정량 검사의 항생제 자화 율 Neisseria gonorrhoeae 집계를 사용 하 여 ATP 이용 상업적인 분석 실험 및 라이브/죽은 얼룩

요약

간단한 ATP 측정 분석 결과 및 라이브/죽은 방법 얼룩 계량 ceftriaxone 치료 후 Neisseria gonorrhoeae 생존을 시각화 하 사용 되었다. 이 프로토콜 검사 어떤 항생제의 항균 효과를 확장할 수 있습니다 고 박테리아 biofilms에서 항생제의 최소 억제 농도 정의 하기 위해 사용할 수 있습니다.

초록

항생제 내성 Neisseria gonorrhoeae (GC)의 출현은 세계적인 건강 위협이 고 치료 하지 못하는 개인을 식별 하는 필요를 강조. 이 그램 음성 박테리아는 인간에서 독점적으로 임 질을 발생합니다. 감염, 동안 양식 집계 biofilms 하 수 있다. 최소 억제 농도 (MIC) 테스트 항생제 자화 율을 결정 하 고 적절 한 치료를 정의 하기 위해 사용 됩니다. 그러나, vivo에서 박멸 및 실험실 결과 관계의 메커니즘은 알려져 있지 않습니다. GC 집계 항생제 자화 율에 영향을 미치는 방법과 집계 크기와 항생제 자화 율 사이의 관계를 표시를 검사 하는 방법 개발 되었다. 때 GC 집계, 그들은 더 죽이 항생제에 저항력이, 센터에서 박테리아와 함께 주변에 그 보다 더 나은 ceftriaxone 치료를 생존. 데이터 표시 N. gonorrhoeae 집계 표준 한 천 격판덮개 기반 마이크 메서드를 사용 하 여 반영 되지 않습니다 ceftriaxone의 민감성을 줄일 수 있습니다. 이 연구에 사용 되는 방법은 연구자 임상 관련 조건 하에서 세균 자화 율 테스트를 수 있습니다.

서문

임 질은 일반적인 성병 감염 (STI)¹. Neisseria gonorrhoeae (GC), 그람 음성 diplococcal 박테리아는이 질병의 원인이 되는 대리인. 생식 기 감염의 증상 통증 배 뇨, 일반화 된 생식 기 통증, 그리고 요도 방전 하는 동안 발생할 수 있습니다. 감염이 종종 무 증상^2,3,,45, 이며 이로써 확장된 식민. 그들은 유기 체의 전송을 촉진 가능성이 있고이 골반 염증 성 질환 (PID) 등의 합병증으로 이어질 수 있습니다 gonococcal 감염 (DGI)⁶전파 이러한 치료 감염 주요 건강 관심사는. 항생제 내성 임 질은 중요 한 공중 위생 위기와 증가 사회경제적 부담⁷. Cephalosporins 감소 민감성 ceftriaxone⁸azithromycin 또는 doxycycline 결합 듀얼 치료에서 단일 항생제 치료 처방 변경 결과입니다. Ceftriaxone 및 azithromycin^9,10, 함께 무 증상 감염의 증가 실패 임 질 치료 실패를 이해 하기 위한 필요를 강조 한다.

한 천 희석 및 디스크 확산 테스트를 포함 하 여 최소 억제 농도 (MIC) 테스트는 항생제에 저항을 식별에 대 한 표준 의학 시험으로 사용 되었습니다. 그럼에도 불구 하 고, 마이크 테스트 세균성 항 생 저항 vivo에서 반영 하는 경우에 명확 하지 않습니다. 항생제의 살 균 농도의 박테리아의 생존에 기여 하는 박테리아 biofilms의 형성: 마이크 테스트 하는 것은이 효과¹¹을 감지할 수. GC는¹²점 막 표면 biofilms을 형성할 수 있다, 때문에 우리가 가설 그 항생제 자화 율 집계 내 개별 GC에서 본 다른 것. 또한, 연구 3 상 가변 표면 분자, Pili, 불투명도 관련 단백질 (Opa), 및 lipooligosaccharides (로스), 규제 간 박테리아 상호 작용, 다른 크기의 집계^13, 으로 이어질 ^{14 , 15}. 항생제 저항에 이러한 구성의 기여 적절 한 방법의 부족으로 검사 하지.

현재, biofilm 박멸을 측정 하기 위해 여러 가지 방법이 있다. 가장 널리 사용 되는 양적 방법 크리스탈 바이올렛¹⁶얼룩을 사용 하 여 바이오 매스의 변화를 측정 하는 것입니다. 그러나, 방법 중요 한 실험적인 조작 실험 반복¹⁷에서 잠재적으로 오류를 생성할 수 있는 필요 합니다. 여기에 사용 되는 라이브/죽은 착 방법 라이브 하 고 죽은 박테리아와 그들의 분포는 biofilm 내의 시각화 수 있습니다. 그러나, biofilm 구조의 염료 침투를 감소 시키는 물리적 장벽으로 발생할 수 있습니다. 따라서, 그룹 내에서 라이브/죽은 박테리아를 계량 하는 얼룩 작은 biofilms 또는 그것의 선구자-microcolonies 또는 집계로 제한 됩니다. 다른 방법을, 한 천 희석 및 디스크 확산 테스트를 포함 하 여 집단의 효과 측정할 수 없습니다. 것 필요 모두를 측정할 수 있는 정량적 분석 결과 박테리아 생활과 그들의 분포를 시각화 항생제 노출, 이상적인 방법 집계에서 GC 민감성을 검사 합니다.

여기에 설명 된 절차는 ATP 사용률 측정 결합 및 라이브/죽은 얼룩을 양적 분석 결과 항생제의 집계에서 GC 민감성을 시각적으로 검사.

프로토콜

1. 일반적인 유지 보수의 GC 변종

1. N. gonorrhoeae 긴장 행진 1% GCK agar에 켈로그¹⁸ (표 1, 표 2) 냉장고 주식에서 보충 하 고 5% CO₂ 16-18 헤 사용 MS11 단계 변수 Opa (MS11Opa +), 아니 Opa (MS11ΔOpa), 표현에 대 한 37 ° C를 품 어 또는 잘린된 로스 (MS11ΔLgtE)입니다.
2. 신중 하 게 부정적인 pili (어두운 가장자리 없이 식민지) 또는 양성 (어두운 가장자리 식민지) 식민지 식민지 형태학¹⁹ 해 가벼운 현미경 및 새로운 GCK 플레이트에 연속 사용에 따라 각 스트레인에서 선택 합니다.
3. 사용 하기 전에 16-18 h 5% CO₂ 와 37 ° C에서 품 어.

2. 생존 GC 집계의 정량화

1. 메 마른 주걱을 사용 하 여 GC를 수집 합니다. 면봉 접시에서 GC와 미리 데워 국물 (GCP, 표 3)에 다시 중단 GC 1%와 4.2% NaHCO₃ 켈로그 솔루션¹⁸보충. 분 광 광도 법을 사용 하 여 650의 파장에서 nm (1의 OD₆₅₀ ~ 109 CFU/mL x 1 =) 중단된 박테리아의 농도 결정 하.
2. ~ 1 × 10로 GC의 농도 조정⁸ CFU/mL.
3. 96 잘 접시의 우물으로 조정 GC 중지 99 µ L를 추가 합니다.
4. 박테리아 수 있도록 5% CO₂ 와 37 ℃에서 6 h에 대 한 접시를 품 어 집계에.
5. 추가 1 µ L의 직렬 희석된 ceftriaxone (1000, 100, 50, 25, 12.5, 6.2, 3.1, 1.5, 0.8, 0.4, 0.2 µ g/mL) 각 우물에. 치료 컨트롤 역할을 일부 우물을 남겨 주세요.
6. 5% CO₂와 37 ℃에서 24 h에 대 한 접시를 품 어.
7. 3 번에 5 144 W에서 s 및 20 kHz에 대 한 각 잘 정지 sonicate
8. 각 잘으로 100 µ L 상용 ATP 이용 발광 시 약의 추가, 최대 플라스틱-그리고 3 번, 아래로 5% CO₂와 37 ° C에서 15 분 동안 품 어.
9. 신중 하 게 96-잘 검은 microplate에 새로운 우물에 각 우물에서 혼합물의 150 µ L를 전송 하 고 거품을 도입 방지.
10. 각 560에서의 흡 광도 측정 nm 플레이트 리더를 사용 하 여.
11. 직렬 ceftriaxone 치료 후 치료 우물에서 독서를 얻은 독서의 비율에 의해 생존 율을 계산 합니다.

3. 라이브/죽은 GC의의 형광 현미경 분석

1. 메 마른 주걱을 사용 하 여 GC를 수집 합니다. 접시에서 면봉 GC와 미리 따뜻하게 GCP 미디어 플러스 1%에서 GC 다시 중단 켈로그 보충.
2. 650의 파장에서 분 광 광도 법으로 박테리아의 수를 결정 nm ~ 1 x 10 GC의 농도 조정 하 고⁷ CFU/mL.
3. 8 잘 coverslip 아래쪽 챔버에 198 µ L로 GC 중지를 추가 합니다.
4. 집계 형성 수 있도록 5% CO₂ 와 37 ℃에서 6 h는 챔버를 품 어.
5. 각 잘 각 집계 조건 내에 ceftriaxone (100 µ g/mL 또는 다양 한 희석)의 2 µ L를 추가 합니다. 5% CO₂와 37 ° C에서 원하는 시간에 품 어.
6. 각 우물에 라이브/죽은 얼룩 솔루션 혼합물의 0.6 µ L을 추가 하 고 5% CO₂와 37 ° C에서 20 분 동안 품 어.
7. Confocal 현미경 (동등한 현미경은 사용할 수 있습니다)를 사용 하 여 Z-시리즈 이미지를 취득 합니다.
8. ImageJ 소프트웨어를 사용 하 여 GC 집계와 라이브-에-죽은 각 집계에 얼룩의 형광 강도 비율 (FIR)의 크기의 측정에 대 한 이미지를 분석 합니다.

4. 이미지 분석

1. 세균의 크기 추정
   1. ImageJ 열고 ImageJ 메뉴 모음에는 raw 이미지 파일을 드래그 하 여 이미지를 엽니다.
   2. ImageJ 메뉴 막대에서 프리 핸드 라인 을 클릭 하 고 이미지에서 각 집단의 영역 원형.
   3. 클릭 분석 | 측정 ImageJ 메뉴 표시줄에서.
   4. 지역 열 아래에서 새 창에 번호를 가져올.
2. 집계의 라이브-에-죽은 비율의 정량화
   1. ImageJ 열고 ImageJ 메뉴 모음에는 raw 이미지 파일을 드래그 하 여 이미지를 엽니다.
   2. 클릭 분석 | 설정 측정 ImageJ 메뉴 표시줄에서.
   3. 팝업 창에서 통합된 밀도 확인 하 고 확인을 클릭 합니다.
   4. 이미지 클릭 | 컬러 | 도구 채널 메뉴 막대에 있는 선택 색상.
   5. 채널 1 라이브 박테리아 얼룩에 대 한 형광으로 확인 합니다.
   6. ImageJ 메뉴 막대에서 프리 핸드 라인 을 클릭 하 고 각 집단의 영역 원형.
   7. 클릭 분석 | 측정 ImageJ 메뉴 표시줄에서.
   8. IntDen 열 수를 가져옵니다.
   9. 죽은 세균성 얼룩에 대 한 형광으로 채널 2 를 확인 합니다. 4.2.6-4.2.8 단계를 반복 합니다.
   10. 숫자 단계의 4.2.8 단계의 4.2.9 숫자로 나누어 살고 죽은 비율을 얻을.
3. 통계 분석
   1. GraphPad Prism 열고 원하는 열에 ImageJ에서 얻은 번호를 입력 합니다.
   2. 분석 을 클릭 하 고 열 분석에서 t 테스트 를 선택 합니다.
   3. 비교에 대 한 원하는 열을 확인 하 고 확인을 클릭 합니다.
   4. 분석 창에서 P-값을 구할.
   5. 단계 4.3.3에서에서 XY 분석 에서 선형 회귀 를 선택합니다
   6. R-광장 및 분석 창에서 P-값 을 가져옵니다.

결과

두 가지 방법을 사용 했다: ATP 사용률 분석 결과 및 라이브/죽은 얼룩 분석 결과. 결과 결합 하거나 개별적으로 항생제 치료 후 집계 내 세균 생존을 검토를 위해 사용 될 수 있습니다 합니다. ATP 사용률 분석 결과 미 균 biofilms^20,21에서 정확 하 게 실행 가능한 박테리아를 측정 하기 위해 표시 되었습니다. 여기, MS11Opa + 필 + ...

토론

박테리아는 인체 감염 시 biofilms을 형성할 수 있다. 전통적인 마이크 테스트는 biofilm에서 박테리아를 박멸 하는 데 필요한 농도 반영 되지 않을 수 있습니다. biofilm에 항균 효과 테스트 하려면 방법 biofilm 바이오 매스를 기반으로 CFUs 도금 biofilm 구조의 영향으로 인해 잘못 된 될 수 있습니다. 예를 들어 도금 방법은는 biofilm 중단 될 수 있습니다 하는 경우 작동 합니다. 따라서, 얻은 CFU 실행 가능한 ?...

자료

Name	Company	Catalog Number	Comments
100x Kellogg's supplement
Agar	United States Biological	A0930
BacTiter Assay	Promega	G8232
Ceftriaxone	TCI	C2226
Difco GC medium base	BD	228950
Ferric nitrate, nonahydrate	Sigma-Aldrich	254223-10G
Glucose	Thermo Fisher Scientific	BP350-1
L-glutamine Crystalline Powder	Fisher Scientific	BP379-100
BacLight live/dead staining	Invitrogen	L7012
MS11 Neisseria gonorrhoeae strain			kindly provided by Dr. Herman Schneider, Walter Reed Army Institute for Research
Potassium phosphate dibasic (K2HPO4)	Fisher Scientific	P290-500
Potassium phosphate monobasic (KH2PO4)	Fisher Scientific	BP329-1
Proteose Peptone	BD Biosciences	211693
Sodium chloride (NaCl)	Fisher Scientific	S671-10
Soluble Starch	Sigma-Aldrich	S9765
Thiamine pyrophosphate	Sigma-Aldrich	C8754-5G
Equipment
Petri Dishes	VWR	25384-302
8-well coverslip-bottom chamber	Thermo Fisher Scientific	155411
96-well tissue culture plates	Corning, Falcon	3370
Biosafety Cabinet (NU-425-600 Class II, A2 Laminar Flow Biohazard Hood)	Nuaire	32776
CO2 Incubator	Fisher Scientific	Model 3530
Confocal microscope equipped with live imaging chamber	Leica	SP5X
Corning  96 Well Black Polystyrene Microplate	Corning	3904
Glomax Illuminator	Promega	E6521
Pipette tips (0.1-10 µL)	Thermo Fisher Scientific	02-717-133
Pipette tips (1000 µL)	VWR	83007-382
Pipette tips (200 µL)	VWR	53509-007
Spectrophotometer Ultrospec 2000 UV	Pharmacia Biotech	80-2106-00
Sterile 15 ml conical tubes	VWR	21008-216
Sterile Microcentrifuge Tubes (1.7 mL)	Sorenson BioScience	16070
Sterile polyester-tipped applicators	Fisher Scientific	23-400-122
Sonicator	Kontes	Equivelent to 9110001