丙烯酸辅助捕获或Acyl-RAC是一种敏感可靠的方法,可用于检测各种生物样品中的蛋白质S-环化。该协议绕过代谢标签和放射性标签的一些限制,并允许同时检测多种蛋白质的S-细胞化。不仅活细胞,而且原组织和冷冻样品。
S-二聚变可以调节各种细胞过程,如蛋白质贩运、血浆膜靶向、信号转导、铁传输和蛋白质-蛋白质相互作用。对于每个实验,使用新鲜准备好的羟基胺溶液,并经过仔细调整的pH值,以确保硫酯键的高效和特定的裂解非常重要。通过演示这种方法,它对于氯仿、甲醇沉淀等步骤至关重要。
在此步骤中获得的煎饼形状颗粒应非常小心处理。它可以是脆弱的,在步骤期间样品的部分损失可能导致样品恢复不均匀。演示这个程序的将是萨凡纳·韦斯特,一个来自我们实验室的研究生。
要获得细胞解酸,请将感兴趣的细胞收集到锥形离心管中。通过离心去除任何细胞碎片。在5毫升PBS中清洗颗粒。
并立即将细胞重新用于600微升新鲜准备的解液缓冲液中。在热摇床中,以每分钟 1,500 转的速度搅拌样品,在 4 摄氏度下搅拌 30 分钟。在通过离心清除溶糖、颗粒洗涤剂和可溶性材料之前。
离心结束时,在冰上预冷却的1.5毫升微离心管中收集清除的利沙酸盐。并执行布拉德福德或双辛辛酸测定,根据标准方案估计蛋白质浓度。加入甲醇和氯仿,以2:1的比例进行口水。
严格摇动,形成均匀悬浮液,并离心样品,在水相和有机相之间的界面收集蛋白质颗粒。倾斜管,使用针头或凝胶加载尖端吸气尽可能多的溶剂。空气干燥蛋白质颗粒几分钟。
在轻轻地将管内装物与600微升甲醇混合之前,注意不要分解颗粒。小心去除甲醇洗涤后,将蛋白质颗粒干燥在长凳上约五分钟。接下来,将蛋白质颗粒重新在200微升2SHB缓冲液中。
在热摇床中,温度为42摄氏度,每分钟旋转1500圈。当颗粒溶解时,在2SHB中加入200微升0.2%MMTS。在42摄氏度下孵育蛋白质15分钟,在热摇床中每分钟孵育1500转。
在孵育结束时,进行3:4氯仿甲醇沉淀,如证明。要去除MMTS,请将颗粒溶解在100微升新鲜2SHB缓冲液中,并进行涡旋。每次沉淀后,用300微升缓冲液 A 稀释样品。
最终沉淀后,将样品溶解在2SHB缓冲液的200微升中,用240微升缓冲液进行稀释。再次测量蛋白质浓度,并留出每个样品中的40微升作为输入控制。将样品分成两个相等的体积 200 微升。并标记管为加羟基胺和减去羟基胺。
将 50 微升新鲜准备好的中性二摩尔羟基胺加入 400 毫摩尔的最终浓度添加到加羟基胺管中。和50微升中性二摩尔氯化钠对负对,一个负羟基胺管。然后在每个管中加入30微升的TS珠浆。
在室温下旋转管子一到两个小时。在孵化结束时,用缓冲液 A 中的 1%SDS 清洗珠子四次,以去除残留的羟基胺。最后一次洗涤后,用三个温和的一分钟微离心洗洗所有珠子样品。
小心吸气的超自然剂和重新暂停珠子在500微升1%SDS在缓冲器 A每次洗涤。上次洗涤后,轻轻旋转珠子,如证明。吸气尽可能多的上一道,而不打扰珠子。
为了从珠子中回收蛋白质,将50微升4%SDS样品缓冲液加入每个管中,并在80摄氏度和每分钟1500转的热摇床中孵育样品15分钟。在孵育结束时,让样品冷却后离心,以完全颗粒珠子。然后使用凝胶加载尖端将洗样蛋白转移到新的 1.5 毫升管中。
并在SDS-PAGE凝胶上运行样品,通过西方印迹分析感兴趣的蛋白质的S-acylation。酪氨酸激酶Lck可以在用中性二摩尔羟基胺处理的乳酸盐中检测。切开半胱氨酸残留物和脂肪酸莫伊蒂之间的硫酯键。
脱衣和与抗体对蛋白质Fyn和LAT的重新剥离表明,丙烯酸树脂辅助捕获测定可用于同时分析多种蛋白质的S-同化。此外,在原小鼠飞溅细胞中,可以很容易地检测到Lck、Fyn和LAT的S-acylation。指示这种修饰在两个物种之间保存。
除了识别新型S-甲基化蛋白外,该方法还可用于评估不同生物条件下蛋白质S-甲基化的变化。新识别的S-甲基化蛋白的数量大大增加后,双重增加意味着快速和可靠的技术,如Acyl-RAC。除了识别新型S-甲基化蛋白外,该方法还可用于评估不同生物条件下蛋白质S-甲基化的变化。