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Method Article
이 프로토콜은 균근 진균으로 발아된 식물 조직 및 종자에서 진균 집락을 연구하기 위해 주사 및 투과 전자 현미경, 빛, 공초점 및 형광 현미경과 같은 다양한 현미경 기술을 적용하여 진균종속영양 식물 샘플을 수집, 고정 및 유지하기 위한 자세한 절차를 제공하는 것을 목표로 합니다.
구조 식물학은 식물의 생태, 생리학, 발달 및 진화를 완전히 이해하는 데 없어서는 안될 관점입니다. 진균 종속 영양 식물 (즉, 곰팡이에서 탄소를 얻는 식물)을 연구 할 때 구조적 적응의 놀라운 측면, 곰팡이에 의한 조직 식민지화 패턴 및 지하 기관의 형태 해부학은 발달 전략과 영양소 공급원 인 균사와의 관계를 계몽 할 수 있습니다. 공생 균류의 또 다른 중요한 역할은 난초 씨앗의 발아와 관련이 있습니다. 모든 난초과과 종은 발아 및 묘목 단계(초기 진균이영양)에서 진균종속영양성이며 심지어 성체기에서 광합성을 하는 종도 있습니다. 난초 씨앗에 영양 매장량이 부족하기 때문에 곰팡이 공생체는 기질을 제공하고 발아를 가능하게하는 데 필수적입니다. 구조적 관점에서 발아 단계를 분석하면 곰팡이와 씨앗의 상호 작용에 관한 중요한 질문에 답할 수 있습니다. 이 기사에서 제안한 것처럼 식물 조직에서 곰팡이 내생식물을 밝히기 위해 다양한 이미징 기술을 적용할 수 있습니다. 식물 장기의 자유형 및 얇은 부분을 염색 한 다음 광학 현미경을 사용하여 관찰 할 수 있습니다. 밀 배아 응집소에 접합 된 형광 색소를 곰팡이에 적용하고 Calcofluor White와 함께 배양하여 컨포칼 현미경에서 식물 세포벽을 강조 표시 할 수 있습니다. 또한, 주사 및 투과 전자 현미경의 방법론은 mycoheterotrophic 난초에 대해 자세히 설명되어 있으며, 관련 식물에 이러한 프로토콜을 적용 할 가능성을 탐구합니다. 난초 종자의 공생 발아 (즉, 균근 진균이있는 경우)는 빛, 공초점 및 전자 현미경으로 분석하기 위해 발아의 여러 단계에서 얻은 구조를 준비 할 수있는 가능성과 함께 프로토콜에 자세히 설명되어 있습니다.
식물 형태학 및 해부학을 다루는 식물학의 구조 연구는 전체 유기체를 이해하는 데 기본이며1,2, 식물의 생태, 생리학, 발달 및 진화에 관한 지식을 통합하고 기여하는 데 필수적인 관점을 제공합니다3. 식물 형태학 및 해부학의 방법은 현재 최근에 개발 된 프로토콜, 장비 및 지식뿐만 아니라 100 년 이상 전에 개발 된 것으로 구성됩니다2. 보다 최근의 기술(예: 컨포칼 현미경, X선 마이크로단층 촬영)과 함께 고전적인 방법(예: 광학 현미경)의 지속적인 실행 및 적응은 방법론 개발을 가능하게 하는 이론적 지식이라는 동일한 필수 기반을 가지고 있습니다.
식물 해부학 및 형태학의 주요 도구는 이미지입니다. 이러한 분석이 주관적인 해석에 공간을 제공하는 단순한 관찰이라는 오해에도불구하고2,이 영역의 이미지를 분석하고 이해하려면 적용된 방법 (장비, 분석 유형, 방법 론적 절차), 세포 구성 요소, 조직 화학 및 식물체 (조직 조직 및 기능, 개체 발생, 형태 학적 적응). 다양한 방법을 통해 얻은 이미지를 해석하면 형태와 기능을 상호 연관시키고, 구조의 화학적 구성을 해독하고, 분류군을 설명하고, 식물 병원체에 의한 감염을 이해하고, 기타 그러한 평가를 수행 할 수 있습니다.
균사 종속 영양 (MH) 식물 (즉, 균근 균류 4,5에서 탄소를 얻는 비 광합성 식물)을 연구 할 때 구조적 적응의 현저한 측면, 곰팡이에 의한 조직 식민지화 패턴 및 지하 기관의 형태 해부학은 개발 전략과 영양소의 원천 인균사와의 관계를 계몽 할 수 있습니다. MH 식물의 지하 기관은 일반적으로 토양 곰팡이와의 연관성과 관련된 중요한 적응을 보여 주므로 이러한 해부학 적 및 형태 학적 조사를 수행하는 것이 필수적입니다6. MH 종의 공중 기관은 균근 진균이 아니더라도 내생 식물이 이러한 조직에 존재할 수 있으므로 무시해서는 안됩니다 (개인 관찰, 아직 발표되지 않음).
전체 수명주기 동안 MH 종과 균근 진균 결합의 잘 확립 된 필수 성 외에도7, 모든 난초 종, 심지어 독립 영양 종조차도 자연 환경에서 초기 의무 진균 종속 영양 단계를 가지고 있습니다. 난초의 배아가 미분화되고 배젖이나 자엽이 없기 때문에 곰팡이 파트너 4,8의 영양 지원 없이는 자연 환경에서 발달하고 확립 할 수 없기 때문에 발생합니다. 이를 고려할 때, 공생 발아 프로토콜은 MH 종뿐만 아니라 광합성 난초에도 적용될 수 있으며, 발아 및 프로토 코름 발달에서 난초-곰팡이 특이성을 조사하는 것을 목표로하며, 멸종 위기 종 보존을위한 이니셔티브에 광범위하게 적용되는 방법론 9,10,11.
이 방법 어셈블리에서는 해부학 적 연구 (섹션 1), 표면 분석 및 샘플 선택 (섹션 2), 절편 방법 (자유형 : 섹션 3, 미세 절제술 : 섹션 4, 저온 미세 절제술 : 섹션 5), 염색 및 장착 (섹션 6), 곰팡이 내생 식물의 형광 및 공초점 현미경 (섹션 7), 주사 전자 현미경 (섹션 8), 및 투과 전자 현미경 (섹션 9). 또한 앞서 언급한 이미징 방법을 발아 과정에서 종자, 원생 및 묘목의 곰팡이 집락을 분석하는 데 성공적으로 적용할 수 있기 때문에 난초 종자(MH 및 독립 영양, 섹션 10)에 대한 공생 발아 방법을 설명합니다.
그림 1: 이미징 방법의 개략적 요약. 회로도는 자세히 설명된 프로토콜 단계의 표시를 제공합니다. 약어 : GMA = 글리콜 메타 크릴 레이트, OCT = 최적 절단 온도 화합물, SEM = 주사 전자 현미경. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
여기에 자세히 설명된 현미경 기술(그림 1)은 샘플 수집, 고정, 탈수, 매립 및 절편과 같은 필수 단계가 선행됩니다. 선택한 기술에 따라 단계가 다양하기 때문에(그림 1), 준비 및 수집 장소로 운송할 고정제, 고정 전에 샘플을 준비하는 방법, 사용할 탈수 공정(섹션 1), 다양한 매립 가능성 및 절단 방법(섹션 4, 5, 및 9). 그림 1 은 아래에 자세히 설명된 각 현미경 기술에 필요한 모든 단계를 순차적으로 요약한 것입니다.
1. 샘플 수집, 고정 및 유지 관리
참고 : 완전 MH 식물은 일반적으로 주로 습하고 쓰레기가 풍부한 지역의 어두운 숲 지하층 12,13에서 발견 될 수있는 반면, 부분적으로 MH 식물은 더 개방 된 숲(12,13)에서 발견 될 수 있습니다. MH 식물은 일반적으로 다양한 모양과 크기의 잘 발달 된 지하 기관을 가지고 있습니다.
10% 중성 완충 포르말린(NBF)14 | |
단계 1 | 증류수 80mL에 37-40% 포름알데히드 용액 10mL를 추가합니다. |
단계 2 | 0.4 g의 인산나트륨 일염기성 일수화물(NaH2PO4· H2O) 용액에 |
단계 3 | 무수 인산 이염 기산 나트륨 0.65g (Na2HPO4) 추가 |
단계 4 | 부피를 100mL로 구성 |
표 1: 10% 중성 완충 포르말린 레시피 14.
카르노프스키의 해( 수정15) | |
단계 1 | 60-70 °C에서 증류수 20mL |
단계 2 | 파라포름알데히드 0.8g을 첨가하여(4% w/v 수득) 교반 |
단계 3 | 40 % NaOH 1-4 방울을 넣고 용액이 깨끗해질 때까지 저어줍니다. |
단계 4 | 냉각하고 0.2M 인산염 완충액 pH 7.2 30mL를 추가합니다(표 3). |
단계 5 | 25% 글루타르알데히드를 0.1M PB(pH 7.2)로 희석하여 1% 글루타르알데히드(최종 부피: ~60mL)를 얻습니다. |
단계 6 | 1 % 글루 타르 알데히드 (5 단계)를 4 단계에서 얻은 용액에 첨가하여 최대 100mL의 정착액을 만들 때까지 첨가합니다. |
표 2 : Karnovsky의 솔루션 레시피 (수정된 15).
0.2 M 인산염 완충액 (PB) pH 7.2 | |
단계 1 | 증류수 14.196mL에 무수 인산이염기산나트륨(Na2HPO4) 400g 첨가 |
단계 2 | 인산나트륨 일염기성 일수화물(NaH2PO4· H2O) |
단계 3 | 용액이 깨끗해질 때까지 저어줍니다. |
단계 4 | 증류수로 최종 부피를 500mL로 조정 |
단계 5 | pH를 7.2로 조정 |
단계 6 | 0.1M PB의 경우 1:1로 희석 |
표 3: 0.2 M 인산염 완충액 제조법.
3% 글루타르알데히드 0.2 M 나트륨 카코딜레이트 완충액 (개질16) | |
단계 1 | 0.2M 카코딜레이트 완충액: 증류수 100mL에 4.28g의 소듐 카코딜레이트 트리하이드레이트 첨가 |
단계 2 | pH를 7.2로 조정 |
단계 3 | 2단계의 용액 25mL에 25% 글루타르알데히드 12mL를 추가합니다(0.2M 카코딜레이트 완충액 pH 7.2). |
단계 4 | 증류수로 부피를 100mL로 구성하십시오. |
표 4: 3% 글루타르알데히드 0.2 M 나트륨 카코딜레이트 완충액 레시피 (변형된16).
2. 고정 및 비 고정 재료의 장기 표면 분석
3. 식물 기관의 자유형 섹션
참고: 식물 장기의 자유형 섹션은 특히 작고 얇은 구조의 경우 어려울 수 있습니다. 그러나, 곰팡이 내생 식물이있는 조직의 이러한 부분은 어떤 경우에는 얇은 부분과 비교하여 균사 및 기타 특징을 더 잘 나타낼 수 있습니다.
4. 수지에 식물 샘플 매립 및 절편
5. 식물 샘플 냉동 및 저온 유지 장치로 절편
참고: 생체 조직을 냉동 절단할 때 필수적인 고려 사항은 샘플을 동결할 때 얼음 결정 형성으로 인한 손상을 줄이는 것입니다. 냉동 보호는 일반적으로 글리세롤 또는 자당19,20과 같은 화학적으로 불활성 인 용액을 주입하여 수행됩니다.
6. 광학 현미경을 위한 식물 절편 및 내생 식물 염색
알림: 식물 섹션에는 많은 유형의 얼룩을 사용할 수 있습니다. 내생 균류와 식물 조직을 차별적으로 염색하는 것은 어렵습니다. 염색 절차는 아니지만, 진균 구조를 표시하는 방법은 섹션 7(밀 배아 응집소 접합체를 사용한 형광)에 제시되어 있습니다. 자유형 섹션(섹션 3에서 설명), 수지 섹션(섹션 4) 및 저온 절편(섹션 5)을 염색할 수 있지만 이러한 경우 GMA 수지 및 OCT가 슬라이드에 대한 접착력을 잃기 때문에 이러한 샘플에는 페놀 및 알코올 기반 얼룩이 어렵습니다.
7. 형광 및 공초점 현미경에서 밀 배아 응집소에 접합된 형광 색소의 적용
알림: 이 방법은 자유형 섹션(섹션 3에서 설명), 수지 섹션(섹션 4) 및 냉동 섹션(섹션 5)에 적용할 수 있습니다. 냉동 절편은 수지 절편과 비교할 때 더 두꺼운 샘플을 제공 할 수 있지만 자유형 단면만큼 두껍지는 않기 때문에 컨 포칼 현미경 용도에 적합 할 수 있습니다. 밀 배아 응집소 (WGA, 재료 표 참조)에 접합 된 형광 크롬은 형광 현미경26에서 진균 이미징에 적용됩니다. 컨포칼 현미경은 식물 구조(27)의 선명한 3차원 이미지를 제공할 수 있지만 필수적인 것은 아니다.
8. 식물 장기의 주사 전자 현미경
9. 투과 전자 현미경
구연산납 용액 (TEM 조영제 염색용) | |
단계 1 | 은박지로 비커 둘러싸기 |
단계 2 | 0.266g의 질산 납 [Pb(NO 3) 2] 6mL의 최근 끓여서 냉각 된 증류수에 녹입니다. |
단계 3 | 2 분 동안 교반 |
단계 4 | 시트르산 삼 나트륨 [Na3 (C6H5O7) .2H2O] 0.352g을 첨가하십시오 (용액은 유백색을 얻어야 함) |
단계 5 | 15분 동안 교반하고 비커를 은박지로 밀봉한 다음 용액을 10mL 비커로 옮깁니다. |
단계 6 | 1N NaOH 1.6mL와 증류수 2.4mL를 추가합니다(용액은 반투명해야 함). |
단계 7 | 필요한 경우 pH를 12에 가깝게 조정하십시오. |
표 5: 구연산납 용액 제조법.
그림 2: 구연산납 및 우라닐 아세테이트 용액과의 대조 염색 계획 . (A) 열가소성 필름으로 거꾸로 뒤집어 (중앙에) 페트리 접시를 준비하여 그 위에 더 넓은 접시 안에 방울을 놓을 수 있습니다. NaOH 펠릿은 중앙 접시 주변의 장소입니다. (B) 우라닐 아세테이트 방울은 문자 U가있는 원에 배치되고 L. DW로 표시된 원의 구연산 납 방울은 증류수 방울을 나타냅니다. 그리드는 컬럼에서 순차적으로 염색되므로 5개의 그리드를 표현된 대로 동시에 염색할 수 있습니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
10. 난초 씨앗의 공생 발아
그림 3 : 종자 방법론의 공생 발아의 개략적 요약. 회로도는 프로토콜의 세부 단계에 대한 표시를 제공합니다. 약어 : OMA = 오트밀 한천, PDA = 감자 포도당 한천. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
발아 단계 | 묘사 |
0 | 발아 없음 |
1 | 배아의 붓기 |
2 | 테스타 파열 |
3 | 흡수성 모발이 발달합니다. |
4 | 줄기 투영 개발 |
5 | 보호 저울 (포엽) 개발 |
6 | 첫 번째 뿌리 개발 |
표 6 : 발아 테스트의 주기적 분석에 적용되는 프로토 코름 발달 단계에 대한 설명. Otero et al.36에 설명 된 단계에서 수정되었습니다.
식물 조직을 고정하는 필수 단계에 이어 세포 구성 요소 및 조직의 형태, 부피 및 공간 조직을 고려하여 가능한 한 유사한 세포 구조가 살아있는 상태와 유사합니다16. 화학적 고정 후 샘플에서 이러한 특성을 관찰하십시오(그림 4). 그림 4C-F는 광학 현미경 하에서 적절하게 고정된 샘플을 나타냅니다. 설명된 ?...
식물 해부학 및 형태학의 이미지 분석은지하 기관6,40, 종자의 공생 발아에 대한 구조 분석39, 공중 및 생식 구조41에 의해 입증된 바와 같이 목표를 달성하고 진균종속영양 식물과 필수 진균 내생 식물 간의 관계를 이해하는 데 도움이 되는 중요한 잠재력을 가지고 있습니다. . 구조 식물학은 지난 10년 동안 식물 과학?...
저자는 공개 할 것이 없습니다.
저자는 FAEPEX 및 FAPESP (2015/26479-6)의 자금 지원에 감사드립니다. MPP는 석사 학위 장학금(프로세스 88887.600591/2021-00)에 대해 Capes에게 감사를 표하고 CNPq. JLSM은 생산성 보조금(303664/2020-7)에 대해 CNPq에 감사드립니다. 저자는 또한 LME (전자 현미경 실험실 - IB / Unicamp), INFABiC (세포 생물학에 적용된 포토닉스에 관한 국립 과학 기술 연구소 - Unicamp) 및 LaBiVasc (혈관 생물학 실험실 - DBEF / IB / Unicamp); LAMEB (UFSC) 및 엘리아나 데 메데이로스 올리베이라 (UFSC) 냉동 보호 프로토콜에 대한 기여; TEM 프로토콜에 대한 기여에 대한 LME.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Acetone | Sigma-Aldrich | 179124 | (for SEM stubs mounting) |
Agar-agar (AA) | Sigma-Aldrich | A1296 | (for seeds germination tests) |
Calcofluor White Stain | Sigma-Aldrich | 18909 | fluorescent dye (detects cellulose) |
Citrate Buffer Solution, 0.09M pH 4.8 | Sigma-Aldrich | C2488 | (for toluidine blue O staining) |
Conductive Double-Sided Carbon Tape | Fisher Scientific | 50-285-81 | (for SEM) |
Confocal Microscope | Zeiss | (any model) | |
Copper Grids | Sigma-Aldrich | G4776 | (for TEM) |
Critical-point dryer | Balzers | (any model) | |
Cryostat | Leica Biosystems | (any model) | |
Dissecting microscope | Leica Biosystems | (= stereomicroscope, any model) | |
Entellan | Sigma-Aldrich | 107960 | rapid mounting medium for microscopy |
Ethyl alcohol, pure (≥99.5%) | Sigma-Aldrich | 459836 | (= ethanol, for dehydration processes) |
Formaldehyde solution, 37% | Sigma-Aldrich | 252549 | (for NBF solution preparation) |
Formalin solution, neutral buffered, 10% | Sigma-Aldrich | HT501128 | histological tissue fixative |
Gelatin capsules for TEM | Fisher Scientific | 50-248-71 | (for resin polymerisation in TEM) |
Gelatin solution, 2% in H2O | Sigma-Aldrich | G1393 | (dilute for slides preparation - OCT adherence) |
Glutaraldehyde solution, 25% | Sigma-Aldrich | G6257 | (for Karnovsky’s solution preparation) |
HistoResin | Leica Biosystems | 14702231731 | glycol methacrylate (GMA) embedding kit |
Iodine | Sigma-Aldrich | 207772 | (for Lugol solution preparation) |
Lead(II) nitrate | Sigma-Aldrich | 228621 | Pb(NO3)2 (for TEM contrast staining) |
Light Microscope | Olympus | (any model) | |
LR White acrylic resin | Sigma-Aldrich | L9774 | hydrophilic acrylic resin for TEM |
Lugol solution | Sigma-Aldrich | 62650 | (for staining) |
Metal stubs for specimen mounts | Rave Scientific | (for SEM, different models) | |
Microtome | Leica Biosystems | manual rotary microtome or other model | |
Oatmeal agar (OMA) | Millipore | O3506 | (for seeds germination tests) |
OCT Compound, Tissue-Tek | Sakura Finetek USA | 4583 | embedding medium for frozen tissues |
Osmium tetroxide | Sigma-Aldrich | 201030 | OsO4 (for TEM postfixation) |
Parafilm M | Sigma-Aldrich | P7793 | sealing thermoplastic film |
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | 158127 | (for Karnovsky’s solution preparation) |
Poly-L-lysine solution, 0.1% in H2O | Sigma-Aldrich | P8920 | (for slides preparation - OCT adherence) |
Poly-Prep Slides | Sigma-Aldrich | P0425 | poly-L-lysine coated glass slides |
Polyethylene Molding Cup Trays | Polysciences | 17177A-3 | (6x8x5 mm, for embbeding samples in GMA resin) |
Polyethylene Molding Cup Trays | Polysciences | 17177C-3 | (13x19x5 mm, for embbeding samples in GMA resin) |
Potassium iodide | Sigma-Aldrich | 221945 | (for Lugol solution preparation) |
Potato Dextrose Agar (PDA) | Millipore | 70139 | (for seeds germination tests) |
Scanning Electron Microscope | Jeol | (any model) | |
Silane [(3-Aminopropyl)triethoxysilane] | Sigma-Aldrich | A3648 | (for slides preparation - OCT adherence) |
Silane-Prep Slides | Sigma-Aldrich | S4651 | glass slides coated with silane |
Silica gel orange, granular | Supelco | 10087 | (for dessicating processes) |
Sodium cacodylate trihydrate | Sigma-Aldrich | C0250 | (for glutaraldehyde-sodium cacodylate buffer) |
Sodium hydroxide | Sigma-Aldrich | S5881 | NaOH (for Karnovsky’s solution preparation and TEM contrast staining) |
Sodium hypochlorite solution | Sigma-Aldrich | 425044 | NaClO (for seeds surface disinfection) |
Sodium phosphate dibasic, anhydrous | Sigma-Aldrich | 71640 | Na2HPO4 (for NBF solution and PB preparation) |
Sodium phosphate monobasic monohydrate | Sigma-Aldrich | S9638 | NaH2PO4·H2O (for NBF and PB) |
Sputter coater | Balzers | (any model) | |
Sucrose | Sigma-Aldrich | S0389 | C12H22O11 (for cryoprotection and germination test) |
Sudan III | Sigma-Aldrich | S4131 | (for staining) |
Sudan IV | Sigma-Aldrich | 198102 | (for staining) |
Sudan Black B | Sigma-Aldrich | 199664 | (for staining) |
Syringe | (3 mL, any brand, for TEM contrast staining) | ||
Syringe Filter Unit, Millex-GV 0.22 µm | Millipore | SLGV033R | PVDF, 33 mm, gamma sterilized (for TEM contrast staining) |
Tek Bond Super Glue 793 | Tek Bond Saint-Gobain | 78072720018 | liquid cyanoacrylate adhesive, medium viscosity |
Toluidine Blue O | Sigma-Aldrich | T3260 | (for staining) |
Transmission Electron Microscope | Jeol | (any model) | |
Triphenyltetrazolium chloride | Sigma-Aldrich | T8877 | (for the tetrazolium test in seeds germination) |
Trisodium citrate dihydrate | Sigma-Aldrich | S1804 | Na3(C6H5O7)·2H2O (for TEM contrast staining) |
Ultramicrotome | Leica Biosystems | (any model) | |
Uranyl acetate | Fisher Scientific | 18-607-645 | UO2(CH3COO)2 (for TEM contrast staining) |
Vacuum pump | (any model) | ||
Wheat Germ Agglutinin, Alexa Fluor 488 Conjugate | TermoFisher Scientific | W11261 | fluorescent dye-conjugated lectin (detects sialic acid and N-acetylglucosaminyl residues) |
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