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본 프로토콜은 Aedes aegypti 모기의 생식력, 날개 크기, 생식력, 성비, 생존 능력, 발달 시간, 수컷 기여도 및 성체 수명을 포함한 일반적인 생명 매개 변수 데이터를 측정하는 방법을 설명합니다. 이러한 측정은 유전자 변형 모기의 적합성을 평가하는 데 사용할 수 있습니다.
형질전환 모기는 야생형 모기에 비해 체력 단련 비용이 많이 드는 경우가 많습니다. 이와 관련하여, 적합성 비용 연구는 유전자 변형 모기로부터 생명 매개변수 데이터를 수집하고, 이를 동일한 유전적 배경에서 전이유전자가 없는 모기와 비교하는 것을 포함한다. 이 원고는 번식력, 날개 크기 및 모양, 생식력, 성비, 생존 가능성, 발달 시간, 수컷 기여도 및 성인 수명을 포함하여 모기 Aedes aegypti의 일반적인 생활사 특성을 측정하는 방법을 보여줍니다. 이러한 매개변수는 번식 성공을 반영하고 측정이 간단하며 일반적으로 문헌에 보고되기 때문에 선택되었습니다. 대표적인 결과는 유전자 knock-out 또는 유전자 구동 요소의 단일 삽입과 관련된 적합성 비용을 정량화합니다. 생명 매개 변수 데이터 수집 방법을 표준화하는 것이 중요한데, 이러한 데이터는 여러 연구에서 생성된 형질전환 모기의 건강 상태를 비교하거나 시뮬레이션된 야생형 모기 개체군에서 전이유전자 고정률을 모델링하는 데 사용될 수 있기 때문입니다. 이 프로토콜은 유전자 변형 Aedes aegypti에 특이적이지만, 특정 생물학적 맥락에 따라 특별한 적응이 필요할 수 있다는 경고와 함께 다른 모기 종 또는 기타 실험적 치료 조건에도 사용될 수 있습니다.
적자생존(survival of the fittest)은 환경에 가장 잘 적응된 유전자를 가진 개체가 그 유전자를 다음 세대에 물려준다는 다윈의 생각이다1. 이것은 그들의 유전자가 생존할 것인지를 결정하는 것이 적합성이라는 것을 의미한다. 150년 이상 된 이 개념은 아마도 형질전환 모기에서 성공적인 유전자 드라이브를 엔지니어링하는 데 있어 가장 중요한 결정 요인일 것입니다. 유전자 드라이브(gene drives) 또는 이기적인 유전 요소가 개체군을 통해 퍼질 수 있도록 하는 슈퍼 멘델 유전 패턴(super-Mendelian inheritance pattern)2이 유전적 해충 관리를 위해 연구되고 있다3. 매개체 통제의 맥락에서 이 전략은 야생형(WT) 절지동물을 병원체에 내성이 있는 절지동물로 대체하거나(개체군 수정) 모두 제거(개체군 억제)하는 것을 목표로 합니다(개체군 억제)4. 그러나 형질전환 모기는 WT 모기에 비해 적합성 비용(유전적 부하라고도 함)을 보이는 경우가 많으며, 이는 형질전환 유전자가 그들을 능가할 수 있는 개체군에서 손실될 것임을 의미합니다. 따라서 전이유전자를 유전자 구동 시스템과 결합하는 것은 적응 비용을 상쇄하고 전형적인 멘델 유전에서 기대되는 것보다 더 높은 수준으로 전이유전자를 집단을 통해 밀어내기 위해 필요하다4.
모기 매개체 종에 대한 실험실 연구는 전이 유전자가 종종 적합성 비용 5,6,7을 표시한다는 것을 보여주었습니다. 예를 들어, Irvin et al. Drosophila actin 5C 또는 합성 3XP3 프로모터에서 향상된 녹색 형광 단백질(eGFP) 또는 transposase 유전자를 발현하도록 조작된 Aedes(Ae.) aegypti에서 다양한 생명 매개변수를 측정하고 이를 야생형 Orlando 균주(파생된 것과 동일한 유전적 배경)와 비교했습니다5. 가장 주목할 만한 것은, 모든 유전자 변형 균주가 생식 적합성을 현저히 감소시킨다는 것을 발견했다5. 전이유전자에 따라, Plasmodium 기생충 발달을 억제하는 전이유전자를 발현하는 일부 Anopheles (An.) 모기도 적합성 비용을 나타냈다6. 구체적으로, 구성적 또는 혈액 가루 유발 프로모터에서 봉독 포스포리파아제(PLA2)를 발현하는 An. stephensi는 대조군에 비해 현저히 적은 수의 난자를 낳았다6. 저자들은 또한 다른 전이유전자인 SM1 도데카펩타이드 테트라머를 발현하는 형질전환 아노펠레스(transgenic Anopheles)가 적합성 비용을 나타내지 않는다는 것을 발견했으며, 이로 인해 형질전환유전자가 부여하는 적합성 비용이 적어도 부분적으로는 생성된 형질전환 단백질의 효과에 의존한다는 결론을 내렸습니다6. 실제로, 적합성 비용은 전이유전자 산물, 위치 효과, off-target 효과, 삽입 돌연변이 유발 또는 실험실 사육 균주에서의 근친 교배 효과에 기인할 수 있다7. 따라서 유전자 드라이브는 이러한 유전자 변형으로 인한 적합성 비용을 상쇄할 수 있을 만큼 충분히 견고해야 하며, 드라이브 자체를 차단하는 삽입 및 삭제(indel)의 발생을 방지해야 합니다.
발달 또는 생식 적합성 비용은 실험실 또는 케이지 연구에서 측정할 수 있으며7 현장에서 알려지지 않은 요인도 영향을 미칠 수 있다는 점에 유의해야 한다. 그럼에도 불구하고, 통제된 적합성 연구는 유전자 드라이브 프로그램과 같은 유전자 변형 모기 방출을 계획하거나 평가할 때 형질전환 계통이 다음 세대에 걸쳐 지속되는지 여부를 결정하기 위한 중요한 첫 번째 단계입니다. 예를 들어, Hammond et al. 여성의 생식력에 필요한 유전자를 파괴하기 위한 감비아 CRISPR/Cas9 기반 유전자 드라이브 평가8. 적어도 25세대에 걸쳐 유지된 케이지 연구를 통해, 저자들은 모기가 CRISPR 표적 분열을 차단하고 암컷의 생식력을 회복시키는 유전자 구동 저항성 대립유전자를 발생시킨다는 것을 발견했다8. 그들의 모델링 노력은 유전자 드라이브에 대한 이형접합 암컷의 생식력이 시뮬레이션된 조건에서 유전자 드라이브 고정에 가장 극적인 영향을 미친다는 것을 시사했다8. 이와 같은 맥락에서, 서로 다른 프로모터 또는 다른 유전자 간 유전자좌에서 자율 유전자 구동 카세트를 발현하도록 설계된 Ae. aegypti(Higgs' White Eye strain, HWE)는 시뮬레이션된 집단에서 서로 다른 유전자 구동 고정률을 나타냈다9. 저자들은 MGDrivE 모델링10을 사용하여 측정된 indel 형성 속도, 모성 효과 및 실험실에서 수집한 생명 매개변수 데이터와 결합하여 모기의 적합성이 시뮬레이션된 조건에서 유전자 드라이브의 지속성에 가장 큰 영향을 미친다는 것을 발견했습니다9. 유전자 드라이브 효율성을 손상시킬 가능성이 가장 높은 적합성 비용은 내재적 드라이브 자체보다는 체세포 Cas9(과잉) 발현 또는 표적화된 유전자, 특히 이형접합체에서 기인합니다 11,12,13,14,15,16,17.
그 중요성을 감안할 때, 적합성은 형질전환 계통이 다음 세대에 걸쳐 지속될 수 있는 능력에 대한 중요한 요소이며, 전이 유전자와 관련된 모든 생리학적 효과에 대한 지표로 사용될 수 있습니다. 예를 들어, 오프 타겟 효과는 피트니스 비용과 관련이 있을 수 있습니다. 이 경우, 여러 세대에 걸쳐 형질전환 계통을 역교배하는 것이 권장됩니다. 더욱이, 현장 집단을 반영하는 것과 형질전환 선을 교차하는 것은 형질전환 집단이 실제 세계에서 얼마나 잘 경쟁할 수 있는지 조사하기 위해 필요할 수도 있습니다. 적합성 비용을 정량화하여 비교할 수 있도록 하기 위해 이 원고는 Ae. Aegypti 모기의 일반적인 생활사 특성을 측정하기 위한 간단한 프로토콜을 제공하며, 특히 형질전환 유전자와 관련된 적합성 비용에 중점을 두어 이러한 연구를 보다 쉽게 재현할 수 있습니다. 프로토콜에는 생식력, 출산력, 성비, 생존 가능성, 발달 시간, 남성 기여도 및 성인 수명이 포함됩니다. 날개 길이와 면적을 측정하는 것은 흉부 길이18,19 및 신체 크기 측정과 관련이 있기 때문에 체력 측정으로 선택되었으며, 이는 혈중 크기, 생식력 및 면역20,21과 직접적인 관련이 있습니다. 체력을 평가하는 방법에는 여러 가지가 있지만, 이러한 매개변수는 생식 성공을 반영하고 측정이 간단하며 일반적으로 문헌에 보고되기 때문에 선택되었습니다.
참고: 이 프로토콜은 이전에 검증되고 확립된 형질전환 및 야생형 Ae. aegypti 라인에 대해 작성되었습니다. 형질전환 Ae. aegypti 생성에 대한 자세한 정보는 Kistler et al.22 및 Coates et al.23. 아래에 요약된 모든 실험은 표준 Ae. aegypti 사육 절차에 따라 수행되었습니다. 모기는 75%-80%의 상대 습도와 12시간 밝음/12시간 어두운 주기로 28°C로 유지되었습니다. 통계 목적으로 모기 염색 당 최소 100 개의 개별 계란 종이가 권장됩니다. 종합적인 피트니스 연구는 완료하는 데 약 3개월이 걸립니다(그림 1).
1. 암컷 모기의 번식력 측정
2. 날개 길이, 면적 및 중심 크기 측정
3. 난자 수정 능력 평가
4. 번데기의 성비 결정
5. 유충 생존 가능성의 결정
6. 유충에서 번데기까지의 발달 시간 결정
7. 남성 기여도의 결정
8. 모기 수명의 결정
위의 프로토콜에 따라 두 가지 모기 계통의 적합성을 평가했습니다: (1) CRISPR/Cas9 매개 knock out of the Ae. aegypti D7L1 (AAEL006424) salivary protein 및 (2) Ae. Aegypti lines 발현 자율적인 CRISPR/Cas9 매개 유전자 드라이브9. 전자의 경우, D7L1 유전자에 특이적인 sgRNA를 배아에 미세주입한 후 파쇄를 생성하기 위해 NHEJ(non-homologous end-joining pathway)를 이용하여 동형접합 D7L1 knock-out line...
Ae. aegypti 피트니스 연구는 이 원고에서 논의된 바와 같이 형질전환 화물(예: 유전자 구동 요소) 또는 유전자 녹아웃과 관련된 피트니스 비용을 평가하기 위해 실험실에서 종종 수행됩니다. 그러나, 이러한 연구는 다양한 목적으로 수행될 수 있으며, Wolbachia-infected 30,31, insecticide resistant32,33 또는 arbovirus-infected
저자는 밝힐 것이 없습니다.
저자들은 이 프로토콜에 대한 지원을 해준 미주리 대학의 Bill Reid 박사와 Alexander Franz 박사에게 감사를 표하고 싶습니다. 저자들은 또한 R 분석을 지원해 준 NIH/NIAID의 Benjamin Krajacich 박사에게 감사를 표하고 싶습니다. 이 연구는 NIH, 보조금 번호 R01 AI130085(KEO) 및 NIH/NIAID 교내 연구 프로그램 AI001246(EC)의 지원을 받았습니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1 oz. translucent plastic souffle cups | WebstaurantStore | 301100PC | |
2 oz. translucent polystyrene souffle cups | WebstaurantStore | 760P200N | |
3 mL plastic pipettors | Cornin | 357524 | |
50 mL conical tubes | Any brand | ||
64 oz. white double poly-coated paper food cup | WebstaurantStore | 999SOUP64WB | for mosquito enclosement |
65 mm lens | Canon | MP-E 65mm f/2.8 1-5x Macro Photo | Canon Macro Photo MP-E 65mm, 7D-65mm-1X; zoom=1, 200, 6.3, ISO=100; for photographing wings or egg papers, although other cameras are likely sufficient |
Aedes aegypti mosquitoes | BEI | multiple strains as eggs are available | |
Artifical membrane feeders | https://lillieglassblowers.com/ | Meduim membrane feeder, Custom made, 33mm | Chemglass also offers, but sizes are wrong for us. Ours are about 3 cm? |
ATP | MP Biomedical | ICN15026605 | Any good quality ATP, 10mM filter sterile aliquots at -20 |
Autoclave | for sterilizing water for hatching | ||
Canon EOS 7D camera | Canon | 3814B004 | for photographing wings or egg papers, although other cameras are likely sufficient |
defibrinated sheep blood | Colorado Serum Co. | 60 ml, every 2 weeks | https://colorado-serum-com.3dcartstores.com/sheep-defibrinated |
Dual Gooseneck Microscope Illuminator | Dolan Jenner Fiber-Lite 180 | 181-1 System | |
Ethanol | |||
Forceps | Dumont | 5SF | |
Gauze | omnisorb ii | 4" non-woven sponges | |
glass microscope slide | Fisher Scientific | 12-544-2 | |
Glass Petri dishes, 100 × 15 mm | VWR | 75845-546 | for anesthesizing/manipulating mosquitoes on ice |
Hogs' gut | Any Deli | we buy in bulk, split, wash and store in small aliquots of ~4X12" at -20 in 50 ml conical | |
Ice | |||
Ice bucket | |||
Kimwipe | Fisher Scientific | 06-666A | |
Leica GZ4 StereoZoom microscope | for screening transgenic mosquitoes (if applicable) | ||
Paintbrush | AIT synthetic brush | size 10-0 | for manipulating larvae/pupae (Amazon) |
Panty hose | Walmart | L'eggs Everyday | Women's Nylon Plus Knee Highs Sheer Toe, 16 pairs (plus fits the carton) |
Pencils | Any brand | ||
Plastic containers for 2° storage of cartons | Walmart | Sterilite 58 Qt Storage Box Clear Base White Lid Set of 8 | |
Plastic containers for growing larvae | Walmart | Sterilite 28 Qt. Storage Box Plastic, White, Set of 10 | |
Plastic containers for hatching larvae | Walmart | Sterilite 6 Qt. Storage Box Plastic, White | |
polypropylene clear deli containers | WebstaurantStore | 127DM12BULK | 12 oz, or 16 oz if needed for bigger (127RD16BULK) |
Rubber bands | Office Max | #100736/#909606 /#3777415 | 12", #64 and #10 |
Rubber stopper | VWR | 217-0515 | for mosquito enclosement |
Sugar source, such as sugar cubes or raisins | |||
Tetramin flake food | Tetramin | 16106 | |
tpsDig | Stony Brook Morphometrics | A free morphometric image-processing software distributed online available at https://www.sbmorphometrics.org/ | |
tpsUtil | Stony Brook Morphometrics | A free morphometric image-processing software distributed online available at https://www.sbmorphometrics.org/ | |
White organza fabric 8” × 8” | FabricWholesale.com | 4491676 | Joann Casa Collection Organza Fabric by Casa Collection |
Whitman Grade 1 Qualitative Filter paper | Whitman | 1001-824 | for egg papers. The white color makes it easier to see the black eggs. |
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