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Method Article
Questo protocollo descrive la selezione di marcatori plasmodesmici ottimali per analisi basate su microscopia confocale del targeting proteico dei plasmodesmi durante le interazioni virus-plasmodesmi o il trasporto plasmodesmico.
I plasmodesmi sono nanopori membranosi che collegano il citoplasma delle cellule vegetali adiacenti e consentono il traffico da cellula a cellula di nutrienti, macromolecole e virus invasori. I plasmodesmi svolgono un ruolo fondamentale nella regolazione della comunicazione intercellulare, contribuendo allo sviluppo delle piante, alle risposte ambientali e alle interazioni con i patogeni virali. La scoperta della localizzazione plasmodesmale di proteine vegetali o virali potrebbe fornire utili informazioni funzionali sulla proteina ed è importante per comprendere i meccanismi delle interazioni pianta-virus. Per facilitare questi studi, descriviamo un protocollo per l'analisi basata sulla microscopia confocale di diverse proteine bersaglio plasmodesmale per selezionare il miglior marcatore plasmodesmale per studiare le interazioni virus-plasmodesma o il trasporto plasmodestmico. In particolare, le analisi di questi eventi sono illustrate utilizzando la proteina del movimento cellula-cellula (MP) del virus della vena di rapa (TVCV), la proteina localizzata 5 di Arabidopsis Plasmodesma (PDLP5) e la proteina legante il callosio 1 di Plasmodesmata. I dati di localizzazione dei plasmodami proteici sono analizzati in parallelo con la visualizzazione globale dei plasmodesmi utilizzando la colorazione con blu all'anilina dei tessuti campionati. Questi approcci possono essere facilmente adattati per analizzare la localizzazione plasmodesmale di qualsiasi proteina cellulare o patogena nelle planta.
I plasmodesmi (PD) svolgono un ruolo fondamentale nel controllo dello sviluppo delle piante, delle risposte ambientali e delle interazioni con i patogeni virali attraverso la regolazione della comunicazione intercellulare 1,2. La PD si forma inizialmente durante la citochinesi, con centinaia di PD inserite nella nuova cellula tra le due cellule figlie, fornendo così i canali per la comunicazione cellula-cellula 3,4. La PD è una struttura ricca di membrana, contenente la membrana derivata dal reticolo endoplasmatico (ER), un desmotubulo trans-PD, nella parte centrale dei pori che sono rivestiti dalla membrana plasmatica 3,4. Gli approcci proteomici comparativi hanno identificato numerose proteine funzionali del PD, tra cui β-1,3-glucanasi (BG), calcosio sintasi (CALS), proteine localizzate nei plasmodesmi (PDLP), proteine leganti il callosio (PDCB), proteine della regione transmembrana di domini C2 multipli (MCTP)3 e chinasi simili al recettore ripetuto ricche di leucina (RLK)5. Recentemente, Kirk et al. hanno sviluppato uno strumento chiamato plasmodesmata in silico proteome 1 (PIP1), che ha reso possibile prevedere nuove proteine PD in 22 specie vegetali6. La PD varia in permeabilità e struttura durante lo sviluppo delle piante e la risposta a vari stress. La deposizione e l'idrolisi del callosio (β-1,3-glucano) nella regione del collo che circonda la PD è uno dei meccanismi ampiamente noti della regolazione della PD7.
Molti microbi patogeni, tra cui funghi, batteri e virus, possono manipolare la dilatazione o la struttura del PD durante la loro infezione 2,8,9. Magnaporthe oryzae, l'agente eziologico del blasto del riso, dispiega ife invasive intracellulari per spostarsi da una cellula all'altra attraverso PD8. Un patogeno batterico Pseudomonas syringae pv. il pomodoro richiede una proteina effettrice HopO1-1 per il movimento intercellulare e la diffusione nella pianta ospite attraverso l'interazione e la destabilizzazione di PDLP7, aumentando così il flusso molecolare nelle cellule vicine in Arabidopsis9. Tuttavia, i virus delle piante sono più versatili nella regolazione del PD durante la loro trasmissione intercellulare, con la proteina del movimento virale (MP) che promuove il movimento da cellula a cellula2. A causa della loro importante funzione nella regolazione dello sviluppo e della crescita delle piante, nonché della loro interazione con i microbi patogeni delle piante, la malattia di Parkinson ha guadagnato una crescente attenzione negli ultimi anni. In Arabidopsis thaliana, ci sono due tipi principali di proteine funzionali del PD, PDLP (1-8) e PDCB (1-5), e molte di esse, ad esempio PDLP5 1,10,11, PDLP112, PDLP613, PDLP714 e PDCB115, hanno un ruolo nella manipolazione della permeabilità del PD attraverso la regolazione della deposizione di callosio. Tuttavia, è stato riscontrato che alcuni PDLP hanno una ridondanza funzionale, ad esempio, i mutanti knockout di pdlp1 e pdlp1,2 non hanno influenzato il traffico molecolare, sebbene i mutanti double knockout di pdlp1,3 e pdlp2,3 abbiano mostrato un aumento della permeabilità plasmodesmale16. È interessante notare che la sottoregolazione/knockout o la sovraespressione di PDLP5 da sola determinano un aumento o una diminuzione della permeabilità plasmodamale, rispettivamente 1,17. Recentemente, Li et al. hanno scoperto che PDLP5 e PDLP6 funzionano in diverse interfacce cellulari13. Questi risultati indicano che PDLP5 potrebbe avere funzioni non ridondanti con altri PDLP.
A causa della funzione critica della PD nella comunicazione intercellulare, abbiamo sviluppato un protocollo per l'implementazione delle proteine PD PDLP5 e PDCB1 e della proteina virale del movimento cellula-cellula (MP) del virus della vena di rapa (TVCV) come marcatori PD semplici, convenienti e affidabili per la sperimentazione di biologia cellulare. Per ulteriori verifiche, la visualizzazione della PD utilizzando la colorazione blu all'anilina dei tessuti campionati è proceduta in parallelo. I protocolli descritti per la localizzazione PD di PDLP5, PDCB1 e TVCV MP possono essere facilmente adattati per analizzare la potenziale localizzazione PD di qualsiasi proteina cellulare o derivata da patogeni nelle piante viventi.
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I dettagli dei reagenti e delle attrezzature utilizzate in questo studio sono elencati nella tabella dei materiali.
1. Crescita delle piante
2. Costruzione vettoriale
3. Agroinfiltrazione
4. Colorazione blu all'anilina
5. Microscopia confocale
6. Analisi dei dati
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Per facilitare gli studi sulla funzione della malattia di Parkinson nella fisiologia delle piante e nelle interazioni con i patogeni, sono state sviluppate tre proteine di riferimento semplici e affidabili per la localizzazione della malattia di Parkinson. Sono state selezionate due proteine PD cellulari e una proteina MP derivata da patogeni codificata dal tobamovirus vegetale TVCV. La localizzazione subcellulare di queste proteine è stata visualizzata utilizzando un reporter autofluor...
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Qualsiasi studio di biologia cellulare sulla comunicazione intercellulare delle piante e sul trasporto da cellula a cellula durante il normale sviluppo e morfogenesi delle piante, così come durante le interazioni pianta-patogeno, richiede l'individuazione e il monitoraggio dello smistamento delle proteine, sia endogene che codificate per i patogeni, nelle connessioni intercellulari delle piante, i plasmodesmi (PD). Questi esperimenti sarebbero sostanzialmente facilitati dall'uso di prot...
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Gli autori dichiarano di non avere interessi concorrenti.
Il lavoro nel laboratorio VC è stato supportato da sovvenzioni da NIH (R35GM144059), NSF (MCB 1913165 e IOS 1758046) e BARD (IS-5276-20) a VC. I finanziatori non hanno avuto alcun ruolo nella progettazione dello studio, nella raccolta e nell'interpretazione dei dati o nella decisione di pubblicarlo.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
ABT AC 1 phase motor | BRANDTECH | ABF63/4C-7RQ | |
Agrobacterium tumefaciens EHA105 | |||
Contamination control | CCI | ||
Gateway BP Clonase II Enzyme mix | Invitrogen | #11789020 | |
Gateway LR Clonase II Enzyme mix | Invitrogen | #11791020 | |
GraphPad Prism 8.0.1. | GraphPad Software Inc. | ||
Image J | National Institutes of Health and the Laboratory for Optical and Computational Instrumentation | ||
Laser scanning confocal microscope | Zeiss | LSM 900 | |
Nicotiana benthamiana | Plant species | ||
pDONR207 | Invitrogen | #12213013 | |
Q5 High-Fidelity DNA Polymerase | NEB | #M0491S |
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