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Neste Artigo

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Resumo

Aqui, descrevemos dois métodos quantitativos para estudar as interações proteína-ligante dos receptores de membrana da vitamina A e da opsina fotorreceptora com seus respectivos ligantes fisiológicos.

Resumo

A distribuição de vitamina A / retinol totalmente trans (ROL) em todo o corpo é fundamental para manter a função retinóide nos tecidos periféricos e gerar a proteína retinilideno para a função visual. RBP4-ROL é o complexo de ROL com a proteína de ligação ao retinol 4 (RBP4), que está presente no sangue. Dois receptores de membrana, o receptor 2 da proteína de ligação ao retinol 4 (RBPR2) no fígado e estimulado pelo retinol 6 retinol (STRA6) no olho, ligam-se ao RBP4 circulatório e esse mecanismo é crítico para internalizar o ROL nas células. O estabelecimento de métodos para investigar a cinética receptor-ligante é essencial para entender a função fisiológica dos receptores de vitamina A para a homeostase retinóide. Usando ensaios de Ressonância Plasmônica de Superfície (SPR), podemos analisar as afinidades de ligação e os parâmetros cinéticos dos receptores de membrana da vitamina A com seu ligante fisiológico RBP4.

Essas metodologias podem revelar novas informações estruturais e bioquímicas dos motivos de ligação a RBP4 em RBPR2 e STRA6, que são críticos para a compreensão dos estados patológicos de deficiência de vitamina A. No olho, o ROL internalizado é metabolizado em retinal 11-cis, o cromóforo visual que se liga à opsina nos fotorreceptores para formar a proteína retinilideno, rodopsina. A absorbância da luz causa a isomerização cis-para-trans da retina 11-cis, induzindo alterações conformacionais na rodopsina e a subsequente ativação da cascata de fototransdução. A diminuição das concentrações de ROL sérico e ocular pode afetar a formação da proteína retinilideno, que por sua vez pode causar localização incorreta da rodopsina, acúmulo de apoproteína opsina, cegueira noturna e degeneração do segmento externo dos fotorreceptores, levando à retinite pigmentosa ou amaurose congênita de Leber.

Portanto, metodologias espectrofotométricas para quantificar o complexo retiniano opsina-11-cis acoplado ao receptor acoplado à proteína G na retina são críticas para a compreensão dos mecanismos de degeneração das células da retina nos estados patológicos acima mencionados. Com essas metodologias abrangentes, os investigadores poderão avaliar melhor o suprimento de vitamina A na dieta na manutenção da homeostase retinóide sistêmica e ocular, que é crítica para gerar e manter as concentrações de proteína retinilideno nos fotorreceptores, o que é crítico para sustentar a função visual em humanos.

Introdução

A vitamina A / retinol totalmente trans / ROL obtido na dieta é um componente importante que desempenha um papel na função visual 1,2. O cromóforo 11-cis retinal, um metabólito da vitamina A da dieta, liga-se à opsina do receptor acoplado à proteína G (GPCR) para gerar a proteína retinilideno, rodopsina, nos fotorreceptores. Quando a luz incide sobre o olho, a configuração da rodopsina sofre uma mudança fundamental por meio da conversão de seu componente 11-cis-retinal para o totalmente trans-retiniano. Essa mudança de configuração desencadeia uma cascata de fototransdução dentro dos fotorreceptores dos bastonetes, convertendo a luz em um sinal elétrico, que é transmitido ao córtex visual no cérebro através do nervo óptico 3,4,5,6,7,8,9,10 . Concentrações diminuídas de ROL sérico e ocular podem afetar a formação da proteína retinilideno, que por sua vez causa localização incorreta da opsina, acúmulo de apoproteína opsina, cegueira noturna e degeneração do EO dos fotorreceptores, levando à Retinite Pigmentosa ou Amaurose Congênita de Leber, que pode causar cegueira 3,10.

O retinol totalmente trans é a forma de transporte fundamental da vitamina A na dieta e é a fonte da qual todos os retinóides funcionais e metabólitos da vitamina A da dieta são derivados. O fígado serve como o principal órgão para o armazenamento de vitamina A na dieta. O retinol hepático é transportado através do soro como seu complexo com a proteína 4 de ligação ao retinol (RBP4). A RBP4, expressa principalmente no fígado, forma um holocomplexo com o substrato retinol e transtirretina (TTR), que entra na circulação 11,12,13,14,15,16,17. O relato de um receptor de superfície celular para RBP4 na década de 1970 levou à hipótese de proteínas de transporte de membrana auxiliando no transporte de retinóides para dentro e para fora das células. O receptor de superfície celular para retinol ligado a RBP4 (RBP4-ROL) foi identificado como estimulado pelo retinol de ácido retinóico 6 (STRA6) no epitélio pigmentar da retina (EPR) do olho. O STRA6 se liga ao complexo holo-RBP4 circulatório e transporta o retinol ligado ao RBP4 através do EPR para ser utilizado pelos fotorreceptores18,19. Mutações no STRA6 podem levar a uma miríade de doenças e fenótipos associados a concentrações reduzidas de ROL ocular. Mutações STRA6 durante o desenvolvimento podem levar a anoftalmia, microftalmia e outros sintomas não oculares que se sobrepõem aos fenótipos associados à síndrome de Matthew-Wood 20,21,22,23,24,25,26,27. O STRA6 é expresso em diferentes órgãos e tecidos, como o EPR no olho, mas não em todos os tecidos26,27. Embora o local primário de armazenamento de retinóides seja o fígado, o STRA6 não é expresso no fígado.

Alapatt e colegas descobriram que o receptor 2 da proteína de ligação ao retinol 4 (RBPR2) se ligava ao RBP4 com alta afinidade e era responsável pela captação de retinol ligado ao RBP4 no fígado, semelhante ao STRA6 no RPE28. Foi relatado que RBPR2 compartilha homologia estrutural com STRA6 29,30,31. Propõe-se que RBP4 se ligue aos resíduos S294, Y295 e L296 em RBPR2, um domínio de ligação a aminoácidos parcialmente conservado entre RBPR2 e STRA6 também 29,30,31. A partir desses estudos, propõe-se que os receptores de membrana da vitamina A, como STRA6 e RBPR2, que contêm um ou mais resíduos/domínios de ligação extracelular, interajam com o RBP4-ROL circulatório. Os receptores de membrana, portanto, desempenham um papel importante na ligação do receptor ao RBP4 circulatório para internalização do ROL nos tecidos-alvo, como o fígado e o olho.

Na primeira parte deste estudo, utilizamos a Ressonância Plasmônica de Superfície (SPR) para investigar a interação de dois receptores de membrana de vitamina A (RBPR2 e STRA6) com seu ligante fisiológico RBP431. As afinidades de ligação e a cinética de associação/dissociação de proteínas a complexos ligantes podem ser medidas em tempo real usando SPR. Essa metodologia teve como objetivo fornecer informações cinéticas, estruturais e bioquímicas críticas sobre os motivos de ligação a RBP4 em RBPR2 e STRA6, que são críticos para a compreensão dos estados patológicos de deficiência de vitamina A31,32. Como mencionado acima, o ROL circulatório é internalizado no EPR via STRA6 para gerar o cromóforo 11-cis retinal, que se liga à opsina para gerar a proteína retinilideno, rodopsina, nos fotorreceptores33. Usamos metodologias de espectrofotometria para quantificar a GPCR-opsina e seu complexo retiniano ligante 11-cis em lisados retinianos murinos, o que é fundamental para a compreensão dos mecanismos de redução da proteína retinilideno, rodopsina, em estados patológicos oculares de Retinite Pigmentosa ou Amaurose Congênita de Leber34. Em geral, esses protocolos podem ser aplicados para estudar in vitro as consequências fisiológicas da RBP4, STRA6 ou RBPR2 mutantes em influenciar a homeostase sistêmica e ocular da vitamina A ou o impacto da rodopsina mutante ou proteínas do ciclo retinóide na função visual35,36.

Protocolo

1. Metodologia de ressonância plasmônica de superfície (SPR)

  1. Preparação e purificação da proteína RBP4 de camundongo
    1. Projete primers para gerar cDNA RBP4 de camundongo de comprimento total (msRBP4) (Sequência de referência NCBI: NM_001159487.1). Clone o cDNA msRBP4 em um vetor de expressão resistente à canamicina pET28a His-tag e expresse em células BL-21 DE3 (Tabela de Materiais).
    2. Transformar as células competentes para BL-21 DE3 (de acordo com o protocolo do fabricante) com o vector msRBP4-pET28a ligado e, em seguida, colocar em placas de ágar de caldo Luria-Bertani (LB) contendo canamicina 50 μg/ml30,37. Incubar as placas durante a noite a 37 °C numa incubadora e procurar colónias positivas no dia seguinte.
    3. Escolha uma única colônia e incube durante a noite a 37 ° C em 5 mL de caldo LB contendo canamicina 50 μg / mL.
    4. Para cultura secundária em 500 mL de caldo LB contendo canamicina 50 μg / mL, use 1% do volume de cultura primária (da etapa 1.1.3.) e incube a 37 ° C por 3-4 h; Verifique a densidade óptica usando um espectrofotômetro. Idealmente, proceda se o valor de OD estiver entre 0,6 e 1 para induzir a expressão da proteína com 0,5 mM IPTG a 24 °C durante a noite.
    5. Use várias concentrações de IPTG de 0,1-1 mM e faixa de temperatura de 16-30 °C para otimizar a expressão e a estabilidade do msRBP4.
    6. Centrifugue a cultura (da etapa 1.1.5.) a 16.000 × g por 10 min, descarte o sobrenadante e mantenha o pellet no gelo.
    7. Homogeneizar o pellet com tampão de lise (50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 0,1% (v/v) Triton X-100, 10% de glicerol, 0,5 mM de PMSF e inibidores de protease [pH 8,0]). Sonicar o lisado por 15 s ON e 30 s OFF cycle usando um homogeneizador com saída de 250 Watt e 40-50% de frequência de saída de 20 kHz. Repita 5x.
    8. Remover os restos celulares e as células não lisadas por centrifugação a 16.000 × g durante 20 min. Passar o sobrenadante do lisado através de uma coluna NTA de níquel com equilíbrio tampão.
    9. Lavar a coluna com tampão de lise (do passo 1.1.8) contendo 30 mM de imidazol.
    10. Em frações, eluir a proteína msRBP4 ligada usando tampão contendo 250 mM de imidazol. Execute as frações eluídas e monitore visualmente a quantidade de proteína com um gel de poliacrilamida SDS a 12%, corado com Coomassie Brilliant Blue R-250 em solução de metanol: água: ácido acético (45:45:10) e remova a coloração com solução sem coloração de Coomassie metanol: água: ácido acético (45:45:10).
    11. Agrupe as frações não utilizadas e dialise as frações agrupadas com um de diálise de 10K de 10 kDa MWCO.
    12. Avalie a qualidade da fração dialisada em um gel SDS-PAGE a 12% e quantifique a concentração de proteína.
      NOTA: A proteína Apo-RBP4 foi usada na análise da RPS. Para gerar holo-RBP4 (RBP4-retinol), consulte protocolos detalhados publicados em outro lugar 36,37.
  2. Validação inicial dos peptídeos RBPR2 e STRA6 com RBP4 para estrutura e interação por ensaio de fluorescência de triptofano e espectroscopia de dicroísmo circular (CD)
    1. Ensaio de fluorescência de triptofano
      1. Use a ferramenta de análise de composição de proteína on-line (https://web.expasy.org/protparam/) e cole a sequência de aminoácidos em código de uma letra para avaliar a composição estrutural da proteína RBP4 recombinante e os peptídeos individuais de RBPR2 e STRA6 para determinar os resíduos de aminoácidos triptofano nos peptídeos e proteínas individuais (Tabela de Materiais).
      2. Clique no botão calcular parâmetros e avalie a composição de aminoácidos para resíduos de triptofano (Trp).
        NOTA: Os resíduos de triptofano devem estar presentes nos peptídeos ou proteínas individuais que estão sendo analisados.
      3. Dilua os peptídeos RBPR2 e STRA6 individuais em várias concentrações micromolares e incube individualmente com 3 μg msRBP4 em uma placa de 96 poços em temperatura ambiente por 5 min. Excitar a mistura a 290 nm e varrer a emissão do comprimento de onda de 300 nm a 400 nm.
      4. Normalize os dados com a condição de controle em branco (somente tampão, sem peptídeo e sem proteína) e peptídeo (sem proteína) e plotagem.
        NOTA: O incremento de fluorescência do triptofano após a exposição a uma concentração de peptídeo baixa a alta sugere uma interação positiva entre os dois peptídeos individuais e a proteína RBP4.
    2. Espectroscopia de dicroísmo circular (CD)
      1. Dilua os peptídeos individuais e a proteína RBP4 recombinante em 1x tampão PBS, pH 7,0. Use várias concentrações de peptídeos RBPR2 e STRA6 e proteína RBP4 de 0,1 a 10 μg/mL para uma verificação de qualidade, conforme descrito abaixo.
      2. Adicionar peptídeos e proteínas diluídos individuais numa cubeta de 0,1 cm de comprimento e medir a absorbância/elipticidade da CD utilizando um espectrofotómetro de CD (195-250 nm). Use a fórmula abaixo para calcular a elipticidade média do resíduo (θ).
        [v] = (S × mRw)/(10cl)
        S representa o sinal CD em mθ; mRw representa a massa média do resíduo; c representa a concentração da proteína em mg/mL; e l representa o comprimento do caminho em cm.
      3. Calcule a variação percentual na estrutura da molécula usando a Análise de Estrutura Secundária BeStSel para Previsão de Dobras de Proteínas por Espectroscopia de CD (https://bestsel.elte.hu).
        NOTA: A estrutura secundária indica o dobramento adequado e as confirmações conservadas cruciais para o estudo de interação e o resultado das interações. Inspecione a estrutura prevista do domínio e prossiga com o estudo de interação.

2. Análise de SPR para determinar as afinidades de ligação e parâmetros cinéticos dos receptores de membrana da vitamina A (RBPR2 e STRA6) com seu ligante fisiológico RBP4

  1. Para a imobilização do RBP4 na configuração da superfície do chip CM5, usamos o chip sensor SPR, que carrega um ligante carboximetil dextrano estendido a um tamanho de ~ 100 nm covalentemente preso em uma superfície de ouro. Na presença de cloridrato de 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil) carbodiimida (EDC), a N-hidroxisuccinimida (NHS) converte os grupos carboxila na superfície do chip em ésteres de N-hidroxisuccinimida, que reagem espontaneamente com os grupos amina de aminoácidos e proteínas, forçando o ligante a se ligar covalentemente à superfície do chip (Tabela de Materiais).
    1. Imobilize a proteína msRBP4 purificada no chip do sensor (Figura 1 e Figura 2). No menu Executar do software, escolha o Assistente e prossiga com a opção de imobilização . Diluir o ligante (proteína msRBP4 obtida na etapa 1.1) em tampão de imobilização (tampão acetato de sódio 10 mM, pH 5,0) para 10 μg/ml (4 μL de ligante + 396 μL de tampão) e alíquota dos reagentes de acoplamento em frascos para injetáveis. Abra a janela do assistente de configuração de imobilização no controle do software, selecione o chip CM5 e a opção Imobilizar a célula de fluxo 2 e o nível-alvo de 1,200 Unidade de resposta (RU) para atingir Rmax de 30 RU no estudo cinético e na solução de lavagem: etanolamina. Digite o nome RBP4 e clique em Avançar.
      NOTA: Opcional: A caixa de diálogo Preparações do sistema para a opção Preparar antes da execução não é necessária se a preparação com o tampão PBST (solução salina tamponada com fosfato com uma solução detergente Tween 20 a 0,05%) tiver sido realizada anteriormente.
    2. Na caixa de diálogo Posição do rack , clique em Ejetar rack. Pegue na prateleira e coloque os frascos com os volumes atribuídos para cada reagente: 156 μL de msRBP4, 177 μL de etanolamina, 89 μL de EDC, 89 μL de NHS e um frasco vazio. Insira o rack com sample frascos e clique em OK e Avançar.
    3. Na caixa de diálogo Preparar Executar Protocolo , clique em Iniciar e Salvar.
  2. Configuração do ensaio cinético dos peptídeos RBPR2 e STRA6
    1. Dilua em série os peptídeos RBPR2, RBPR2 mutante e STRA6 de camundongo (sintetizados quimicamente anteriormente31 e listados na Tabela de Materiais) em tampão de corrida em uma faixa de 0,8-26,6 μM.
    2. Abra o software de controle e selecione o assistente Kinetics/Affinity. Clique em Arquivo | Abra o modelo e selecione Cinética/Afinidade. Insira o caminho do fluxo de diálogo da sequência de injeção 2-1 (célula de fluxo 2 como ativa e célula de fluxo 1 como referência), verifique o Tipo de chip CM5 e clique em Avançar. Na caixa de diálogo de configuração , marque Executar ciclos de inicialização, insira Solução: buffer e ciclos: e clique em Avançar.
    3. Na caixa de diálogo de parâmetros de injeção , insira os valores para os parâmetros da amostra : tempo de contato: 120 s, vazão 30 μL/min, tempo de dissociação 300 s; para parâmetros de regeneração : insira o nome da solução de regeneração: Glicina-HCl (pH 2.5), tempo de contato: 30 s, vazão: 30 μL/min e clique em Avançar.
    4. Na caixa de diálogo de amostras , insira o nome dos peptídeos, peso molecular e concentrações e clique em Avançar. Na caixa de diálogo Posição do rack , atribua os peptídeos diluídos como amostras individuais de ~120 μL de várias concentrações de 1 a 100 μM e ~230 μL de tampão, ~120 μL de tampão e ~1.000 μL de glicina, pH 2,5, às posições no rack. Clique em Ejetar rack e insira todos os frascos. Clique em Avançar e, na caixa de diálogo Preparar Protocolo de Execução , clique em Iniciar, insira um nome de arquivo e Salvar (Figura 2).
    5. No software, clique no menu Iniciar e selecione Avaliação. Escolha abrir o arquivo no software e, no menu suspenso de seleção, escolha Fc2-1 para analisar o sensorgrama ativo subtraído em branco da célula de referência para as fases de associação e dissociação dos peptídeos msRBP4 e msRBPR2 e msSTRA6 mutantes.
    6. Clique no botão suspenso Cinética/Afinidade e escolha Limite de superfície; para abrir a caixa de diálogo Selecionar curvas , marque a coluna de inclusão na tabela e clique em Avançar. Selecione a caixa de diálogo Dados para mostrar os sensorgramas subtraídos em branco; clique em Cinética e afinidade, mantenha os parâmetros padrão e clique na opção Ajustar para ajuste de curva. Inspecione a guia Relatório para obter a constante de dissociação de equilíbrio Kd e Ka ou Kna taxa de associação e Kd ou Kna taxa de dissociação. Salve o sensorgrama de dados cinéticos em .txt formato delimitado por guias e use os valores para plotar gráficos (Figura 3).
    7. Para determinar a constante cinética de afinidade Kd (concentração de ligante que se liga a metade dos receptores em equilíbrio), copie e cole as colunas de dados no arquivo de formato .txt gerado a partir do gráfico de avaliação para XY usado no software. Clique em Analisar e regressão não linear (ajuste de curva), verifique a coluna de dados e clique em Ok. Na caixa de diálogo de parâmetros , clique em Saturação de vinculação e em Modelo de encaixe de vinculação específico de um site com a fórmula de:
      Y= (Bmax*X)/(Kd + X)
      Onde Bmax é o número máximo de sítios de ligação (Unidade de Resposta), X é a concentração dos peptídeos e Y é a ligação (Unidade de Resposta) (Figura 3).

3. Metodologia de espectrofotometria para quantificar o complexo proteico retiniano GPCR-11-cis (retinilideno proteína rodopsina) em lisados retinianos

  1. Transporte o grupo predeterminado de camundongos que consiste em camundongos WT-C57BL/6J adultos para a sala escura.
  2. Adapte os camundongos durante a noite por 12-16 h e, sob luz vermelha, coloque o camundongo em uma câmara de eutanásia e abra a válvula de gás CO2 no regulador a 5 L / min por ~ 5 min. Garanta a morte aplicando pressão no pescoço e na cauda puxada para trás (luxação cervical).
  3. Enuclear os globos oculares e homogeneizar os olhos num tampão gelado contendo 20 mM de bis-tris propano (1,3-bis (tris(hidroximetil)metilamino)propano; BTP) pH 7,4, NaCl 150 mM, EDTA 1 mM e com inibidor de protease (Tabela de Materiais).
  4. Centrifugar o homogenato durante 15 min a 16000 x g a 4 °C, rejeitar o sobrenadante contendo proteínas citosólicas solúveis em água. Ressuspender e solubilizar a membrana peletizada e as proteínas da membrana em tampão contendo 20 mM de n-dodecil-β-d-maltosídeo (DDM), 20 mM de bis-tris propano (BTP) pH 7,4, 100 mM de NaCl, 1 mM de EDTA e com inibidor de protease durante 1 h a 4 °C numa plataforma rotativa.
  5. Centrifugar a fracção de membrana resolubilizada durante 1 h a 16000 x g, 4 °C. Misturar o sobrenadante com 30 μL de esferas de anticorpo Rho 1D4 e incubar durante 1 h a 4 °C numa plataforma rotativa.
  6. Usando um suporte magnético, separe o pulldown usando contas, descarte o sobrenadante e lave as contas com tampão 20 mM bis-tris propano (BTP) pH 7.4, 500 mM NaCl e 2 mM DDM.
  7. Eluir a proteína rodopsina incubando por 5-10 min em temperatura ambiente com tampão 20 mM bis-tris propano (BTP) pH 7,4, 100 mM NaCl, 2 mM DDM contendo 0,2 mg / mL 1D4 peptídeo (-TETSQVAPA) (Figura 4 e Figura 5).
  8. Analise a absorbância do eluimento de 200 nm a 800 nm usando uma cubeta retangular, submicro, quartzo, abertura de 2 mm, comprimento de caminho de 10 mm, 50 μL em uma configuração de varredura rápida com espectrofotômetro.
    NOTA: Use apenas cubetas de quartzo de alta qualidade (Figura 4).
  9. Para validar e determinar a qualidade, verifique e exponha a eluição à luz brilhante por 1 min e, em seguida, repita a etapa 3.8.
  10. Subtraia a absorbância em branco e calcule a proporção dos espectros de absorbância analisados com absorbância a 500 nm para opsina ligada à retina 11-cis, 380 nm para opsina ligada à retina totalmente trans exposta à luz e 280 nm para proteína Apo-Opsina livre de ligante (Figura 6). A opsina livre sem ligante retinal fornece uma absorbância basal a 500 nm.
  11. Para quantificar a concentração de rodopsina, use a Lei de Beer-Lambert:
    A = ε · C·l ou C=A/ε·l
    Onde A é a absorbância, ε o coeficiente de extinção molar (rodopsina ε500 = 40.600 M1 cm1 para Apo Opsina livre ε280 = 81.200 M1 cm1), C é a concentração e l comprimento do caminho.
  12. Para quantificar a opsina ligante em porcentagem, use uma proporção de A280 / A500.
  13. Traçar os espectros de absorvância subtraídos em branco e calcular o valor de opsina livre32.
  14. Calcule a concentração de rodopsina usando o coeficiente de extinção ε500 = 40600 M1 cm1. A concentração de opsina livre de ligante é calculada com a Lei de Beer-Lambert usando o coeficiente de extinção ε280 = 81.200 M1 cm1.

Resultados

Métodos quantitativos são descritos para estudar as interações proteína-ligante de receptores de membrana de vitamina A e fotorreceptor opsina com seus respectivos ligantes fisiológicos. O RBP4 de camundongo recombinante deve ser expresso em E. coli e a proteína purificada usada como ligante conjugado em um chip SPR. O RBPR2, STRA6 sintetizado quimicamente e o mutante S294A RBPR2 "SYL motif RBP4 interacting extracellular site" de um peptídeo de ~ 40 aminoácidos é usado...

Discussão

Etapas críticas no protocolo
Metodologia SPR
Modelagem in silico e análise de docking: A estrutura prevista de RBPR2 (https://alphafold.ebi.ac.uk/entry/Q9DBN1) e STRA6, e a estrutura conhecida para obanco de dados ms RBP4 PDB (RSCB PDB ID: 2wqa), devem ser usadas para o estudo de docking29,31. Além disso, métodos in vitro (cultura de células) devem ser usados...

Divulgações

Os autores declaram não haver conflito de interesses. Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo; na coleta, análise ou interpretação de dados; na redação do manuscrito ou na decisão de publicar os resultados.

Agradecimentos

Os autores agradecem à Dra. Beata Jastrzebska, Ph.D. (Departamento de Farmacologia, Case Western Reserve University, OH) por seus conselhos sobre o protocolo de absorbância de rodopsina. Este trabalho foi apoiado por uma bolsa do NIH-NEI (EY030889 e 3R01EY030889-03S1) e, em parte, pelos fundos iniciais da Universidade de Minnesota para a GPL.

Materiais

NameCompanyCatalog NumberComments
2-D Quant KitCytiva80648356
Amine Coupling KitCytivaBR100050
Biacore evaluation softwareBiacore S200Version 1.1
Biacore Sensor chip CM5CytivaBR100530
Bis tris propaneSigmaB6755-25G20 mM
BL21 DE3 competent cellsThermo ScientificEC0114
CD spectrophotometerJascoJ-815 Spectropolarimeter
Glycine HCLFisher BioreagentsBP381-1
GraphPad Prism Model fitting, data analysis
LB brothFisher BioreagentsBP1426-500
n-dodecyl-β-d-maltoside (DDM)EMD Millipore324355-1GM2-20 mM
pET28a His-tag Kanamycin-resistant expression vector Addgene69864-3
Plasmid purification kitQiagen27106
Rho1D4 MagBeadsCubeBiotech33299
Slide-A_Lyzer 10K dialysis cassetteThermo Scientific66810
Tween20Fisher BioreagentsBP337-5000.05%
UV vis SpectrophotometerAgilent Cary 60 UV-Vis
Peptide namePeptide sequenceHPLC-purityMass Spec
Mouse Rbpr2 (42)HVRDKLDMFEDKLESYLTHM
NETGTLTPIILQVKELISVTKG
92.14%Conforms
Mouse Stra6 (40)SVVPTVQKVRAGINTDVSYL
LAGFGIVLSEDRQEVVELVK
90.84%Conforms
Mouse Rbpr2 mutant S294A (42)HVRDKLDMFEDKLEAYLTHM
NETGTLTPIILQVKELISVTKG
0.92%Conforms

Referências

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