Mantar yaprakları mısır patojenlerinin neden olduğu enfeksiyonun canlı hücre görüntülemesi için müstakil mısır kılıfları

Özet

Bu makale, mantar bitki patojenleri ile mısır etkileşimlerinin tekrarlanabilir sitolojik, fizyolojik ve moleküler çalışmaları için ayrılmış mısır yaprağı kılıflarını kullanan optimize edilmiş bir aşılama protokolünü detaylandırmaktadır. Yaprak kılıfları, sabitlenmemiş dokularda canlı bitki ve mantar arasındaki hücresel etkileşimlerin gerçek zamanlı gözlemini kolaylaştırır.

Özet

Mısır yaprağı kılıflarını hemibiotrofik ve nekrotrofik yaprak patojenik mantarlarla aşılamak için bir protokolü optimize ettik. Yöntem, orijinal olarak pirinç yaprağı kılıflarına uygulanandan modifiye edilmiştir ve canlı bitki hücrelerinde mantar büyümesi ve gelişiminin doğrudan mikroskobik gözlemine izin verir. İki adet tam yaprak boğazı ile mısır fidelerinden toplanan yaprak kılıfları, 20 μL damla 5 x 10⁵ spor/mL mantar sporu süspansiyonu ile aşılanır ve sürekli floresan ışık altında 23 °C'de nem odalarında inkübe edilir. 24-72 saat sonra, kimyasal fiksasyon veya temizleme gerektirmeden doğrudan görüntülenebilen optik olarak berrak bir numune olan tek bir epidermal hücre tabakası bırakmak için fazla doku bir tıraş bıçağıyla çıkarılır. Bitki ve mantar hücreleri deney süresince canlı kalır ve etkileşimler gerçek zamanlı olarak görselleştirilebilir. Kılıflar, enfeksiyon ve kolonizasyon sırasında konakçı ve patojen hücrelerin gelişimsel sitolojisini ve canlılığını incelemek için boyanabilir veya plazmolize tabi tutulabilir. Floresan proteinleri eksprese etmek için dönüştürülen mantar suşları, daha fazla çözünürlük için ve rekabetçi veya sinerjik etkileşimlerin değerlendirilmesini kolaylaştırmak için kılıflar üzerine aşılanabilir veya birlikte aşılanabilir. Floresan füzyon proteinlerini eksprese eden mantar suşları, plantadaki bu bireysel proteinlerin üretimini ve hedeflenmesini izlemek ve ölçmek için kullanılabilir. Aşılanmış kılıf dokuları, nükleik asitleri, proteinleri veya metabolitleri karakterize etmek için ekstrakte edilebilir. Bu kılıf tahlillerinin kullanımı, mısırda mantar patojenitesi mekanizmalarının ve ayrıca patojeniteye katkıda bulunan mantar protein efektörlerinin ve ikincil metabolitlerin ayrıntılı çalışmalarını büyük ölçüde ilerletmiştir.

Giriş

Hücresel düzeyde mekansal ve zamansal analizler, mantar-bitki etkileşimlerinin fizyolojisini ve sitolojisini anlamak için kritik öneme sahiptir. Kimyasal olarak sabitlenmiş ^1,2,3 veya temizlenmiş ve boyanmış⁴ yaprak dokuları ve yapay zarlar^5, geçmişte yaprak patojen gelişiminin sitolojisini ve bitki-mantar etkileşimlerini araştırmak için kullanılmıştır. Bununla birlikte, canlı konakçı dokulardaki enfeksiyon olaylarının fiksasyon veya temizleme olmadan gerçek zamanlı olarak araştırılması, görüntüleme için optik olarak şeffaf örneklerin hazırlanmasıyla ilgili teknik sorunlar nedeniyle zordur.

1940'ların sonlarında, canlı pirinç epidermal hücrelerinin pirinç patlaması mantarı Magnaporthe oryza^6'ya karşı direncinin parlak alan mikroskobik araştırması için müstakil bir yaprak kılıfı aşılama protokolü geliştirilmiştir. Daha yakın zamanlarda, Colletotrichum ve Magnaporthe türleri tarafından konak kolonizasyonunun ayrıntılı moleküler, fizyolojik ve sitolojik gözlemleri, bu yaprak kılıfı yönteminin modifiye edilmiş versiyonlarının floresan proteinleri eksprese eden mantar dönüştürücüleri ve epifloresan ve konfokal mikroskopi dahil olmak üzere yüksek performanslı canlı hücre görüntüleme protokolleri ile birleştirilmesiyle büyük ölçüde kolaylaştırılmıştır 7,8,9,10^,11,12,13.

Bu makale, hemibiyotrofik ve nekrotrofik yaprak mantar patojenleri tarafından enfeksiyon süreçlerinin gözlemlenmesi için ayrılmış mısır yaprağı kılıfları kullanılarak optimize edilmiş bir aşılama protokolünü detaylandırmaktadır. Antraknoz yaprak yanıklığı ve sap çürüklüğünün etken maddesi olan Colletotrichum graminicola (C. graminicola) ve Diplodia yaprak yanıklığına ve sap çürümesine neden olan Stenocarpella maydis'i incelemek için özel olarak kullandık. Bununla birlikte, yöntem diğer hemibiotrofik ve nekrotrofik yaprak mantar patojenlerine uygulanabilir olmalıdır. Bu eksize edilen yaprak kılıflarında enfeksiyon ve kolonizasyon olayları sırasındaki sitolojik ve fizyolojik yanıtlar, tüm yaprak bıçaklarındakilere^{benzerdir 12,14,15}. Ayrıca, kılıf epidermal hücrelerinin C. graminicola tarafından hemibiyotrofik kolonizasyonu, sap öz hücrelerinin^{kolonizasyonuna benzer 16,17}. Müstakil kılıflar, mantar penetrasyonu ve kolonizasyonunun yaprak bıçaklarından veya sap özü dokularından daha fazla eşzamanlılık ve deneysel tekrarlanabilirlik gösterir^14,16,17,18. Çoğu mısır çeşidi bu protokol için kullanılabilir. Bununla birlikte, kılıflarda aşırı mor pigmentlere sahip akrabalı veya melezler, pigmentler görüntülemeye müdahale ettiği için daha az uygundur. Golden Jubilee tatlı mısır, çalışmalarımız için özellikle yararlı olmuştur, çünkü işlenmemiş tohumlar ticari olarak temin edilebilir, bitkiler birçok yaprak hastalığına karşı oldukça hassastır ve serada iyi büyürler. Amerika Birleşik Devletleri'ndeki ilk antraknoz sap çürüklüğü salgınları, 1970'lerde Indiana'da tatlı mısır mahsullerinin toplam kaybına neden oldu^19,20. Bu yaprak kılıfı aşılama yöntemi, canlı ve yerel olarak öldürülmüş bitki hücrelerinde mantar büyümesini ve gelişimini doğrudan gözlemlemek ve ölçmek, mantar enfeksiyonuna uyumlu/uyumsuz yanıtlarda direnç reaksiyonlarını göstermek ve aynı kılıf üzerindeki mantar suşları arasındaki etkileşimleri gerçek zamanlı olarak test etmek için uygulanabilir.

Protokol

NOT: Yöntemin iş akışı Şekil 1'de gösterilmiştir.

Şekil 1: Ayrılmış mısır yaprağı kılıfları kullanılarak optimize edilmiş aşılama protokolündeki adımlar. Spor süspansiyon hazırlama, yaprak kılıfı aşılama ve canlı hücre mikroskobu için numune hazırlama sırasıyla yeşil (A), mor (B) ve turuncu (C) kutularda vurgulanmıştır. BioRender.com ile oluşturuldu. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

1. Bitki ve mantar materyali

1. Bitki büyümesi
   1. Serada (14 saat açık/27 °C ve 10 saat karanlık/22 °C) SC10 kaplarda mısır fideleri (Malzeme Tablosuna bakınız) yetiştirin (bkz. Malzeme Tablosu). Üç kısım ticari saksı toprağından (Malzeme Tablosuna bakınız) ve iki kısım buharla sterilize edilmiş üst topraktan oluşan bir büyüme ortamı kullanın.
   2. Fideleri sabahları her gün bir kez üstten sulama sistemi ile 2 dakika sulayın.
   3. Fideleri toprak seviyesinde keserek V2 aşamasında hasat edin. V2 büyüme aşamasına, fideler 5 ila 10 cm boyunda olduğunda ve iki görünür yakalı yaprağa^{sahip olduğunda ulaşılır 21}.
   4. Bitkileri nemli bir kağıt havluyla sarın ve daha sonraki işlemler için laboratuvara taşınmak üzere plastik bir torbaya koyun.
2. Mantar kültürleri
   1. Depolanmış mantar silika stok kültürlerini^{aseptik koşullar altında yeniden etkinleştirin 22}istila edilmiş silikanın yaklaşık 50 granülünü uygun bir agar ortamına serperek. Morfolojik değişiklikleri ve patojenite kaybını önlemek için, alt kültür suşları reaktivasyondan sonra 3x'ten fazla değildir. Patates dekstroz agar (PDA; Malzeme Tablosuna bakınız) rutin olarak C. graminicola kültüründe kullanılırken, yulaf ezmeli agar (OA; Malzeme Tablosuna bakınız) S. maydis için kullanılır.
   2. Mantar stoklarını kültürlemek için PDA'yı hazırlamak için, 500 mL deiyonize (DI) su içinde ticari olarak hazırlanmış 19.5 g susuz pda'yı askıya alın. OA yapmak için, ticari olarak hazırlanmış 36 g kurutulmuş OA'yı DI suda 15-30 dakika kaynatın, üç kat tülbentten süzün ve süzüntüyü DI su ile 500 mL'ye getirin. Sterilize etmek için otoklav ortamı.
   3. Transformant suşlarla çalışırken erimiş, soğutulmuş ortamı uygun bir antibiyotikle (örneğin, higromisin B, genetin) artırın. 500 mL ortamdaki nihai higromisin veya genetin konsantrasyonları sırasıyla 250 μg / mL ve 100 μg / mL'dir.
   4. Sporlanan bir miselyum gelişene kadar kültürleri en uygun koşullar altında inkübe edin. Colletotrichum graminicola ve S. maydis , sürekli floresan ışığı ve ortam nemi seviyeleri ile 23 ° C'de iyi büyür. Sporülasyon, S. maydis için aşılamadan (dai) 7 gün sonra veya C. graminicola için 14 dai gerçekleşir.

2. Yaprak kılıfı aşılamaları

1. Camyünü filtre ünitesi montajı
   1. Kapağı ve 0.5 mL'lik bir mikrosantrifüj tüpünün konik tabanından yaklaşık 1.5 mm kesmek için ağır hizmet tipi makas veya makas kullanın (bkz.
   2. Şekil 0.5'de gösterildiği gibi, orta deliği kapatmak için kesilen tüpün içine bir parça cam yünü (yaklaşık 0.5 cm x 2 cm; Malzeme Tablosuna bakın) yerleştirin.
   3. Borosilikat cam tahrişe neden olabileceğinden cam yünü keserken eldiven giyin.
2. Yaprak kılıf destek raflarının hazırlanması
   1. Eteksiz 96 oyuklu bir PCR plakasını (Malzeme Tablosuna bakın) Şekil 8A'da gösterildiği gibi altı adet iki sütunlu (2 x 3 oyuklu) destek rafına kesin.
   2. İki sütunlu rafları, kuyuların konik tabanları yukarı ve düz üst kısımları aşağı bakacak şekilde çevirin (Şekil 3B).
   3. Her bir desteği nemli filtre kağıdı içeren bir cam Petri plakasına yerleştirin ve kapakla kapatın (bkz. Bu ünite, kılıflar için küçük bir nem odası işlevi görür.
3. Aşı hazırlama
   1. Her mantar suşu için, monte edilmiş bir cam yünü filtre ünitesini, Şekil 2'de gösterildiği gibi sağlam bir steril 1,5 mL mikrosantrifüj tüpüne yerleştirin. İkincisi, bir toplama tüpü olarak işlev görür.
   2. Tüpleri etiketleyin.
   3. Önce her bir plakayı 3-4 mL steril DI su ile doldurarak spor yapan kültürlerden conidia hasat edin. Bazı durumlarda koloni yüzeyinde bir sıvı tabakası oluşturmak için daha fazla su gerekebilir. Bu sistemde ıslatıcı maddelere gerek yoktur.
   4. Tüm plakayı eşit şekilde kazımak için steril bir konik uçlu havaneli ( Malzeme Tablosuna bakın) kullanarak agardaki sporları gevşetin.
   5. 1 mL spor süspansiyonunu aseptik olarak bir cam yünü filtre ünitesine uygulayın ve sporların yerçekimi ile toplama tüpüne akmasına izin verin.
   6. Filtrelenmiş spor süspansiyonlarını içeren toplama tüplerini 3.500 x g'da 5 dakika santrifüjleyin. Sporlar, mikrosantrifüj tüpünün dibinde peletlenmelidir.
      NOT: C. graminicola sporlarının burada önerilenden daha yüksek hızlarda santrifüjlenmesi, önemli bir canlılık kaybına neden olur.
   7. Sıvıyı otoklavlanabilir bir kaba dökün, 1 mL steril DI su ekleyin ve peletlenmiş sporları yeniden süspanse etmek için hafifçe çalkalayın. Adım 2.3.6'daki gibi santrifüjleyin.
   8. Çimlenmeyi veya penetrasyonu azaltabilecek otomatik inhibitörler içerebilecek herhangi bir konidiyal matrisi çıkarmak için sporları 3x yıkayın.
   9. Üçüncü yıkamadan sonra, miktar tayini için sporları yeniden süspanse etmek için 300-500 μL steril DI su ekleyin.
   10. Spor konsantrasyonunu belirlemek için 100x büyütmede bileşik mikroskop altında bir hemositometre kullanın. Saymadan önce spor boyama gerekli değildir.
   11. Steril DI su ile 5 x 10⁵ spor/mL süspansiyon hazırlayın.
       NOT: C. graminicola spor süspansiyonu, hızlı canlılık kaybından önce oda sıcaklığında 4 saatten fazla tutulamaz. Soğutma conidia canlılığı artırmaz.
4. Kılıf aşıları
   1. Bitkileri mantar suşları ile aşılamadan önce ilgili biyogüvenlik uygulamalarını ve prosedürlerini kontrol edin.
   2. Kılıfın üst üste binen kenarı boyunca bir küçük resim geçirerek kılıfı V2 fidelerinin ilk gerçek yaprağından çıkarın ve sürgünden yavaşça gevşetin. Çıkarmaya çalışmadan önce kılıfı çekimin her iki tarafından gevşetin.
   3. Geri kazanılan yaprak kılıflarını 3-5 cm'lik parçalar halinde kesin. Aşılamadan önce kılıfların yüzeyini dezenfekte etmek gerekli değildir.
   4. İç (adaksiyal) epidermal tabakayı ortaya çıkarmak için her bir parçayı çok nazikçe açın.
   5. Kılıfları aşılama için hazırlarken, kurumasını önlemek için kalan eksize edilmiş kılıfları nemli bir kağıt havluyla sarılı tutun.
   6. Şekil 20'te gösterildiği gibi, kılıf parçasının ortasındaki iç yüzeye, doğrudan orta kaburganın üzerine 4 μL mantar sporu süspansiyonu yerleştirin.
   7. Aşılanmış yaprak kılıflarını, Şekil 5'te gösterildiği gibi nemli bir filtre kağıdı içeren bir cam Petri plakasının içindeki desteğe orta kaburga altta olacak şekilde yatay olarak yerleştirin.
   8. Her raf yedi adede kadar kılıf tutar. Numune hazırlama veya inkübasyon sırasında meydana gelebilecek kopya kaybını telafi etmek için suş başına en az beş kılıf aşılayın.
   9. Küçük nem odalarını nemli çimlenme kağıdıyla kaplı şeffaf bir saklama kutusuna yerleştirin (Malzeme Tablosuna bakın).
   10. Kutuyu kapakla örtün. Kutuyu 23 °C'de, mantara ve gözlemlenecek mantar gelişim aşamalarına bağlı olarak amaçlanan zaman boyunca sürekli aydınlatma ile inkübe edin. C. graminicola ile aşılanmış mısır kılıfları için zaman seyrinin bir özeti Tablo 1'de verilmiştir.
   11. Kılıflarda hastalık belirtileri/semptomları olup olmadığını her gün kontrol edin ve hem çimlenmeyi hem de filtre kağıtlarını nemli tutun. Yaprak kılıfları, aşılama yokluğunda belirgin bitki hücresi ölümü veya bozulması olmadan 6 güne kadar tutulabilir.

Şekil 2: Camyünü filtre ünitesinin hazırlanması. (A) Konik tabanı çıkarılmış mikrosantrifüj tüpü 1'in içine 0,5 cm x 0,5 cm'lik bir cam yünü top yerleştirilir. (İ.Ö.) Filtre tüpü daha sonra spor süspansiyon hazırlığı için monte edilmiş bir filtre ünitesi oluşturmak üzere mikrosantrifüj tüpü 2'ye yerleştirilir. BioRender.com ile oluşturuldu. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Eteksiz 96 oyuklu bir PCR plakasını kesme yöntemi. (A) PCR plakası altı destek rafına kesilmiş, 8 x 2 kuyucuk. Tek bir kılıf desteği örneği (B )'de gösterilmiştir. Yaprak kılıfları destek üzerine yatay olarak döşenir. BioRender.com ile oluşturuldu. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Kılıf aşılama yöntemi. Kılıf bölümünün adaksiyal yüzeyine doğrudan uygulanan tek damla aşılama. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 5: Kılıf inkübasyon yöntemi. Aşılanmış yaprak kılıfları, nemlendirilmiş filtre kağıdı içeren bir cam Petri plakasının içindeki bir destek rafına yatay olarak yerleştirilir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

3. Canlı hücre mikroskobu

1. Mikroskopi için numune hazırlama
   1. Yapışmamış sporları veya yüzeysel mantar büyümesini gidermek için kılıf parçalarını steril DI suyla nazikçe durulayın.
   2. Kılıfı, kılıf parçasının adaksiyal (iç) yüzeyi aşağı bakacak ve abaksiyal (dış) yüzey en üstte olacak şekilde temiz bir cam mikroskop lamına ( Malzeme Tablosuna bakın) yerleştirin.
   3. Kılıf uçlarından yaklaşık 1 cm kesmek için yeni bir tek kenarlı tıraş bıçağı kullanın ( Malzeme Tablosuna bakın) ve orta damarın her iki tarafındaki lamina dokusunun çoğunu çıkarın.
   4. Abaksiyal orta damardan dokuyu tıraş etmek ve aşılanan noktanın üzerindeki adaksiyal yüzeydeki epidermal tabakayı ortaya çıkarmak için tıraş bıçağını kılıfa göre 90°'lik bir açıyla tutun. Düzgün bir kalınlık sağlamaya çalışın. Yaprak kılıfları traş edildikten sonra, numuneye zarar verebileceğinden daha fazla budamak önerilmez.
   5. Tıraşlanan bölümlerin 1 cm x 1 cm'den büyük olmamasına dikkat edin. Bu işlem sırasında kılıfın ortasına bastırmaktan kaçının. Farklı spor süspansiyonları ile aşılanmış kılıflarla çalışırken, eldivenleri dezenfekte edin ve numuneler arasında tıraş bıçağını değiştirin.
   6. Temiz bir cam mikroskop lamını hazır bulundurun. Kılıf bölümünü bir kenardan kaldırın ve dikkatlice yeni bir kızağa aktarın. Kılıfın aşılanmış (adaksiyal) yüzeyi, objektif merceğe en yakın olan en üstte olmalıdır. Mantar yapılarına zarar vermemek için bölümleri nazikçe monte edin.
   7. Bölüme 60 μL steril DI su uygulayın ve 24 mm x 60 mm'lik bir cam lamel ekleyin (bkz. Hava kabarcıklarını önlemek için bunu yavaşça yapın.
   8. Mikroskopi için hazır olduğunuzda, her bir kenara küçük bir damla koyarak ve ardından damlaları bir oje fırçasıyla birleştirerek lameli şeffaf oje ile kapatın ( Malzeme Tablosuna bakın).
      NOT: Bu kılıf protokolü, sitolojik boyalarla, örneğin 4',6-diamidino-2-fenilindol (DAPI), nötr kırmızı veya tripan mavisi ile veya bitki hücresi canlılığını değerlendirmek için hücre plazmolizinin gözlemlenmesi için kullanılabilir. Kılıf boyama veya hücre plazmoliz deneyleri için lamel sızdırmaz hale getirmeyin.
   9. Plazmoliz deneyleri için, lamel bir kenarına hipertonik bir çözelti (0.75 M sükroz veya 1 M sodyum klorür) ekleyin ve çözeltiyi numune boyunca lamel diğer kenarına çekmek için katlanmış tüy bırakmayan bir kağıt mendil kullanın. Boyama için, leke çözeltisini uygulamak için benzer bir yöntem kullanın.
2. Geniş alan mikroskobu
   1. Yaprak kılıfları mikroskop lamlarına monte edildikten sonra, 400x büyütmede geniş alan ışık mikroskobu kullanarak mantar kolonizasyonu açısından inceleyin.
   2. Mantar yapılarını ayrıntılı olarak gözlemlemek için, numunelerin daha iyi görüntü kalitesi için yağ yerine suya daldırma objektifi kullanın. Kırılma indisi uyumsuzluğundan kaynaklanan küresel sapma görüntü bozulmasına neden olabilir. Geniş alan ışık mikroskopları ve konfokal mikroskoplar için su hedefleri mevcuttur.
   3. Kılıf başına nispi kolonizasyon miktarını belirlemek için, 100x büyütmede geniş alan ışık mikroskobu kullanarak her bir mantar penetrasyon bölgesinden istila edilen mısır hücrelerinin sayısını sayın. Bu niceleme, suşları, tedavileri ve/veya gelişim aşamalarını karşılaştıran herhangi bir istatistiksel analizden önce uygun bir tarama adımıdır.
3. Konfokal lazer tarama mikroskobu
   1. Transgenik mantar suşlarının gelişimi sırasında mısır dokularındaki floresan proteinleri gözlemlemek için temel görüntü elde etme parametrelerini ayarlayın. Seçilen floresan işaretleyiciye göre en iyi uyarma/emisyon ayarlarını belirleyin.
      NOT: Salgılanan proteinlerle oluşturulan floresan füzyonları analiz ederken 60x su hedefi tercih edilir. Modern konfokal mikroskoplar, artefaktları ve şekil sapmalarını önlemek için yüksek oranda düzeltilmiş suya daldırma hedeflerine sahiptir.
   2. Floresan proteinlerin canlı hücre görüntülemesi amaçlanıyorsa, otofloresan için kontrol olarak dönüştürülmemiş mantar suşları kullanın. Ters konfokal mikroskopta ve mCherry floresan proteini için mantar-konak dinamiklerini yakalamak için aşağıdaki görüntü toplama parametrelerini kullanın. Lazer gücünü %5'e kadar ayarlayın, ifade seviyesine bağlı olarak 450-600 yüksek voltaj (HV), 1.375 X kazanç, %3 ofset, bölüm başına beş mısır hücresine kadar analiz için 1 optik yakınlaştırma faktörü ve bireysel hif için 2-5 optik yakınlaştırma faktörü.
      NOT: Yüksek çözünürlüklü Z-yığını konfokal görüntüler, üç boyutlu veriler ve konakçı ile patojen arasındaki gerçek zamanlı etkileşimlerin daha iyi bir görünümünü sağlar.
   3. Salgılanan füzyon proteinlerine karşılık gelen floresan yoğunluklarının ölçülmesi için, konfokal üreticinin görüntü analiz yazılımını veya çevrimiçi olarak ücretsiz olarak indirilebilen ImageJ gibi bir görüntü işleme programını kullanın. Floresan sinyallerinin buna göre nasıl ölçüleceğine ilişkin ayrıntılar için bir kılavuza bakın.

Sonuçlar

Aşağıdaki örnekler, mısır yaprağı kılıfı aşılama yönteminin kullanılmasını takiben temsili sonuçları açıklamaktadır. Bu örnekler, bu optimize edilmiş tahlil ile mısır-mantar etkileşimlerinin gözlemlenmesi ve karşılaştırılmasının gerçek zamanlı olarak gerçekleştirilebileceği kolaylık, hız ve hassasiyeti göstermektedir. Canlı hücre görüntüleme ayrıca nicel bilgilerin çıkarılmasına izin vererek karşılaştırmalı moleküler, sitolojik ve fizyolojik çalışmalar için y...

Tartışmalar

Burada açıklanan optimize edilmiş yaprak kılıfı aşılama yöntemi, pirinç yaprağı kılıfları^6,8,36 için geliştirilmiş ve uygulanmış olan orijinal bir protokolden değiştirilmiştir. Geniş alan veya konfokal mikroskopi ile canlı bitki hücrelerinde mantar büyümesi ve gelişiminin doğrudan, ayrıntılı gözlemlerine izin verir. Protokol, mısır kolonizasyonu sırasında, uyumlu ve uyumsuz etkileşimler sı...

Malzemeler

Name	Company	Catalog Number	Comments
Axiocam monochrome microscope camera	ZEISS	426560-9010-000	Compatible with the Axioplan 2 microscope; provides low read noise and high speed for live cell imaging
Axioplan 2 epifluorescence microscope	ZEISS	N/A	Allows live viewing and image/video capture of biological samples
Benchtop centrifuge 24 X 1.5/2 mL	Thermo Fisher Scientific	75002431	Sorvall Legend Micro 17; max speed: 13,300 rpm (17,000 x g)
Falcon bacteriological Petri dish with lid	Fisher Scientific	08-757-105	Polystyrene material; hydrophobic surface
Filter paper	Fisher Scientific	09-920-115	Whatman grade 1 for Petri plate moist chambers
FV 3000 laser scanning confocal microscope	Olympus	N/A	For visualization of fungal transformants'
Germination paper	Anchor Paper Co.	SD7615L	76# heavy weight for plastic box moist chambers
Glass Petri dishes	VWR International	75845-542	Type 1 class A, 33 expansion borosilicate glass; complete set (cover + bottom), for Petri plate moist chambers
Glass wool	Ohio Valley Specialty Chemical	3350	For glass-wool filter units
Hemocytometer/Neubauer counting chamber and cover glass	VWR International	15170-172	0.1 mm chamber depth; comes with two 0.4 mm cover glasses
Microscope coverslips	Fisher Scientific	12-553-457	Borosilicate glass; 100/Pk.; 22 mm length, 22 mm width
Maize cultivar Golden Jubilee seeds	West Coast Seeds Ltd., Delta, BC, Canada	CN361	Matures in 95-105 days; seed type: F1
Microcentrifuge tubes	USA Scientific	1415-2500	1.5 mL capacity
Microscope slides	Fisher Scientific	12-550-123	Superfrost white tab slide; 76 mm length, 25 mm width
Oatmeal Agar (OA)	VWR International	255210	Difco Oatmeal Agar, BD; 500 g
Nail polish	Revlon	43671	Clear nail polish for sealing microscope slides; color 771 Clear
Non-skirted 96-well PCR plate	USA Sientific	1402-9500	100 uL plate volume
Pestle for microcentrifuge tubes	USA Scientific	1415-5390	Conical tip; polypropylene material
PlanApo 60X/1,00 WLSM water objective	Olympus	1-UB933	Compatible with the Olympus FV 3000 confocal microscope
Potato Dextrose Agar (PDA)	VWR International	90000-758	Difco Potato Dextrose Media, BD; 500 g
Pro-Mix BX	Premium Horticulture Supply Co.	N/A	Premium general-purpose growing medium formulated to provide a balance of water retention and proper drainage
SC10 cone-tainers	Greenhouse Megastore	CN-SS-SC-10B	1.5 inch diameter, 8.25 inch depth, and a volume of 164 mL
SC10 cone-tainers tray	Greenhouse Megastore	CN-SS-SCTR98	24 inch length x 12 inch width x 6.75 inch height; holds up to 98 of SC10 cone-tainers
Single edge razor blade	Thermo Fisher Scientific	17-989-145	AccuTec blade; steel material; 38 mm length blade
Storage containers/boxes with latch closure	Target	002-02-0405	Clear view storage boxes for rmoist chamber; outside dimensions: 23 5/8 inch x 16 3/8 inch x 6 1/2 inch; 32 qt. capacity