The authors would like to acknowledge the NHMRC for career development award and grant support APP1066336 which supported this work.

문화 미디어와 요리 1. 준비 <ol><li> 5.54 g의 NaCl, 0.356 g의 KCl, 0.25 g의 CaCl2를, 0.162 g의 H 2 KO 4 P, 및 0.294 g의 황산 밀리 Q 물 L 1을 추가하여 비 거스 위튼과 위튼 (BWW) (17) 작업 용액 200 mL로 . 이 원액이며 개월까지 4 ℃에서 유지 될 수있다. </li><li> 스톡 용액으로부터,의 NaHCO3 420 mg의 추가 - 200 mg의 글루코스, 6mg의 피루브산 나트륨 600 mg을 소 혈청 알부민, 0.74 ml의 나트륨 락 테이트, 및 BWW 스톡 4.0 HEPES 완충액 ml를 193 ml의. 이 작업 솔루션이며 항상 사용하기 전에 날에 신선한 만든 37 ° C 평형을한다. </li><li> 캐 뉼러를하려면, 튜브가 녹기 시작하는 것이 (일반적으로 메탄올 불꽃) 등을 0.4 mm의 내부 직경 1.1 mm의 외부 직경 폴리에틸렌 (PE) 관을 가지고 약한 불로 보유. 즉시 outw 튜브를 당겨ARD는 스트레칭과 외부 직경이 좁아 확인합니다. </li><li> 정관 쉽게 삽관을 허용 한 쪽 끝이 좁아을 생산 컷. </li><li> 약 15cm에 캐 뉼러의 다른 쪽 끝을 잘라. 무딘 끝으로 30 G 바늘을 삽입하고, 그것에 3 ML의 주사기를 연결 (완전 수축). </li><li> PE 튜브 (4.2 mm 내경 6.4 mm 외경)의 20cm 길이를 절단하여 흡입 마우스 피스를 확인합니다. 한쪽에 마우스 피스를 삽입합니다. </li><li> 마이크로 유리 모세관 튜브 홀더와 유리 마이크로 모세관 자체 (전형적으로 마우스에 대한 3 μL, 쥐 40 μL)를 삽입한다. </li></ol> 마우스에서 Epididymides 2. 제거 <ol><li> 각 기관에 특정 IACUC 승인 절차에 따라 쥐를 안락사. </li><li> 동물을 가지고 부고환을 노출 음낭에 작은 절개를합니다. 시계의 # 5 포셉 한 쌍을 사용하여 캐비티에서 고환과 부고환을 당깁니다. </li><li> 이러한 적어도 1-2cm가 카우의 부고환에 부착 된 상태로 유지 정관을 잘라. 또한, 고환 부고환 접속 근위 원심성 덕트 및 조직을 절단하고, 전체 트랙의 남성 생식을 제거한다. </li><li> 5-40X의 순서로 확대 범위 해부 현미경 전체 남성의 생식 트랙을 놓습니다. </li></ol> 3. 부고환을 Cannulating <ol><li> 축소 (원추형) 끝에 1-2 센티미터 렌즈를 통해 무료로 볼 수 있도록 현미경에 캐 뉼러 아래 테이프. </li><li> 시계의 # 5 포셉 한 쌍을 가지고 부드럽게 정관의 양쪽 걸쇠와 캐 뉼러는 정관으로 진행되도록, 캐 뉼러에 정관을 당깁니다. </li><li> 비 흡수성 검은 꼰 치료 실크 (크기 5-0)의 길이를 가지고 유관 정관 주위에 매듭을 묶어. 확인 매듭이 정관 내부 캐 뉼러를 개최 단단히 당겨지면 공기 압력 FR옴 주사기 적용됩니다. </li></ol> 4. 역행 또는 꼬리 부고환 정자의 백 플러싱 <ol><li> 시계 제작자의 # 5 집게를 사용하여 카우의 epididymides의 말단부를 잡고 하나의 부고환 세관을 노출하기 위해 외막 albuginea를 제거합니다. </li><li> 포셉 사용하여 부드럽게 보이도록 가느 다란 관을 끌어와 정자가 해제 될 때까지 구멍을 만들 수 있도록 다음 떨어져 애타게. </li><li> 정관에 주사기에서 공기를 배출 할 수 있도록 조심스럽게 3 ㎖ (마우스) 20 ㎖ (쥐) 주사기에 밀어 넣습니다. 적절한 압력, 정자 천천히 카우의 부고환의 말단부에 깨진 가느 다란 관에서 나오는 시작합니다. 이때, 유리 모세관에 정자를 그릴 마우스 피스 흡입을 적용한다. 주 : 일반적으로 마우스에서, 정자 2-3 μL가 동물의 나이에 따라 얻을 수있다. 쥐 의지, 평균 수익률이 30 ~ 40 μL에. </li></ol> 5. 세척및 단백질 체학을위한 준비에 정자를 용균 <ol><li> 부드럽게 마우스 피스 불고 또는 주사기를 부착하고 모세관에서 다시 정자를 밀어하기 위해 공기를 추방하여 BWW 용액 1 ml의 용액 (37 ° C)에 유리 모세관에서 정자를 추방. </li><li> 정자 세포가 확산되면, 오염 단백질을 제거하는 1 ml의 BWW 3 배 (300 XG, 5 분)을 씻는다. 최종 세척 한 후, 상층 액을 제거합니다. 주 :이 시점에서, 정자 세포가 나중에 사용하기 위해 고정 될 수있다. </li><li> 간헐 텍싱 함께 1 시간 동안 4 % CHAPS, 2 M 티오 우레아, 50 mM 트리스, pH가 7.4를 사용하여 단백질을 가용화. </li><li> 세포를 원심 분리 (10,000 XG, 20 분) 용균 후, 상층 액을 새로운 튜브로 전송할 수 있습니다. 주 :이 시점에서, 단백질의 정량을 행할 수있다. </li></ol> 6. 이황화 채권 감소와 알킬화 <ol><li> 용해 단백질에 최종 농도가 10 mM의 DTT를 추가, vort전은 30 분 동안 실온에서 품어. </li><li> 해물, 소용돌이에 최종 농도로 idodoacetamide의 50 mM을 추가하고 어둠 속에서 실온에서 30 분 동안 배양한다. </li></ol> 7. 강수량 <ol><li> 메탄올 클로로포름, 해물 1 볼륨 (예를 들어 400 μL)를 추가하여 샘플을 침전 메탄올 하나의 볼륨 (400 μL) 0.5 볼륨 (200 μL) 클로로포름을 추가합니다. </li><li> 소용돌이 샘플 및 스핀 (10,000 XG, 2 분). </li><li> 두 단계 원심 분리 다음 나타납니다합니다. 상위 계층 (조심 인터페이스를 방해하지)의 모든하지만 2mm를 폐기하십시오. </li><li> 메탄올의 1 볼륨 (400 μl를) 추가, 반전 튜브는 부드럽게 (10,000 XG, 15 분) 혼합하고 다시 스핀 1-2X. 3 ~ 4 분 동안 낭비 뜨는 공기 건조 펠렛을 폐기하십시오. </li></ol> 8. 트립신 소화 <ol><li> (50)의 비율을 1 M 우레아를 함유하는 25 mM의 중탄산 암모늄의 트립신 재구성 : 1 (W / W 단백질 : 트립신) 및 비켜 인큐베이션바람직하게는 써모 700 rpm에서 37 ° C에서 rnight. </li><li> 스핀 (10,000 XG, 15 분) 소화되지 않은 물질을 펠렛. 새로운 튜브에 뜨는을 전송합니다. </li></ol> 9. 포스 포 심화 <ol><li> 이전 18 설명 된대로 소화 트립신에서 정제 및 인산 화합물의 농축을 수행합니다. 350 ㎎ / ㎖의 2,5- dihydrobenzesulfonic 벤조산 (DHB), 80 % (V / V) ACN (아세토 니트릴), 2 % (v / v)의 TFA (트리 플루오 : 트립신 펩티드에게 DHB 완충액에서 10 배 희석 [DHB 버퍼 이루어져 산)] 및 티오 2 구슬 (200 μg의)를 건조에 적용됩니다. </li><li> 1 시간 동안 실온에서 회 전자에 둡니다. </li><li> , DHB 버퍼와 샘플을 씻으 스핀 뜨는을 제거합니다. 그런 다음 샘플을 세척 버퍼 [80 % ACN (v / v)의 2 % TFA (v / v)로] DHB를 제거하려면로 3 회 세척한다. </li><li> 최종 스핀 후 직접 2.5 % 수산화 암모늄 25 μL, pH가 10.5 ≥ 용액을 첨가하여 용출 완충제를 사용하여 포스 포 용출. 에스핀과 상층 액을 제거합니다. 즉시 ~ 0.3 μL 포름산으로 중화. </li></ol>

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E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Use+of+differential+isotopic+labeling+and+mass+spectrometry+to+analyze+capacitation-associated+changes+in+the+phosphorylation+status+of+mouse+sperm+proteins.">Use of differential isotopic labeling and mass spectrometry to analyze capacitation-associated changes in the phosphorylation status of mouse sperm proteins.</a> J. Proteome. Res. 8, 1431-1440 (2009).</li></ol>

The authors declare that they have no competing financial interests.

정자의 성공 재현 단백질체 분석을위한 중요한 단계는 다음과 같습니다 출발 물질의 1) 순도; 원치 않는 염 및 세제의 2) 제거; 트립신은 단백질의 높은 수율을 소화 할 수 있도록하기 위하여 3) 그들의 전체 범위로 단백질을 변성 및 4) 펩티드의 손실을 줄이기 위해 처리 샘플을 최소화한다. 성공적 카우의 부고환 역류하기 위해서는, 정충 종료되는 사이의 영역을 찾는 것이 필수적이다. 랫트와 마우스 모두의 경우에, 이것은 부고환 꼬리 영역의 중앙에 (도 2A 참조), 오목 영역의 정점이다. 하나 정관 향해 더 오면 역세가 용이하고 성공 확률이 높다. 그러나, 이것은 정자 번호 손실 온다. 하나 이상의 코퍼스 근위 이동하려고 낸다면 압력의 양은 epididym 통해 다시 밀어 정자 필요알 덕트는 부고환에 손상이 필연적으로 발생, 종종 너무 높다. 부고환 역세 전통적 정자 22-25을 제거하기 위해 물을 포화 광유 매체로서 주사기 자체 평형 염 용액을 사용하여 수행된다. 두 절차는 LC-MS의 잠재적 문제가있다. 첫째, 미네랄은 그 어느 것도 절차에 이월되지 않도록주의해야한다 기본적으로 프로테옴 분석 및 관리에 전 세계적으로 사용되는 나노 C18 나노 열을 차단하는 것입니다. 이 경우, 그것은 계속 불가능하고 샘플을 본질적으로 손실된다. 이것은이 성공적이지만, 조만간 BWW 용액을 접촉한지 마자 정자 많은 운동성되어 있다고 인식하고, 꼬리 부고환 혼합 그러나 BWW 또는 주사기 다른 균형 염 용액의 사용에 의해 극복 될 수있다 세포. 이 문제를 회피하기 위해 우리는 단순히 공기와 정자를 백 플러시. 뿐만 아니라이다 QUAL액체 기반의 방법에 필적 정자의 성만하지만, 양이 동일하다. Phosphoproteomics 아마도 신호 전달 경로가 정자 포스트 사정에서 발생되는 확립 할 수있는 유일한 방법 중 하나입니다. 우리가 조사중인 주요 경로 중 하나는 capacitation하는 과정입니다. 이 난자에 결합 할 전에 정자는 &quot;capacitation&quot;을 거쳐야. 실제로, 이는 시간 동안 인큐베이션하여 정자 기본적으로 달성된다 (랫트에서 1.5 시간, 40 분 마우스 인간 3-24 시간) 혈청 알부민 용액 BWW. 이전에, 우리와 다른 capacitation에 관련된 여러 키나제의 역할을 보여 주었다. 관심, PKA의 삭제 II는 누구의 정자를 체외에서 자발적으로 수영 마우스를 생산하지만, hyperactivation (26)를받을 수 없습니다 μ. 후자는 정자가 낮은, 높은 속도, 낮은 진폭에서 자신의 수영 패턴을 변경함으로써, capacitation의 특징이다속도, 높은 진폭은 주파수를 이겼다. 우리는이 과정에 참여 다운 스트림 키나제가 pp60-CSRC (SRC)를 포함 보여 주었다 13,27 C-예 (28)와 C-ABL (14). 흥미롭게도, SRC의 억제는 capacitation에 의존하는 티로신 인산화 (13)를 중지합니다. 그러나, 이는 SRC 직접 티로신 인산화 (29)의 일반적인 발병에 관여하지 않고, 29 포스파타제 조절할 수 있음을 시사 okadaic 산으로 극복 될 수있다. 부고환에서 정자를 강제로 매체로 BWW 사용에 문제는 한 번 활성화, 마우스 정자 만 ...의 자격을 주다 약 40 분 소요됩니다. 정자의 분리가 5 분 / 마우스와 종종 여러 생쥐 실험에서 사용되는 걸릴 수 있음을 감안할 때, 다음 정자 실험의 시작 성숙의 다른 단계에있을 것입니다. 이것을 극복하기 위해, 공기 압력은 유리로 꼬리 정맥에서 부고환 정자 푸시 할 수있다. 뿐만 아니라 모든 정자 INACT 있습니다필자 그들이 꼬리 환경에서 발견되는 바와 본질적으로, 그것이 가능 운동성 및 운동성 phosphoproteomics과 비교한다. 두 개의 상이한 기능에 정자 상태를 비교할 때 phosphoproteomics 핸들링 샘플을 최소로 유지되어야한다. 단백질 침전 1)의 다른 전통적인 방법에 비해 메탄올의 클로로포름을 사용하는 2) 염 및 지방의 거의 모든 흔적을 제거하고 3) TCA (19) 위에 낮은 풍부한 단백질을 침전 입증 된 능력을 가지고, 추가적인 세척 단계에 대한 필요성을 감소시킨다. 트립신 소화하기 전에 단백질 침전 단백질 (트립신 에이즈 소화하는) 변성이 도움을 수행하지만 세포에 존재하는 MS와 호환되지 않는 대사 산물의 대부분을 제거뿐만 아니라 이후 좋습니다. 정자 포스 포의 비교는 다수의 방식으로 수행 될 수있다. 다른 것과의 기본 레벨, 하나의 샘플에서의 포스 포 식별 단순 비교에서&quot;스펙트럼 계수&quot;로 알려진 과정에서 샘플은 행해질 수있다. 초기 단백질체 연구는 낮은 복제물을 사용하고 있기 때문에 비판은 기본적으로이 방법에있다 (풀러 논의 Lundren 등. 30 참조). 더 정교한 접근은 펩티드 모 질량의 강도를보고, 다른 샘플 (라벨없는 비교 예)와이를 비교하는 것이다. 도 4에 도시 된 예에서, m / z 650-670에서 운동성에서 (도 4 위)로부터 존재하지만 운동성 존재 펩티드 (도 4 하단) 정자는 알 수있다. MS 기반의 라벨없는 정량화라고도이 프로세스는, 라벨없는 전략이다. 일반적 단백체 실행에 필요한 정량의 양을 감소시키기 위해 사용 들여서는 동위 원소를 사용하는 것이다. 동위 원소의 질량이 다르므로, 질량 분석기는 엘 루트의 세기를 비교하기 위해 사용될 수있다펩티드를 보내고. 그러나, 대부분의 다른 세포 유형과 달리, 일부 동위 원소 표지는 정자 적용 할 수 없다. 조직 배양에 사용될 수있는 예를 들면, 안정 동위 원소를 첨가 (버전이 다른 점화기에 첨가되는 동안 하나의 무거운 동위 원소, 하나의 샘플에 더해진다). 동위 원소가 혼입 된 단백질 얻을 때, 단백질 체학 분석은 두 샘플 (다중화)을 조합함으로써 수행 될 수있다. 그러나 정자의 경우, 이는, 1) 동위 원소 표지가 조직 배양에서 (~ 8)까지 여러 통로를 필요로하며, 2) 정자 세포가없고 따라서 핵 유전자 전사와 번역이없고, 단순히 사실 덕분에, 수행 할 수없는 어쨌든 그들은 모든 단백질에 동위 원소를 포함 할 수 없습니다. 이 주위에 한 가지 방법은 방사성 동위 원소를 마우스를 주문하는 것입니다, 그러나, 이러한 악명 비싸다. 대안적인 접근은 화학적 태그를 사용하는 것이다. 이 비 capacitated 마우스를 capacitated 마우스와 비교했을 때 수행되었습니다. 이 경우, D와 D 0에서 <sub&gt; 3 -label이 질량 분석기 (31)과 다른 하나의 샘플을 구별하기 위해 사용되었다. 다른 접근 방법은 라이신이 다른 질량 동위 원소와 화학적으로 표시되어있다 iTRAQ (상대 및 절대 정량 압법 태그)의 사용을 포함 할 수있다; 시스테인이 다른 질량 동위 원소 무거운 빛 물 라벨에 표시되어있다 스패 ​​터 주입 및 분사기 TMS-VI (동위 원소 코딩 선호도 태그). 각각의 모든 경우에, 그러나, 한가지 명심해야한다. MS는 샘플에 존재하는 것을보고, 이것은 그 시점에 그 샘플까지 일어난 모든 것을 반영한다. 각 단계에서의 수율을 최대화하는 동안 시료 처리를 최소화하는 것이 성공적인 프로테옴 분석을 위해 필요하다.

고환에서 등장하는 데, 정자는 매우 아직 현저하게 차별화된다,이 세포는 1, 2 미숙. 이와 같이, 이들은 3 개의 난자 헤엄 능력 인드 포함한 완전한 기능이 부족하다. 정자 세포의 성숙이 더 필요하지만 그들의 세포 분화 과정이 단계들은 유전자 전사와 상기 단백질 생합성 4 없게되어 있기 때문에, 이것은 표준적인 경로를 통해 이루어질 수 없다. 그들은 정소두고 부고환 5라고도 남성 생식 기관의 일부를 입력 생물학적 능력이 정자에게 부여된다. 부고환은 정관에 (고환) 원심성 덕트를 연결하고 모든 남성 포유 동물 6에 존재 단단히 코일, 차별화 된 관입니다. 정자는 점진적으로 CR은 끊임없이 변화하는 내강 환경에 의존, 부고환 하강하는 동안 그들의 시비 가능성을 취득로컬 부고환 상피 세포 7 어갈. 부고환 환경의 행동에 존재하는 다양한 분비 및 재 흡수 활동은 단백질, 탄수화물 및 지질 성분 (6)을 변경, 정자 자체를 수정합니다. 이러한 구성의 특히 초기 &#39;CAPUT&#39;영역 부고환의 중요성은, 외과 용 결찰 기법을 이용하여 8 예로 들었다. 원심성 덕트 결찰에 의해 고환 내에서 유지 정자는 완전히 난자 9-11을 비옥하게하기 위해 어떤 능력이 부족합니다. 부고환 환경에 더하여, 정자 워크 내 신호 전달 경로는 전기 - 병진 기존 정자 세포 보충을 수정한다. 예를 들어, 부고환 초기 영역에서 정자 이러한 후자의 영역 -5,12- 비해 단백질 인산화의 다른 패턴을 표시. C 광대 차이가 있기 때문에 이는 놀랍지 않다이 지역에서 정자의 apability. 예를 들어, 초기의, 부고환 CAPUT 정자는 immotilite이다. 대조적으로, 카우 영역으로부터 정자 앞으로 한번 등장 매질에 배치 프로그레시브 운동성을 받게 될 것이다. 부고환 정자 세포가 드 노보 단백질 생합성 능력이 있기 때문에, 정자의 기능을 조절하는 모든 고유 경로는 번역 후 변형 (PTM)를 통해해야합니다. 따라서, 그 단백질 체학을 당연한, 우리는 정자 세포 성숙을 이해하는 경우 특히 이러한 인산화 등 PTMS의 조사는 큰 추력을해야합니다. 다른 방법은 13 ~ 16 복고풍 백 플러싱 사용 epididymidies에서 정자를 얻을 수있다. 이 기술은 확실히 더 많은 시간이 소모되며 조작자의 지식을 가진 큰 정도 소요되지만, 정충 일관 99.99 % 이상의 순도를 입증 수득. 또한, 모든 다른 기술과는 달리, 정자의 CAN 가능 정자 운동성이 개시되는 방법 공부하게 정지 상태로 단리 할. 샘플 준비가 단백질체 분석에 가장 중요한 측면이므로, 정자의 분리 정자 프로테오믹스 연구의 가장 중요한 측면 중 하나가되고있다. 이 프로토콜은 카우의 부고환에서 분리하는 방법 정자에 대한 설명을 제공합니다. 이어서, 형성된 티오 포스 포이 농축 과정은 고도로 분화 된 세포로부터 정자 펩티드를 추출하는 방법에 대한 참조로, 개략되어있다. MS 접근법은 하나 하나의 상태에 꼬리 부고환 정자과 비교한다면 변화 포스 포를 구별하는데 사용될 수있다 (immotile 또는 비 capacitated) 정자 공부이에게 강력한 접근 방식을 (등 반응 운동성 capacitated, 첨체) 다른 기능.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="687">
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Name of Material/ Equipment</td>
			<td style="width:175px;">Company</td>
			<td style="width:129px;">Catalog Number</td>
			<td style="width:167px;">Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2,5-dihydroxy-1,4-benzoquinone</td>
			<td>Aldrich</td>
			<td>195464</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2-D Quantitation Kit</td>
			<td>VWR (GE Healthcare)</td>
			<td>80-6483-56</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Albumin from bovine serum</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A7030</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ammonia Solution 25%</td>
			<td>Merck</td>
			<td>1.05432</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ammonium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>A6141</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Calcium Chloride</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>C5080</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">CHAPS 3-[3-(cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfonate</td>
			<td>Research Organics</td>
			<td>1300C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Chloroform</td>
			<td>BDH</td>
			<td>10077.6B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">di-sodium hydrogen phosphate</td>
			<td>Merck</td>
			<td>1.06580</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Dithiothreitol (DTT)</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>D9779</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Formic Acid</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>O6440</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Glucose</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>G6152</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Glutamine-L</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>G7513</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Hepes (free acid)</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>H3375</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Iodoacetic acid free acid</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>I4386</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Lactic Acid</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L1750</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Magnesium Chloride</td>
			<td>Res. Org.</td>
			<td>0090M</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Methanol</td>
			<td>Merck</td>
			<td>10158.6B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Percoll (sterile)</td>
			<td>VWR (GE Healthcare)</td>
			<td>GEHE17-0891-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Phosphatase Inhibitor Cocktail Halt</td>
			<td>ThermoFisher Scientific (Pierce)</td>
			<td>PIE78420</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Potassium Chloride</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>P9333</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Potassium Hydrogen Carbonate</td>
			<td>Medical Store</td>
			<td>CH 600</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sodium Bicarbonate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S3817</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sodium Chloride&#160;</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S7653</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sodium di-hydrogen phosphate</td>
			<td>Merck</td>
			<td>1.06346</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sodium hydrogen carbonate</td>
			<td>BDH</td>
			<td>10247.4V</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sodium Pyruvate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>S8636</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Tris Ultra Pure Grade</td>
			<td>Amresco (Astral)</td>
			<td>AM0497</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trypsin Gold-Mass Spec Grade</td>
			<td>Promega</td>
			<td>V5280</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Urea</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>U5128</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Zinc Chloride</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>Z0173</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">0.4 mm polyethylene tubing</td>
			<td style="width:175px;">Goodfellow</td>
			<td style="width:129px;">ET317100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">30 gauge needle</td>
			<td style="width:175px;">Terumo</td>
			<td style="width:129px;">NN2038R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">3 mL syringe</td>
			<td style="width:175px;">Terumo</td>
			<td style="width:129px;">SS035</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">4.2 mm polyethylene tubing</td>
			<td style="width:175px;">Goodfellow</td>
			<td style="width:129px;">ET317640</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Braided silk (5-0)</td>
			<td style="width:175px;">Dynek</td>
			<td style="width:129px;">CSS0100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trichloroacetic acid</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>299537</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">TiO2 beads (from disassembled column)</td>
			<td style="width:175px;">Titansphere</td>
			<td style="width:129px;">6HT68003</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Eppendorf Tube</td>
			<td style="width:175px;">Eppendorf</td>
			<td style="width:129px;">22431081</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">C7B30</td>
			<td style="width:175px;">Sigma</td>
			<td style="width:129px;">C0856</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

phosphopeptide analysis of rodent epididymal spermatozoa

정자는 세포 유형의 사이에 매우 독특합니다. 고환에서 생산하지만 사전 커서 라운드 셀 연장과 형태 학적으로 정자로 인식되고 무엇으로 분화하기 시작하면, 모두 핵 유전자 전사 및 번역이 꺼져 있습니다. 그러나, 정자 운동성 또는 계란에 대한 인식 능력을 갖지 않는, 매우 미성숙하다. 이들 이벤트 모두 정자 통과되면 부고환으로 알려진 보조 기관을 발생한다. 정자 세포 부고환 통과 걸리는 ~ 십이일 통로 중에 존재하는 단백질의 번역 후 변형은 세포의 성숙에 중추적 역할을한다. 그러한 하나의 중요한면은 단백질 인산화이다. 정자 성숙 중에 일어나는 인산화를 특성화하기 위하여, 순수한 정자 세포 집단 및 포스 포 사전 분획 모두 확립되어야한다. 순수한 오 정자의 분리를 위해, 방법을 플러싱 기술을 다시 사용말단 또는 꼬리 epididymides에서 F 높은 품질과 수율이 설명되어 있습니다. 가용화, 소화 및 이산화 티탄 친 화성 크로마토 그래피를 통해 정자 포스 포의 사전 분류하는 단계는 설명한다. 격리되면, 유기 인산 화합물은 정자 성숙 과정에서 일어나는 인산화 수준을 특정 아미노산 잔기에 모두 단백질 인산화를 식별하고 정량화하기 위해 MS에 주입 될 수있다.

어떤 단백질체 분석 결과의 품질은 출발 물질에 의존하고있다. 현대 MS로, 샘플 준비에 약간의 오염은 쉽게 선택됩니다. 따라서, 고순도의 정자를 제공하는 방법을 선택하는, 정자 세포 프로테오믹스의 경우, 중요하다. 도 1에 도시 된 바와 같이, 역행 역세는 카우의 부고환에서 정자를 검색하는 데 사용된다. 이것은 하나 천천히 부착 된 주사기에서 공기 압력을 적용 할 수 있습니다 PE 튜브와 정관을 cannulating 포함한다. 그림 1a는 정관과 함께 카우의 부고환을 보여줍니다. 그림 1B는 정관이 연결되는 방식의 근접 촬영입니다 캐 뉼러를 삽입됩니다. 이 과정에서, 그래서 정자는 꼬리 epididymides에서 한 세관의 절제 끝에서 방출된다. 도 2a에 도시 된 바와 같이,이 정자 caud의 정점 영역에서 추출부고환과는 정지 상태 (그림 2B)에 유리 모세관에 빨려된다. 이 이전과 운동의 활성화 후 정자의 phoshoproteomic 분석을 수행 할 수있는 능력이다 조금도있는 전통적인 &quot;수영 - 업&quot;방법에 비해 몇 가지 장점을 가지고있다. 정자는 다음 중 하나의 선택의 매체로 추방 될 수있다. 그림 2C (왼쪽)은 정자가 BWW 미디어로 추방 후 즉시보고하는 방법을 보여줍니다. 세포의 대부분은 뭉쳐있다. 그들이 용액 (도 2C, 우측 셀) 내로 균일 밖으로 수영 때문에, 세포의 10 분 후 능력이 증명된다. 백 플러싱 기술은 정자 세포에 거의 영향을 가지고 있기 때문에, 우리는 가까운 100 % 운동을 획득하고 세포가 외부 자극없이 미디어로 빠르게 분산. 일반적인 백 플러싱 실험에서 정자는 스위스 - 마우스가 포함되어에서 복구6 10 × 1-5 사이의 세포. 이것은 동물의 나이에 크게 의존와 마우스의 다른 균주에 따라 다를 수 있습니다. 노르웨이 쥐, 우리는 일반적으로 200 × 106 정자를 얻을, ± 20 %. 그림 2D는 쥐 카우의 부고환에서 얻은 정자의 순도를 나타냅니다. 샘플 자체 외에, 샘플 제조에 관한 주요한 문제점 중 하나는 트립신 소화 수율이다. 단백질 침전뿐만 아니라 단백질의 변성,뿐만 아니라 MS와 호환되지 않는 둘 불필요한 세제 염을 제거에 중요한 역할을한다. 우리는 최선을 작업 할 수있는 메탄올 - 클로로포름 침전을 발견했다. 뿐만 아니라,이 절차는 TCA 침전 (19) 등 다른 것보다 더 낮은 풍부한 단백질을 침전보고되어 있지만, 부가적인 장점을 가지고있다. TCA 침전 후, 꽤 남아있을 수 TCA 펠릿 정지 후 pH를 다시​​ 조정하는 것이 필요하다산성. TCA 침전의 펠렛 아세트산을 제거 높은 유기 용액으로 세정 될 수 있지만, 이는 처리 및 결과 irreproducibility 견본을 추가한다. 산을 중화 않으면 가난한 트립신 펩티드 수율 발생합니다. 메탄올 - 클로로포름 침전뿐만 아니라 퀵하지만 샘플을 산성화하지 않을 것이다. (3)은 일반적으로 상부 및 하부 사이의 상간 100 μg의 샘플에서 본 단백질 펠렛을 도시한다. 인산 화합물의 분리는 다수의 방식으로 발생할 수있다; 그러나 재현성이 샘플이이 단계를 포함까지 취급 된 방법에 따라 달라집니다. 일반적인 개발 방법 중 하나는 티오 2, 원래 마틴 라센 18,20,21의 그룹에 의해 개발했다. 마이크로 컬럼에 사용하기위한 프로세스로서 설명했지만, 우리는 일괄 크로마토 그래피를 이용하여 재생 가능한 데이터를 획득 할 수있다. 프로세스의 성공은 용출 버퍼에 크게 의존, 미친있는이어야합니다<html> 올바른 구성과 전자; 그렇지 않으면 인산 화합물이 전혀 용출되지 않습니다. 이산화 티탄의 프로토콜과 대표 데이터의 재현성이 아닌 운동성 (그림 4 위)과 m에서 운동성 (그림 4 하단) 상태에서 카우의 부고환 정자에서 포스 포 농축 / Z 650-670 볼 수 있습니다. 우리는이 생물 복제합니다 (17)를 사용하여도 매우 재현 기술이 있음을 증명하고있다. 시간이 지남에 따라 나타나는 청색 줄무늬 아세토 니트릴의 농도가 증가로서 C18 나노 컬럼으로부터 용출 된 펩타이드이다. 분명히, 운동성 인구 (N = 3, N = 8 도시 전형적 실행), 비 - 운동성 범위에 완전히 존재하지 않는 다 651.5 범위 주위 모노 이소 ​​토픽 질량, 펩티드 클러스터있다. 탠덤 질량 분석은 다음이 펩티드를 식별하는 데 사용된다. 546 / 51546fig1highres.jpg &quot;/&gt; 그림 1 :. 카우의 부고환의 카우의 부고환의 캐 뉼러 (A) 그림. 정맥 자체는 미리 뽑아 끝 부분의 약 1-2cm를 노출 아래로 녹화됩니다. 이는 미세 # 1 5watchmakers 집게를 사용 정관에 삽입된다. (B) 캐 뉼러 정관과 캐 뉼러를 모두 포함 세그먼트 주위에 잘 실크 매로 고정된다. 마우스에서 꼬리 부고환 세포 및 유체의 약 2-3 μL를 1 × 106 / μL의 농도로 수집된다. 쥐 (도시)에서 유체의 약 30 ~ 40 μl의 비슷한 농도를 얻을 수있다. <img alt="그림 2" src="/files/ftp_upload/51546/51546fig2highres.jpg" /> 그림 2 : 유능한 부고환 정자를 수집하는 데 사용되는 유리 모세관. (A) 카우 전자의 정점에서 하나의 가느 다란 관<html> pididymis 격리 및 깨진 것입니다. 이 도시되어 발생되는 대략적인 위치. (B) 이미지의 상단에는 빈 유리 모세관 튜브를 표시하고 아래는 이전에 백 플러싱 쥐에서 하나 보여줍니다. 더 혈액 오염을 최소화 상피 세포 오염이 없습니다. (C) 정자가 여전히 부고환 액에 희석하지 않았을 아르, 그들은 활성화하기 시작하지 않았습니다. 정자가 처음 BWW 솔루션으로 추방 될 때, 컴팩트 &quot;문자열&quot;(왼쪽)으로 나와. 10 분 후에 정자의 대부분은 어떠한 외란 (오른쪽)없이 용액에 수영 때문에 셀의 능력을 용이하게 확립된다. (D)들이 수영 왼쪽왔다 직후 꼬리 부고환 세포의 분취 량 포토 아웃 세포의 순도를 보여준다. g3highres.jpg &quot;/&gt; 그림 3 :. 메탄올 - 클로로포름 침전되면 정자 용해왔다, 가용성 분획 메탄올 - 클로로포름은 단백질과 오염 물질의 제거의 변성을 보장하기 위해 침전이다. 단백질 펠렛은 메탄올 / 물과 클로로포름 단계 사이의 인터페이스에 나타납니다. 이 펠렛을 방해하지 않도록 조심스럽게 상층을 제거한다. 그것은 어떤 단백질이 손실되지 않도록 상위 단계의 2 ~ 3 mm로 떠날 것이 일반적이다. <img alt="그림 4" fo:content-width="6in" src="/files/ftp_upload/51546/51546fig4highres.jpg" width="600" /> 그림 4 :. 일반적인 이산화 티탄 풍성 포스 포 프로필 설명 프로토콜을 사용하여, 꼬리 부고환 정자는 (상위 N = 3) immotile 하나에서 분리되었다 또는 운동성이있는 상태 (아래, N = 3). ~ 651.5 D의 단일 동위 원소 질량 펩타이드 클러스터이 immotile 것 (화살표)에서 운동성이 인구에 존재하지만 완전히없는 것으로 표시됩니다. 이러한 특성의 비교는 &quot;이 라벨없는 (MS는 기반)&quot;라고 칭한다. 펩티드 질량 및 체류 시간은 다음 펩티드로부터 유래 된 단백질을 탠덤 질량 분석 용 화합물을 대상으로 식별하는 데 사용된다.

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Phosphopeptide Analysis of Rodent Epididymal Spermatozoa

Proteomic analysis of any cell type is highly dependent on both purity and pre-fractionation of the starting material in order to de-complexify the sample prior to liquid chromatography mass spectrometry (MS). By using back-flushing techniques, pure spermatozoa can be obtained from rodents. Following digestion, phosphopeptides can be enriched using TiO2.

설치류 부고환 정자의 포스 포 분석

Spermatozoa are quite unique amongst cell types. Although produced in the testis, both nuclear gene transcription and translation are switched off once ...

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Research

JoVE Journal

Biology

12.8K 조회수.  University of Newcastle. Proteomic analysis of any cell type is highly dependent on both purity and pre-fractionation of the starting material in order to de-complexify the sample prior to liquid chromatography mass spectrometry (MS). By using back-flushing techniques, pure spermatozoa can be obtained from rodents. Following digestion, phosphopeptides can be enriched using TiO2.

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Primary Dissociated Midbrain Dopamine Cell Cultures from Rodent Neonates

The ability to create primary cell cultures of dopamine neurons allows for the study of the presynaptic characteristics of dopamine neurons in isolation from systemic input from elsewhere in the brain. In our lab, we use these neurons to assess dopamine release kinetics using carbon fiber amperometry, as well as expression levels of dopamine related genes and proteins using quantitative PCR and immunocytochemistry. In this video, we show you how we generate these cultures from rodent neonates.
The process involves several steps, including the plating of cortical glial astrocytes, the conditioning of neuronal cell culture media by the glial substrate, the dissection of the midbrain in neonates, the digestion, extraction and plating of dopamine neurons and the addition of neurotrophic factors to ensure cell survival.
The applications suitable for such a preparation include electrophysiology, immunocytochemistry, quantitative PCR, video microscopy (i.e., of real-time vesicular fusion with the plasma membrane), cell viability assays and other toxicological screens.

Primary dissociated midbrain dopamine cell cultures allow for the study of presynaptic characteristics of dopamine neurons. They can be used to monitor real-time dopamine release kinetics and protein/mRNA levels of regulators of dopamine exocytosis. Here, we show you how to generate these cultures from rodent neonates.

쥐 Neonates에서 기본 Dissociated Midbrain의 도파민 세포 문화

The ability to create primary cell cultures of dopamine neurons allows for the study of the presynaptic characteristics of dopamine neurons in isolation ...

연구

생물학

A Neuronal and Astrocyte Co-Culture Assay for High Content Analysis of Neurotoxicity

High Content Analysis (HCA) assays combine cells and detection reagents with automated imaging and powerful image analysis algorithms, allowing measurement of multiple cellular phenotypes within a single assay. In this study, we utilized HCA to develop a novel assay for neurotoxicity. Neurotoxicity assessment represents an important part of drug safety evaluation, as well as being a significant focus of environmental protection efforts. Additionally, neurotoxicity is also a well-accepted in vitro marker of the development of neurodegenerative diseases such as Alzheimer's and Parkinson's diseases. Recently, the application of HCA to neuronal screening has been reported. By labeling neuronal cells with &beta;III-tubulin, HCA assays can provide high-throughput, non-subjective, quantitative measurements of parameters such as neuronal number, neurite count and neurite length, all of which can indicate neurotoxic effects. However, the role of astrocytes remains unexplored in these models. Astrocytes have an integral role in the maintenance of central nervous system (CNS) homeostasis, and are associated with both neuroprotection and neurodegradation when they are activated in response to toxic substances or disease states. GFAP is an intermediate filament protein expressed predominantly in the astrocytes of the CNS. Astrocytic activation (gliosis) leads to the upregulation of GFAP, commonly accompanied by astrocyte proliferation and hypertrophy. This process of reactive gliosis has been proposed as an early marker of damage to the nervous system. The traditional method for GFAP quantitation is by immunoassay. This approach is limited by an inability to provide information on cellular localization, morphology and cell number. We determined that HCA could be used to overcome these limitations and to simultaneously measure multiple features associated with gliosis - changes in GFAP expression, astrocyte hypertrophy, and astrocyte proliferation - within a single assay. In co-culture studies, astrocytes have been shown to protect neurons against several types of toxic insult and to critically influence neuronal survival. Recent studies have suggested that the use of astrocytes in an in vitro neurotoxicity test system may prove more relevant to human CNS structure and function than neuronal cells alone. Accordingly, we have developed an HCA assay for co-culture of neurons and astrocytes, comprised of protocols and validated, target-specific detection reagents for profiling &beta;III-tubulin and glial fibrillary acidic protein (GFAP). This assay enables simultaneous analysis of neurotoxicity, neurite outgrowth, gliosis, neuronal and astrocytic morphology and neuronal and astrocytic development in a wide variety of cellular models, representing a novel, non-subjective, high-throughput assay for neurotoxicity assessment. The assay holds great potential for enhanced detection of neurotoxicity and improved productivity in neuroscience research and drug discovery.

This article describes a novel protocol and reagent set designed for sensitive measurement of neurotoxic effects of compounds and treatments on co-cultures of neurons and astrocytes using high content analysis. Results demonstrate that high content analysis represents an exciting novel technology for neurotoxicity assessment.

Neurotoxicity 높은 컨텐츠 분석의 연결 및 Astrocyte 공동 문화 분석

High Content Analysis (HCA) assays combine cells and detection reagents with automated imaging and powerful image analysis algorithms, allowing ...

Ex vivo Method for High Resolution Imaging of Cilia Motility in Rodent Airway Epithelia

An ex vivo technique for imaging mouse airway epithelia for quantitative analysis of motile cilia function important for insight into mucociliary clearance function has been established. Freshly harvested mouse trachea is cut longitudinally through the trachealis muscle and mounted in a shallow walled chamber on a glass-bottomed dish. The trachea sample is positioned along its long axis to take advantage of the trachealis muscle to curl longitudinally. This allows imaging of ciliary motion in the profile view along the entire tracheal length. Videos at 200 frames/sec are obtained using differential interference contrast microscopy and a high speed digital camera to allow quantitative analysis of cilia beat frequency and ciliary waveform. With the addition of fluorescent beads during imaging, cilia generated fluid flow also can be determined. The protocol time spans approximately 30 min, with 5 min for chamber preparation, 5-10 min for sample mounting, and 10-15 min for videomicroscopy.

Ex vivo Method for High Resolution Imaging of Cilia Motility in Rodent Airway Epithelia

An easy and reliable technique for visualizing and quantifying airway cilia motility and cilia generated flow using mouse trachea is described. This technique can be modified to determine how a wide range of factors influence cilia motility, including pharmacological agents, genetic factors, environmental exposures, and/or mechanical factors such as mucus load.

설치류기도 상피의 섬모 운동성의 높은 해상도 이미지를위한 생체 방법

An ex vivo technique for imaging mouse airway epithelia for quantitative  analysis of motile cilia function important for insight into mucociliary  ...

Transgenic Rodent Assay for Quantifying Male Germ Cell Mutant Frequency

De novo mutations arise mostly in the male germline and may contribute to adverse health outcomes in subsequent generations. Traditional methods for assessing the induction of germ cell mutations require the use of large numbers of animals, making them impractical. As such, germ cell mutagenicity is rarely assessed during chemical testing and risk assessment. Herein, we describe an in vivo male germ cell mutation assay using a transgenic rodent model that is based on a recently approved Organisation for Economic Co-operation and Development (OECD) test guideline. This method uses an in vitro positive selection assay to measure in vivo mutations induced in a transgenic &#955;gt10 vector bearing a reporter gene directly in the germ cells of exposed males. We further describe how the detection of mutations in the transgene recovered from germ cells can be used to characterize the stage-specific sensitivity of the various spermatogenic cell types to mutagen exposure by controlling three experimental parameters: the duration of exposure (administration time), the time between exposure and sample collection (sampling time), and the cell population collected for analysis. Because a large number of germ cells can be assayed from a single male, this method has superior sensitivity compared with traditional methods, requires fewer animals and therefore much less time and resources.

De novo mutations in the male germline may contribute to adverse health outcomes in subsequent generations. Here we describe a protocol for the use of a transgenic rodent model for quantifying mutations in male germ cells induced by environmental agents.

형질 전환 쥐 분석 정량화 남성 생식 세포 돌연변이 주파수에 대한

De novo mutations arise mostly in the male germline and may contribute to adverse health outcomes in subsequent generations. Traditional methods for ...

Rodent Working Heart Model for the Study of Myocardial Performance and Oxygen Consumption

Isolated working heart models have been used to understand the effects of loading conditions, heart rate and medications on myocardial performance in ways that cannot be accomplished in vivo. For example, inotropic medications commonly also affect preload and afterload, precluding load-independent assessments of their myocardial effects in vivo. Additionally, this model allows for sampling of coronary sinus effluent without contamination from systemic venous return, permitting assessment of myocardial oxygen consumption. Further, the advent of miniaturized pressure-volume catheters has allowed for the precise quantification of markers of both systolic and diastolic performance. We describe a model in which the left ventricle can be studied while performing both volume and pressure work under controlled conditions. 
In this technique, the heart and lungs of a Sprague-Dawley rat (weight 300-500 g) are removed en bloc under general anesthesia. The aorta is dissected free and cannulated for retrograde perfusion with oxygenated Krebs buffer. The pulmonary arteries and veins are ligated and the lungs removed from the preparation. The left atrium is then incised and cannulated using a separate venous cannula, attached to a preload block. Once this is determined to be leak-free, the left heart is loaded and retrograde perfusion stopped, creating the working heart model. The pulmonary artery is incised and cannulated for collection of coronary effluent and determination of myocardial oxygen consumption. A pressure-volume catheter is placed into the left ventricle either retrograde or through apical puncture. If desired, atrial pacing wires can be placed for more precise control of heart rate. This model allows for precise control of preload (using a left atrial pressure block), afterload (using an afterload block), heart rate (using pacing wires) and oxygen tension (using oxygen mixtures within the perfusate).

Isolated working heart models can be used to measure the effect of loading conditions, heart rate, and medications on myocardial performance and oxygen consumption. We describe methods for preparation of a rodent left heart working model that permits study of systolic and diastolic performance and oxygen consumption under various conditions.

심근 성능 및 산소 소비의 연구에 대한 설치류 작업 심장 모델

Isolated working heart models have been used to understand the effects of loading conditions, heart rate and medications on myocardial performance in ways ...

Laboratory Protocol for Genetic Gut Content Analyses of Aquatic Macroinvertebrates Using Group-specific rDNA Primers

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the invasion of non-indigenous species. However, an exact identification of field predator-prey interactions is difficult in many cases. These analyses are often based on a visual evaluation of gut content or the analysis of stable isotope ratios (&#948;15N and &#948;13C). Such methods require comprehensive knowledge about, respectively, morphologic diversity or isotopic signature from individual prey organisms, leading to obstacles in the exact identification of prey organisms. Visual gut content analyses especially underestimate soft bodied prey organisms, because maceration, ingestion and digestion of prey organisms make identification of specific species difficult. Hence, polymerase chain reaction (PCR) based strategies, for example the use of group-specific primer sets, provide a powerful tool for the investigation of food web interactions. Here, we describe detailed protocols to investigate the gut contents of macroinvertebrate consumers from the field using group-specific primer sets for nuclear ribosomal deoxyribonucleic acid (rDNA). DNA can be extracted either from whole specimens (in the case of small taxa) or out of gut contents of specimens collected in the field. Presence and functional efficiency of the DNA templates need to be confirmed directly from the tested individual using universal primer sets targeting the respective subunit of DNA. We also demonstrate that consumed prey can be determined further down to species level via PCR with unmodified group-specific primers combined with subsequent single strand conformation polymorphism (SSCP) analyses using polyacrylamide gels. Furthermore, we show that the use of different fluorescent dyes as labels enables parallel screening for DNA fragments of different prey groups from multiple gut content samples via automated fragment analysis.

Most common gut content analyses of macroinvertebrates are visual. Requiring intense knowledge about morphological diversity of prey organisms, they miss soft bodied prey and, due to strong comminution of prey, are nearly impossible for some organisms, including amphipods. We provide detailed, novel genetic approaches for macroinvertebrate prey identification in the diet of amphipods.

Macroinvertebrates 사용 하 여 그룹별 수생 rDNA 뇌관의 유전 직감 콘텐츠 분석을 위한 실험실 프로토콜

Analyzing food webs is essential for a better understanding of ecosystems. For example, food web interactions can undergo severe changes caused by the ...

Preparation of Adipose Progenitor Cells from Mouse Epididymal Adipose Tissues

Obesity and metabolic disorders such as diabetes, heart disease, and cancer, are all associated with dramatic adipose tissue remodeling. Tissue-resident adipose progenitor cells (APCs) play a key role in adipose tissue homeostasis and can contribute to the tissue pathology. The growing use of single cell analysis technologies &#8211; including single-cell RNA-sequencing and single-cell proteomics &#8211; is transforming the stem/progenitor cell field by permitting unprecedented resolution of individual cell expression changes within the context of population- or tissue-wide changes. In this article, we provide detailed protocols to dissect mouse epididymal adipose tissue, isolate single adipose tissue-derived cells, and perform fluorescence activated cell sorting (FACS) to enrich for viable Sca1+/CD31-/CD45-/Ter119- APCs. These protocols will allow investigators to prepare high quality APCs suitable for downstream analyses such as single cell RNA sequencing.

We present a simple method to isolate highly viable adipose progenitor cells from mouse epididymal fat pads using fluorescence activated cell sorting.

마우스 전형 지방 조직에서 지방 전구의 준비

Obesity and metabolic disorders such as diabetes, heart disease, and cancer, are all associated with dramatic adipose tissue remodeling. Tissue-resident ...

Rodent Estrous Cycle Monitoring Utilizing Vaginal Lavage: No Such Thing As a Normal Cycle

The current methodology establishes a reproducible, standardized, and cost-effective approach to monitoring the estrous cycle of female Sprague Dawley (SD) adolescent rats. This study demonstrates the complexity of hormonal cycles and the broad spectrum of understanding required to construct a reliable and valid monitoring technique. Through an in-depth examination of principal experimental design and procedural elements,&#160;this description of the cycle and its fundamental principles provides a framework for further understanding and deconstructs misconceptions for future replication.
Along with an outline of the sample collection process employing vaginal lavage, the procedure describes the mechanism of data categorization into the four-stage model of proestrus, estrus, metestrus, and diestrus. These stages are characterized by a new proposed approach, utilizing the 4 categorizing determinants of vaginal fluid condition, cell type(s) present, cell arrangement, and cell quantity at the time of collection. Variations of each stage, favorable and unfavorable samples, the distinction between cyclicity and acyclicity, and graphic depictions of the collected categorizing components are presented alongside effective interpretive and organizational practices of the data. Overall, these tools allow for the publication of quantifiable data ranges for the first time, leading to the standardization of categorization factors upon replication.

This study details the crucial factors to consider in experimental designs involving female rats. In a larger sense, these data serve to decrease stigma and assist in the development of more inclusive diagnostic and intervention tools.

질 세척을 활용한 설치류 에스트로우스 사이클 모니터링 : 정상주기와 같은 것은 없습니다.

The current methodology establishes a reproducible, standardized, and cost-effective approach to monitoring the estrous cycle of female Sprague Dawley ...

Viral Transgene Expression in Rodent Hearts and the Assessment of Cardiac Arrhythmia Risk

Heart disease is the leading cause of morbidity and mortality worldwide. Due to the ease of handling&#160;and abundance of transgenic strains, rodents have become essential models for cardiovascular research. However, spontaneous lethal cardiac arrhythmias that often cause mortality in heart disease patients are rare in rodent models of heart disease. This is primarily due to the species differences in cardiac electrical properties between human&#160;and rodents and poses a challenge to the study of cardiac arrhythmias using rodents. This protocol describes an approach to enable efficient transgene expression in mouse and rat ventricular myocardium using echocardiography-guided intramuscular injections of recombinant virus (adenovirus and adeno-associated virus). This work also outlines a method to enable reliable assessment of cardiac susceptibility to arrhythmias using isolated, Langendorff-perfused mouse and rat hearts with both adrenergic and programmed electrical stimulations. These techniques are critical for studying heart rhythm disorders associated with adverse cardiac remodeling after injuries, such as myocardial infarction.

The present protocol describes methods for transgene expression in rat and mouse hearts by direct intramyocardial injection of the virus under echocardiography guidance. Methods for the assessment of the susceptibility of hearts to ventricular arrhythmias by the programmed electrical stimulation of isolated, Langendorff-perfused hearts are also explained here.

설치류 심장에서의 바이러스 전이 유전자 발현 및 심장 부정맥 위험 평가

Heart disease is the leading cause of morbidity and mortality worldwide. Due to the ease of handling&#160;and abundance of transgenic strains, rodents ...

마우스 부고환에서 유래한 지방 조직 유래 줄기 세포의 1차 배양

Isolation, In Vitro Expansion, and Characterization of Mesenchymal Stem Cells from Mouse Epididymal Adipose Tissue

Mesenchymal stem cells (MSCs) have been extensively studied as a new therapeutic approach, mainly to stop exacerbated inflammation due to their potential to modulate the immune response. The MSCs are immune-privileged cells capable of surviving in immunologically incompatible allogeneic transplant recipients based on low expression of class I major histocompatibility complex (MHC) molecules and in the use of cell-based therapy for allogeneic transplant. These cells can be isolated from several tissues, the most commonly used being the bone marrow and adipose tissues. We provide an easy protocol to isolate, culture, and characterize MSCs from epididymal adipose tissue of mice. The epididymal adipose tissue is surgically excised, physically fragmented, and digested with 0.15% collagenase type II solution. Then, primary adipose tissue-derived stem (ADSCs) cells are cultured and expanded in vitro, and the phenotypic characterization is performed by flow cytometry. We also provide the steps to differentiate the ADSCs into osteogenic, adipogenic, and chondrogenic cells, followed by functional characterization of each cell lineage. The protocol provided here can be used for in vivo and ex vivo experiments, and as an alternative, the adipose-derived stem cells can be used to generate MSCs-like immortalized cells.

저자 스포트라이트: Advancing Treatment Approaches with Adipose-Derived Stem Cells(지방 유래 줄기세포를 이용한 치료 접근법 발전)

The adipose tissue is an excellent source of mesenchymal stem cells. Here, we bring the step-by-step extraction, cultivation, and characterization of adipose tissue-derived stem cells (ADSCs) from Swiss mice epididymal adipose tissue.

Isolation, In Vitro Expansion, and Characterization of Mesenchymal Stem Cells from Mouse Epididymal Adipose Tissue(마우스 부고환 지방 조직에서 중간엽 줄기 세포의 분리, 체외 확장 및 특성 분석)

Mesenchymal stem cells (MSCs) have been extensively studied as a new therapeutic approach, mainly to stop exacerbated inflammation due to their potential ...