹 이니셜의 시작을 관찰할 수 있었습니다(그림 6B1). 새싹은 2주와 3주 동안 계속 나타났고(그림 6C), 4주 후에는 새싹이 뿌리 유도 배지로 옮겨질 준비가 되었습니다(그림 6D).
추정되는 형질전환 식물의 식별은 β-글루쿠로니다아제(GUS) 조직화학적 분석을 사용하여 수행되었으며, 싹의 길이가 약 0.5cm가 되면 잎 세그먼트를 채취했습니다. 양성 형질전환 식물은 체관부 조직에서 예상되는 염색 패턴을 보여주었으며, 이는 도 4에서 입증되었다. 양성 GUS 염색 새싹은 뿌리 유도 배지로 옮겨져 4주 후에 강력한 발근 시스템을 개발했습니다(그림 1E). 그런 다음 뿌리를 내린 식물을 토양으로 옮겼습니다. 도 4 는 AtPP2 프로모터β로 형질전환된 내로우리프 질경이와 AtPP2 프로모터로 형질전환된 야생형 및 네로우리프 질경이와 함께 AtPP2 프로모터로 형질전환된 내로우리프 질경이에서 염색한 결과를 나타낸 것이다. 출현 한 모든 싹은 형질 전환으로 확인되었습니다. 형질전환 효율은 평균 20%로 결정되었으며, 형질전환된 뿌리 10개당 약 2개의 새싹이 나왔다. 확인된 형질전환 식물을 더 큰 화분으로 옮기고 성충 단계에 도달할 때까지 4-8주 동안 성장시켰습니다(그림 1F).
그림 1: 질경이 천(Plantago lanceolata ) 변형의 타임라인. 프로토콜의 각 단계를 대표하는 이미지입니다. (A) MS 플레이트에 도금된 발아되지 않은 종자. (B) 씨앗은 1 주일 후에 발아하여 마젠타 색 상자로 옮길 준비가되었습니다. (C) 성장 3주 후 MS 상자에 있는 식물. 뿌리는 녹색이고 건강하며 변형에 이상적인 단계에 있습니다. (D) 4주 후 슛 유도 배지의 슛은 발근 배지로 옮겨질 준비가 됩니다. 이 단계에서 해당되는 경우 β-글루쿠로니다아제(GUS) 조직화학적 염색을 수행할 수 있습니다. (E) 성장 4주 후에 뿌리가 형성된 뿌리 유도 매체가 있는 상자에 담긴 식물. (F) 형질전환 식물은 토양에서 4주 동안 성장한 후 전체 길이로 자랍니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 2: 체관 특이적 프로모터 AtPP2가 삽입된 이진 벡터 플라스미드 pBI101 + β-글루쿠로니다아제(GUS)의 다이어그램. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 3: 변환 단계 각 변환 단계의 대표 이미지입니다. (A) 형질전환 중 새싹에서 뿌리를 분리합니다. (B) 박테리아/SS 현탁액에 뿌리를 담그기. (C) 과도한 박테리아를 제거하기 위해 종이 타월에 뿌리를 건조시킵니다. (D) 공동 배양 배지에 도말된 뿌리. (E) 알루미늄 호일로 싸인 SS 플레이트. 식물을 촬영 매체로 옮기기 전에 2-3일 동안 배양했습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 4: GUS 염색. 좁은 잎 질경이 잎 세그먼트의 β-글루쿠로니다아제(GUS) 염색 결과. (A) 야생형. (B) AtPP2 프로모터를 보유하는 플라스미드로 형질전환된 좁은 잎 질경이(빈 벡터). (C) AtPP2 프로모터 및 β-글루쿠로니다아제(GUS) 유전자를 보유하는 플라스미드로 형질전환된 좁은 잎 질경이. 각 잎은 GUS 조직화학적 염색 프로토콜을 사용하여 염색한 다음 현미경 카메라로 이미지화했습니다. 이미지 (B) 및 (C)는 GUS 유전자의 부재로 인한 염색 패턴을 나타내지 않습니다. 오른쪽 이미지는 정맥의 맑은 파란색 염색 패턴을 보여 식물이 형질 전환임을 확인합니다. 막대는 1mm를 나타내며 각 잎 부분의 길이는 약 1cm입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 5: 촬영 배지에서 >1개월 배양 후 다양한 조직 유형의 형질전환 효율 비교 . (A) 성장 1개월 이상 후의 뿌리 조직. 뿌리는 확장 된 굳은 살을 경험했으며 싹 이니셜이 나타났습니다. 형질전환되지 않은 굳은살은 항생제 선택에 반응하여 죽기 시작했습니다. (B) 성장 1개월 이상 경과 후의 잎과 잎자루 조직. 조직은 약간의 굳은 살 확장을 경험했지만 항생제에 대한 반응으로 곧 사망했습니다. 어느 조직에서도 싹이 나오지 않았습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 6 : 변형 된 조직에 굳은 살과 싹의 출현. 서로 다른 길이의 배양 후 촬영 배지에 놓인 조직의 대표 이미지. (A) 촬영 매체에 도금된 직후의 뿌리 조직. (B) 촬영 매체에서 1주일 후 치근 조직. 굳은살의 확장이 관찰될 수 있으며, (B1) 첫 번째 싹의 이니셜이 나타나기 시작했다. (C) 촬영 매체에서 3주 후 치근 조직. 더 많은 촬영 이니셜이 등장했습니다. (씨1) B1 이니셜 촬영에서 나온 촬영. (D) 배양 4주 후의 뿌리 조직. 변형되지 않은 조직은 검은색/갈색으로 변하기 시작하여 죽기 시작했으며 새로 나오는 새싹이 계속 자랍니다. 이 단계에서 싹을 뿌리 매체로 옮길 준비가되었습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
표 1: 배지 준비 레시피. 변환을 위해 매체를 준비하는 방법에 대한 설명입니다. 첨가되는 비타민의 양은 표시된 원액 농도를 기준으로 계산됩니다. 비타민 원액 준비에 대해서는 표 2 를 참조하십시오. 모든 배지에 대해 시약을 900mL의 이중 증류된H2O, pH를 표시된 수준으로 첨가한 다음 최종 부피 1,000mL에 물을 첨가합니다. * = 멸균 후 추가. ** = 1 M KOH의 pH. = 1M NaOH의 pH. 이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
표 2: 질경이 배지용 비타민 재고. 모든 비타민은 보관 전에 필터 멸균 및 라벨을 정확하게 부착해야 합니다. 표시된 경우 분말을 먼저 1N NaOH에 용해시킨 다음 이중 증류된 H2O로 원하는 부피를 구성합니다 . 이 표를 다운로드하려면 여기를 클릭하십시오.
Plantago 속의 식물에 대한 형질 전환 프로토콜의 부족은 특히 연구자가 유전자 기능을 탐구하는 데 관심이 있을 때 이러한 식물을 모델로 사용하는 것을 제한합니다. P. lanceolata는속 16에서 가장 일반적으로 연구되는 식물이기 때문에 유전자 변형 프로토콜을 개발하기 위해 선택되었습니다. 개발된 프로토콜은 혈관 생물학, 생태학, 식물-곤충 상호 작용 및 비생물적 스트레스 생리학과 관련된 연구를 더욱 발전시키는 도구로 사용될 것입니다.
제시된 프로토콜은 사용자가 형질전환 식물을 얻을 수 있도록 하는 단계를 명확하게 설명합니다. 조직 배양 환경에서 번성하는 P. lanceolata 의 능력 외에도 여러 요인이 우리 형질전환 방법의 성공에 기여했습니다. 첫째, 형질전환을 위해 고품질의 멸균 식물 뿌리 조직을 사용하는 것의 중요성이 관찰되었습니다. 뿌리는 3-4주 된 식물에서 채취했을 때 가장 높은 변형률을 보였으며 녹색 또는 옅은 흰색으로 나타났습니다. 박테리아 또는 곰팡이 오염이 어느 정도 있는 상자에서 채취한 뿌리는 종종 오염된 사격 배양을 초래했으며 갈색으로 보이는 오래된 뿌리는 성공적인 변형을 초래하지 않았습니다. 뿌리 조직은 잎과 잎자루 조직이 새싹을 발달시키는 데 실패했기 때문에 현재의 방법을 사용하여 변형에 가장 효율적인 조직 유형이었습니다.
또 다른 중요한 관찰은 형질전환을 위해 뿌리 조직을 수집하는 최적의 방법은 갓 자른 뿌리 재료를 멸균수에 넣는 것이라는 것입니다. 이 단계는 뿌리가 성장 용기에서 제거될 때 빨리 마르는 경향이 있기 때문에 조직의 나머지 부분이 수집되는 동안 뿌리 재료가 수분을 유지하는 것을 효과적으로 허용했습니다. 이 단계는 또한 한 번에 더 많은 뿌리가 박테리아에서 배양될 수 있게 해주었기 때문에 형질전환의 성공률을 높이는 데 도움이 되었습니다.
이 프로토콜은 뿌리 조직이 공동 배양 배지에서 배양하는 시간을 2일로 줄임으로써 수정할 수 있습니다. 2일 또는 3일의 잠복기가 감염을 허용하기에 충분하여 싹 이니셜을 초래하는 것으로 관찰되었습니다. 그러나 배지에 항생제 억제제가 없으면 종종 A. tumefaciens 과증식이 발생하여 신생 조직을 죽일 수 있다는 것이 관찰되었기 때문에 더 긴 배양 시간은 권장되지 않습니다.
이 연구의 한계는 비교를 위해 P. lanceolata 형질전환에서 A. tumefaciens의 다른 방법 또는 종의 성능에 대한 사용 가능한 데이터가 부족하다는 것입니다. 우리가 아는 한, 이 프로토콜은 참신합니다. 초기 시험에서 A. tumefaciens GV3101에서 높은 형질전환 효율이 나타났으며, 다른 균주를 실험하는 대신 이 균주를 사용하여 기술을 개선하는 데 중점을 두었습니다. 20 %의 변형 효율은 플랜트 변형에 대해 상대적으로 높습니다 - 많은 기존 방법은 > 1 %를 성공으로 간주합니다26,27,28. 그러나여러 종의 뿌리 형질전환에 사용되는 것으로 알려진 A. rhizogenes와 같은 A. tumefaciens의 다른 균주를 사용하면 훨씬 더 높은 성공률을 얻을 수 있습니다. P. lanceolata 의 형질전환 효율 증가를 촉진하기 위해 다른 균주를 사용하는 것의 영향을 평가하기 위해서는 추가 실험이 필요할 것입니다.
P. lanceolata의 성공적인 변형은 많은 연구 분야에 도움이 될 것입니다. 높은 형질전환 효율과 조직 배양 배지에서 식물의 빠른 성장은 P. lanceolata를 유전자 기능 연구를 위한 실현 가능한 후보로 만든다15.
저자는 공개 할 것이 없습니다.
이 연구는 국립 과학 재단 (EDGE IOS-1923557 to C.Z. and Y.Z.)의 지원을 받았다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
14 mL Round Bottom TubeA4A2:A34 | ThermoFisher Scientific | 150268 | |
1-Naphthylacetic acid | Gold Biotechnology | N-780 | |
3M Micropore Surgical Paper Tape | ThermoFisher Scientific | 19-027761 | |
50 mL Centrifuge Tubes | Research Products International Corp. | 163227LC | |
600 Watt High Pressure Sodium Lights | Plantmax | PX-LU600 | |
6-Benzylaminopurine (6-BAP) | Gold Biotechnology | B-110 | |
Aluminum Foil | ThermoFisher Scientific | 01-213-100 | |
Bacto Agar | Thermofisher Scientific | 214010 | |
Binary Plasmid pBI101 | Clontech, USA | 632522 | |
Cool White Grow Light Sylvania LLC | Home Depot | 315952205 | |
D-biotin | ThermoFisher Scientific | BP232-1 | |
ddH2O | |||
DH5a E. coli | Invitrogen, USA | 18258012 | |
Disposable Petri Dishes, Sterile 150 x 16 mm | ThermoFisher Scientific | FB0875712 | |
Disposable Petri Dishes, Sterile 95 x 15 mm | ThermoFisher Scientific | FB0875714G | |
Dissecting Scissors | Leica Biosystems | 38DI12044 | |
Ethanol 200 Proof | Decon Labs | 2705 | |
Folic Acid | Fisher Scientific | BP2519-5 | |
Forceps | Leica Biosystems | 38DI18031 | |
Gelrite | Research Products International Corp. | G35020-1000 | |
Glycerol | ThermoFisher Scientific | 17904 | |
Glycine | Sigma | 241261 | |
Incubated Tabletop Orbital Shaker | ThermoFisher Scientific | SHKE420HP | |
Indole-3-Acetic Acid (IAA) | Gold Biotechnology | I-110 | |
Indole-3-Butyric Acid (IBA) | Gold Biotechnology | I-180 | |
Kanamycin Monosulfate | Gold Biotechnology | K-120 | |
Macrocentrifuge | ThermoFisher Scientific | 75007210 | |
Magenta Boxes | ThermoFisher Scientific | 50255176 | |
Micro Pipet Tips 1000 µL | Corning | 4140 | |
Micro Pipet Tips 200 µL | Corning | 4138 | |
Micro Pipette Tips 10 µL | Corning | 4135 | |
Microcentrifuge | ThermoFisher Scientific | 75002410 | |
Micropipettor 0.5-10 µL | Corning | 4071 | |
Micropipettor 100-1000 µL | Corning | 4075 | |
Micropipettor 20-200 µL | Corning | 4074 | |
Micropipettor 2-20 µL | Corning | 4072 | |
Murashige & Skooge Basal Medium with Vitamins | PhytoTech | M519 | |
Murashige & Skooge Basal Salt Mixture | PhytoTech | M524 | |
myo-Inositol | Gold Biotechnology | I-25 | |
Nicotinic acid | Sigma | N0761-100g | |
Parafilm (paraffin film) | ThermoFisher Scientific | S37440 | |
Potassium Hydroxide (KOH) | Research Products International Corp. | P44000 | |
Pyridoxine HCl | Sigma | P6280-10g | |
Scalpel Blade Handle | Leica Biosystems | 38DI36419 | |
Scalpel Blades | Leica Biosystems | 3802181 | |
Sodium Chloride, Crystal (NaCl) | Mallinckrodt Chemicals | 7581-06 | |
Sodium Hydroxide (NaOH) | Research Products International Corp. | S24000 | |
Sodium Hypochlorite | Walmart | 23263068401 | |
Soil- Bark Mix | Berger, USA | BM7 | |
Square Pots (3.5 inches squared) | Greenhouse Megastore | CN-TRK-1835 | |
Sucrose | Research Products International Corp. | S24060 | |
Thermocycler | ThermoFisher Scientific | A24811 | |
Thiamine HCl | Sigma | T4625-5G | |
Timentin Ticarcillin/Clavulanate (15/1) (Timentin) | Gold Biotechnology | T-104 | |
trans-Zeatin Riboside (ZR) | Gold Biotechnology | Z-100 | |
Tryptone | Thermofisher Scientific | 211705 | |
Wild Type Plantago lanceolata seeds | Outsidepride Seed Source, OR, USA | F1296 | Outsidepride.com |
Yeast Extract Granulated | Research Products International Corp. | Y20025-1000 |
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