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O presente protocolo descreve procedimentos utilizados para estudar e caracterizar enzimas relacionadas à parede celular, principalmente β-1,3-glucanase e peroxidase, em plantas de trigo. Seus níveis de atividade aumentam durante a interação trigo-RWA e estão envolvidos na resposta de defesa da planta por meio do reforço da parede celular, o que impede a alimentação de pulgões.
Plantas de trigo infestadas por pulgões do trigo russo (RWA) induzem uma cascata de respostas de defesa, incluindo as respostas de hipersensibilidade (HR) e indução de proteínas relacionadas à patogênese (PR), como β-1,3-glucanase e peroxidase (POD). Este estudo tem como objetivo caracterizar as propriedades físico-químicas do POD associado à parede celular e da β-1,3-glucanase e determinar seu sinergismo na modificação da parede celular durante a interação RWASA2-trigo. As cultivares suscetíveis Tugela, moderadamente resistente Tugela-Dn1 e resistente Tugela-Dn5 foram pré-germinadas e plantadas em casa de vegetação, adubadas 14 dias após o plantio e irrigadas a cada 3 dias. As plantas foram infestadas com 20 indivíduos partenogenéticos do mesmo clone RWASA2 no estádio de 3 folhas, e as folhas foram colhidas de 1 a 14 dias após a infestação. O fluido de lavagem intercelular (IWF) foi extraído por filtração a vácuo e armazenado a -20 °C. Os resíduos das folhas foram triturados em pó e usados para componentes da parede celular. A atividade e caracterização do POD foram determinadas usando substrato de guaiacol 5 mM e H2O2, monitorando a mudança na absorbância a 470 nm. A atividade da β-1,3-glucanase, o pH e as condições ótimas de temperatura foram demonstrados medindo-se os açúcares redutores totais no hidrolisado com reagente DNS usando substratos de β-1,3-glucano e β-1,3-1,4-glucano, medindo a absorbância a 540 nm e usando a curva padrão de glicose. O pH ótimo foi determinado entre pH 4 a 9, temperatura ótima entre 25 e 50 °C e estabilidade térmica entre 30 °C e 70 °C. A especificidade do substrato β-1,3-glucanase foi determinada a 25 °C e 40 °C usando substratos de coalhada e cevada β-1,3-1,4-glucana. Além disso, o modo de ação da β-1,3-glucanase foi determinado usando laminaribiose para laminaripentaose. Os padrões do produto de hidrólise de oligossacarídeos foram analisados qualitativamente com cromatografia em camada delgada (TLC) e quantitativamente analisados com HPLC. O método apresentado neste estudo demonstra uma abordagem robusta para infestar trigo com RWA, extração de peroxidase e β-1,3-glucanase da região da parede celular e sua caracterização bioquímica abrangente.
Os pulgões do trigo russo (RWA) infestam o trigo e a cevada, causando perda significativa de rendimento ou redução da qualidade do grão. O trigo responde à infestação induzindo várias respostas de defesa, incluindo o aumento dos níveis de atividade da β-1,3-glucanase e peroxidase nas cultivares resistentes, enquanto as cultivares suscetíveis reduzem a atividade dessas enzimas no período inicial da infestação 1,2,3,4. As principais funções da β-1,3-glucanase e POD na planta de trigo incluíram a regulação do acúmulo de calose na cultivar resistente e a extinção de espécies reativas de oxigênio (ROS) na parede celular e regiões apoplásticas durante a infestação por RWA 1,3,5,6,7. Mafa et al.6 demonstraram que houve uma forte correlação entre o aumento da atividade do POD e o aumento do teor de lignina na cultivar de trigo resistente após infestações por RWASA2. Além disso, o aumento do teor de lignina indicou que a parede celular da cultivar de trigo resistente infestada foi reforçada, levando à redução da alimentação com RWA.
A maioria dos grupos de pesquisadores extraiu e estudou a β-1,3-glucanase apoplástica e a POD durante a interação trigo/cevada-RWA; além disso, a maioria desses estudos afirmou que essas enzimas influenciam a parede celular da planta de trigo infestada com RWA sem medir a presença da enzima na região da parede celular. Apenas alguns estudos usaram técnicas microscópicas para mostrar que os níveis de atividade da β-1,3-glucanase estavam ligados à regulação da calose 7,8,9 ou extraíram os principais componentes da parede celular para demonstrar a correlação entre as atividades do POD e a modificação da parede celular no resistente 6,10. A falta de sondagem da associação β-1,3-glucanase e POD à parede celular indica a necessidade de desenvolver métodos que permitam aos pesquisadores medir diretamente as enzimas ligadas à parede celular.
O método atual propõe que é necessário remover o fluido apoplástico do tecido foliar antes de extrair as enzimas ligadas à parede celular. O procedimento de extração do fluido apoplástico deve ser realizado duas vezes do tecido foliar, que é usado para extrair as enzimas ligadas à parede celular. Esse processo reduz a contaminação e a confusão das enzimas apoplásticas com as encontradas nas regiões da parede celular. Assim, neste estudo, extraímos POD ligado à parede celular, β-1,3-glucanase e β-glucanase específica para MLG e realizamos sua caracterização bioquímica.
O estudo foi conduzido com a aprovação e permissão do Comitê de Ética em Pesquisa Ambiental e de Biossegurança da Universidade do Estado Livre (UFS-ESD2022/0131/22). Os detalhes dos reagentes e do equipamento aqui estão listados na Tabela de Materiais.
1. Condições de crescimento das plantas
2. Infestação de cultivares de trigo com RWASA2
3. Extração do fluido de lavagem intercelular (IWF) do apoplasto
4. Extração da β-1,3-glucanase associada à parede celular e POD
NOTA: Os resíduos foliares deixados após a extração da IWF foram utilizados para extrair a proteína total da parede celular.
5. Determinação do padrão proteico
6. Prepare o padrão de glicose para a atividade da β-1,3-glucanase
7. Determinação do ensaio de atividade da β-1,3-glucanase
NOTA: A atividade enzimática da β-1,3-glucanase ligada à parede celular extraída de Tugela, Tugela-Dn1 e Tugela-Dn5 foi determinada pela quantidade de açúcares redutores totais liberados da hidrólise de 0,5% (p/v) de substratos ligados a 0,5% (p/v) de β-1,3-1,4-glucano (MLG) e 0,4% (p/v) de β-1,3-glucano usando um método modificado conforme descrito por Miller et al.15. Mantenha sempre os tubos com alíquotas de proteína no gelo. Se as amostras foram congeladas, descongele-as no gelo e proceda imediatamente após o descongelamento.
8. Determinando a atividade da peroxidase (POD)
NOTA: A atividade da peroxidase ligada à parede celular das cultivares de trigo Tugela, Tugela-Dn1 e Tugela-Dn5 foi determinada quantificando a formação do tetra-guaiacol produzido por unidade de tempo a partir do guaiacol16.
9. Caracterização do POD
NOTA: Os ensaios de caracterização de POD foram conduzidos usando extratos enzimáticos 3 dias pós-infestação (dpi) de Tugela, Tugela-Dn1 e Tugela-Dn5 seguindo métodos semelhantes descritos na etapa 8, com pequenas alterações nos tampões de reação e temperaturas. As amostras de enzimas foram sempre mantidas no gelo enquanto os experimentos estavam sendo conduzidos. Execute as reações em quadruplicados com uma reação paralela em branco.
10. Caracterização da β-1,3-glucanase
NOTA: Realizar os ensaios de caracterização seguindo o método descrito na etapa 7 usando extratos enzimáticos de 3 dpi, com algumas modificações nos tampões de reação e temperaturas. Execute as reações em quadruplicados, com uma reação em branco paralela para cada substrato.
11. Avaliação do mecanismo de ação da β-1,3-glucanase em diferentes substratos de glucano
NOTA: Os substratos de glucano contêm o mesmo resíduo de glicose em sua espinha dorsal, mas as ligações glicosídicas entre as unidades de glicopiranose são diversas e podem assumir a orientação α ou β17. As ligações glicosídicas podem se formar entre vários átomos de carbono de moléculas de glicose, definindo sua estrutura química, por exemplo, β-1,3-glucano, β-1,4-glucano e β-1,3-1,4-glucano ligado misto (MLG) 18 , 19 , 20 . O mecanismo de ação da β-1,3-glucanase foi determinado usando amostras de Tugela, Tugela-Dn1 e Tugela-Dn 5 infestadas por RWASA2 (fontes de enzimas) e os seguintes substratos β-1,3-glucano (CM-coalhada), MLG (de cevada) e β-1,4-glucano (AZO-CM-Celulose). O mecanismo de ação é determinado em condições ótimas de ensaio (25 °C e 40 °C, pH 5,0), usando 0,1% (p/v) β-1,4-glucano, 0,4% (p/v) β-1,3-glucano ou 0,5% (p/v) substratos MLG.
12. Determinando o modo de ação da β-1,3-glucanase
NOTA: O modo de ação da β-1,3-glucanase induzido por Tugela, Tugela-Dn1 e Tugela-Dn5 infestado com RWASA2 foi testado com laminarina-oligossacarídeos (LAMs) com o grau de polimerização (DP) entre 5 e 2. Use cromatografia em camada fina (TLC), cromatografia líquida-espectrometria de massa (LC-MS) e kit de glicose oxidase peroxidase (GOPOD) para determinar o DP necessário para que a β-1,3-glucanase hidrolise o substrato. A CCD foi utilizada para análise qualitativa e a LC-MS para análise quantitativa, que determinou a concentração dos oligossacarídeos no hidrolisado após a reação21.
13. Coleta e análise dos dados
Quatro repetições biológicas de cultivares de trigo (Tugela, Tugela-Dn1 e Tugela-Dn5) foram infestadas com RWASA2 no estádio de crescimento de 3 folhas. Após a infestação, as folhas foram colhidas em 1, 2, 3, 7 e 14 dpi. Os tratamentos controle não foram infestados com RWASA2 para tornar os resultados do experimento comparáveis aos de plantas de trigo não expostas ao estresse. Os experimentos foram conduzidos em quadruplicados, e os resultados foram apresentados como valores médios.
O trigo e a cevada são culturas de cereais frequentemente infestadas por espécies de pulgões, incluindo pulgões russos do trigo (Diuraphis noxia)7,24. Plantas de trigo resistentes induzem a regulação positiva das atividades de POD e β-1,3-glucanase como respostas de defesa durante todo o período de infestação para modificar a parede celular regulando o acúmulo de calose e lignina 6,25,...
Os autores declaram não haver conflito de interesses envolvido neste trabalho.
M. Mafa recebeu financiamento da NRF-Thuthuka (Número de referência: TTK2204102938). S.N. Zondo recebeu a bolsa de pós-graduação da National Research Foundation para seu mestrado. Os autores agradecem ao Instituto Agricultural Research Council - Small Grain (ARC-SG) por fornecer as sementes utilizadas neste estudo. Quaisquer opiniões, descobertas e recomendações expressas neste material são de responsabilidade do(s) autor(es) e, portanto, os financiadores não aceitam qualquer responsabilidade em relação a isso.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
10 kDa Centrifuge concentrating membrane device | Sigma-Aldrich | R1NB84206 | For research use only. Not for use in Diagnostic procedures. For concentration and purification of biological solutions. |
2 g Laminaribiose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM2 | High purity laminaribiose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
3 g Laminaritriose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM3 | High purity laminaritriose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
3,5 Dinitro salicylic acid | Sigma-Aldrich | D0550 | Used in colorimetric determination of reducing sugars |
4 g Laminaritetraose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM4 | High purity laminaritetraose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
5 g Laminaripentaose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | O-LAM5 | High purity laminaripentaose for use in research, biochemical enzyme assays and in vitro diagnostic analysis. |
95% Absolute ethanol | Sigma-Aldrich | 107017 | Ethanol absolute for analysis |
acetic acid | Sigma-Aldrich | B00063 | Acetc acid glacial 100% for analysis (contains acetic acid) |
Azo-CM-Cellulose | Megazyme (Wicklow, Ireland) | S-ACMC | The polysaccharide is dyed with Remazolbrilliant Blue R to an extent of approx. one dye molecule per 20 sugar residues. |
Beta glucan (barley) | Megazyme (Wicklow, Ireland) | G6513 | A powdered substrate, less soluble in water. Used in determining β-1,3-glucanase activity. |
Bio-Rad Protein Assay Dye | Bio-Rad Laboratories, South africa | 500-0006 | Colorimetric assay dye, concentrate, for use with Bio-Rad Protein Assay Kits I and II |
Bovine serum albumin (BSA) | Gibco Europe | 810-1018 | For Laboratory use only |
Citrate acid | Sigma-Aldrich | C0759 | For Life Science research only. Not for use in diagnostic procedures. |
CM-curdlan | Megazyme (Wicklow, Ireland) | P-CMCUR | Powdered substrate for determining β-1,3-glucanase activity. Insoluble in water. |
D-Glucose | Sigma-Aldrich | G8270 | For Life Science research only. Not for use in diagnostic procedures. |
Guaiacol | Sigma-Aldrich | G5502 | Oxidation indicator. Used for determining peroxidase activity. |
Hydrogen peroxide | BDH Laboratory Supplies, England | 10366 | Powerful oxidising agent. |
Mikskaar Professional Substarte | Mikskaar (Estonia) | NI | Peat moss-based seedling substrate. |
Multifeed fertiliser (5.2.4 (43)) | Multifeed Classic | B1908248 | A water soluble fertiliser for young developing plants and seedlings with a high phosphorus (P) requirement to ensure optimum root development. |
Naphthol | Merck, Germany | N2780 | Undergoes hydrogenations in the presence of a catalyst. |
Phenol | Sigma-Aldrich | 33517 | Light sensitive. For R&D use only. Not for drug, household, or other uses. SDS available |
Potassium sodium tartrate tetrahydrate (Rochelle salt) | Sigma-Aldrich | S2377 | used in the preparation of 3,5-dinitrosalicylic acid solution used in the determination of the reducing sugar. |
Silica plate (TLC Silica gel 60 F254) | Sigma-Aldrich | 60778-25EA | Silica gel matrix, with fluorescent indicator 254 nm |
Sodium hydroxide | Sigma-Aldrich | S8045 | For R&D use only. Not for drug, household, or other uses. |
Sodium metabisulfite | Sigma-Aldrich | 31448 | Added as an antioxidant during the preparation of 3,5-dinitrosalicylic acid solutions. |
Sodium phosphate dibasic heptahydrate | Sigma-Aldrich | S9390 | Used as a buffer solution in biological research to keep the pH constant. |
Sodium phosphate monobasic heptahydrate | Sigma-Aldrich | 71500 | An inorganic compound, which is soluble in water. Used as a reagent in the development of silicate-based grouts. |
Statistical analysis software | TIBCO Statistica | version 13.1 | |
Sulfuric acid | Merck, Darmstadt, Germany | 30743 | Sulfuric acid 95-97% for analysis of Hg, ACS reagent. |
Tris-HCl | Sigma-Aldrich | 10812846001 | Buffering agent in incubation mixtures. It has also been used as a component of lysis and TE (Tris-EDTA) buffer. For life science research only. Not for use in diagnostic procedures. |
UV–Visible Spectrophotometer | GENESYS 120 | ||
NI = not identified. |
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