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Method Article
Verfahren zur Verfolgung synaptisch verbundenen Neuronen beschrieben. Wir verwenden TVA Spezifität eines vorgeschalteten Zelle zu untersuchen, ob eine Zellpopulation von Interesse synaptischen Input von genetisch definierten Zelltypen erhält.
Klassische Methoden zur Untersuchung neuronaler Schaltkreise sind ziemlich geringen Durchsatz. Transsynaptische Viren, insbesondere das Pseudorabiesvirus (PRV) und Tollwutvirus (RABV) und neuerdings vesikuläre Stomatitis-Virus (VSV), eine Schaltung zur Untersuchung, wird immer beliebter. Diese höheren Durchsatz Methoden verwenden Viren, die zwischen den Neuronen entweder in der anterograde oder retrograde Richtung übertragen.
Kürzlich wurde eine modifizierte RABV für monosynaptischen retrograden Tracing entwickelt. (Abbildung 1A). Bei diesem Verfahren wird das Glycoprotein (G)-Gen aus dem viralen Genom gelöscht und wieder zugeführt nur in gezielter Neuronen. Infektion Spezifität wird durch Substituieren eines chimären G, der extrazellulären Domäne des ASLV-A Glykoprotein und die zytoplasmatische Domäne des RABV-G (A / RG) zusammengesetzt ist, für die normale RABV-G 1 gelöst. Dieses chimäre G gezielt infiziert Zellen, die den TVA-Rezeptor-1. Das Gen kodiert TVA kann schon delivered durch verschiedene Verfahren 2-8. Nach RABV-G Infektion einer TVA-exprimierenden Neuronen, kann die RABV zu anderen, synaptisch verbundenen Neuronen in retrograder Richtung von der Natur des eigenen G, die mit dem Rezeptor TVA zusammen geliefert war zu übertragen. Diese Technik kennzeichnet eine relativ große Anzahl von Eingängen (5-10%) 2 auf einem definierten Zelltyp, Bereitstellen eines Probenahme von allen Eingängen auf einen definierten Starter Zelltyp.
Wir haben vor kurzem diese Technik, um VSV als transsynaptische Tracer 9 verwenden modifiziert. VSV hat mehrere Vorteile, einschließlich der Schnelligkeit der Genexpression. Hier haben wir ausführlich eine neue virale Tracing-System mit VSV nützlich für das Sondieren Mikrotechnik mit erhöhter Auflösung. Während die ursprünglich veröffentlichten Strategien Wickersham et al. 4 und Beier et al. 9 Erlaubnis Beschriftung bei allen Neuronen, projizieren eingangs infiziert TVA-exprimierenden-Zellen, hier VSV dazu entworfen wurde, um nur zu übertragen, um TVA-exprimierenden Zellen (Abb. 1B). Das Virus wird zuerst mit RABV-G pseudotypisiert zur Infektion von Neuronen hinter TVA-exprimierenden Neuronen ermöglichen. Nach der Infektion dieses ersten Population von Zellen, das Virus freigesetzt nur infizieren TVA-exprimierenden Zellen. Weil die transsynaptische viralen Ausbreitung auf TVA-exprimierenden Zellen, die Anwesenheit von Abwesenheit von Konnektivität von definierten Zelltypen beschränkt wird dann mit hoher Auflösung untersucht werden. Eine experimentelle Flußdiagramm dieser Versuche ist in Abbildung 2 gezeigt. Hier zeigen wir, ein Modell-Schaltung, dass der Richtungswechsel-Selektivität bei der Maus Netzhaut. Wir untersuchen die Konnektivität starburst Amakrinzellen (SAC) an retinalen Ganglienzellen (RGZ).
Ein. Erstellen Virus aus cDNA: Recovery von VSV aus cDNA mit Vaccinia-T7 System 10
2. Passage und Konzentration des VSV
3. Viruns Injection
4. Harvesting Tissue / Tissue Vorbereitung
5. Repräsentative Ergebnisse
Das Virus, das aus cDNA gerettet wird, sollte in der Lage sein TVA800 Zellen, aber nicht 293T-Zellen (Figur 3) zu infizieren. Die Versorgung der RABV-G ermöglicht die Infektion von mehreren Zell-types, einschließlich 293T. Da jedoch der A / RG Genoms in das Genom kodiert wird, unter den Zellen verteilt bei einer viel höheren Rate im TVA-exprimierenden Zellen.
Sobald das Virus ist konzentriert, typisch Titer zwischen 10 8 ffu / ml und 10 10 ffu / ml. Diese Titer ausreichend sind für die Verwendung in vivo.
Während LGN Injektion in die Maus, wissen wir nicht unterscheiden dorsalen LGN (DLGN) von ventral LGN (vLGN), da beide in der Regel infiziert. Daher werden mehrere RGC Typen bezeichnet (Abbildung 4), einschließlich derer, die Projekt zum vLGN wie Melanopsin RGCs (Abbildung 4D) und ON-DSGCs (4E), und diejenigen, die Projekt zum DLGN, wie die kleinen arbor RGCs (4C) und ON-OFF-DSGCs (Abbildung 4F). Obwohl mehr als eine Art von RGC übertragen Virus SACs, wie an anderer Stelle berichtet (Beier et al., In review), hier konzentrieren wir uns nurauf den gut untersuchten Verbindungen von ON-OFF-DSGCs um Schutzgebiete.
(-), Wenn wir Mäuse des Genotyps CTVA (+) / ChAT-Cre injizieren, wo kein TVA ausgedrückt werden soll, werden nur markierte RGCs (dh Abbildung 4). Diese sind auf anfängliche Aufnahme des RABV-G pseudotypisierten Virus durch den RGCs und keine Ausbreitung auftritt. Keine RGCs werden aus einer Infektion der LGN rVSV (A / RG) nicht mit Virus-G RABV pseudotypisiert aufgrund einer Unfähigkeit dieser Virionen an der langen transversalen Axone dieser RGCs infiziert. Wenn jedoch Einspritzen CTVA (+) / ChATCre (+) (und R26TdT (+)) Mäuse in der LGN, bedeutet virale Ausbreitung auftreten, nur um rote Blutkörperchen, die das Cre-Reporter (zB Fig. 5) exprimieren. Diese Zellen auch mit-Label mit dem anti-ChAT Antikörper und Schichtung nur in den beiden Plättchen ChAT und bestätigt ihre Identität als SAC (5B ', C'). Die Zahl der viral bezeichnet SACs pro DSGC reichten 1-9.
Abbildung 1. Unsere retrograde transsynaptische Tracing-System im Vergleich zu der ursprünglich entwickelten Methode. (A) (i) In der Methode von Wickersham und Kollegen entwickelte "starter Zellen" sind mit drei Genen transfiziert: die TVA-Rezeptor, zur Infektion spezifisch ermöglichen der transfizierten Zellen, die RABV-G, verwendet, um die RABV ergänzen, die selbst hatte das G-Gen deletiert und ein rot fluoreszierendes Protein, um transfizierte Zellen zu identifizieren. (Ii) Ein RABV mit dem A / RG Protein pseudotypisiert infiziert TVA-exprimierenden Zellen, wodurch sie gelb. (Iii) Retrograde transsynaptische Übertragung erfolgt zum vorgeschalteten Neuronen. (B) (i) In unserem Verfahren werden TVA-exprimierenden Zellen genetisch, definiert und mit einem bedingten roten fluoreszierenden markierten protein. (ii) Die "Starter Zellen" sind die von einem VSV Codieren des A / RG Gen im viralen Genom infiziert. Diese Starter-Zellen exprimieren nicht das TVA-Rezeptor. (Iii) Retrograde transsynaptische Übertragung erfolgt TVA-exprimierenden Neuronen nur dann, wenn diese Zellen synaptischen Input liefern auf die Starter-Neuronen. Klicken Sie hier für eine größere Abbildung zu sehen .
Abbildung 2. Schematische Darstellung des experimentellen Verfahren. (A) Zunächst wird das Virus aus cDNA gerettet. Es wird dann passagiert und mit pseudotypisiert RABV-G und eingeengt und titriert. Das Virus wird dann in das Gehirn injiziert, wo es erlaubt ist, für den gewünschten Zeitraum zu inkubieren. DanachEs wird das Auge geerntet, und die Netzhaut seziert und analysiert. (B) Schematische Darstellung der Pseudotypisierung das Virus mit RABV-G. Dies ist notwendig für die Infektion von retinalen Ganglienzellen von einem Gehirn Injektion. Die RABV-G-Gen zunächst in Zellkultur-Zellen transfiziert Ausdruck der TVA-Rezeptor. Diese Zellen werden dann mit dem rVSV (A / RG) Virus infiziert. Die Virionen freigesetzt wird RABV-G in der Virushülle zu haben, aber nicht haben das Gen für RABV-G in das virale Genom. (C) Eine schematische Darstellung des Maus kreuzt notwendig dreifach transgenen Tieren. Bedingter TVA und tdTomato Allele sind mit einer Cre Fahrer nach Wahl, so dass sowohl TVA und tdTomato nur in Zellen mit einem Cre Expression Geschichte exprimiert werden gekreuzt. In diesem Beispiel verwendeten wir ChAT-Cre. (D) Eine schematische Darstellung des retinalen Infektion um Trace-SAC DSGC Schaltungen. Das Chat-Zellen zu exprimieren TVA und tdTomato gemacht, wie in (C) gezeigt. RGCs aus einem LGN in infiziertfection des Virus hergestellt in (B). Da das Virus exprimiert GFP, werden diese RGCs grün sein. Der Virus wird dann nur breitete sich TVA-exprimierenden ChAT Amakrinzellen, wenn sie an den markierten RGC verbunden sind. Diese Zellen werden sowohl rot und grün, oder gelb. Klicken Sie hier für eine größere Abbildung zu sehen .
Abbildung 3. Verhalten rVSV (A / RG) Virus auf 293T und TVA800 Zellen. Diese Zellen wurden mit einem niedrigen Titer rVSV (A / RG) mit RABV-G pseudotypisiert infiziert. Das Virus breitet sich zwischen TVA-exprimierenden Zellen in einer Angelegenheit von Stunden, 6 Stunden nach der Infektion (HPI), 1 und 2 Tage nach der Infektion (DPI) gezeigt. Allerdings ist die Verbreitung auf 293T-Zellen, die nicht exprimieren die TVA-Rezeptor, obwohl icht auftritt, passiert viel langsamer. Maßstab = 100 um.
Abbildung 4. Repräsentative Infektionen von RGCs von nicht-exprimierenden Mäusen TVA. Die Tiere wurden in der LGN mit dem rVSV (A / RG) Virus mit RABV-G pseudotypisiert injiziert und Gewebe geerntet 2 dpi. (A) Sparse (RGCs angedeutet durch gelbe Pfeilspitzen) oder (B) dichter Infektionen können erhalten werden, je nach dem Titer der Viren und die Qualität der Injektion. Viele verschiedene Arten von RGCs können basierend auf der Morphologie, einschließlich (C) kleine Laube RGCs, (D) Typ 1 Melanopsin RGCs, (E) ON-DSGCs, und (F) ON-OFF-DSGCs unter anderem identifiziert werden. Maßstabsbalken = 50 um.
Abbildung 5. RVSV (A / RG) Übertragung von ON-OFF-DSGCs um SACs folgt dem erwarteten Muster. (A) ON-OFF-DSGCs (weiß Pfeilspitze mit grünen ausfüllen) übertragen Virus mehrere Schutzgebiete (gelb Pfeilspitzen). (A '). Alle grünen Zellen, die nicht das DSGC Co-Label mit dem Cre-Reporter, der angibt, dass sie TVA-exprimierenden SACs sind. (BC) Die DSGC (weiß Pfeilspitze mit grünen Füllung) und BSG (gelb Pfeilspitzen) in den entsprechenden ChAT Schichten der Netzhaut inneren plexiformen Schicht (IPL) schichten. Die Zellen, die das Virus überträgt umfassen sowohl ON und OFF-Schutzgebiete. Zahlen in Paneele B 'und C' zeigen die IPL Laminae. Die Lage des DSGC Soma ist nur durch die Pfeilspitze angezeigt, aber nicht in Panel C gezeigt, um die BSG markieren. Maßstabsbalken = 50 um.
Verwendung von Viren zu studieren neuronalen Schaltkreise ist eine relativ hohe Durchsatzleistung Verfahren zum Analysieren angeschlossenen Neuronen. Allerdings Erzeugung sowohl VSV und RABV Virionen ist nicht trivial. Obwohl die obige Protokoll zur Rettung Virus aus cDNA aufgeführten vorgesehen ist, ist es immer noch ein geringer Wahrscheinlichkeit Ereignis. Die Niveaus von jedem der N, P, und L Plasmide müssen fein eingestellt werden, und viele Studien und repliziert müssen getan, um virale Rettungs gewährleisten....
Keine Interessenskonflikte erklärt.
Wir möchten Sean Whelan zur Unterstützung bestätigen Sie mit Rettung rekombinanten VSV Varianten und Didem Goz und Ryan Chrenek für technische Unterstützung. Diese Arbeit wurde von HHMI (CLC) unterstützt, und # NS068012-01 (KTB).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Tissue Culture | |||
Baby Hamster Kidney (BSRT7) cells | available upon request | ||
vaccinia (vTF7-3) | available upon request | ||
pN, pP, pl plasmids | available upon request | ||
Calcium Chloride | Sigma | C1016 | |
Magnesium Chloride | Sigma | M8266 | |
HEK 293T cells | Open Biosystems | HCL4517 | |
60 mm TC-Treated Culture Dish | Corning | 430166 | |
75 cm2 Rectangular Canted Neck Cell Culture Flask with Vent Cap | Corning | 430641 | |
Media : DMEM (Dulbecco's Modified Eagle Medium) | Invitrogen | 12491-015 | |
1 M HEPES pH 7.4 | Gibo | 15630-080 | |
FBS: Fetal Bovine Serum | Gibco | 10437-028 | |
PKS | Invitrogen | 15140-163 | |
Lipofectamine 2,000 Transfection Reagent | Invitrogen | 11668-019 | |
Syringe: 5 ml Luer-Lock syringe | Sigma | Z248010-1PAK | |
Syringe Filters | Nalgene | 190-2520 | |
PEI: High Potency Linear PEI | Polysciences | 23966 | |
Viral Centrifugation | |||
Corning 150 ml Tube Top Vacuum Filter System, 0.45 μm Pore | Corning | 430314 | |
Thinwall, Ultra-Clear, 38.5 ml, 25 x 89 mm ultracentrifuge tubes | Beckman-Coulter | 344058 | |
Ultracentrifuge | Beckman-Coulter | optima XL-80K | |
SW28 Ultracentrifuge rotor | Beckman-Coulter | 342207 | |
Mouse Injection | |||
Capillary micropipets | Drummond | 5-000-2005 | |
Stereotax | Narishige | SR-5M | |
Micromanipulator | Narishige | SM-15 | |
Ump injector | World Precision Instruments | Sys-Micro4 | |
Four channel microcontroller | World Precision Instruments | UMP3 | |
M.TXB Bench Motor with C.EMX-1 Dial Control, 115 Volt | Foredom | M.TXB-EM | |
H.10 Handpiece, Quick Change | Foredom | H.10 | |
Step Drill, 0.5 mm | Foredom | A-58005P | |
Micr–lectrode holder | World Precision Instruments | MEH2S | |
Ketamine | Henry Schein | 995-2949 | |
Xylazine | Henry Schein | 4015809TV | |
Buprenorphine | Henry Schein | 1118217 | |
1 ml syringe | Becton-Dickinson | 309628 | |
30 gauge injection needle | Becton-Dickinson | 305106 | |
Protective Ophthalmic Ointment | Doctors Foster and Smith | 9N-014748 | |
Ethanol | Sigma | 493511 | |
Iodine | Sigma | PVP1 | |
Surgery and Dissection tools | |||
Scissors | Fine Science Tools | 91402-12 | |
Standard Forceps | Fine Science Tools | 11000-12 | |
Fine Forceps | Fine Science Tools | 11255-20 | |
Vannas spring scissors | Fine Science Tools | 15000-00 | |
Scalpel handle | Fine Science Tools | 10003-12 | |
Scalpel blades | Fine Science Tools | 10015-00 | |
Sutures | Robbins Instruments | 20.SK640 | |
Dissection and antibody staining | |||
paraformaldehyde | Sigma | P6148 | |
Phosphate Buffered Saline | Sigma | P4417 | |
Triton X-100 | Sigma | T9284 | |
Donkey Serum | Jackson Immunoresearch | 017-000-121 | |
Antibodies | |||
Antibodies | millipore | AB144P | |
Anti-gfp | Abcam | ab13970 | |
Donkey anti-chicken Dylight 488 | Jackson immunoresearch | 703-545-155 | |
Donkey anti-chicken Alexa Fluor 647 | Jackson immunoresearch | 705-605-147 | |
DAPI | Invitrogen | D1306 | |
Tissue mounting | |||
Superfrost plus microscope slides | Fisher | 12-550-100 | |
Cover glass 22 x 22, 0 thickness | Electron Microscopy Sciences | 72198-10 | |
Silicone elastomer | Rogers Corp | HT-6220 | |
Clear nail polish | Electron Microscopy Sciences | 72180 | |
Prolong Gold antifade reagent | Invitrogen | P36930 | |
|
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