저자는 닭 조직을 수확에서의 도움 니콜 M. 네 메스 (조지아 대학)와 쟌느 M. 페어 (LANL)를 감사하고, 촬영하는 동안 그의 도움 스티븐 A. 스프링 것입니다. 본 연구의 모든 조류의 보호는 로스 알 라모스 국립 보안, LLC, 로스 알 라모스의 운영자에있는 기관 동물 케어 및 사용위원회에 의해 승인되었습니다 실험실 동물과 모든 프로토콜의 인도적인 사용을위한 건강 지침 국립 연구소 준수에 있었던 계약에 따라 국립 연구소 에너지 미국학과와 번호 DE-AC52-06NA25396. 본 연구의 생쥐의 보호는 UCSD 동물 승인 프로토콜을 준수하고 있습니다. 인간 조직은 UCSD 승인의 IRB 프로토콜의 일환으로 획득했다. 이 작품은 캘리포니아 랩 요금 회장 프로그램의 대학 (PG)와 보조금 NS047101 신경 질환 국립 연구소에서와 뇌졸중 (신경 과학의 현미경 공유 시설, UC 샌디에고)에서 보조금 118,645에 의해 지원되었다.

1. 10월의 조직 퍼가기 <ol><li> 얕은 스티로폼 상자에 2 메틸 부탄에 드라이 아이스를 추가하여 냉동 욕조를 준비합니다. </li><li> 조직을 수확하고, 부드럽게 초과 액체를 건조하기 위해 조직 종이에 습기. 스냅 - 냉동 조직을 (액화 질소에 냉동 된 조직)을 사용하면, 조직은 cryo-마이크로톰 챔버에 배치하여 -20 ° C까지 따뜻하게 할 수 있습니다. </li><li> 충분히 금형의 하단을 충당하기 위해, 필-A-웨이 냉동 금형에 10월의 작은 금액을 추가합니다. </li><li> 금형의 조직을 놓고, 조직이 원하는 방향에있는 금형의 하단에 안식되어 있는지 확인하십시오. 일단 냉동 조직 블록은 바닥에서 또는 측면에서 중 sectioned 될 것입니다. </li><li> 10월과 조직을 커버하고, 냉동 목욕탕에 금형을 배치합니다. 조직은 냉동으로 10월 화합물은 흰색으로 바뀝니다. </li><li> 일단 표시된 냉동 가방에 냉동 블록과 장소에서 금형 껍질을 벗기면 냉동. </li><li> 냉동 블록이 유지 될 수-80 ° C에서 사용까지. </li></ol> 2. Sectioning 조직 <ol><li> 장소 조직 cryo-마이크로톰 챔버에 블록, 그들을 -20 ° C를 (약 30 분)에 도달 할 수 있습니다. </li><li> 3-5 μm 두께의 섹션을 잘라 내고 섹션의 상단에 긍정적 요금이 부과 유리 슬라이드를 놓습니다. 조직 슬라이드를 준수합니다. </li><li> 항공은 30-60 분의 조직을 건조. </li><li> 슬라이드는이 단계에서 사용할 수 있습니다, 또는 그들은 -80 ° C에서 나중에 사용하기 위해 보관 할 수 있습니다. </li></ol> 3. 조직 염색법 <ol><li> -80에 저장된 슬라이드 ° C : 슬라이드가 30 분 동안 실온에서 건조 해동과 공기 할 수 있습니다. </li><li> 10 % 상온에서 30 분에 포르말린 버퍼로 슬라이드를 수정합니다. </li><li> 250 ML 버퍼에있는 슬라이드에게 10 번을 찍어 각 세척을위한 PBS 또는 TBST 버퍼에 세 번 씻으십시오. PBS 버퍼 인산 가수 분해 효소 - conjug 알카라인와 chromogenic 검색을 위해, 그러나, immunofluorescence 얼룩 사용할 수 있습니다항체를 ated, TBST은 PBS에있는 인산염부터 사용되어야은 알카라인 인산 가수 분해 효소 활동을 억제한다. </li><li> 조직 섹션 슬라이드 이제 물들 할 수 있습니다. </li></ol> 4. 점액을 감지하는 등 Alcian 블루와 정기 산성 스키 프와 같은 Histochemical 착색제를 사용하여 <ol><li> Alcian 블루 얼룩 : <ol><li> 물에 슬라이드를 씻어 상온에서 3 분 3 % 아세트산에 품다. </li><li> 실온에서 30 분에 Alcian 블루 산도 2.5 솔루션 청바지. </li><li> 10 분에 수돗물을 실행에 슬라이드를 씻으, DI 물에 씻어. </li><li> 상온에서 5 분을 위해 원자력 빠른 빨간색으로 Counterstain. </li><li> 워시는 DI 물에 세 번 슬라이드. </li></ol></li><li> 정기 산성 스키 프 얼룩 : <ol><li> 물에 슬라이드를 씻어, 5 분을위한 신선하게 조리 된 1% 정기적으로 산에 품다. </li><li> DI 물에 세 번 씻어 한 번 miliQ 물에 담구. </li><li> 객실 temperatur 15 분 동안 쉬프 시약으로 얼룩5. </li><li> 10 분에 수돗물을 실행에 슬라이드를 씻으, DI 물에 씻어. </li><li> 실온에서 30 초에 Surgipath Hematoxylin에 Counterstain. </li><li> 워시는 DI 물에 세 번 슬라이드. </li><li> 배양은 상온에서 스캇의 수돗물에 30 초를 슬라이드. </li><li> DI 물에 세 번 씻으십시오. </li></ol></li><li> 탈수 및 100 % 에탄올에 세 신속한 변경 및 Citrisolv의 세 변화, 2 분마다 다음 95 % 에탄올에서 1 분, 잠복기하여 슬라이드를 취소합니다. 실온에서 모든. </li><li> 수지 매체 (Cytoseal 60)와 coverslips에 슬라이드를 탑재합니다. </li></ol> 5. Histochemical 방법으로 Glycan Epitopes를 감지 할 수 Lectins과 항체 (표 1)를 사용 <ol><li> lectins로 3 glycan의 epitopes의 형광 검출를 들어, 실온에서 10-30 분 동안 PBS에 1 % BSA와 함께 슬라이드를 차단합니다. </li><li> biotinylated 렉틴이 사용되기 때문에, 0.1 %로 15 분 잠복기에 의해 내생 비오틴를 차단아비딘은 실온에서 0.01 % 비오틴과 15 분 부화 다음. </li><li> 각 차단 단계 후에 PBS에서 슬라이드를 씻으십시오. </li><li> 갓 1 μg / ML Rhodamine-복합 succinylated 밀 배아 agglutinin (sWGA), 1.3 μg / ML biotinylated Sambucus nigra agglutinin (SNA), 5 μg / HEPES / NaCl 버퍼에 ML Fluorescein-복합 Jacalin (10 밀리미터 HEPES,의 혼합물을 준비 150 MM NaCl의 산도 7.5). </li><li> 평평한 표면 또는 착색 상자 및 레이어 상단에있는 렉틴 혼합물 장소 슬라이드. 혼합 볼륨이 부드럽게 액체를 parafilm을 배치하여 감소 될 수 parafilm는 액체를 평탄하고 증발을 방지 할 수 있습니다. </li><li> 어둠 속에서 실온에서 1 시간을 품다. </li><li> 워시는 PBS로 세 번 슬라이드. </li><li> 0.7 μg / ML streptavidin - 복합 CY5 (biotinylated-SNA를 감지 할), 그리고 어둠 속에서 실온에서 30 분에 품다와 레이어 슬라이드. </li><li> 워시는 PBS로 세 번 슬라이드. </li><li> 0.1 &amp; m로 핵을 CounterstainU; g / ML DAPI. </li><li> VectaMount 설치 미디어 (또는 수성 미디어) 등의 수성 매체가 coverslips에 슬라이드를 탑재합니다. </li></ol> 6. 렉틴 염색의 특이성에 대한 통제 <ol><li> 렉틴 염색의 특이성 전에 얼룩을 대상 glycan 에피토프의 특정 효소 절단 또는 작은 분자와 경쟁하여 중 제어됩니다. </li><li> Sambucus nigra agglutinin (SNA) 결합 특이성에 대한 효소 절단 <ol><li> 250 50 MM 나트륨 아세테이트 산도 5.5의 무 / ML에 Arthrobacter ureafaciens sialidase (AUS)을 희석. </li><li> 팁 박스 빈의 바닥에 물을 추가이 부화하는 동안 습윤 챔버를 형성합니다. </li><li> 장소 슬라이드 coverslip으로 슬라이드와 커버에 팁 박스, 층 150-200 μl AUS 솔루션의 상단 트레이에 직면하고 있습니다. 기포 형성을 피하십시오. </li><li> 2.5 시간에 37 ° C에서 상자 뚜껑과 품다를 닫​​습니다. </li><li> 워시 룸 성질에 PBS로 3 번 슬라이드무료로 sialic 산을 제거 할 ature. 이 슬라이드는 SNA의 착색에 대해서는 제외해야합니다. </li></ol></li><li> Jacalin 및 succinylated 밀 배아 agglutinin (sWGA) 특이성에 대한 경쟁력 억제제 <ol><li> 렉틴 혼합물의 나누어지는 200 μl 단계 5.4 두 Eppendorf 용 시험관에 준비했습니다. </li><li> 다른 유리 병에 1시 10분 희석에서 병 및 키틴 - 가수 분해물 (sWGA 억제제) 중 하나에 200 MM Melibiose을 (Jacalin 억제제)를 추가합니다. </li><li> 있는 오버레이 대조군 슬라이드 억제제 함유 슬라이드의 나머지 부분과 같은 시간에 실온에서 혼합 및 품다 1 시간입니다. 이 슬라이드는 각각 Jacalin 또는 sWGA의 착색에 대해서는 제외해야합니다. </li></ol></li></ol> 7. 대표 결과 cryo-protectant 미디어 (OCT)에 포함 된 냉동 조직에 파라핀에 포함 된 조직 샘플 사이의 비교는 muci에 얼룩의 보존과 품질에서 큰 차이점을 보여N의 glycoproteins. 이러한 Alcian 블루와 정기 산성 스키 프와 같은 histochemical 염료와 조직 염색법은 냉동 또는 파라핀 임베디드 샘플 (그림 1)에서 비교 조직 섹션에서 매우 다른 결과를 생산하고 있습니다. 이 나타납니다 유기 용매 파라핀 삽입 과정에서 사용되는 (크실렌 또는 Citrisolv)은 상피 조직에서 분비의 mucins 배포뿐만 아니라 많은 샘플 (그림 2)에서 glycolipids의 제거 등의 영향을 미칩니다. 그 결과, 점액 층은 점막 세포에 쓰러져 대부분 블렛 세포에서 발견됩니다 나타납니다. cryo-protectant 미디어 조직의 플래시 동결 (OCT)는 샘플 보습을 유지하고 분비 mucins 레이어 크기를 보존. 파라핀 퍼가기 과정은 비슷한 방식으로 다른 점액 - 관련 glycans 및 glycolipids에 영향을. Glycan 배포를 찾을 epitopes에 대해 정기적으로 glycan 탐지에 사용되는 lectins, (그림 3)과 항체를 사용하여 검사를 한mucins 및 glycolipids (그림 6). 렉틴 구속력이 잘 정의되지 않고 glycans뿐만 아니라 glycan 구조 14,15의 공간적 분포의 영향 때문에 렉틴 착색에 대한 적절한 컨트롤을 적용하는 것이 중요합니다. 효소 절단 및 경쟁 억제 : 여기 우리는 테스트 조직에 렉틴 착색을 제어하기위한 두 가지 방법을 보여줍니다. glycan의 epitopes의 절단은 glycan 특정 효소와 조직 섹션을 소화하여 수행, 예를 들어 세균 sialidase에 대한 SNA (그림 4)에 의해 구속력을 sialic 산성에 대한 제어 있습니다.되었습니다 특정 효소 (예 glycosidase) 공부 glycan 에피토프를 제거를 사용할 수 없습니다 경우에는 렉틴 특이성은 이러한 sWGA의 착색에 대한 Jacalin의 착색 또는 키틴 - 가수 분해물에 대한 Melibiose (그림 5)와 같은 경쟁력있는 억제제를 추가하여 확인 할 수 있습니다. 우리는 스냅 - 냉동 조직 샘플은 어느 rou 것을 여기에 설명tinely 병원과 연구소의 취득, 추가 10월에 포함하고 점액 glycoproteins하고에 존재하는 많은 glycans을 연구하는 데 사용할 수 있습니다. <table border="1"><tbody><tr><td> 렉틴 / AB </td><td> 출처 </td><td> 주요 특성 </td></tr><tr><td> LFA </td><td> Limax flavus (황색 탄환) </td><td> 터미널 SIA </td></tr><tr><td> MAA의 * </td><td> Maackia amurensis (아무르 Maackia) </td><td> Galβ1-R에 Siaα2-3Galβ1-R / 3-O-황산 </td></tr><tr><td> SNA </td><td> Sambucus nigra (Elderberry) </td><td> Siaα2 - 6Gal / Siaα2 - 6GalNAc </td></tr><tr><td> WGA </td><td> Triticum의 vulgaris (밀 배아) </td><td> GlcNAcβ1 - 4GlcNAcβ1-4GlcNAc / SIA </td></tr><tr><td> sWGA </td><td> Succinylated Triticum의 vulgaris (밀 배아) </td><td> GlcNAc &amp; B도착 예정 시간, 1 4GlcNAcβ1 - 4GlcNAc </td></tr><tr><td> PNA </td><td> Arachis hypogaea (땅콩) </td><td> Galβ1 - 3GalNAc (수정되지 않은 T-항원) </td></tr><tr><td> Jacalin </td><td> Artocarpus integrifolia (Jacalin) </td><td> Galβ1 - 3GalNAc는 O-링크 glycans에서 발견 </td></tr><tr><td> ECA </td><td> Erythrina cristagalli (산호 나무) </td><td> Galβ1 - 4GlcNAc </td></tr><tr><td> TKH2 </td><td> 항독소 </td><td> O-링크 glycans에 Siaa2-6GalNAc (역) </td></tr><tr><td> CA19-9 </td><td> 항독소 </td><td> Siaa2 - 3Galβ1-4 (Fuca1-3) GlcNAc (SLe) </td></tr><tr><td> SNH3 </td><td> 항독소 </td><td> Siaa2 - 3Galβ1-3 (Fuca1-4) GlcNAc (SLe X) </td></tr></tbody></table> 약어 : AB, 항체, SIA, Sialic 산, 걸, 갈락토오스, GalNAc, <em&gt; N-acetylgalactosamine, GlcNAc, N-acetylglucosamine, Fuc, Fucose, 역, Sialyl TN, SLe, sialyl Lewisa, SLe X, sialyl 루이스 X. MAA에 대한 * 상용 소스는 말리, MALII 및 마판이 포함되어 있습니다. 표 1. glycan의 epitopes에 대한 lectins과 항체의 일부 목록입니다. <img alt="그림 1" src="/files/ftp_upload/3928/3928fig1.jpg" /> 1 그림. Alcian 블루 및 냉동 및 파라핀 - 임베디드 결장 조직의 정기적 산성 스키 프 착색. 인간, 마우스 또는 닭 결장 표본의 조직 섹션 10월 (위 패널)에 냉동 또는 파라핀 (아래 패널)에 포함이 정기 산 스키 프 (PAS)에 물들되었습니다 또는 Alcian 블루 (AB). 이 시약은 각각 분홍색이나 파란색 점액을 얼룩. 상단 패널 : 냉동 조직에서 고 블렛 셀에 mucins뿐만 아니라, 분비의 점액도 마주했다였죠 (화살표). 낮은 패널 :에서 파라핀 - 임베디드 조직, 점액의 착색은 고 블렛 셀에 국한되었다. 핵은 Surgipath (PAS) 또는 메이어의 (AB) Hematoxylin과 counterstained했다. 스케일 바는 100 μm을 나타냅니다. <a href="http://www.jove.com/files/ftp_upload/3928/3928fig1large.jpg" target="_blank">큰 그림을 보려면 여기를 클릭하십시오</a> . <img alt="그림 2" src="/files/ftp_upload/3928/3928fig2.jpg" /> 그림 2. 10 % 포르말린 버퍼와 수화 (왼쪽 패널) 유지에 mucins의 상당한 손실 Citrisolv의 배양 결과입니다. 냉동 닭 회장의 표본의 직렬 섹션은 연속 70%에서 부화, 90 % 및 100 % 에탄올에 의한 에탄올의 탈수 20 분 동안 고정 된 각 (가운데 패널) 또는 에탄올에 수분이 1 시간 (오른쪽 패널)에 대한 Citrisolv에게 허가. 건조 샘플은 Hematoxylin과 Eosin (H &amp; E) 또는 Alcian 블루 염색하기 전에 PBS로 rehydrated되었습니다. 에탄올 탈수 및 Citrisolv 개간 개선 조직 morphology (예를 들어, 맨 위에, 중간 및 오른쪽 이미지를 대 왼쪽 이미지). 에탄올 탈수는 Alcian 블루 착색 (중간 행, 왼쪽 중간 이미지를 비교)에 더 큰 영향을 미치지 않았다. 반면, Citrisolv의 부화는 Alcian 블루 착색을 감소 파라핀 - 임베디드 조직 (그림 1)에서 볼 수 비슷했다 패턴의 고 블렛 셀 (중간 행, 오른쪽 이미지)에 국한. 이 데이터는 파라핀 - 임베디드 샘플에 점액의 과립의 강한 착색이 소요되는 단계에서 감소하고 잔 세포에서 점액의 응축에 의한 것을 암시. 냉동 월 임베디드 조직에서 점액의 희미하고 덜 조밀 한 착색은 조직에서 점액의 더 자연 분포를 반영합니다. 박스 지역의 높은 배율은 화살표로 표시됩니다. 스케일 바는 50 μm (상단 및 중간 행)와 10 μm (하단 행)을 나타냅니다. <img alt="그림 3" src="/files/ftp_upload/3928/3928fig3.jpg" /> 그림 3. 의 바인딩냉동 및 파라핀 - 임베디드 조직에 glycan의 epitopes에 lectins. 치킨 소장 (회장) 표본은 10월 (상단 패널)에 냉동 또는 Jacalin (파란색), sWGA (녹색)와 SNA를 탐색했다 (아래 패널) 파라핀에 포함 (빨간색 ). 박스 지역의 높은 배율은 화살표로 표시됩니다. 냉동 조직에서 O-링크 glycans에게 구속력 Jacalin는 루멘 (Jacalin, 상단 패널, 화살표)로 블렛 셀에서 흘러 것으로 보인다 구조를 공개했다. 반면, 파라핀 - 임베디드 조직에 대한 구속력을 Jacalin는 고 블렛 셀 (Jacalin 낮은 패널, 화살표)과 villi 브러시 테두리 (왼쪽 하단 이미지, 화살표)에 국한되었다. β1-4GlcNAc의 sWGA의 착색은 부분적으로 모두 냉동 조직의 Jacalin의 렉틴의 바인딩 (상단 패널, 화살표)로 공동 번역과에서 조직 (하단 패널, 화살표) 파라핀 - 임베디드. 반면, α2-6 연결 sialic 산에 바인딩 SNA의 렉틴은 (SNA, 화살촉) 세포이며, Jacalin (색상 공동 현지화되지 않습니다붉은 색의 이미지, SNA는 화살촉, 점선 화살표로 표시된 파란색으로 Jacalin)로 표시된. 스케일 바는 100 μm (왼쪽 이미지) 및 20 μm을 (확대 박스 영역) 나타냅니다. <img alt="그림 4" src="/files/ftp_upload/3928/3928fig4.jpg" /> 4 그림. SNA와 sialic 산성 염색을위한 효소 절단 제어. 치킨 소장의 표본은 37 ° C.에 250 무 / ML Arthrobacter ureafaciens sialidase (AUS) 또는 2.5 H 50 MM 나트륨 아세테이트 산도 5.5 버퍼와 incubated되었습니다 AUS 치료 sialic 산에 SNA 결합 특이성을 확인, biotinylated SNA와 얼룩 시킨다는. 스케일 바는 100 μm을 나타냅니다. <img alt="그림 5" src="/files/ftp_upload/3928/3928fig5.jpg" /> 그림 5. Jacalin 및 sWGA과 glycan 착색을위한 경쟁 저해 제어 할 수 있습니다. 치킨 소장 (회장) 표본은 특정 lec의 존재에 Jacalin와 sWGA 혼합물에 incubated되었습니다주석 억제제 : Melibiose (가운데 열), 키틴 - 가수 분해물 (오른쪽 열) 또는 억제제없이 (A와 D). 어퍼 패널 (왼쪽) 억제제없이 Jacalin의 착색. (중앙) Jacalin의 착색은 Melibiose에 의해 저해되었다. (오른쪽) 키틴 - 가수 분해물은 Jacalin의 착색을 억제하지 않았습니다. 낮은 패널 (왼쪽) 억제제없이 sWGA의 착색. (중앙) Melibiose는 sWGA의 착색을 억제하지 않았습니다. (오른쪽) sWGA의 착색은 키틴 - 가수 분해물에 의해 저해되었다. 이 억제는 조직과 lectins의 특정 상호 작용을 확인합니다. 착색 억제의 별표 마크 이미지입니다. 스케일 바는 100 μm을 나타냅니다. <img alt="그림 6" src="/files/ftp_upload/3928/3928fig6.jpg" /> 6 그림. 분비의 mucins, glycolipids 및 냉동 인간의 대장 암 조직에서 glycan epitopes의 감지. villous 암과 점액 암에서 대장 암 biopsies는 액체 질소 스냅인 냉동 있었고, 10월에 포함. 조직 섹션은 1 H에 대한 incubated되었습니다분비 점액에 대한 항체와 MUC5AC는 sialyl 루이스 - glycan 에피토프는 gangliosides (대장 암 마커 CA 19-9)에 있으며 sialyl-TN - mucins에 풍부한 glycan의 에피토프은 (TKH2 항체를 검출)와 30 분 배양 한 다음 biotinylated 당나귀 안티 - 마우스 IgG 항체 보조하고, 퍼 옥시 데이즈 - 복합 streptavidin으로 30 분 배양. 추가 조직은 퍼 옥시 데이즈 - 복합 streptavidin으로 30 분 부화 다음, biotinylated lectins SNA와 sWGA으로 1 시간에 incubated되었습니다. 퍼 옥시 데이즈의 착색은 AEC 키트를 사용하여 개발되었습니다. 블랙 규모 바는 200 μm을 나타냅니다.

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A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Microscopy, Immunohistochemistry, and Antigen Retrieval Methods: For Light and Electron Microscopy. , 53-70 (2002).</li><li>Cohen, M., Hurtado-Ziola, N., Varki, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ABO+blood+group+glycans+modulate+sialic+acid+recognition+on+erythrocytes.">ABO blood group glycans modulate sialic acid recognition on erythrocytes.</a> Blood. 114, 3668-3676 (2009).</li><li>Cohen, M., Varki, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+sialome--far+more+than+the+sum+of+its+parts.">The sialome--far more than the sum of its parts.</a> OMICS. 14, 455-464 (2010).</li><li>Ota, H., Katsuyama, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alternating+laminated+array+of+two+types+of+mucin+in+the+human+gastric+surface+mucous+later.">Alternating laminated array of two types of mucin in the human gastric surface mucous later.</a> Histochemical J. 24, 86-92 (1992).</li><li>Matsuo, K., Ota, H., Akamatsu, T., Sugiyama, A., Katsuyama, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Histochemistry+of+the+surface+mucous+gel+layer+of+the+human+colon.">Histochemistry of the surface mucous gel layer of the human colon.</a> Gut. 40, 782-789 (1997).</li><li>Boyde, A., Maconnachie, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Treatment+with+lithium+salts+reduces+ethanol+dehydration+shrinkage+of+glutaraldehyde+fixed+tissue.">Treatment with lithium salts reduces ethanol dehydration shrinkage of glutaraldehyde fixed tissue.</a> Histochemistry. 66, 181-187 (1980).</li></ol>

관심 없음 충돌이 선언 없습니다.

냉동 조직의 점액과 glycan epitopes의 보존은 파라핀에 포함 된 조직의 우수합니다. 우리는 분비의 점액 층 (그림 1 및 3)과 파라핀 - 임베디드 조직에 비해 냉동 조직의 세 glycans 구조의 분포 (그림 3)의 보전을 보여 주었다. 이러한 Carnoy의 솔루션으로 전문 fixatives은 (60 % 에탄올, 30 % 클로로포름, 10 % 아세트산) 17는 조직 샘플에있는 점액 층의 최적의 보존을 위해 개발되었습니다. 최적이 솔루션은 점액 연구에 최선을 다하고 있습니다 조직 샘플을 수집하는 데 사용되어야하며 점액 층 16-17의 원활한 모양을 유지하기 위해 표시되었습니다. 10월에 포함 된 고정되지 않은 냉동 샘플의 점액 층이 견고 나타나고 일부 지역에서 조직에서 분리 할 수​​ 있습니다, 그러나 전체 층의 두께는 Carnoy의 솔루션과 embedd 고정 된 조직에서 관찰 그와 계약에파라핀 16-17에서 거구나. 16 - 예를 들어, 냉동 인간의 결장 조직 섹션에있는 점액 층은 Carnoy&#39;s - 고정 인간 대장 샘플 55.4 ± 2.5 μm (204.8 μm 범위 7.7)에 대한보고 범위 내에 ~ 100 μm (그림 1)입니다. 그것은 수십 년 동안 알려져왔다 그 생물 표본 18 ~ 30 %의 수축 및 조직 13 일부터 같은 크실렌 등의 유기 용제, Citrisolv과 어느 정도 클로로포름 추출 지질, glycolipids하고는, 단백질한다는 점에서 에탄올 탈수 결과. 고정 (10 % 포르말린 버퍼), 탈수 (증가 에탄올 농도) 및 어음 (Citrisolv 또는 크실렌) : 파라핀 삽입하기위한 조직 처리는 다음 단계가 포함되어 있습니다. 고정되지 않은 냉동 조직 섹션에서 다음 단계를 모방함으로써, 우리는 Citrisolv합니다 (Figur 파라핀 - 임베디드 조직의 그것과 비슷 조직 형태의 결과로 냉동 조직 섹션에서 점액을 추출하는 증명전자 2, 오른쪽 패널). 반면, 점액 층은 (그림 2, 왼쪽과 중앙 패널) 포르말린 또는 에탄올과 부화에 의해 변경되지 않았습니다. 이 제안이 Citrisolv / 크실렌에서 장시간 배양을 필요로 표준 파라핀 퍼가기 절차의 소요 단계, 점액 층의 붕괴의 결과. 포르말린 고정이 쉽게 glycans, glycolipids 및 단백질 (그림 2, 3, 6)에 대한 lectins과 항체 물들 일 수있는 포르말린으로 고정 된 점액 층 및 냉동 조직 섹션을 손상하지 않습니다. 이러한 효과는 막에 바인딩 단백질 및 조직 병리의 연구 크지 않을 수 있습니다하지만, 이러한 분비 점액 층으로 높은 수화 구조에 망연자실하고 있습니다. mucins의 그러나 조직 학적 연구는 계속 점액 층 보존 차선이있는 파라핀 - 임베디드 샘플과 주로 실시하고 있습니다. 이러한 SE의 정확한 신원과 같은 점액 층 구성의 깊이 분석에서creted 또는 막 바운드 MUC 당 단백질의 조합은 특정 항체와 단백질 백본의 식별을위한 대량 분석법이 필요합니다. 점액 층의 보존은 연구뿐만 초기 요구 사항입니다. 대부분의 실험실은 다른 프로젝트에 과거에 수집 된 10월에 냉동 조직 샘플이 조직은 쉽게 mucins, glycolipids 및 점액 보존을 위해 독특하게 디자인 된 특수 fixatives으로 조직을 수집 할 필요가 없습니다 glycan 분포를 연구하는 데 사용할 수 있습니다. 냉동 조직은 최소한의 처리를 받아야하기 때문에 자연의 수화 아르 glycans의 자연 배포, 보존되어 있습니다. 이 미생물 - 호스트 상호 작용의 영역에서 특히 중요합니다. 이 &quot;장벽&quot;분자 장식 분비의 mucins과 많은 glycan 구조의 자연 배포하고 풍부한 지식은 호스트 방어, 미생물 착취와 pathogenes을 이해 열쇠가 될 것이다수 있습니다.

<table border="1"><tbody><tr><td> 시약 및 장비 명 </td><td> 회사 </td><td> 카탈로그 번호 </td></tr><tr><td> 2 - 메틸 부탄 </td><td> 피셔 과학 </td><td> 03551-4 </td></tr><tr><td> AEC 퍼 옥시 데이즈 기판 키트 </td><td> 벡터 연구소 </td><td> SK-4200 </td></tr><tr><td> Alcian 블루 </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td> A3157 </td></tr><tr><td> 안티 - CA 19-9 단클론 항체 </td><td> Calbiochem </td><td> CA1003 </td></tr><tr><td> 안티 MUC5AC 단클론 항체 </td><td> Millipore </td><td> MAB2011 </td></tr><tr><td> 아비딘 - 비오틴 차단 키트 </td><td> 벡터 연구소 </td><td> SP-2001 </td></tr><tr><td> Biotinylated 당나귀 안티 - 마우스 항체 </td><td> 잭슨 Immunoresearch </td><td> 90,863 </td></tr><tr><td> Biotinylated SNA </td><td> 벡터 연구소 </td><td> B-1305 </td></tr><tr><td> 소 혈청 albu분 </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td> A4503 </td></tr><tr><td> 키틴 - 가수 분해물 </td><td> 벡터 연구소 </td><td> SP-0090 </td></tr><tr><td> 그라 이오 스탯 마이크로톰 </td><td> Leica 마이크로 시스템즈 </td><td> Leica CM 1800 </td></tr><tr><td> Hematoxylin </td><td> Surgipath 의료 공업 </td><td> 3801570 </td></tr><tr><td> 과산화수소 30% </td><td> 피셔 과학 </td><td> H325-100 </td></tr><tr><td> Jacalin-FITC </td><td> 벡터 연구소 </td><td> FL-1151 </td></tr><tr><td> 마이어의 Hematoxylin </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td> MHS32 </td></tr><tr><td> Melibiose </td><td> 시그마 - 알드리치 </td><td> M5500 </td></tr><tr><td> 원자력 빠른 레드 </td><td> 벡터 연구소 </td><td> H-3403 </td></tr><tr><td> 10월 화합물 </td><td> VWR 인터내셔널 </td><td> 25608-930 </td></tr><tr><td> 퍼 옥시 데이즈 복합 streptavidin </td><td> 잭슨 Immunoresearch </td><td> 94,638 </td></tr><tr><td> 쉬프 시약 </td><td> 전자 현미경 과학 </td><td> 26,052 </td></tr><tr><td> sWGA-Rhodamine </td><td> 벡터 연구소 </td><td> RL1022S </td></tr><tr><td> TKH2 단클론 항체 </td><td> ATCC </td><td> HB-9654 </td></tr><tr><td> VectaMount 수성 장착 미디어 </td><td> 벡터 연구소 </td><td> H-5501 </td></tr><tr><td> Cytoseal 60 </td><td> 열 과학 </td><td> 8310-4 </td></tr><tr><td> 필-A 웨이 금형 </td><td> Polysciences 주식회사 </td><td> 18646A-1 </td></tr></tbody></table>

using unfixed, frozen tissues to study natural mucin distribution

Mucins 무게 1-3으로 70 % 이상 탄수화물을 포함 복잡하고 크게 glycosylated O-링크 glycoproteins입니다. 분비의 mucins은 고 블렛 셀과 위 점막에서 생산, 마이크로 미터 두께의 점액 층의 비계를 제공하는 선 내장 및 호흡기 3,4의 상피 조직. mucins뿐만 아니라, 점액 레이어는 또한 항균 펩티드, 크린 시토 킨, 그리고 면역 글로불린 5-9가 포함되어 있습니다. 점액 층은 호스트 타고난 면역의 중요한 부분이며, 미생물 8,10-12을 침해 방어의 첫 번째 라인을 형성한다. 따라서 점액이 미생물과 다양한 상호 작용에 따라 달라질 수 있습니다, 모두 병원균과 symbionts 및 분비의 mucins이 상호 작용에 대한 중요한 인터페이스를 형성하고 있습니다. 이러한 생물학적 상호 작용의 연구는 일반적으로 조직 수집 및 착색에 대한 조직 학적 방법을 포함한다. 조직 수집 및 preserv에 대한 두 가지 가장 일반적으로 사용되는 조직 학적 방법병원 및 연구소의 ation은 다음과 같습니다 포르말린 고정은 cryo-protectant 미디어에 삽입하여 다음에 파라핀 삽입하여 다음과 조직 냉동. 파라핀 - 임베디드 조직 샘플은 명확하고 잘 정의 된 형태를 포함한 조직 학적 시각화에 대한 최적의 품질로 섹션을 생산합니다. 그러나, 파라핀 삽입 과정에서 epitopes의 숫자가 변경 이러한 epitopes을 연구하기 위해, 조직 섹션은 더 많은 에피토프 검색 방법 13 하나 처리해야된다. 분비 mucins 및 지질은 유기 용제 (크실렌 또는 Citrisolv)로 부화을 연장해야 파라핀-퍼가기 소요되는 단계 동안 조직에서 추출됩니다. 그러므로이 방법은 mucins 및 생체 내 점액의 성격 및 배포에 초점을 연구에 대한 하위 최적입니다. 대조적으로, 최적의 절삭 온도에서 동결 조직 (OCT)는 매체를 삽입공극 샘플의 탈수 및 개간 및 샘플 보습을 유지합니다. 이것은 수화 점액 층의 더 나은 보존이 가능하고, 따라서 상피 생물학 mucins의 다양한 역할 연구를 할 수 있습니다. 이 방법은 조직의 최소한의 처리를 필요에 따라, 조직은보다 자연 상태로 보존되어 있습니다. 따라서 냉동 조직 섹션 전에 착색에 대한 추가 처리를 필요로하지 않으며 쉽게 immunohistochemistry 방법을 사용하여 분석 할 수 있습니다. 우리는 냉동 대장 샘플에 마이크로 미터 두께의 분비 점액 층의 보전을 보여줍니다. 같은 조직은 파라핀에 포함 된 경우 계층은 크게 감소된다. 우리는 또한 공장 lectins를 사용하여 mucins에 표시 glycan의 epitopes의 immunofluorescence 얼룩을 보여줍니다. 이 방법의 장점은 특별한 fixatives의 사용을 요구하고 이미 연구실에 보존 할 수 있습니다 냉동 조직을 활용 할 수 없다는 것입니다.

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Using Unfixed, Frozen Tissues to Study Natural Mucin Distribution

최적의 절삭 온도 매체 (OCT)에 포함 된 고정되지 않은 냉동 조직 샘플은 숨겨진 점액 자연 유통 및 글리코 실화를 공부하는 데 사용할 수 있습니다. 이 접근법 조직 처리에 최소한이며, glycolipids, mucins 및 glycan - epitopes의 자연 프리젠 테이션는 보존됩니다. 조직 섹션은 형광 또는 chromogenic 검색을 사용하여 immunohistochemistry에 의해 분석 할 수 있습니다.

자연 점액 배포를 공부하기 위해 떼어 낸, 냉동 조직을 사용하여

Mucins are complex and heavily glycosylated O-linked glycoproteins, which contain more than 70% carbohydrate by weight1-3. Secreted mucins, produced by ...

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Research

JoVE Journal

Biology

47.5K 조회수.  University of California, San Diego. 최적의 절삭 온도 매체 (OCT)에 포함 된 고정되지 않은 냉동 조직 샘플은 숨겨진 점액 자연 유통 및 글리코 실화를 공부하는 데 사용할 수 있습니다. 이 접근법 조직 처리에 최소한이며, glycolipids, mucins 및 glycan - epitopes의 자연 프리젠 테이션는 보존됩니다. 조직 섹션은 형광 또는 chromogenic 검색을 사용하여 immunohistochemistry에 의해 분석 할 수 있습니다.

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Testing Visual Sensitivity to the Speed and Direction of Motion in Lizards

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of the visual system provide more empirical evidence for functional applications. Investigation into the sensory system provides information about the sensory capacity, learning and memory ability, and establishes known baseline behaviour in which to gauge deviations (Burghardt, 1977). However, unlike mammalian or avian systems, testing for learning and memory in a reptile species is difficult. Furthermore, using an operant paradigm as a psychophysical measure of sensory ability is likewise as difficult. Historically, reptilian species have responded poorly to conditioning trials because of issues related to motivation, physiology, metabolism, and basic biological characteristics. Here, I demonstrate an operant paradigm used a novel model lizard species, the Jacky dragon (Amphibolurus muricatus) and describe how to test peripheral sensitivity to salient speed and motion characteristics. This method uses an innovative approach to assessing learning and sensory capacity in lizards. I employ the use of random-dot kinematograms (RDKs) to measure sensitivity to speed, and manipulate the level of signal strength by changing the proportion of dots moving in a coherent direction. RDKs do not represent a biologically meaningful stimulus, engages the visual system, and is a classic psychophysical tool used to measure sensitivity in humans and other animals. Here, RDKs are displayed to lizards using three video playback systems. Lizards are to select the direction (left or right) in which they perceive dots to be moving. Selection of the appropriate direction is reinforced by biologically important prey stimuli, simulated by computer-animated invertebrates.

Testing visual sensitivity in lizards using an operant conditioning paradigm that employs video playback of random-dot kinematograms and computer-generated invertebrates.

도마뱀의 운동의 속도와 방향에 시각 민감도 테스트

Testing visual sensitivity in any species provides basic information regarding behaviour, evolution, and ecology. However, testing specific features of ...

연구

생물학

Computer-Generated Animal Model Stimuli

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In particular, understanding the constraints on visual signal design for communication has been of great interest. Traditional methods for investigating animal interactions have used basic observational techniques, staged encounters, or physical manipulation of morphology. Less intrusive methods have tried to simulate conspecifics using crude playback tools, such as mirrors, still images, or models. As technology has become more advanced, video playback has emerged as another tool in which to examine visual communication (Rosenthal, 2000). However, to move one step further, the application of computer-animation now allows researchers to specifically isolate critical components necessary to elicit social responses from conspecifics, and manipulate these features to control interactions. Here, I provide detail on how to create an animation using the Jacky dragon as a model, but this process may be adaptable for other species. In building the animation, I elected to use Lightwave  3D to alter object morphology, add texture, install bones, and provide comparable weight shading that prevents exaggerated movement. The animation is then matched to select motor patterns to replicate critical movement features. Finally, the sequence must rendered into an individual clip for presentation. Although there are other adaptable techniques, this particular method had been demonstrated to be effective in eliciting both conspicuous and social responses in staged interactions.

Computer-generated stimuli using the Jacky dragon as a model.

컴퓨터가 만든 동물 모델 자극

Communication between animals is diverse and complex. Animals may communicate using auditory, seismic, chemosensory, electrical, or visual signals. In ...

Using the optokinetic response to study visual function of zebrafish

Optokinetic response (OKR) is a behavior that an animal vibrates its eyes to follow a rotating grating around it. It has been widely used to assess the visual functions of larval zebrafish1-5. Nevertheless, the standard protocol for larval fish is not yet readily applicable in adult zabrafish. Here, we introduce how to measure the OKR of adult zebrafish with our simple custom-built apparatus using a new protocol which is established in our lab. Both our apparatus and step-by-step procedure of OKR in adult zebrafish are illustrated in this video. In addition, the measurements of the larval OKR, as well as the optomotor response (OMR) test of adult zebrafish, are also demonstrated in this video. This OKR assay of adult zebrafish in our experiment may last for up to 4 hours. Such OKR test applied in adult fish will benefit to visual function investigation more efficiently when the adult fish vision system is manipulated.
Su-Qi Zou and Wu Yin contributed equally to this paper.

Optokinetic response has been widely used to assess the visual functions of larval zebrafish. Nevertheless, the standard protocol for larval fish is not yet readily applicable in adults1-5. Here, we introduce how to measure the OKR of adult zebrafish using a new protocol which is established in our lab.

zebrafish의 시각 기능을 연구하기 위해 optokinetic 응답을 사용하여

Optokinetic response (OKR) is a behavior that an animal vibrates its eyes to follow a rotating grating around it. It has been widely used to assess the ...

Reverse Genetic Morpholino Approach Using Cardiac Ventricular Injection to Transfect Multiple Difficult-to-target Tissues in the Zebrafish Larva

The zebrafish is an important model to understand the cell and molecular biology of organ and appendage regeneration. However, molecular strategies to employ reverse genetics have not yet been adequately developed to assess gene function in regeneration or tissue homeostasis during larval stages after zebrafish embryogenesis, and several tissues within the zebrafish larva are difficult to target. Intraventricular injections of gene-specific morpholinos offer an alternative method for the current inability to genomically target zebrafish genes in a temporally controlled manner at these stages. This method allows for complete dispersion and subsequent incorporation of the morpholino into various tissues throughout the body, including structures that were formerly impossible to reach such as those in the larval caudal fin, a structure often used to noninvasively research tissue regeneration. Several genes activated during larval finfold regeneration are also present in regenerating adult vertebrate tissues, so the larva is a useful model to understand regeneration in adults. This morpholino dispersion method allows for the quick and easy identification of genes required for the regeneration of larval tissues as well as other physiological phenomena regulating tissue homeostasis after embryogenesis. Therefore, this delivery method provides a currently needed strategy for temporal control to the evaluation of gene function after embryogenesis.&#160;

An adaptable reverse genetic method for zebrafish to assess gene function during later stages of development and physiological homeostasis such as tissue regeneration using intraventricular injections of gene-specific morpholinos.

Zebrafish의 유충의 여러 어려운 대상 조직을 형질 심장 심실 사출을 사용하여 유전 모르 폴리 노의 접근을 반전

The zebrafish is an important model to understand the cell and molecular biology of organ and appendage regeneration. However, molecular strategies to ...

High-throughput Image Analysis of Tumor Spheroids: A User-friendly Software Application to Measure the Size of Spheroids Automatically and Accurately

The increasing number of applications of three-dimensional (3D) tumor spheroids as an in vitro model for drug discovery requires their adaptation to large-scale screening formats in every step of a drug screen, including large-scale image analysis. Currently there is no ready-to-use and free image analysis software to meet this large-scale format. Most existing methods involve manually drawing the length and width of the imaged 3D spheroids, which is a tedious and time-consuming process. This study presents a high-throughput image analysis software application &#8211; SpheroidSizer, which measures the major and minor axial length of the imaged 3D tumor spheroids automatically and accurately; calculates the volume of each individual 3D tumor spheroid; then outputs the results in two different forms in spreadsheets for easy manipulations in the subsequent data analysis. The main advantage of this software is its powerful image analysis application that is adapted for large numbers of images. It provides high-throughput computation and quality-control workflow. The estimated time to process 1,000 images is about 15 min&#160;on a minimally configured laptop, or around 1 min&#160;on a multi-core performance workstation. The graphical user interface (GUI) is also designed for easy quality control, and users can manually override the computer results. The key method used in this software is adapted from the active contour algorithm, also known as Snakes, which is especially suitable for images with uneven illumination and noisy background that often plagues automated imaging processing in high-throughput screens. The complimentary &#8220;Manual Initialize&#8221; and &#8220;Hand Draw&#8221; tools provide the flexibility to SpheroidSizer in dealing with various types of spheroids and diverse quality images. This high-throughput image analysis software remarkably reduces labor and speeds up the analysis process. Implementing this software is beneficial for 3D tumor spheroids to become a routine in vitro model for drug screens in industry and academia.

We present a high-throughput image analysis software application to measure the size of three-dimensional tumor spheroids imaged with bright-field microscopy. This application provides a fast and effective way to examine the effects of therapeutic drugs on spheroids, which is beneficial for researchers who wish to use spheroids in drug screens.

종양 상체의 높은 처리량의 이미지 분석 : 자동으로 정확하게 상체의 크기를 측정하는 사​​용자 친화적 인 소프트웨어 응용 프로그램

The increasing number of applications of three-dimensional (3D) tumor spheroids as an in vitro model for drug discovery requires their adaptation to ...

Using Mouse Mammary Tumor Cells to Teach Core Biology Concepts: A Simple Lab Module

Undergraduate biology students are required to learn, understand and apply a variety of cellular and molecular biology concepts and techniques in preparation for biomedical, graduate and professional programs or careers in science. To address this, a simple laboratory module was devised to teach the concepts of cell division, cellular communication and cancer through the application of animal cell culture techniques. Here the mouse mammary tumor (MMT) cell line is used to model for breast cancer. Students learn to grow and characterize these animal cells in culture and test the effects of traditional and non-traditional chemotherapy agents on cell proliferation. Specifically, students determine the optimal cell concentration for plating and growing cells, learn how to prepare and dilute drug solutions, identify the best dosage and treatment time course of the antiproliferative agents, and ascertain the rate of cell death in response to various treatments. The module employs both a standard cell counting technique using a hemocytometer and a novel cell counting method using microscopy software. The experimental procedure lends to open-ended inquiry as students can modify critical steps of the protocol, including testing homeopathic agents and over-the-counter drugs. In short, this lab module requires students to use the scientific process to apply their knowledge of the cell cycle, cellular signaling pathways, cancer and modes of treatment, all while developing an array of laboratory skills including cell culture and analysis of experimental data not routinely taught in the undergraduate classroom.

A feasible laboratory module for biology undergraduates that explores advanced cellular and molecular concepts using animal cell culture is described. Students grow, characterize and manipulate a breast cancer cell model by exposure to chemotherapy agents. Cell viability is assayed through cell counting using both a standard and novel method.

핵심 생물학 개념을 가르치는 마우스 유방 종양 세포를 사용 : 간단한 랩 모듈

Undergraduate biology students are required to learn, understand and apply a variety of cellular and molecular biology concepts and techniques in ...

Using Caco-2 Cells to Study Lipid Transport by the Intestine

Studies of dietary fat absorption are generally conducted by using an animal model equipped with a lymph cannula. Although this animal model is widely accepted as the in vivo model of dietary fat absorption, the surgical techniques involved are challenging and expensive. Genetic manipulation of the animal model is also costly and time consuming. The alternative in vitro model is arguably more affordable, timesaving, and less challenging. Importantly, the in vitro model allows investigators to examine the enterocytes as an isolated system, reducing the complexity inherent in the whole organism model. This paper describes how human colon carcinoma cells (Caco-2) can serve as an in vitro model to study the enterocyte transport of lipids, and lipid-soluble drugs and vitamins. It explains the proper maintenance of Caco-2 cells and the preparation of their lipid mixture; and it further discusses the valuable option of using the permeable membrane system. Since differentiated Caco-2 cells are polarized, the main advantage of using the permeable membrane system is that it separates the apical from the basolateral compartment. Consequently, the lipid mixture can be added to the apical compartment while the lipoproteins can be collected from the basolateral compartment. In addition, the effectiveness of the lentivirus expression system in upregulating gene expression in Caco-2 cells is discussed. Lastly, this paper describes how to confirm the successful isolation of intestinal lipoproteins by transmission electron microscopy (TEM).

Caco-2 cells can serve as an in vitro model to study the enterocyte transport of lipids, and lipid-soluble drugs/vitamins. The permeable membrane system separates the apical from the basolateral compartment, while the lentivirus expression system offers an effective gene overexpression method. The isolation of lipoproteins is confirmed by TEM.

소장에 의해 지질 전송을 연구하기 위해 카코 2 셀을 사용하여

Studies of dietary fat absorption are generally conducted by using an animal model equipped with a lymph cannula. Although this animal model is widely ...

Mucin Agarose Gel Electrophoresis: Western Blotting for High-molecular-weight Glycoproteins

Mucins, the heavily-glycosylated proteins lining mucosal surfaces, have evolved as a key component of innate defense by protecting the epithelium against invading pathogens. The main role of these macromolecules is to facilitate particle trapping and clearance while promoting lubrication of the mucosa. During protein synthesis, mucins undergo intense O-glycosylation and multimerization, which dramatically increase the mass and size of these molecules. These post-translational modifications are critical for the viscoelastic properties of mucus. As a result of the complex biochemical and biophysical nature of these molecules, working with mucins provides many challenges that cannot be overcome by conventional protein analysis methods. For instance, their high-molecular-weight prevents electrophoretic migration via regular polyacrylamide gels and their sticky nature causes adhesion to experimental tubing. However, investigating the role of mucins in health (e.g., maintaining mucosal integrity) and disease (e.g., hyperconcentration, mucostasis, cancer) has recently gained interest and mucins are being investigated as a therapeutic target. A better understanding of the production and function of mucin macromolecules may lead to novel pharmaceutical approaches, e.g., inhibitors of mucin granule exocytosis and/or mucolytic agents. Therefore, consistent and reliable protocols to investigate mucin biology are critical for scientific advancement. Here, we describe conventional methods to separate mucin macromolecules by electrophoresis using an agarose gel, transfer protein into nitrocellulose membrane, and detect signal with mucin-specific antibodies as well as infrared fluorescent gel reader. These techniques are widely applicable to determine mucin quantitation, multimerization and to test the effects of pharmacological compounds on mucins.

Mucins are high-molecular-weight glycoconjugates, with size ranging from 0.2 to 200 megadalton (MDa). As a result of their size, mucins do not penetrate conventional polyacrylamide gels and require larger pores for separation. We provide a detailed protocol for mucin agarose gel electrophoresis to assess relative quantification and study polymer assembly.

점액 아가로 오스 겔 전기 영동 : 높은 분자량 당 단백질에 대한 웨스턴 블로 팅


Mucins, the heavily-glycosylated proteins lining mucosal surfaces, have evolved as a key component of innate defense by protecting the epithelium against ...

Deploying Community Scientists to Conduct Nondestructive Genetic Sampling of Rare Butterfly Populations

Global insect declines continue to accelerate. Effective genetic sampling is critically needed to advance the understanding of many taxa and address existing knowledge gaps. This protocol represents a demonstrated method for nondestructively sampling rare butterflies for population genetic structure or DNA barcoding analyses. It uses the chorion of hatched butterfly ovae to yield sufficiently high quantity and quality DNA for successful gene sequencing to confirm species identity and quantify genetic variation. It may be particularly useful when other tissue sampling techniques are impractical or unavailable. While developed for a lepidopteran, it nonetheless could easily be adapted for use with other insect species. It was specifically designed with ease of use as a goal to help maximize broad implementation by individuals of varying experience and skill levels, such as community scientists, conservation practitioners, and students, and for use over large geographic areas to facilitate broad population sampling. The data generated can help inform taxonomic and listing decisions, conservation and management actions, and enhance basic ecological research.

Here, we present a straightforward protocol for noninvasive genetic sampling of butterfly populations based on the field collection of residual egg debris. It can be used to confirm species identity and quantify genetic variation. This protocol can be easily adapted to broader groups for community science involvement.

희귀 나비 개체군의 비파괴 유전자 샘플링을 수행하기 위해 지역 사회 과학자 배치

Global insect declines continue to accelerate. Effective genetic sampling is critically needed to advance the understanding of many taxa and address ...

Isolation and Profiling of Single Nuclei from Frozen Mammalian Tissues(냉동 포유류 조직에서 단일 핵의 분리 및 프로파일링)

A Simple, Quick, and Partially Automated Protocol for the Isolation of Single Nuclei from Frozen Mammalian Tissues for Single Nucleus Sequencing

Single-cell and single-nucleus RNA sequencing have become common laboratory applications due to the wealth of transcriptomic information that they provide. Single nucleus RNA sequencing, particularly, is useful for investigating gene expression in difficult-to-dissociate tissues. Furthermore, this approach is also compatible with frozen (archival) material. Here, we describe a protocol to isolate high-quality single nuclei from frozen mammalian tissues for downstream single nucleus RNA sequencing in a partially-automated manner using commercially available instruments and reagents. Specifically, a robotic dissociator is used to automate and standardize tissue homogenization, followed by an optimized chemical gradient to filter the nuclei. Lastly, we accurately and automatically count the nuclei using an automated fluorescent cell counter. The performance of this protocol is demonstrated on mouse brain, rat kidney, and cynomolgus liver and spleen tissue. This protocol is straightforward, rapid, and readily adaptable to various mammalian tissues without requiring extensive optimization and provides good quality nuclei for downstream single nuclei RNA sequencing.

저자 스포트라이트: Enhancing Drug Discovery - Development of Automated, Standardized Protocols for Nuclei Extraction from Frozen Tissues(신약 개발 강화 - 동결 조직에서 핵 추출을 위한 자동화되고 표준화된 프로토콜 개발) 

The study describes a simple, quick, and partially automated protocol to isolate high-quality nuclei from frozen mammalian tissues for downstream single nuclei RNA sequencing.