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Method Article
* Questi autori hanno contribuito in egual misura
La maggior parte degli organismi fotoautotrofici che nuotano mostrano cambiamenti comportamentali fotoindotti (comportamento fotografico). Il presente protocollo osserva il suddetto comportamento fotografico nell'organismo modello Chlamydomonas reinhardtii.
Per la sopravvivenza dei microrganismi fototrofici mobili, essere in condizioni di luce adeguate è fondamentale. Di conseguenza, mostrano comportamenti fotoindotti (o fotocomportamenti) e alterano la loro direzione di movimento in risposta alla luce. I comportamenti fotografici tipici includono la risposta al fotoshock (o fotofobico) e la fototassi. Il photoshock è una risposta a un improvviso cambiamento dell'intensità della luce (ad esempio, l'illuminazione del flash), in cui gli organismi smettono temporaneamente di muoversi o si muovono all'indietro. Durante la fototaxi, gli organismi si muovono verso la sorgente luminosa o nella direzione opposta (chiamata fototassi positiva o negativa, rispettivamente). L'alga verde unicellulare Chlamydomonas reinhardtii è un organismo eccellente per studiare il comportamento fotografico perché cambia rapidamente il suo modello di nuoto modulando il battito delle ciglia (alias flagelli) dopo la fotoricezione. Qui, vengono mostrati vari metodi semplici per osservare i comportamenti fotografici in C. reinhardtii. La ricerca sui fotocomportamenti di C. reinhardtii ha portato alla scoperta di meccanismi regolatori comuni tra ciglia eucariotiche e channelrhodopsins, che possono contribuire a una migliore comprensione delle ciliopatie e allo sviluppo di nuovi metodi optogenetici.
La luce è una fonte di energia indispensabile per gli organismi fotosintetici, ma troppa luce può causare danni fotoossidanti. Pertanto, gli organismi fototrofici devono sopravvivere sotto una luce di intensità moderata, dove possono fotosintetizzare ma non subire danni foto-ossidativi1. Nelle piante terrestri, i cloroplasti non possono uscire dalla foglia e mostrare movimenti fotografici nella cellula; i cloroplasti si spostano alla periferia della cellula in condizioni di luce intensa e la superficie cellulare in condizioni di scarsa illuminazione2, mentre molte alghe mobili mostrano fotocomportamenti che consentono loro di trovare condizioni di luce adeguate per la fotosintesi e, quindi, facilitare la loro sopravvivenza3.
Chlamydomonas reinhardtii è un'alga verde unicellulare considerata un organismo modello in campi di ricerca come le ciglia (alias flagelli), la fotosintesi e il fotocomportamento. C. reinhardtii si presenta con una macchia oculare e due ciglia per cellula, utilizzate rispettivamente per la fotoricezione e il nuoto. La macchia oculare ha due componenti: le channelrhodopsins (ChRs), i canali ionici light-gated nella membrana plasmatica e gli strati di granuli ricchi di carotenoidi situati proprio dietro i ChRs. La macchia oculare agisce come un recettore della luce direzionale poiché gli strati di granuli ricchi di carotenoidi funzionano come un riflettore di luce 4,5.
I ChR sono stati inizialmente identificati come fotorecettori che causano fotocomportamenti in C. reinhardtii 6,7,8,9. Sebbene due isoforme, ChR1 e ChR2, si trovino nella macchia oculare, esperimenti di abbattimento hanno dimostrato che ChR1 è il fotorecettore primario per i fotocomportamenti10. Nonostante ciò, ChR2 ha ricevuto maggiore attenzione e ha svolto un ruolo centrale nello sviluppo dell'optogenetica, una tecnica per controllare l'eccitazione cellulare mediante la luce11. Pertanto, lo studio dei meccanismi regolatori che regolano i fotocomportamentatori in C. reinhardtii favorirà la comprensione della funzione ChR e migliorerà l'optogenetica.
Dopo la fotoricezione, le cellule di C. reinhardtii mostrano due tipi di fotocomportamenti: fototaxi e risposta al fotoshock12. La fototaxi è il comportamento delle cellule che nuotano nella direzione della sorgente luminosa o nella direzione opposta, chiamata fototassi positiva o negativa, rispettivamente. La risposta al fotoshock è un comportamento che le cellule mostrano dopo aver rilevato un improvviso cambiamento nell'intensità della luce, ad esempio quando illuminato da un flash. Le cellule smettono di nuotare o nuotano all'indietro (cioè nuotano con il corpo cellulare in avanti) per un breve periodo, in genere <1 s.
I movimenti ciliari in C. reinhardtii sono coinvolti nei suoi fotocomportamenti. Due ciglia di solito battono come la rana di un essere umano che nuota, e questo è modulato per i fotocomportamenti. Per la fototassi, le forze generate dalle due ciglia sono sbilanciate dalla modulazione della frequenza di battitura e dall'ampiezza della forma d'onda di ciascun cilio13. Il cilio più vicino alla macchia oculare è chiamato cis cilium e l'altro è chiamato trans cilium. Queste due ciglia differiscono su vari punti. Ad esempio, la frequenza di battitura ciliare del transcilio in vitro è del 30%-40% superiorea 14. Inoltre, la loro sensibilità Ca2+ è diversa. La riattivazione dei modelli di cellule demembranate15 ha mostrato che il cis cilium batte più fortemente del trans cilium per Ca2+ <1 x 10−8 M, mentre il contrario è vero per Ca2+ >1 x 10−7 M. Questa asimmetria nella sensibilità di Ca2+ è probabilmente importante per i turni fototattici poiché i mutanti privi di questa asimmetria non presentano una normale fototassi16,17. Al contrario, la conversione della forma d'onda è necessaria per il photoshock. La forma d'onda ciliare si trasforma dalla forma d'onda asimmetrica nel nuoto in avanti alla forma d'onda simmetrica nel nuoto all'indietro. Questa conversione della forma d'onda è regolata anche da Ca2+, ad una soglia di 1 x 10−4 M18,19. Poiché i difetti nella regolazione dei movimenti ciliari causano discinesia ciliare primaria negli esseri umani, lo studio dei fotocomportamentatori in C. reinhardtii potrebbe aiutare a comprendere meglio queste malattie e gli sviluppi terapeutici20.
Qui, vengono dimostrati quattro semplici metodi per osservare i fotocomportamentatori in C. reinhardtii . In primo luogo, viene mostrato un test di fototassi utilizzando piastre di Petri e, in secondo luogo, un test di fototassi contro le goccioline di sospensione cellulare. Il fenomeno osservato in entrambi i casi non è strettamente fototaxi ma fotoaccumulo, dove le cellule tendono ad accumularsi vicino al lato della sorgente luminosa o al lato opposto. In C. reinhardtii, il fotoaccumulo è causato principalmente dalla fototassi in un modo che può essere usato come approssimazione alla fototassi. In terzo luogo, viene mostrato un test più rigoroso per la fototassi al microscopio, e l'ultimo è un test di fotoshock al microscopio.
Nel presente studio, un ceppo wild-type di Chlamydomonas reinhardtii, una progenie della croce CC-124 x CC-125 con agg1+mt-, è stato utilizzato21. CC-124 e CC-125 sono stati ottenuti dal Chlamydomonas Resource Center (vedi Tabella dei materiali) e mantenuti su un mezzo tris-acetato-fosfato (TAP)22, 1,5% di agarosio a 20-25 °C. Qualsiasi ceppo mobile può essere utilizzato per questo protocollo.
1. Coltura cellulare
Figura 1: Coltura liquida dopo 2 giorni di coltivazione. Da una piastra di agar TAP-1,5%, un pezzo di cellule selvatiche che riempivano il loop di platino è stato inoculato in ~ 150 ml di mezzo liquido TAP in un pallone. La densità cellulare dopo coltura di 2 giorni era ~ 5,0 x 106 cellule / ml. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
2. Pretrattamento delle cellule
Figura 2: Sospensione cellulare sotto semaforo rosso. Una normale luce bianca fluorescente ricoperta da un foglio di cellophane rosso. Un tubo contenente la sospensione cellulare è posto sotto ~10 μmol fotoni·m−2·s−1 luce rossa. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
3. Test di fototatassi con la capsula di Petri (il cosiddetto "saggio del piatto")
Figura 3: Illuminazione laterale per il saggio della parabola della fototaxi. (A) Una capsula di Petri contenente una sospensione cellulare posta su una lightbox in una camera oscura desktop. Luce verde (piastra LED da 525 nm, ~100 μmol fotoni·m−2·s−1) illuminata lateralmente. (B) Metodo di illuminazione alternativo. Un LED da 5 mm a palla di cannone. (C) Per bloccare la luce dall'esterno, è possibile utilizzare una scatola con un panno nero all'interno al posto di una camera oscura desktop. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 4: Esempio di fototassi negativa dopo un'illuminazione laterale di 5 minuti. (A) Sospensione cellulare wild-type in una capsula di Petri illuminata per 5 min. La maggior parte delle cellule si è accumulata sul lato opposto della sorgente luminosa. Questi dati possono essere interpretati come fototaxi negativi. (B) Immagine del piatto dall'alto. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 5: Quantificazione del saggio di fototassi del piatto. Un esempio di celle che mostrano fototassi negativa (la fonte di luce è sul lato destro). L'immagine a colori viene convertita in scala di grigi (passaggio 3.5.) e quindi invertita (passaggio 3.6.). Le regioni di interesse (ROI), l'intero piatto (passaggio 3.7.) e la metà lato sorgente luminosa del piatto (passaggio 3.8.) sono stati delimitati. È stata misurata la densità di ciascun ROI (Step 3.9.). In questo caso, l'indice fototattico (PI) è di circa 0,18 ([1.512 x 11,671] / [2.970 x 26,077]). PI è 1 o 0 quando tutte le cellule mostrano rispettivamente fototassi positiva o negativa. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
4. Saggio di fototassi con goccioline di coltura cellulare
Figura 6: Saggio di fototassi a goccia. (A) Nove goccioline di una sospensione cellulare da 25 μL poste su un foglio di plastica bianca e illuminate lateralmente da un LED verde. (B) Dopo 3 minuti di illuminazione. In ogni goccia, le cellule si sono accumulate sul lato della sorgente luminosa (fototassi positiva), accumulate sul lato opposto (fototaxi negativi) o diffuse nella goccia (senza fototaxi). Barra della scala = 1 cm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
5. Analisi della fototassi al microscopio
Figura 7: Realizzazione di distanziali sui bordi delle coperture. (A) Un sottile strato di vaselina è stato applicato al palmo di una mano. Una piccola quantità di petrolio bianco è stata raschiata via con il bordo di una copertura. (B) Un distanziatore sul bordo di una copertura. (C) Un altro distanziatore sul bordo opposto. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 8: Illuminazione laterale al microscopio. (A) Configurazione di un LED verde. Un LED verde a palla di cannone è fissato al manicotto e fissato al supporto accanto al microscopio. Le cellule sono state osservate al microscopio a campo scuro con un filtro a taglio acuto (λ > 630 nm). (B) Illuminazione laterale tramite LED verde. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Filmato 1: Analisi della fototaxi al microscopio. Luce verde illuminata a ~0 s da destra. A quel punto, le cellule tendevano a nuotare in una direzione casuale. Dopo 0 s nel contatore del tempo, le cellule nuotavano a destra oa sinistra, mostrando fototassi positiva o negativa. La luce è stata spenta a ~ 15 s quando le cellule hanno iniziato a nuotare di nuovo in una direzione casuale. Barra della scala = 100 μm. Fare clic qui per scaricare questo filmato.
6. Tracciamento delle cellule fototattiche e disegno dell'istogramma polare
7. Test di risposta al fotoshock al microscopio
Filmato 2: Illuminazione Photoshock da un flash della fotocamera. Il flash della fotocamera è stato tenuto fino allo stadio del microscopio e acceso. Clicca qui per scaricare questo film.
Filmato 3: Risposta al photoshock causata da un flash al microscopio. Le cellule sono state osservate sotto una debole luce rossa. Un flash è stato emesso a ~ 0 s. Quasi tutte le cellule hanno smesso di nuotare in avanti, hanno nuotato all'indietro per un breve periodo e hanno recuperato il nuoto in avanti. Barra della scala = 100 μm. Fare clic qui per scaricare questo filmato.
Filmato 4: Risposta al photoshock causata dalla rimozione di un filtro rosso al microscopio. Le cellule sono state osservate sotto una debole luce rossa. Il filtro rosso è stato rimosso a ~ 5 s. Quasi tutte le cellule hanno smesso di nuotare in avanti, hanno nuotato all'indietro per un breve periodo e hanno recuperato il nuoto in avanti. Barra della scala = 100 μm. Fare clic qui per scaricare questo filmato.
Filmato 5: Rimozione di un filtro rosso. Rimozione rapida di un filtro rosso impostato nel percorso della luce per fornire photoshock. Clicca qui per scaricare questo film.
I tipici saggi di fototassi e risposta al fotoshock di C. reinhardtii sono mostrati qui. Dopo la stima della densità cellulare, la coltura cellulare wild-type (una progenie della croce CC-124 × CC-125 con agg1+ mt -)23 è stata lavata con una soluzione sperimentale di fotocomportamentare per il test della piastra di fototaxi. La sospensione cellulare è stata posta sotto una debole luce rossa per ~ 1 ora. Una sospensione cellulare da 2 ml è stata collocata in una capsula di Petri da 3,...
Il presente protocollo è facile e non richiede molto tempo. Se si sospetta che un mutante di C. reinhardtii presenti difetti nella fotoricezione o nel moto ciliare, questo metodo potrebbe servire come analisi fenotipica primaria.
Tuttavia, esistono alcuni passaggi critici. Uno è quello di utilizzare le cellule nell'esperimento nella fase di crescita da iniziale a metà registro. Dopo aver coltivato per lunghi periodi, le cellule diventano meno mobili, meno sensibili alla luce e form...
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Questo studio è stato supportato da sovvenzioni della Japan Society for the Promotion of Science KAKENHI (https://www.jsps.go.jp/english/index.html) a NU (19K23758, 21K06295), TH (16H06556) e KW (19H03242, 20K21420, 21H00420), dalla Ohsumi Frontier Science Foundation (https://www.ofsf.or.jp/en/) a KW, e dalla Dynamic Alliance for Open Innovation Bridging Human, Environment and Materials (http://alliance.tagen.tohoku.ac.jp/english/) a NU, TH e KW.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
15 mL conical tube | SARSTEDT | 62.554.502 | |
5 mm Cannonball green LED | Optosupply | OSPG5161P | |
50 mL conical tube | SARSTEDT | 62.547.254 | |
AC adaptor for the light box | ATTO | 2196161 | |
Auto cell counter | DeNovix | CellDrop BF | |
CaCl2 | Nakalai tesque | 06731-05 | |
Camera flash | NEWWER | TT560 | |
Centrifuge | KUBOTA | 2800 | |
Chlamydomonas strains CC-124 and CC-125 | Chlamydomonas Resource Center | https://www.chlamycollection.org/ | |
C-mout CCD camera | Wraymer | 1129HMN1/3 | |
Desktop darkroom | Scientex | B-S8 | |
Digital still camera | SONY | RX100II | |
EGTA | Dojindo | G002 | |
Fiji | https://fiji.sc/ | ||
Green LED plate | CCS | ISLM-150X150-GG | |
HCl | Fujifilm WAKO | 080-01066 | |
HEPES | Dojindo | GB70 | |
KCl | Nakalai tesque | 238514-75 | |
Lightbox (Flat viewer) | ATTO | 2196160 | |
Microscope | Olympus | BX-53 | |
Petri dish (φ3.5 cm) | IWAKI | 1000-035 | |
Pottasium acetate | Nakalai tesque | 28434-25 | |
Power supply for the green LED plate | CCS | ISC-201-2 | |
Red filter | Shibuya Optical | S-RG630 |
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