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この記事について

  • 要約
  • 要約
  • 概要
  • プロトコル
  • 代表的な結果
  • ディスカッション
  • 開示事項
  • 謝辞
  • 資料
  • 参考文献
  • 転載および許可

要約

特定の阻害剤をスクリーニングするための迅速かつ正確な化学アッセイは、医薬品開発の武器庫における重要なツールです。ここでは、HAT1アセチル化活性の阻害を測定するためのスケーラブルなアセチルクリックケミストリーアッセイを紹介します。

要約

HAT1は、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ1とも呼ばれ、ヌクレオソーム形成前に新生H4を安定化およびアセチル化することにより、クロマチン合成において重要な役割を果たします。さまざまなシステムでの腫瘍増殖に必要であり、がん治療の標的となる可能性があります。HAT1酵素活性を阻害する化合物の同定を容易にするために、迅速なスクリーニングのためのアセチルクリックアッセイを考案しました。この簡便なアッセイでは、活性化されたヒト細胞から精製された組換えHAT1/Rbap46を用います。この分析法では、アセチル-CoA 類似体である 4-ペンチノイル-CoA(4P)をクリックケミストリーアプローチで利用します。これには、HAT1依存性アシル化反応によるアルキンハンドルのビオチン化H4 N末端ペプチドへの酵素的転写が含まれます。捕捉したペプチドはニュートラアビジンプレート上に固定化され、続いてビオチン-アジドによるクリックケミストリー官能基化が行われます。続いて、ストレプトアビジン-ペルオキシダーゼリクルートメントを使用してアンプレックスレッドを酸化し、定量的な蛍光出力が得られます。アシル化反応中に化学的阻害剤を導入することで、蛍光シグナルの減少に基づいて酵素阻害を定量することができます。重要なことは、この反応はスケーラブルであり、HAT1酵素活性の潜在的な阻害剤のハイスループットスクリーニングを可能にすることです。

概要

数ある真核生物のアセチルトランスフェラーゼの中で、HAT1は最初に単離されたヒストンアセチルトランスフェラーゼであった1,2,3。その後の研究により、クロマチン複製、特にS期4期の新しいヌクレオソームの合成における極めて重要な役割が確固たるものとなりました。研究の結果、HAT1は乳腺細胞の上皮成長因子(EGF)処理によって高度に刺激されることが認識されました5。さらに、HAT1はin vivoでの急速な細胞増殖と腫瘍形成に必要であることが明らかになっています6,7,8,9。データによると、HAT1は細胞分裂の同化プロセスとエピジェネティックプロセスの調整に不可欠であり、腫瘍の増殖を促進します。

HAT1は、ヒストンH4のアミノ末端テールをリジン5および12上のジアセチル化し、シャペロンタンパク質Rbap46と複合体でヒストンに....

プロトコル

1.方法1:組換えHAT1 / Rbap46複合体の生成と精製

  1. HEK293f細胞の融解、回収、増殖
    1. 100 mLフラスコ中で、1〜1,000万個のHEK293f哺乳類細胞26 を30 mLのフリースタイル293発現培地に解凍します。8% CO2 を 37 °C で 60 rpm で回転させながらインキュベートします。
    2. 翌日、細胞の生存率をカウントして確認し、回転速度を120rpmに調整します。1 L フラスコで 300 mL 培養液に増殖させ、播種密度を 500,000 細胞/mL に維持し、密度が 3 x 106 cells/mL を超える前に細胞を分割します。
  2. HEK293fトランスフェクション
    1. 5 x 105 cells/mL を 1 L フラスコで 300 mL 培養し、24 時間培養します。翌日、細胞を数えて、7.5 x 105 から 1.2 x 106 cells/mL の間であることを確認します。
    2. 30 mL の PBS 中に 300 μg の pHEK-FLAG-HAT1 と 300 μg の pHEK-Rbap46 プラスミド DNA の混合物を調製します。1.2 mLのポリエチレンイミン....

代表的な結果

適切なアッセイ性能を確保するために、すべてのプレートに重複した標準曲線(16ウェル)を含める必要があります。検量線データは、溶液中の Pra 含有ペプチドと未変性 H4 ペプチドの比率に応じて、100% から 0% の範囲で表形式で設定する必要があります(表 1)。アンプレックスレッドシグナルは、100% pra/0% ネイティブ H4 ペプチドウェルで最も高く、0% pra/100% ネイティブ H4 ペプチド?.......

ディスカッション

過去10年間で、クリックケミストリーが顕著になり20、相互作用する化学構造の正確な設計が可能になりました。この文脈の中で、種々の生体直交共有結合21 が、それらの自然環境において複合体を形成するための有望な選択肢として浮上してきた。クリックケミストリーは、一般に「クリック反応」として知られる、迅速で選択的な反応を示す官能基のペ.......

開示事項

HAT1アセチルクリックアッセイに関する特許を出願しています(PCT/US20/29395)。J.J.G. は、Sharma Therapeutics, LLC および Guidepoint とのコンサルティング契約と、Hummingbird Biosciences からの研究支援 (彼の機関への) を報告しています。

謝辞

H4K12CoAを提供してくださったGeorge Zheng氏に感謝します。有益な議論とフィードバックを提供してくれたGruber Labのメンバーに感謝します。NIH/NCI(1K08CA245024)、CPRIT(RR200090)、V財団(V2022-022)からの支援に感謝します。

....

資料

NameCompanyCatalog NumberComments
4P CoACayman Chemical10547Click chemistry co-factor
Amplex RedFisher SciA12222Fluorescence substrate
Biotin-PEG-AzideAlfa AesarJ64996MCClick chemistry
Copper SulfateSigma-aldrich 7758-98-7Click chemistry
DMSOFisher Scientific 67-68-5diluent
DTTAcros Organics03-12-3483reducting agent
ForskolinVWR102987-310Protein expression
Freestyle 293 Expression MediumThermo Fisher12338018Media
Freestyle 293-F cellsThermo FisherR790-07Protein expression
H4-peptide/1-23-GGK-biotinAnaspecAS65097peptide substrate
HEPESSigma-aldrich 7365-45-9EB buffer
Hydrogen peroxide 30% solutionSigma-aldrich Z00183-99-0initiator
M2 FLAG antibody slurryMillipore-SigmaA2220Protein purification
Macrosep 10K Filter (Pall Lab)VWR89131-980Protein purification
Neutravidin PlateThermo Sci15127BSA-pre-blocked
NP40 (IGEPAL)MP Biomedical19859620x buffer
pHEK-293 plasmidTakara Bio3390Protein expression
Phosphate Buffered Saline 10xAlfa Aesar Z00082-33-6wash buffer
Pra peptideGenscriptCustom synthesisbiotinylated
Sodium AscorbateSigma-aldrich 134-03-2Click chemistry
Sodium chlorideSigma-aldrich 7647-14-5EB buffer
Sodium phosphateVWR International7558-80-7buffer
StreptavidinEMD Millipore189730competitor
Streptavidin-HRPCell Signaling3999Senzyme
THPTA ligandFisher Sci1010-500Click chemistry
Tris baseSigma-aldrich 77-86-120x buffer
Triton-X 100VWR International 9002-93-1EB buffer
Tween-20Sigma-aldrich 9005-64-5Wash buffer
UreaSigma-Aldrich57-13-6quencher

参考文献

  1. Kleff, S., et al. Identification of a gene encoding a yeast histone H4 acetyltransferase. J Biol Chem. 270 (42), 24674-24677 (1995).
  2. Parthun, M. R., Widom, J., Gottschling, D. E.

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